Krooninen sairaus

tiivistelmä

Kaliumkanavia on tullut painopiste syövän biologian niillä rooleja solun käyttäytymistä liittyy syövän etenemiseen, kuten solujen lisääntymisen , muuttoliike ja apoptoosin. Kahden huokosten domain (K

2P) kaliumkanavia ovat tausta kanavia, jotka mahdollistavat vuoto kaliumionien soluista. Koska nämä kanavat ovat avoimia levossa niillä on suuri vaikutus solukalvon potentiaalia ja myöhemmin sähköistä toimintaa ja käyttäytymistä soluissa, joissa niitä ilmennetään. K

2P perheen kanavia on 15 nisäkkäiden jäsentä ja jo 4 tämän perheen jäseniä (K

2P2.1, K

2P3.1, K

2P9.1, K

2P5 0,1) ovat sekaantuneet syöpää. Tässä tarkastellaan ilmaus kaikkien 15 jäsentä K

2P perheen kanavia eri syöpätyyppien. Tämä saatiin aikaan käyttämällä online syöpä microarray tietokanta, Oncomine (www.oncomine.org). Kukin geeni tutkittiin yli 20 syöpätyyppejä, verrataan mRNA ilmentyminen syövän normaalia kudosta. Tämä analyysi paljasti kaikki paitsi 3 K

2P perheenjäsenet (K

2P4.1, K

2P16.1, K

2P18.1) osoittavat muuttunutta ilmentymistä syöpä. Yliekspressio K

2P kanavia havaittiin erilaisia ​​syöpiä, kuten rinta-, leukemia ja keuhkojen kun taas syöpiä (aivot, peräsuolen, maha-suolikanavan, munuaisten, keuhkojen, melanooma, ruokatorven) osoitti ali yhden tai useamman kanavan. K

2P1.1, K

2P3.1, K

2P12.1, oli yli-ilmentynyt eri syöpiä. Vaikka K

2P1.1, K

2P3.1, K

2P5.1, K

2P6.1, K

2P7.1 ja K

2P10.1 osoitti merkittävää ali poikki syöpätyyppeihin tutkittu. Tämä analyysi tukee käsitystä, että erityinen K

2P kanavat saattavat olla rooli syövän biologian. Heidän muuttunut ilme sekä niiden kyky vaikuttaa toimintaan muiden ionikanavia ja niiden herkkyys ympäristön ärsykkeisiin (pO2, pH, glukoosi, stretch) tekee ymmärtäminen rooli näiden kanavien olla syöpä avainasemassa.

Citation : Williams S, Bateman A O’Kelly I (2013) Altered Expression of Two-Pore Domain Kalium (K

2P) kanavat Cancer. PLoS ONE 8 (10): e74589. doi: 10,1371 /journal.pone.0074589

Editor: Sven G. Meuth, University of Muenster, Saksa

vastaanotettu: 03 kesäkuu 2013; Hyväksytty: 03 elokuu 2013; Julkaistu: 07 lokakuu 2013

Copyright: © 2013 Williams et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Work rahastoiva jonka Gerald Kerkut Charitable Trust (https://www.southampton.ac.uk/~gktrust/). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Perinteisesti tutkimus ionikanavia on keskittynyt niiden roolit eksitatorisessa soluissa (hermosolujen, sydämen ja eritys-), mutta viime aikoina, ionikanavia on tunnistettu niiden roolit käyttäytymistä syöpäsolujen ja kehitystä ja etenemiseen syövän. Vuonna viimeisten 15 vuoden yhä enemmän näyttöä tukee roolia ionikanavia mitogeneesiä, valvontaan solujen lisääntymisen ja apoptoosin sekä solujen vaeltamiseen ja etäpesäkkeiden [1] – [8]. Yliekspressio joissakin ionikanavia on yhdistetty huonoon ennusteeseen [9], kun muut kanavat ovat nyt tunnustettu mahdollisiksi biomarkkereita erityisesti syöpätyyppeihin [10], [11]. Nämä raportit yhdessä mahdollisuuksia kohdistaminen ionikanavan toimintoa farmakologisen modulaatio, jotta ymmärtää rooli ionikanavia syöpäbiologian avainasemassa.

K

+ kanavat pelata perustavanlaatuinen rooli solun käyttäytymistä liittyy syövän etenemisessä, mukaan lukien solujen jakautumisen, muuttoliike, apoptoosin ja angiogeneesin [2], [12] – [14]. Solukalvon potentiaalia (vetämänä K

+ kanava aktiivisuus) on tärkeä säätelevä rooli solusyklin etenemistä ja lisääntymistä, erittäin jakautuvat solut näytetään positiivisempi kalvojännite- kuin lepotilassa olevat solut, kun taas ohimenevä kalvo hyperpolarisaatioon mahdollistaa G1 etenemistä [15 ] – [18]. Tarkka sääntelymekanismit ovat epäselviä, mutta todisteet tukevat kahden hypoteesin. Ensimmäinen ehdottaa muutoksia kalvopotentiaalissa johtuen K

+ kanava aktiivisuutta moduloi jänniteherkkiin Ca

2 + kanavia, vaikuttaen Ca

2+ virtaa ja alavirran signalointia [17], [19]. Vaihtoehtoinen hypoteesi ehdottaa, että muutokset soluvolyymiä nähdyksi lisääntymistä (solu turvotusta) ja apoptoosin (solu kutistuminen) voidaan säännellä K

+ kanava toimintaa [18], [20], [21]. Samalla tavalla, K

+ kanava valvonta membraanipotentiaalille on osoitettu vaikuttavan solujen vaeltamiseen säätelemällä solujen määrän, pH ja solunsisäiset Ca

2+ pitoisuus. Suora vaikutus muutoksen kalvon potentiaalia cytoskeletal polymerisaatio on myös osoitettu [14], [22], [23].

Altered K

+ kanava ilmaisun ja /tai toiminta tapahtuu eri syöpätyyppejä, joissa ionikanavia kustakin K

+ kanava perheet (jänniteherkkää (K

V), kalsiumherkkää (K

Ca); sisäänpäin oikaisemisesta (K

IR) ja kaksi -pore domain (K

2P) kanavaa) osallisena syövän kehittymisen ja etenemisen. Sisällä K

V perhe, K

V11.1 (hERG) osoittaa muuttunutta ilmentymistä riviksi syöpätyyppeihin ja sen on osoitettu vaikuttavan soluproliferaatioon (melanooma, paksusuolen ja peräsuolen syövän ja Barrettin ruokatorvi), maahanmuutto (melanooma, kilpirauhasen ja rintasyöpä), pahanlaatuisiksi (head niska syöpä) ja apoptoosin (mahalaukun syöpä). Vaikka K

V11.1 on yleisimmin raportoitu sen roolista syövässä, joukko muita K

+ kanavat myös ehdotettu molekyylikomponentit edistää syövän kehittymistä ja etenemistä [9], [10], [24 ] – [80] (yhteenveto taulukossa 1).

mahdollista osuutta K

2P kanavien syöpä on erityisen kiinnostava. Nämä kanavat suorittaa ulospäin K

+ tausta virtaukset ja toimivat lepokalvopotentiaalit, joten niillä on suora vaikutus lähtötilanteen solujen toimintaa solujen levossa kuten kalvo potentiaalia, kalsiumtasapainoa ja solujen tilavuuden säätely. K

2P kanavat osoittavat myös herkkyyttä fysiologisiin ärsykkeisiin kuten pH, happi jännitys, glukoosipitoisuuden ja venyttää; keskeiset fysiologiset parametrit, jotka häirinnyt sisällä syöpäsoluja ja niiden ympäristöön [81] – [83].

Niistä 15 nisäkkäiden K

2P perheenjäsenet, neljä K

2P kanavat (K

2P2.1 (TREK-1), K

2P3.1 (TASK-1), K

2P9.1 (TASK-3) ja K

2P5.1 (TASK-2)) on jo osallisena syövän. Vuonna 2003 Mu

et al

. [77] on kuvattu KCNK9 koodaava geeni K

2P9.1, mahdollisena proto-onkogeenin, jossa genominen yli-ilmentyminen geenin havaittiin 10%: lla rinta- karsinoomien ja proteiini havaittiin 44%: ssa rintasyövistä immunohistokemiallisesti mutta ei normaalissa kudoksessa valvontaa. Onkogeenisel- kyky (mitattuna proliferatiivinen etuna) osoitettiin riippuu funktionaalinen kanava [84]. K

2P9.1 immunopositivity on sittemmin todettu peräsuolen karsinoomat [78] ja melanooma kudosnäytteiden [85].

Lisääntynyt K

2P2.1 ekspressiota havaittiin eturauhasen adenokarsinooma näytteissä verrattuna normaaliin eturauhasen epiteelin ja vähentää leviämisen eturauhassyövän solulinjoissa havaittiin, kun K

2P2.1 kokeellisesti pudotettiin [74].

tekemässä tutkimuksessa Nogueira

et al

. (2010) [75] liittyvät K

2P3.1 ilmaus aldosteronin tuotantoon sekä aldosteronin tuottavissa adenoomien ja normaali lisämunuaisissa, ja ehdotti K

2P3.1 voi olla rooli Ca

2+ signalointi asetuksen . Samoin K

2P3.1 ja K

2P9.1 on aiemmin raportoitu olevan rooli K

+ – riippuvaista apoptoosia rae solujen hermosoluissa viljelmässä [86].

transcriptome analyysi ihmisen duktaalisessa rintaepiteelin tuumorisolulinja, T47D, seuraavat joko stimulaatio joko estrogeenireseptorin (ER) α joka indusoi tai ER, joka on antiproliferatiivisia vaikutuksia osoitti, että K

2P5.1 mRNA voimistuvan ERa signalointi [87 ]. mRNA, proteiini ja toiminnallinen lauseke (happo-herkkä ulospäin virrat) K

2P5.1 ilmoitettiin kohonneen vastauksena 17β-estradioli stimulaation ERa signaloinnin T47D ja ihmisen rinta adenokarsinoomasolulinjasta MCF-7. Vaikka kokeellinen Knockdown K

2P5.1 kohtalaisen alennetaan pohjapinta leviämisen T47D-solujen merkitsevästi suurempi väheneminen estrogeenin aiheuttama proliferaatio havaittiin [76].

Todisteet näistä tutkimuksista tukee oletusta, että muutokset ilmentymistä tai toimintaa K

2P kanavia syöpäsoluissa voi olla rooli syövän kehittymisessä ja etenemisessä. Kohdentamalla kanavat voivat johtaa uusiin syövän hoitomuotoja; siksi pyrittiin määrittämään transkriptio ilmaisua kunkin K

2P kanavien erilaisia ​​syöpiä käyttämällä online syöpä microarray tietokanta, Oncomine (www.oncomine.org, Compendia biotieteiden, Ann Arbor, MI, USA). Tämä tieto asiakirjoja muutoksia ilmaus K

2P perheenjäsenten eri syöpätyyppien ja on arvokas resurssi, jotta lisätutkimisesta proteiinin ilmentymistä ja mahdollisia rooleja näiden tärkeitä kanavia syövän etenemiseen.

menetelmät

analyysi KCNK mRNA ilmaisun syövän kudosnäytteistä (meta-analyysi KCNK geenien ja niihin liittyvät tilastolliset analyysit) suoritettiin käyttäen online syöpä microarray tietokanta, Oncomine (www.oncomine.org, Compendia biotieteiden, Ann Arbor, MI, USA). Oncomine kerää julkisesti saatavilla syöpään microarray tiedot ja käsittelee kaikki tiedot otetaan käyttöön samat kriteerit [88]. MRNA ekspressiotietojen on organisoitu syöpätyyppeihin määritelty alkuperäisessä julkaisuissa. mRNA ilmaisu saatu tietoja Oncomine elokuun 2012 tammikuuta 2013. lainaukset kaikkien ensisijainen tutkimuksissa käytettiin sekä tietoa syövän tyypistä ja lavastus (jos saatavilla) esitetään taulukossa S1 File S1.

Only aineistoja tutkimalla KCNK geenin mRNA: n ekspression syöpäkudoksessa joka sovittaa normaalia kudosta hallintalaitteet (syöpä vs. normaali) on mukana tässä tutkimuksessa. Kynnys kriteerit oli saavuttaa kunkin tutkimuksen sisällytettäväksi analyysissä. Kynnys hakukriteerit käytetty tässä tutkimuksessa olivat p-arvo 0,05, kertamuutos 2 ja geenin listalla prosenttipiste 10%. P-arvot esitetään tässä tutkimuksessa ero ilmentymisen analyysi KCNK geenejä laskemaan Oncomine käyttämällä kaksipuolista Studentin t-testiä ja useita testaus korjaus [86], [87]. Useita testaus korjaus tehtiin käyttäen väärä löytö korko menetelmä, jossa korjataan p-arvot (Q-arvot) laskettiin Q = NP /R (jossa P = p-arvo N = kokonaismäärä geenien ja R on lajitellut listalla p-arvo) [88], [89]. Tässä tutkimuksessa p-arvo alle 0,05 pidettiin merkittävänä. Kertainen muutos määritellään lineaarisen muutoksen mRNA kiinnostavan geenin syöpäkudoksessa verrattuna normaaliin ilmentymistasoon, että kudoksen, tässä tapauksessa kertainen muutos 2 ja suurempi sisällytettiin analyysiin. Kunkin aineisto geenit tutkitaan paremmuusjärjestykseen niiden p-arvo. Geeni sijoitus prosenttipiste on prosenttiosuus sijoitusta kiinnostavan geenin verrattuna kaikkiin muihin geeneihin analysoitava että aineisto perustuu p-arvot. Keskimäärin geenien tarkastellaan microarray tiedot esitetään tässä tutkimuksessa oli noin 14.000 geenejä. Aineistot, joissa geeni oli top 10% geeneistä muuttui sisällytettiin. Näitä raja-arvoja on yhdistetty Boolen AND, siksi analyysi oli vain luokiteltu yli kynnyksen, kun se täyttää kaikki kolme kriteeriä.

Aluksi KCNK geenejä (KCNK1-18) tutkittiin useilla 20 syöpätyyppien, jotka on ryhmitelty niiden kudoksen alkuperän (taulukko S2 File S1), verrataan mRNA: n ekspression, että syöpä tyyppi normaaliin kudokseen valvontaa. Gene yhteenveto näkymä Oncomine käytettiin analyysin aikana ja esitetään tässä ilme ranking osoittaa värisävyjen. Expression väritys geenin tietyn syövän liittyy geenin sijoitus persentiilin korkeimmat edellä kynnyksen analyysi.

Lisäksi analyysi suoritettiin kunkin KCNK geenin, ilmentämistä varten yleisin syöpä tyypit perustuvat GLOBACON 2008 WHO rankingissa (https://globocan.iarc.fr/) [90]. Lymfooma, myelooma, sarkooma, maksan ja munasarjojen syöpiä poistettiin lisäanalyysiä alhaisen KCNK ilme. Alatyypin ”muut syövät”, joka määritellään syöpiä, jotka eivät kuulu määrättyjä alatyyppeihin (esim. Kohdun ja lisämunuaisen syövät) poistettiin myös tarkempaa analysointia, koska suuri monimuotoisuus syövän alatyyppejä tämän ryhmän tekisi yksityiskohtaisen analyysin epäinformatiivisia. Käyttäen kynnyskriteeri on kuvattu aikaisemmin kaikki edellä mainitut raja-analyysit kunkin KCNK geenin uutettiin Oncomine ja noudatetaan.

Kun kaikki edellä mainitut raja-tiedot kunkin KCNK geeni oli noudatettu, vertaileva meta-analyysi suoritettiin syövän alatyypin kanssa yli viisi aineistot (n≥5) käytettävissä, tämä analyysi tarjosi mediaani geeni listalla ja mediaani p-arvo kyseiselle syövän alatyypin.

tulokset ja keskustelu

KCNK geenit osoittavat muuttuneen ilmaisun eri syövät

KCNK geenejä 1-18 (jättämällä pois KCNK8, KCNK14 ja KCNK11 jotka köynnökset proteiineja mutta sittemmin luovuttu nimikkeistön päällekkäisyyttä) koodaavat nisäkkään perheen K

2P kanavat [91]. Aluksi saada yleiskuva muutosten K

2P kanavaekspression syövän, käytimme Oncomine syöpä microarray tietokanta analysoida muutoksia havaittiin KCNK geenin mRNA ilmentymisen 20 yleisimmin diagnosoitu syöpiä, ryhmitellään niiden kudoksen alkuperästä , verrattuna normaaliin kudokseen valvontaa. Sisällytettäväksi analyysissä muutoksia geenien ilmentyminen verrattuna normaaleihin kontrolleihin tuli täyttää kynnyskriteereiden saavuttaa p-arvo 0,05, kertamuutos 2 ja geenin listalla prosenttipiste 10%. Geeni sijoitus prosenttipisteet kullekin 15 KCNK geenien syövissä verrattuna normaaliin kudokseen tarkastukset tutkittiin ja prosenttipistettä korkein analyysit esitetään kaikista KCNK geeniä ja jokainen syöpä kudostyypin kuvassa 1. suorittaminen analyysi tällä tavalla käytössä vertailu muutokset geenien ilmentyminen voidaan suorittaa eri microarray kokeiluja ja paljasti, että kaikki KCNK geenit lukuun ottamatta KCNK4 (K

2P4.1 tai TRAAK), KCNK16 (K

2P16.1 tai TALK1) ja KCNK18 (K

2P18.1 tai TRESK) näyttää muuttuneen ilmaisun 20 syöpätyypeissä tarkasteltiin verrattuna normaaliin kudokseen valvonnan (kuvio 1A B). Syövät neljäntoista kudostyypeistä osoitti yli-ilmentyminen useamman kuin yhden KCNK geenin (kuvio 1A), jossa on viisi syöpä kudostyypeistä (rinta, munuainen, leukemia, keuhkosyöpä, lymfooma), jolla on yli-ilmentymisen kolmen tai useamman KCNK geenien (kuvio 1A). Vaikka laaja syöpäkudoksessa tyyppejä pidetään tässä alustavan analyysin ja sisältävät erilaisia ​​syöpäsairauksia, ne tarjoavat arvokasta alustavaa tietoa ilmentymistä KCNK geenien syöpää ja edelleen analysoitava ottaen huomioon erityiset syöpä alatyyppejä (esim akuutti vs. krooninen leukemia) oli suoritetaan tiettyjä kanavia seuraavissa analyyseissä.

Expression of KCNK geenien (KCNK1-18) 20 syövissä verrattuna normaaliin kudokseen valvontaa. Näkyy on geeni ja proteiini nimet kullekin kanavalle. A) yliekspressio KCNK geenejä. B) ali KCNK geenejä. Syöpätyyppeihin järjestää niiden kudoksen alkuperän, aste värin korreloi geenin listalla prosenttipistettä korkein analyysit. Hakuehtoja olivat mRNA aineistoja ja syöpä vs. normaali analyysi vain, jossa raja-arvot p-arvo 0,05, taita muutos 2 ja geenin listalla prosenttipiste 10%.

Tutkiessaan ali ja KCNK geenejä, syövän 19 20 kudostyypeissä analysoitiin osoittivat vähentynyttä ilmentymistä yhden tai useamman KCNK geenejä verrattuna normaaliin kudokseen ilmentyminen (kuvio 1 B). Kuusi K

2P perheenjäsenet (KCNK1, KCNK2, KCNK3, KCNK5, KCNK7 ja KCNK10) osoittavat ali yli 5 eri syöpäkudoksessa tyyppisiä (kuvio 1 B). Kun taas 10 eri syövän kudostyypeistä (aivot, rinnan, paksusuolen ja peräsuolen, maha-suolikanavan, pään ja kaulan, munuaiset, keuhkot, melanooma, eturauhasen ja sarkooma) osoittavat ali vähintään kolme KCNK geenien (kuvio 1 B). Silmiinpistävän erityisiä K

2P kanavilla kasvoi mRNA: n ilmentymisen joissakin syövän kudoksissa, kun taas vähentynyt ilmentyminen toisissa. Tämä on erityisen ilmeistä KCNK1, KCNK3, KCNK5 ja KCNK6, joka näytetään mRNA ilmentyminen muuttuu (joko ylös tai alas erillisiä syövät), joka asettaa ne top 1% geenien osoittaa muuttuneen ilmaisun niille syöpiä. KCNK1 esimerkiksi on top 1% geenien osoittaa yli-ilmentymisen virtsarakon, kohdunkaulan, keuhkojen ja haiman syövät, kun taas syövät keskushermostossa KCNK1 esittää yhtä vähentäisi eniten ilmaisun verrattuna normaaliin kudokseen valvontaa (taulukko 2). Nämä analyysit viittaavat siihen, että vaikutus alas-säätely K

2P kanavia solujen toiminta saattaa olla yhtä tärkeä muutos kuin lisääntynyt ilmentyminen syöpäbiologiassa.

KCNK ilmentymistä tietyissä syöpätyypeissä

15 jäsentä K

2P kanava perhe on jaettu 6 erilliseen ryhmät, joiden perusteella niiden sekvenssihomologian ja määrittelemällä biofysikaalisten ominaisuuksien. Ilmaisu Kunkin geenin kullakin 14 syöpäkudoksessa tyypit (6 kudokset suljettiin pois tämän analyysin alhaisen aineisto numeroita tai korkea syövän alatyypin monimuotoisuus) tutkittiin yksityiskohtaisesti käyttäen analyysiä kynnysarvoja kuin ennen (p-arvo 0,05, kertainen muutos 2 ja geenin listalla prosenttipiste 10%), ja tulokset on esitetty kunkin kanavan ryhmästä (taulukot 2, 3, 4, 5, 6 taulukko S3 File S1). Tiedot vertaileva meta-analyysi suoritettiin tietyille KCNK geenien syöpää alatyyppiä, jossa riittävä määrä microarray tutkimuksia (n≥5) tutkii nämä geenit olivat saatavilla, on esitetty taulukoissa 2, 3, 4, 5, 6 ja suoritettiin käyttämällä kaikkia aineistoja, joissa geeni tutkittiin eikä vain niitä, jotka sijoittui edellä kynnysarvot. Meta-analyysi edellyttäen mediaani geeni listalla ja mediaani p-arvo, jolloin vertailu eri microarray tutkimuksia. Jos mediaani sijoittui analyysi oli merkittävä p-arvo se osoitti, että ilmaisulla suuntaus, että geeni oli todennäköisesti muuttaa että syöpä alatyyppi. Jos alle 5 riippumattomien tutkimusten minkään geenien tiettyyn syöpään alatyypin eivät olleet käytettävissä Oncomine, meta-analyysi tietojen saavuttanut kynnystä ei suoritettu, vaan koottiin ja esitetty taulukossa S3 File S1.

Kahden pore domain heikko sisäänpäin korjaamisesta K

+ (Twik) kanava perheen

Twik kanavat sisältävät KCNK1 (K

2P1.1, TWIK1), KCNK6 (K

2P6.1, TWIK2) ja KCNK7 (K

2P7.1). Mikään näistä kanavista on aikaisemmin liitetty pelissä rooli syövän, mutta analyysi esitetään tässä osoittaa merkittävää yliekspressio KCNK1 useimmissa syöpien analysoitu (12 ulos 20 syöpäkudoksessa tyypit osoittavat yli-ilmentymisen kanssa KCNK1 sijoittui top 10% useimmissa muuttaa geenejä), kun taas 6 syöpä kudostyypeistä osoitti KCNK1 ali verrattuna normaaliin kudokseen (kuvio 1). KCNK6 todettiin olevan joukossa 1% geenien yli-ilmennetään rintasyövän ja top 1% geenien ali-ilmentynyt kolorektaalisyövässä. Vaikka KCNK7 ole osoittanut yli-ilmentymisen jossakin syöpätyyppien tutki se osoitti merkittävää ali useissa eri syöpien ja oli top 1% of ali-ilmentynyt geenien sekä melanooman ja kohdunkaulan syöpiä (kuva 1).

Syöpä alatyyppejä jossa KCNK1 osoitti yli kynnyksen muutoksia ilmentymisessä on esitetty taulukossa 2 (jos riittävä tutkimukset olivat saatavilla meta-analyysi (n≥5)) tai taulukossa S3 File S1 (jos riittämätön määrä tutkimukset olivat saatavilla meta-analyysi ( n≤4)). Kaikki syöpä alatyypit kanssa KCNK1 yliekspressio oikeutettuja meta-analyysissä havaittiin olevan merkittäviä määriä yli-ilmentymisen (mediaani p-value≤0.05; taulukko 2). Lung adenokarsinoomat oli merkittävin lisäys ilmentymisessä verrattuna normaaliin kudokseen, jossa on 3,22 ± 0,64 tarkoittaa kertainen lisäys päässä 4 tutkimuksista joka saavutti kynnystä osallisuuden ja mediaani p-arvo 8.51E-13 (n = 7, taulukko 2) . Vaikka haiman adenokarsinoomat osoitti suurin keskimääräinen (± SEM) kertaiseksi (4,80 ± 0,79) in KCNK1 transkriptio verrattuna normaaliin valvonnan 5 tutkimuksissa yllä kynnyskriteereiden.

Brain syöpien hermotukisoluun alkuperää (astrosytooma, glioblastooma, oligodendrioglioma), medulloblastoma ja melanoomat kaikki osoitti merkittävää säätelyä alaspäin KCNK1 suhteen normaalin kontrollisilkkipaperia (taulukko S3 File S1). Kaikki mutta glioblastooma oli riittävän suuri määrä riippumattomia analyysejä, jotta sisällyttämistä vertailevassa meta-analyysissä (taulukko S3 File S1), kun taas glioblastooma 4 yläpuolella kynnyksen analyysit osoittivat ali vaihtelee 8 ja 20 kertaa pienenee KCNK1 transkriptio ilmaisun taas yksi tutkimus osoitti 3-kertainen KCNK1 mRNA: ta (taulukko 2). Vertaileva meta-analyysin kaikki 8 tutkimuksissa, joissa KCNK1 transkriptin ilmentymistä tutkittiin paljasti yleinen merkittävä (p = 5.14E-6), vähentyneen ilmentämisen KCNK1 glioblastoma (taulukko 2). KCNK1 ei ole ainoa geeni näyttää ilmeisesti ristiriidassa ilmentymisen profiilit, mutta tämä voi johtua siitä, että laaja ryhmittymien kussakin syöpätyyppeihin. Merkittävästi tämä havaitaan myös KCNK10 aivoissa glioblastooma (taulukko 3).

Vaikka KCNK6 osoittaa yli-ilmentymisen sekä duktaalisessa (keskiarvo kertainen muutos 2,46; n = 2) ja invasiivisia (taita muutos 3,57 (n = 1)) rintasyöpä, yleinen, KCNK6 ja KCNK7 näytä lisää transkripti ali (taulukko 2). Vaikka, meta-analyysi KCNK6 ilmentymisen tiehyen Rintasyövän löytyi lisääntynyt ekspressio ei päästä merkitystä (p = 0,076; n = 10). Sekä KCNK6 ja KCNK7 näyttää ali melanooman ja ruokatorven adenokarsinooman. KCNK6 osoitti merkittäviä vähentynyttä ilmentymistä peräsuolen adenokarsinooma (mediaani p-arvo = 0,028; n = 11) ja keskiarvo (± SEM) kertaisesti vähentynyt ilmentyminen 2,11 ± 0,02 3 edellä kynnyksen analyysejä ali. KCNK7 ali-ilmentynyt Barrettin ruokatorven verrattuna normaaliin kudokseen valvonnan mutta riittämätön määrä tutkimukset olivat saatavilla voivat analysoida (taulukko S3 File S1). KCNK7 osoitti merkittäviä alassäätöä kohdunkaulan levyepiteelisyöpä (mediaani p-arvo 7.99E-04; n = 5), joiden keskimääräinen (± SEM) kertaisesti vähentynyt ilmentyminen 4,37 ± 1,19. Jos on käytetty pienempää ilmentyminen KCNK7 havaittu ruoansulatuskanavan adenokarsinooman pystynyt osoittamaan merkitys seuraavat meta-analyysi (mediaani p-arvo 0,446, n = 5) ja saavutti mediaani geeni listalla 9583 ulos noin 14000 geenien viittaa siihen, että muutokset KCNK7 ilmaisun vähemmän tärkeitä ruoansulatuskanavan adenokarsinoomia.

Twik liittyvät K

+ (TREK) kanava perheen

TREK perhe on 3 perheenjäsenet KCNK2 (K

2P2.1, TREK1), KCNK4 (K

2P4.1, TRAAK) ja KCNK10 (K

2P10.1, TREK2). KCNK4 pystynyt osoittamaan muuttuneen ilmaisun yläpuolelle asetetun kynnysarvot 20 syöpiä tutkitaan ja siksi ei vielä analysoitu.

KCNK2 oli joukossa 5% geenien yli ilmaistu keuhkosyövässä ja alle ilmaistu rinta-, ruoansulatuskanavan ja pään ja kaulan alueen syövät (kuvio 1). KCNK10 oli joukossa 1% geenien ali-ilmentynyt (verrattuna normaaliin kudokseen tarkastukset) peräsuolen ja munuaisten syövät, kun rinta- ja aivojen syövät KCNK10 oli joukossa 5% geenien ali-ilmentynyt (kuvio 1A B). Kuten nähdään KCNK1 glioblastoma, kahden edellä mainitun kynnyksen analyysit osoittavat laski KCNK10 ilmentymistä (verrattuna normaaliin kudokseen kontrollit) vaihtelee 2,9-4,8 kertaiseksi pienenee, kun taas kolmasosa analyysi osoittaa 2,5 kertainen lisäys KCNK10 ilmaisua. Meta-analyysi mukaan lukien kaikki tutkimukset, joissa KCNK10 ilmentymistä tutkittiin glioblastoma syövän paljasti huomattavan vähentynyttä ilmentymistä (mediaani p-arvo = 5.03E-05; n = 5), mutta kun selviä muutoksia KCNK10 ekspressiotasot havaitaan glioblastoma lisätutkimuksia ja analyysi vaaditaan luonteen määrittämiseksi näitä muutoksia esiintyy. KCNK10 myös sijoittui top 10% yli-ilmentynyt geenien akuutti myelooinen leukemia (kuvio 1A taulukko S3 File S1; n = 4), mutta riittämättömät tutkimukset olivat saatavilla, jotta vankka meta-analyysi voidaan suorittaa määrittämiseksi merkitys tästä muutoksesta. KCNK10 osoittaa vähentynyttä ilmentymistä rinta- duktaalisessa ja lobulaarinen karsinoomia ja suolen kasvainten, adenokarsinooma ja karsinooma sekä munuaisten kirkas cell carcinoma (taulukko 3 taulukko S3 File S1). Vain rinta duktaalikarsinooma ja peräsuolen adenokarsinooma oli riittävä määrä tutkimuksia, jotta meta-analyysi (taulukko 3). Tämä analyysi paljasti muutoksia rintojen duktaalikarsinooma ole merkittävä (mediaani p-arvo = 0,15, n = 5), kun taas peräsuolen adenokarsinooma osoitti merkittäviä vähentynyt ilmentyminen KCNK10 (mediaani p-arvo = 8.12E-07; n = 14)

KCNK2 osoitti vähentynyt ilmentyminen invasiivisen rintasyövän, ruoansulatuskanavan adenokarsinooma sekä pään ja kaulan okasolusyöpä mutta näissä tutkimuksissa ei joko sisällyttää meta-analyysissä alhaisen tutkimuksen numeroita tai pystynyt osoittamaan merkitys seuraavat meta-analyysi ( Taulukko 3 taulukko S3 File S1).

Nämä tiedot samalla rajoittaa otoskoko tarjoavat riittävästi todisteita lisätutkimuksia rooliin KCNK10 sekä glioblastoma ja peräsuolen adenokarsinooma.

Twik liittyvät happoherkistä K

+ (tehtävä) kanava perheen

tehtävään perheessä on kolme jäsentä KCNK3 (K

2P3.1, TASK1), KCNK9 (K

2P9.1, TASK3) ja KCNK15 (K

2P15.1, TASK5).

KCNK3 osoitti muuttunutta ilmentymistä useimmissa syöpien tutki (13 ulos 20) ja oli top 1% jopa geenien munuaisten syöpään ja top 5% jopa geenien rinta-, leukemia ja lymfooma (kuvio 1A). KCNK3 oli top 1% alle-ilmaistuna geenien sarkooma, rinta-, keuhko- ja haimasyöpä. KCNK3 oli myös top 5% alle-ilmaistuna geenien syöpää CNS, virtsarakon, peräsuolen ja eturauhasen (kuvio 1 B). Yksityiskohtainen meta-analyysi syövän alatyyppejä on pienentynyt KCNK3 ilme paljasti ali olevan merkittäviä haiman adenokarsinooma (mediaani p-arvo = 2.46E-07; n = 7), keuhkon adenokarsinooma (mediaani p-arvo = 4.33E-11; n = 6), suolen kasvainten (mediaani p-arvo = 2.37E-04; n = 5) ja glioblastooma (mediaani p-arvo = 0,007; n = 7; taulukko 4). Keuhkojen okasolusyöpä osoitti sekä korkeimman merkitys seuraavista meta-analyysi 5 tutkimuksissa, joissa KCNK3 geenin ilmentymistä tutkittiin (mediaani p-arvo = 5.90E-20), ja suurin keskimääräinen kertaisesti alentunut KCNK3 lausekkeen 4 tutkimukset, jotka saavutettiin kynnys (6,98 ± 2,30; taulukko 4).

analyysi KCNK3 transkriptin ilmentymistä tietyissä syövissä sisällä laajassa syöpätyyppeihin näkyy merkittävä kasvu KCNK3 ilmentymisen invasiivisen rintasyövän (mediaani p-arvo = 0,005) ja selkeä solujen munuaisten (mediaani p-arvo = 1.14E-04) syöpien kanssa 4,5-8,4 kertainen lisäys ilmentyminen selkeä solussa munuaiskarsinoomat verrattuna normaaliin kudokseen valvontaa (taulukko 4).

Vaikka K

2P9. 1 on aikaisemmin todettu rinta-, paksusuoli- ja melanoomaa syöpien [78], [82], [83], KCNK9 vain osoitti yli kynnyksen analyysi invasiivisia rintakarsinoomista (p-arvo = 1.16E-12, taulukko 4). Kun vertaileva meta-analyysi suoritettiin 14 analyysit tutkimalla KCNK9 invasiivisissa rintakarsinoomissa, muutoksia ei havaittu olevan merkittäviä (mediaani p-arvo = 0,459).

KCNK15 osoittaa merkittävää yliekspressio, jonka vertaileva analyysi, vuonna ductal rintakarsinoomista (mediaani p-arvo = 0,008; 5,37 ± 1,88 tarkoittaa kertaistanut 3 yläpuolella kynnyksen analyysit) ja ali ruuansulatuskanavan adenokarsinoomat (mediaani p-arvo = 0,043, taulukko 4).

Twik liittyviä emäksinen pH aktivoitu K

+ (PUHE) kanava perheen

TALK perhe on kolme perheenjäseniä KCNK5 (K

2P5.1, TASK2), KCNK16 (K

2P16.1, TALK1) ja KCNK17 (K

2P17.1, TALK2). KCNK16 pystynyt osoittamaan muuttuneen ilmaisun yläpuolelle asetetun kynnysarvot 20 karsinoomien tutkittiin aluksi, joten ei vielä analysoitu.

KCNK5 osoitti muuttunutta ilmentymistä 50% syövistä tutkitaan. Se oli top 1% jopa geenien ruokatorven syöpien ja top 5% jopa geenien rinta- ja keuhkosyöpää (kuvio 1A). Vähentynyt ilmentyminen KCNK5 havaittiin laajemman syövän alatyyppejä kanssa KCNK5 top 1% alle-ilmaistuna geenien melanooman ja top 5% alle-ilmaistuna geenien rinta-, paksusuolen ja peräsuolen, munuainen, leukemia, maksan syöpien ja sarkooma ( kuvio 1 B). Vaikka kaikki syövän alatyypeistä, jotka osoittivat muutoksia ilmaus KCNK5 oli riittävä määrä tutkimuksia vertaileva analyysi (taulukko S3 File S1), meta-analyysi ja peräsuolen adenokarsinooma tutkimuksissa havaittiin merkittävä lasku KCNK5 lauseke (mediaani p-arvo = 2.35E -07; n = 11, taulukko 5), jonka keskimääräinen kertainen pieneneminen 2,96 ± 0,23 (n = 4). Lisätutkimuksia tarvitaan sen määrittämiseksi, onko alas-säätely KCNK5 havaittu muissa syöpään alatyyppeihin ovat myös merkittäviä.

Yksi tutkimus saavuttanut rajan kriteerit ja osoitti 3,26 kertainen lisäys KCNK17 ilmentymisen invasiivisia rintakarsinoomista (taulukko 5). Kuitenkin kun vertaileva meta-analyysi suoritettiin analyysien tutkii KCNK17 invasiivisessa rintakarsinoomista (n = 12) todettiin ole merkittävä (mediaani p-arvo = 0,752), mikä viittaa tutkimukseen, joka saavutti rajoitus ei saa olla edustava KCNK17 ilmaisun rintasyövässä.

kaksi pore domain halotaani esti K

+ (thik) kanava perheen

thik perhe on kaksi perheenjäsenet KCNK12 (K

2P12.1, THIK1) ja KCNK13 (K

2P13.1, THIK2).

KCNK12 näytti muuttuneen ilmentymisen verrattuna normaaliin kudokseen valvontaa 7 20 syöpätyyppien tutkittiin sekä yli-ilmentymisen ja ali havaittu (kuvio 1 Taulukko S3 File S1). Edellä kynnys vähennykset KCNK12 ilmentymistä havaittiin astrosytooma ja glioblastooma, vaikka voimistunutta ilmentymistä havaittiin akuutin lymfaattisen leukemian ja keuhkoadenokarsinooma mutta riittämätön otoskoot mitään näistä syövän alatyypeistä esti vertaileva meta-analyysi KCNK12 on suoritettava.