Krooninen sairaus

tiivistelmä

tavoite

tarkastella yhden nukleotidin polymorfismi (SNP) in

MUC16

(CA125) ja

MUC1

(CA15.3) in suhteessa munasarjojen syöpäriskiä ja selviytymistä.

Methods

genotyyppi ituradan muunnelmia

MUC16

(rs2547065, rs1559168, rs12984471, rs2121133) ja

MUC1

(rs2070803, rs4072037, rs1045253) käyttäen otetuista näytteistä 758 munasarjasyöpä tapauksissa ja 788 valvontaa kirjoilla New England tapauskontrollitutkimuksessa vuosina 2003 ja 2008. Laskimme ikävakioitu kertoimet suhde (OR) ja 95%: n luottamusvälit (CI) tautien riskiä käyttämällä ehdottomia ja polytomous logistinen regressio ja hazard ratio (HR) hengissä käyttämällä Coxin suhteellista riskisuhteita. Alaryhmässä tapauksissa vertasimme log-normalisoitu CA125 arvot genotyypin käyttäen yleistetty lineaarinen malli.

Tulokset

Kotelot homotsygoottisia variantin alleelin

MUC16

SNP, rs12984471 , oli huonompi kokonaiselossaoloaika (log-rank p = 0,03) ja suurempi CA125 tasoilla, erityisesti tapauksissa yli 65-(p = 0,01). Sillä

MUC1

SNP, rs4072037, naiset homotsygoottinen G variantin oli ei-merkittävästi vähentynyt riski vakavasta invasiivisia tyyppejä mutta kohonnut riski vakavasta rajatapaus kasvaimia, mucinous rajatapaus ja invasiivisia kasvaimia, ja endomet- kasvaimia. Naiset, joilla variantti alleelin

MUC16

SNP, rs2547065, varsinkin ne, jotka olivat homotsygoottisia oli kohonnut munasarjasyövän; mutta tämä yhdistys ei varmistetaan erillisellä aineisto.

Johtopäätös

Tämä kohdennettu näyttö seitsemän polymorfismien

MUC16

ja

MUC1

geenit ole yksilöinyt ja vahvistavat vaikutukset munasarjasyövän riskin yleistä. Saattaa kuitenkin olla vaikutuksia

MUC16

rs12984471 eloonjäämiseen ja

MUC1

rs4072037 riskien histologisen tyypit munasarjasyövän muuta kuin invasiivisia vakavasta. Edelleen tutkimus on aiheellinen.

Citation: Williams KA, Terry KL, Tworoger SS, Vitonis AF, Titus LJ, Cramer DW (2014) polymorfismit

MUC16

(CA125) ja

MUC1

(CA15.3) sijoittaminen suhteessa munasarjojen syöpäriski ja Survival. PLoS ONE 9 (2): e88334. doi: 10,1371 /journal.pone.0088334

Toimittaja: Surinder K. Batra, University of Nebraska Medical Center, Yhdysvallat

vastaanotettu: 18 syyskuu 2013; Hyväksytty: 06 tammikuu 2014; Julkaistu: 13 helmikuu 2014

Copyright: © 2014 Williams et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Work oli tukee NIH lupanumeroita R01CA054419, P50CA105009, R01CA49449, R01CA67272, R01CA50383, UM1 CA176726, ja P01CA87969; Department of Defense lupanumeroon W81XWH-10-1-0280 ja tutkijat lääketieteen Office Harvard Medical School ja Department Naistenklinikka Brigham and Women n sairaala. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistelua käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

kytkettynä ihmisen musiineilla (MUC) ovat perheen suuri, raskaasti glykosyloituja transmembraaniproteiineja, joilla on erilaisia ​​toimintoja [1]. CA125 tai MUC16, on suurin glykoproteiini limakalvon perheen, ja on yleensä ilmaistu epiteelisolujen eri kudoksiin, etenkin naisten synnytyskanavan [1]. CA125 on koholla seerumissa noin 82% munasarjasyöpä potilaiden ja sitä käytetään ennustamaan toistumisen [2], [3]. CA15.3 tai MUC1, myös ilmentyy epiteelisolujen eri kudoksiin, esillä vahva ilmentyminen maitorauhasen ja naisen synnytyskanavassa raskauden ja imetyksen aikana. CA15.3 on yli-ilmentynyt erilaisia ​​syöpiä, mukaan lukien rinta- ja munasarjasyöpä [1], [4]. Vaikka nämä kaksi musiineja tunnetaan parhaiten kasvainmerkkiaineet, osoittavat, että ne voivat olla rooli syövän etäpesäkkeiden, tuumorin kasvua ja selviytymistä, esto immuunivasteen, ja ennusteen [1], [5], [6].

Useat tutkimukset ovat tarkastelleet geneettistä vaihtelua osallistuvien geenien glykosylaation CA125 ja CA15.3 ja munasarjasyövän riskiä, ​​tarkkailemalla yleinen null yhdistysten [7], [8], [9], [10]; on kuitenkin olemassa muutamia tutkimuksia geneettinen vaihtelu erityisesti

MUC16

tai

MUC1

ja niiden yhdessä munasarjasyövän riskiä tai selviytymistä. Siksi tutkimme yhdistyksen välillä kohdennetun joukon yhden nukleotidin polymorfismien (SNP) in

MUC16

(rs2547065, rs1559168, rs12914471, rs2121133) ja

MUC1

(rs2070803, rs4072037, rs1045253) vuonna suhteessa munasarjojen syöpäriskiä ja selviytymistä.

Methods

Ethics lausunto

Institutional Review Boards Brigham and Women n sairaala, Dana Farber Cancer Institute, ja Dartmouth Medical School hyväksyi tutkimukset ja kaikki TET allekirjoitti tietoisen suostumuksen.

tutkimus väestö- ja suunnittelu

Data ja näytteet tulevat viimeisestä ilmoittautuminen vaihe New England Case valvonta Study munasarjasyöpä 2003-2008 (NECC) . Tiedot koskevat tapaus ja valvontaa ilmoittautuminen tätä tutkimusta on kuvattu muualla [11], [12]. Lyhyesti, 1610 tapaus tapauksissa munasarjasyövän tunnistettu sairaala kasvain levyt ja osavaltion syöpärekisterit vuosien 2003 ja 2008, 897 1238 oikeutettuja suostunut osallistumaan. Kontrolliraskauksiin kaupungin läpi kirjoja Itä Massachusetts ja ajokortin luetteloihin New Hampshire. Hylkäämisperusteet valvontaa mukana kyvyttömyys ottaa yhteyttä, historia munasarjojen poisto, kielimuuri tai siirtäminen ulkopuolella tutkimusalueella. Of 2522 valvonta tunnistettu, 1673 olivat oikeutettuja ja 857 suostui osallistumaan.

Kun kirjallinen suostumus, demografisia tietoja, lisääntymis- ja sairaushistoria, ja elämäntapaan liittyvien tekijöiden arvioitiin henkilökohtaista haastattelua ja heparinisoidusta kerättiin verinäytteitä.

genotyypin

DNA uutettiin ja tehtiin genotyypin Dana-Farber /Harvard Cancer Center (DF /HCC) korkea suoritusteho polymorfismi Core, tytäryhtiö Partners Healthcare Center for Henkilökohtainen Genetic Medicine . DNA uutettiin buffy coat näytteitä QIAmp (Qiagen, Chatworth, CA). Genotyypin

MUC16

(rs2547065, rs1559168, rs12914471, rs2121133) ja

MUC1

(rs2070803, rs4072037, rs1045253) suoritettiin käyttäen 5′-nukleaasin määritykset (Taqman®) Applied Biosystems Prism 7900HT Sequence Detection System (Applied Biosystems, Foster City, Kalifornia). Alukkeita, koettimia, ja olosuhteet Genotyyppausanalyysiin määritykset ovat saatavilla pyynnöstä. Replikaattia 10% näytteistä otettiin mukaan laadunvalvontaan. Laboratorion henkilöstö sokaissut tapauksessa valvonta-asema ja sijainti laadunvalvonnan.

Alustavien tietojen pyrimme vahvistaa yksi SNP itsenäisessä aineisto. Käytimme näytteet 534 tapausta ja 1513 tarkastuksia päässä Nurses Health Study kohortteja (NHS /NHSII) [13]. NHS sisältää 121700 osallistujaa, 32826 joista säädetty verinäytteitä vuonna 1990 ja 33040, jotka antoivat poskeen solujen näytteet 2001-2004. NHSII sisältää 116430 osallistujaa, joista 29611 säädetty veren 1996-1999 ja 29859 edellyttäen poskeen soluja 2004-2006. Tapauksessa havaittiin näytteenoton jälkeen ja ennen 1 päivää kesäkuuta 2010 mennessä (NHS) tai 01 kesäkuu 2009 (NHSII). Demografiset tiedot NHS ja NHSII osallistujat on kuvattu aiemmin [13]. Lyhyesti, osallisina olevat ikäluokat ovat enimmäkseen valkoinen ( 96%), mutta NHS on vanhempi kohortin kuin NHSII mikä näkyy osallistujien keski-ikä (NHS: 65 vuotta, NHSII: 49 vuotta), koskaan synnytyksen (95% NHS , 76% NHSII), ja yhä ehkäisytablettien käyttö (45% NHS, 81% NHSII).

Preoperatiivisen CA125 Levels

tarkistetaan kaikki potilastiedot ja atk laboratorio ilmoittaa tapauksista, jotka saivat hoitoa Brigham ja naisten sairaala tai Massachusetts General Hospital (n = 809) [14]. CA125 arvot otetun naisille, joiden tasoja oli mitattu ennen leikkausta ja /tai neoadjuvanttikemoterapian. Pystyimme hakea CA125 arvot 353 tapauksista genotyyppi tässä tutkimuksessa. Tiedot CA15.3 eivät olleet saatavissa.

Tilastollinen analyysi

Käytimme chi-neliö kokeet arvioida Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE) kullekin SNP kontrollien joukossa. Ehdoton logistista regressiota käytettiin laskettaessa yleistä kertoimet suhdeluvut (OR) ja 95%: n luottamusväli (95% CI) munasarjasyövän riski ikä- (jatkuva), tutkimuskeskuksen (Massachusetts tai New Hampshire), ja rotu (valkoiset tai ei- valkoinen). Yleisempi alleelin kullekin SNP toimi viiteryhmä regressiomalleista. Co-hallitseva (heterotsygoottista vs. villityyppi tai homotsygoottinen variantti vs. villityyppi), resessiivinen (homotsygoottinen variantti vs. heterotsygoottinen ja villityypin), ja kohti alleeli (trendi testi) malleissa laskettiin. Monimuuttuja regressiomalleja lisäksi mukautettu suvussa munasarjasyövän tai varhain alkanut rintasyöpä ja henkilökohtainen ollut rintasyöpä.

Polytomous logistisen regression avulla laskettiin OR (95% CI) riskin eri histologisia alatyyppejä oikaistu ikä, tutkimuskeskuksessa, ja rotu. Todennäköisyys osamäärätesti käytettiin testaamaan heterogeenisuus histologisia luokat (vakavien rajatapaus, serous invasiivisia [sisältää korkealaatuista siirtymäkauden solu ja sekoitetaan vakavien], mucinous [rajatapaus ja invasiivisia], endomet- tai seka endomet- /kirkas solu, kirkas solu, eriytymättömiä [sisältyy määrittelemätön ja Brenner kasvaimet]) verrataan malli, joka mahdollistaa arvion yhdistyksen vaihtelevan histologisen tyypin malliin, joka rajoittaa erään arvion yhdistyksen kaikille histologisia tyyppejä.

Coxin suhteellinen vaara mallit (HR) käytettiin tutkimaan yhdistyksen välillä jokaisen polymorfismin ja selviytymisen korjattuna tutkimuskeskuksen ja rotu ja toissijainen mallin vaiheen (I-IV) ja histologia (vakavien, ei vakavasta). Co-hallitseva, resessiivinen, ja kohti alleeli malleja käytettiin kuvattu täydentäviä menetelmiä (Methods S1). Kaplan-Meier-menetelmää käytettiin arvioitaessa eloonjäämiskäyrien ja laskea log-rank tilastoihin.

keskimääräinen geometrinen CA125 arvot genotyypin laskettiin kullekin

MUC16

polymorfismi. Tilastolliset analyysit käyttää yleistä lineaarista regressio, oikaistu ikä, rotu, ja aika välillä CA125 mittauksen ja diagnoosi (≤30 päivää, 30 päivää, puuttuu), käyttäen jatkuva log-transformoituja CA125 tasoilla ja muuttuja, joka edustaa yhä variantti alleelien kullekin polymorfismi ( 0, 1, 2). CA125 tasot voivat vaihdella kuukautiskierron aikana, ja tasot vaihtelevat ennalta ja postmenopausaalisilla naisilla [15], [16], joten me ositettu näiden analyysien kolmeen ikä /vaihdevuosien luokat (Premenopausaaliset, ”keski-iän” postmenopausaalista (ikä 65), ja ”vanhukset” postmenopausaalista (ikä = 65)). Kaikki analyysit suoritettiin käyttäen SAS vastaan ​​9,1 (SAS, Cary, North Carolina) ja välijäähdytetty Stata 9 (StataCorp LP, College Station, Texas).

Tulokset

Kaikkiaan 758 naisten munasarjojen syöpä ja 788 kontrollia sisällytettiin lopulliseen analyyttinen näyte (taulukko 1). Molemmissa tapauksissa ja valvontaa, keski-ikä oli 54. Tutkimusaineiston muodosti pääasiassa valkoihoisilla naisilla ( 95%) ja valkoinen etnisyys oli yleisempää valvontaa. Keskimäärin, valvonta oli korkeampi pariteetti, pitempi ehkäisytablettien käytön, ja korkeampi taajuus munanjohtimen sitomiseen, endometrioosi tai kivuliaat kuukautiset, ja henkilökohtainen ollut rintasyöpä. Suvussa munasarjojen tai varhain alkava rintasyöpä, tupakoinnista, ja vaihdevuosien tila ei eronnut merkittävästi tapausten ja kontrollien välillä. Vakavien invasiivisia (49,7%) oli yleisin histologiset alatyypin joukossa tapauksia seurasi endomet- (17,8%).

Kaikki seitsemän polymorfismit olivat Hardy-Weinberg tasapainoa ja oli genotyypityksen menestys yli 95% lukuun ottamatta rs2547065 (93%). Yleensä pienet alleeli taajuuksilla (MAF) löysimme meidän ohjaus ei verrattavissa Kaukasian Euroopan (CEU) HapMap väestö (tuloksia ei ole esitetty). Vuonna NECC tutkimuksessa yksi neljästä

MUC16

polymorfismien liittyi munasarjasyövän riski (taulukko 2). Sillä polymorfismi rs2547065, havaitsimme kasvu munasarjasyövän riski (per alleeli OR = 1,26, 95% CI: 1,09-1,47). Riski oli ilmeisin varten homotsygoottinen variantti genotyyppi verrattuna villin tyypin genotyyppi (OR = 1,68, 95% CI: 1,23-2,29). Kuitenkin polymorfismi rs2547065 ei liittynyt munasarjojen syöpäriskiä (per alleeli: OR = 1,05, 95% CI: 0,91-1,21) itsenäisessä aineisto mukaan lukien 534 tapausta ja 1513 tarkastuksia päässä Nurses Health Study kohortteja (NHS /NHSII). Ei ollut merkittävää heterogeenisyyttä histologisen tyypin minkään

MUC16

polymorfismien.

MUC1

yksikään polymorfismien testasimme liittyi merkittävästi yleistä munasarjasyövän riski kohti alleelin mallia. Naiset kuljettavat kaksi kopiota

MUC1

polymorfismi rs2070803 variantti oli lisääntynyt riski vakavasta kohdunkaulan syöpä tilastollisen merkitsevyyden rajoilla (OR = 1,35, 95% CI 0,99-1,86) on resessiivinen mallissa. Vaikka emme havainneet merkittäviä riskejä

MUC1

polymorfismi rs4072037 yleistä, merkittävä heterogeenisyys histologisesti havaittu arvioitaessa väistyvä mallina polymorfismi (p-heterogeenisuus = 0,02). Naiset homotsygoottinen G variantti rs4072023 oli ei-merkittävästi vähentynyt riski invasiivisen serous syöpien mutta Kohonnut riski vakavien rajatapaus kasvaimet (OR = 1,91, 95% CI 1,08-3,36), mucinous rajatapaus ja invasiivisia (OR = 1,68, 95% CI 1,00-2,83), ja endomet- kasvaimet (OR = 1,54, 95% CI 1,01-2,33). Tarvittiin suvussa munasarjasyövän tai varhain alkanut rintasyöpä ja henkilökohtainen ollut rintasyöpä ei muuttanut arvioita tahansa

MUC1

tai

MUC16

polymorfismien.

Tutkiessaan vaikutusta musiinituoton polymorfismien ja selviytymistä, havaitsimme huonompi eloonjäämiseen naisten kuljettaa variantti alleelin

MUC16

polymorfismi rs12984471 (log-rank p = 0,03; kuvio 1A) sekä lisääntynyt kuolleisuus (ikävakioitu HR = 1,23 95% CI: 1,02-1,48, taulukko 3). Nämä yhteydet olivat voimakkaimmin vuotiailla naisilla 65 ja vanhemmat (log-rank p = 0,02; ikävakioitu HR = 1,53 95% CI: 1,07-2,19) (kuvio 1 B). Kuolleisuus oli 57% suurempi naisilla, jotka olivat homotsygoottisia variantin alleelin rs12984471 (ikävakioitu HR = 1,57 95% CI: 1,09-2,28). Säätö vaiheessa ja histologia heikennettyjä yhdistyksen (monimuuttuja HR = 1,32 95% CI: 0,91-1,92); vaihe oli vahvin ennustaja selviytymisen. Mikään muu assosiaatioita jäljellä musiinituoton polymorfismien ja eloonjäämistä havaittiin.

. Kaikki naiset B. Postmenopausaaliset naisten ikä 65 ja vanhemmat.

Lopuksi arvioimme yhdistyksen välillä

MUC16

polymorfismien ja seerumissa CA125 mitattiin ennen leikkausta (taulukko 4). Kaikista tapauksista, havaitsimme mitään lineaarista assosiaatioita

MUC16

polymorfismien ja CA125 tasolla; kuitenkin, rs2121133 oli korkein ca125 tasot hetero- (319,9) ja pienin homotsygoottinen variantteja (110,0) (p = 0,03). Iäkkäiden postmenopausaalisilla naisilla, kasvava variantti alleelin polymorfismin rs12984471 olivat merkitsevästi yhteydessä lisääntyvää CA125 (p = 0,02).

Keskustelu

MUC1

geeni sijaitsee 1q21-22, joka on alue usein muuttaa sekä neoplastisia että ei-neoplastisia sairauksia.

MUC1

geenimonistuman lisääntyneen geenikopiomäärä on havaittu munasarja-, rinta-, papillaarinen kilpirauhasen, ja syöpien [17], [18], [19], [20]. Neoplastiset maitorauhasen solujen on osoitettu olevan korkea taajuus muuttunut DNA: n muuttuvan nukleotidin toistoalueen (VNTR) ja MUC1- suurimman alueen tämän proteiinin ja sivuston O-glykosylaatio [1], [21], [22 ]. MUC1 on osoitettu olevan olennainen munasarjasyövän tuumorigeneesiä hiiri malleja ja yli ilmaistuna noin 90-100% ja vakavien karsinoomien [23], [24], [25]. Kolme

MUC1

SNP tutkittiin valittiin perustuu aiempiin julkaisuihin, jossa tutkittiin assosiaatioita

MUC1

polymorfismien ja ruoansulatuskanavan syöpien [26], [27]. Polymorfismi rs4072037 on korreloinut seerumin MUC1 tasoilla ja tiedetään rooli vaihtoehtoisen silmukoinnin [28], [29]. Polymorfismi rs2070803 sijaitsee ylävirtaan

MUC1

geenin suuri LD lohko, ja polymorfismi rs1045253 on aiemmin tunnistettu tagSNP edustaja

MUC1

alueella [30], [31], [ ,,,0],32]. Mikään näistä kolmesta polymorfismien vaikuttaa riskiä tai eloonjääminen munasarjasyöpään yleistä. Naiset, jotka olivat homotsygoottisia variantin G alleelin rs2070803 oli 35% nousu riski invasiivisen vakavasta munasarjasyöpä. Vaikka havainto oli tilastollisen merkitsevyyden rajoilla, on japanilainen tutkimuksessa todettiin riski ”diffuusi” tyyppinen mahasyöpä korotettava hallussa G-alleelin [31]. Kokeissa teimme heterogeenisyys histologisen tyypin munasarjasyöpä, vain rs4072037 vaihteli lisääntynyt riski muissa kuin invasiivisia serous lukien erityisesti vakavien rajatapaus, mucinous, ja endomet-. Yleisesti kaikki histologinen tyypit epiteelin munasarjojen kasvaimia, sekä hyvän- että pahanlaatuisia, ilmaista MUC1 solun pinnalla immunohistokemiallisesti [33]. Kuitenkin tuore tutkimus käyttäen geenin ilmentymisen ehdotetaan, että MUC1-ekspressio on alhainen yksi alatyypin invasiivisia vakavien kasvainten [34].

MUC16

geeni sijaitsee 19p13, joka on muuttunut eri syöpien, erityisesti munasarjojen. Munasarjojen syöpä, 19p13 on tunnistettu kromosomissa kaistan useimmiten aiheuttavat rakenteen uudelleenjärjestäytymisen [35], [36]. Tämä alue on myös osoitettu olevan erittäin monistaa korkealaatuista serous syöpä [37]. Polymorfismit rs12984471, rs1559168, rs2121133 ovat tagSNPs ja valittiin tutkimuksessamme, koska ne edustavat eri alueiden

MUC16

geenin. Vähäinen alleelien rs12984471 ja rs1559168 käyttöön missensemutaatioita kun rs2121133 on intronista [38]. Polymorfismi rs2547065 valittiin, koska se oli aiemmin tutkittu suhteessa munasarjojen epiteelin syövän [39], ja otetaan käyttöön missensemutaatio, jotka voivat edistää toiminnallisen muutoksen geenin tuotteen. Niistä

MUC16

polymorfismien tutkittu, havaitsimme yhdistysten välillä rs2547065 ja munasarjasyövän riskin välillä rs12984471 ja selviytymistä.

Pienessä tutkimuksessa, joka tarkasteli kahta

MUC16

variantit mukaan lukien rs2547065 , Bouanene et ai. havaittu, että CC-genotyyppi oli yleisempää tapauksessa (49%) kuin verrokeilla (34%), samanlainen suuntaan kuin mitä havaitsimme mutta joiden merkitys niiden tutkimus, joka sisälsi vain 41 tapauksessa ja 76 tarkastuksia [39]. Huolimatta siitä, että homotsygoottinen variantti genotyyppi (CC) polymorfisuudesta rs2547065 liittyi munasarjasyövän riski yleistä ja invasiivisen serous munasarjasyövän NECC data, emme pystyneet vahvistamaan tätä havaintoa riippumattomissa tietoja Nurses Health Study. Positiivisia tuloksia Tutkimuksessamme tukevia tuloksia ainoa julkaistu tutkimus liittyy tähän SNP, mutta nolla tuloksia NHS, validointi on tarpeen ja suunnitellaan sisällä munasarjasyöpä Association Consortium.

MUC16

polymorfismi rs12984471 oli ainoa SNP liittyy selviytymisen. Variantti alleeli, jolla annettiin huonompi selviytymisen kaikista tapauksista, myös korreloi korkean CA125 seerumin postmenopausaalisilla naisilla, erityisesti yli 65-vuotiaita Mahdollisuus, että yhdistyksen välillä rs12984471 ja selviytymisen voi olla biologinen perusta on ehdottanut mahdollista toiminnallisia seurauksia MUC16 proteiinia. Polymorfismi rs12984471 sijaitsee pääosin tuntemattomia solunulkoisen alayksikköä, jossa C variantti vastaa konservatiivinen missensemutaatio muuttaminen glutamaatin aspartaatti [38], [40]. Konservatiivisia aminohappo- muutoksia teoreettisesti antaa 40% todennäköisyys geenien toiminnan muutos verrattuna hiljainen mutaatio [41]. Siten on todennäköistä, että missensemutaatioita aiheuttamien polymorfismi voi vaikuttaa toimintaan

MUC16

geenituote ehdottivat sen vaikutuksia CA125 tasoilla tapauksissa.

Yhteenvetona tutkimuksessamme tarkasteltiin neljää SNP

MUC16

(CA125) ja kolme SNP

MUC1

(CA15.3) suhteessa munasarjasyöpään riskejä ja selviytymistä New England tapauskontrollitutkimuksessa. Yksi neljästä

MUC16

SNP, rs2547065, liittyi lisääntynyt riski munasarjasyöpä. Erilainen

MUC16

SNP, rs12984471, liittyi selviytymisen ja myös korreloivat seerumin CA125. Kolmesta

MUC1

SNP tutkittu, löysimme yksi, rs4072037, mikä näkyy merkittävää heterogeenisyyttä histologisen tyypin. Meillä oli mahdollisuus tutkia yhden näistä havainnoista, rs2547065 lisääntynyt riski, on tietoja Sairaanhoitajan Health Study. Löydös ei ole vahvistanut ottamiselle esiin mahdollisuuden selittää havaintomme. Kuitenkin yhdistys rs12984471 in

MUC16

pelastautumiskoulutukseen on jonkin verran biologinen tukea, että se on myös korreloi CA125 tasoilla. Koska tutkimuksemme väestö koostuu pääasiassa valkoihoisilla naisilla, emme voineet yleistää tuloksemme muihin etnisten ryhmien. Tutkimuksemme ei tulisi pitää lopullisesti, koska me kohdennettuja SNP vastakohtana suorittamasta laajaa geenin tai genomin kattavaa tutkimusta. Arviointi laajemmalle koodaus SNP on suunnitteilla Munasarjojen Cancer Association Consortium.

tukeminen Information Tool Menetelmät S1.

Täydentäviä menetelmiä iästä ja histologisten luokittelu, tilastollisia malleja, ja SNP valinta ja genotyypin määritystä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0088334.s001

(DOCX) B

Kiitokset

Haluamme kiittää osallistujia ja henkilökunnan NHS ja NHSII kohortteja heidän arvokkaasta panoksesta sekä seuraavassa kunnossa syöpärekisterit heidän avustaan: AL, AZ, AR, CA, CO, CT, DE, FL , GA, ID, IL, IN, IA, KY, LA, ME, MD, MA, MI, NE, NH, NJ, NY, NC, ND, OH, OK, OR, PA, RI, SC, TN, TX , VA, WA, WY. Lisäksi tämä tutkimus hyväksyi Connecticut Department of Public Health (DPH) Human Tutkimukset komitea. Tietyt käytetyt tiedot tässä julkaisussa saatiin DPH. Kirjoittajat täyden vastuun analyysejä ja tulkita näitä tietoja.