PLoS ONE: assosiaatioiden NBS1 polymorfismit ja peräsuolen syövän Kiinan Väkiluku

tiivistelmä

Koska keskeinen proteiini kaksinkertaisen säikeen katkoksia (DSB) aiheuttaman DNA korjaukseen liittyvä reitti,

NBS1

osallistuu havaitsemaan DSB ja olennainen rooli ylläpitämisessä genomista vakautta. Yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) in

NBS1

geeni olivat yleisesti testannut liittyvät alttiuteen useita syöpiä, mutta tulokset pysyivät kiistanalainen. Niinpä teimme kaksi riippumatonta sairaala-pohjainen tapausverrokkitutkimukset käsittää 1072 peräsuolen syövän potilaiden ja 1263 tarkastuksia arvioida yhdistyksen neljän

NBS1

SNP ja peräsuolen syövän riskiä. Tulos osoitti, että rs2735383C /G polymorfismi 3′-alue (UTR) on

NBS1

oli merkitsevästi yhteydessä paksusuolisyövän riskin logistisen regressiomallin (

P

10

-4). Lisäksi havaitsimme, että rs2735383CC genotyyppi liittyi merkittävästi lisääntynyt paksusuolisyövän riskin (riskisuhde = 1,55, 95% luottamusväli = 1,27-1,94) verrattuna rs2735383GC + GG genotyyppiä. Lisäksi toiminnalliset kokeet osoittivat, että rs2735383C alleelin

NBS1

häiritsi sitoutumisaffiniteettia on-miR-509-5p on

NBS1

3′-UTR kolorektaalisyövässä soluissa, jotka vaikuttavat

NBS1

transkriptionaalisen aktiivisuuden ja ilmentymisen tasolla. Lopuksi nykyinen näyttö viittaa siihen, että rs2735383C /G-polymorfismi voisi lisäävät riskiä peräsuolen syövän.

Citation: Li J-T, Zhong B-Y, Xu H-H, Qiao S-Y, Wang G, Huang J, et al. (2015) assosiaatioiden

NBS1

polymorfismit ja peräsuolen syövän Kiinan Population. PLoS ONE 10 (7): e0132332. doi: 10,1371 /journal.pone.0132332

Editor: Yifeng Zhou, Medical College of Soochow yliopisto, Kiina

vastaanotettu: 05 toukokuu 2015; Hyväksytty: 14 Kesäkuu 2015; Julkaistu: 17 heinäkuu 2015

Copyright: © 2015 Li et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään

Data Saatavuus: kaikki asiaankuuluvat tiedot ovat paperi.

Rahoitus: Dr. Hong-Chuan Zhao sai varat kansallisesta korkean teknologian tutkimus- ja kehittämisohjelma Kiina (863 Program) (nro 2014AA020801), International Science Teknologia yhteistyöohjelma Kiinan (No.2013DFA31510) ja Research Fund of Beijing Municipal Science Teknologia-komissio (nro Z111107067311021); Dr. Hui-Zhen Fan tukivat National Natural Science Foundation of China (nro 81360606). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

peräsuolen syöpä (CRC) on yksi yleisimmistä pahanlaatuisia kasvaimia johtava syy syöpään liittyvien kuolemien kaikkialla maailmassa [1]. Viime vuosikymmenellä, suuria ponnisteluja on keskittynyt kehittämään uusia hoitomuotoja ja diagnostisia tekniikoita, mutta ilmaantuvuus ja kuolleisuus merkittävästi lisäämään ja Aasian väestöstä [2, 3]. Lisäksi ympäristöön liittyvien riskitekijöiden ja elämäntapojen [4, 5], geneettiset muutokset mukaan lukien yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) in kandidaattigeenit, jotka osallistuvat DNA korjaukseen liittyvä reitti ovat sekaantuneet peräsuolen syövän synnyn [6-9].

DNA korjaukseen polkuja avainasemassa säilyttämisessä genomista eheys ja estää solujen syöpää vastaan ​​[10]. Sen sijaan on käynyt ilmeiseksi, että puutteet DNA double-säikeen katkoksia (DSB: t) korjaus karsinogeenien voi johtaa genomista epävakautta ja siten korreloivat syövän kehittymistä [11]. Kaksi DNA korjaus väyliä sisältää homologisen rekombinaation korjaus (HR) ja ei-homologisen end-liittymällä (NHEJ) reittejä mukana ihmisen soluissa johtaa vahingoittaa korjata palkkaamalla erityisten DNA: n korjaukseen molekyylejä paikalle vahinko [12-14]. Rekrytointi ydin- proteiinikinaasi ataksia teleangiektasia mutatoitunut (ATM) DNA DSB: ihin pidetään kriittinen vaihe molempien reittien sen aktivointia ja toiminta. Kuitenkin on todettu, että ATM rekrytointi paikkoihin DSB: ihin tarvitaan ja helpotti erityisiä kumppani proteiinit meioottisiin rekombinaatio 11 homologi (MRE11), ihmisen RAD50 homologin (RAD50) ja Nijmegenin Murtumaoireyhtymä 1 (NBS1) [15]. Keskeisenä pelaaja MRN monimutkainen, NBS1 suoraan vuorovaikutuksessa H2AX muodostaa ydinaseiden pesäkkeitä paikoissa DNA-vaurion ja laukaisee myöhemmin vaiheet DNA-vaurioita varhaisen reagoinnin [15, 16]. Lisäksi

NBS1

on olennaisia ​​rooleja kokoonpanoon MRN kompleksit ja ohjaa MRN komplekseja koordinoida DSB käsittelyyn ja korjata [17, 18]. Siksi geneettinen variantit

NBS1

geeni voi moduloida DNA korjaus kapasiteetti, ja vaikuttaa taipumus aiheuttaa syöpää. Kertyvät tutkimukset ovat tutkineet assosiaatiot yhteinen polymorfismien

NBS1

ja ihmisen syövissä riski [19-22]. Esimerkkinä, yksi yleisimmin tutkittu polymorfismien rs1805794G /C on tutkittu liittyvät alttiuteen useita syöpiä [22-24]. Lisäksi SNP rs2735383C /G 3′-UTR

NBS1

voi vaikuttaa sitomiskykyä MikroRNA, mikä voi vaikuttaa geenin ilmentymisen [22, 23]. Kuitenkin vähän tietoa on raportoinut yhdistysten näiden yhteisten

NBS1

polymorfismit ja riski CRC Kiinan väestöstä. Siksi me arveltu, että yhteinen polymorfismia

NBS1

geeni voi liittyä riski CRC.

Näiden oletusten suoritimme kaksi sairaala-pohjainen tapausverrokkitutkimukset arvioimaan mahdollisia vaikutuksen yhteinen polymorfismien (rs1805794G /C, 31129G /A, 924T /C ja rs2735383C /G) CRC riski Kiinan väestön.

Materiaalit ja menetelmät

Tutkittavat

Kaikki yksilöt olivat geneettisesti jotka eivät liity etnisesti homogeenisen han-kiinalaisten, ja voivat osallistujat olivat 21-90 vuotta ikäisiä rekrytoinnissa tutkimusjakson aikana. Löytö asettaa, yhteensä 763 potilasta diagnosoitu CRC ja 892 valvonta taajuus-sovitettu tapauksiin suhteen iän (± 5 vuotta), sukupuolen ja asuinalueen otettiin peräkkäin rekrytoitiin Kansan sairaalan Yichun City (Yichun, Kiina) ja Kiinan ja Japanin Friendship Hospital (Peking, Kiina). Validointia, 313 CRC potilaita ja 371 valvonta taajuus-sovitettu tapauksiin suhteen iän (± 2 vuotta), sukupuolen ja asuinalueen olivat peräkkäin ilmoittautunut päässä Kiinan ja Japanin Friendship Hospital (Peking, Kiina). Joukossa osallistujamäärää, rekrytointi hinnat olivat noin 95% potilailla, ja noin 81% valvontaa. Kaikki potilaat eivät olleet saaneet mitään kemoterapiaa tai sädehoitoa ja ei ollut ikä, vaihe, tai histologian rajoituksia. Kasvain lavastus ja patologinen tyyppi arvioitiin mukaan vuonna 2002 Yhdysvaltain sekakomitean Cancer pysähdyspaikan järjestelmä. Osallistumisprosentti valvontaa oli 89%. Kliininen ominaisuudet Kaikkien potilaiden ja verrokkien löytämisen asettaa ja validointi asettaa on lueteltu taulukossa 1. rekrytointi, jokainen osallistuja oli määrä haastattelussa on epidemiologinen kyselyn annettuaan kirjallisen tietoon perustuvan suostumuksen ja tarjotaan noin 5 ml verinäyte DNA-analyysiä varten . Epidemiologisen kyselyn mukana demografiset tiedot, yksityiskohtaiset tiedot tupakoinnin ja alkoholinkäytön suvussa syöpää ja niin edelleen. Tämä tutkimus oli hyväksynyt Medical Ethics komitean Kansan sairaalan Yichun kaupungin ja lääketieteellisen eettisen komitean Kiinan-Japanin Friendship Hospital Pekingiin.

Genotyyppausanalyysiin

Perustuen mahdollisuus toiminnallisen muutoksen

NBS1

SNP genomissa yhteydessä neljä

NBS1

SNP (924T /C 5′-UTR, rs1805794G /C eksonissa 5, 31129G /A eksonissa 10 ja rs2735383C /G 3′-UTR) aiemmin raportoitu suhteessa sairauksien seurauksia, kuten syöpiä valittiin ja analysoitiin [22, 25]. Perimän DNA eristettiin ääreisveren näytteistä kunkin oppiaineen käyttäen Veri Genome DNA Extraction Kit (Takara, Dalian, Kiina). Nämä neljä

NBS1

SNP: tä genotyypitettiin alleelispesifinen MALDI-TOF-massaspektrometrialla (Sequenom, San Diego, CA), kuten aiemmin on kuvattu [26, 27] tietämättä aiheista tila. Myös vahvistaa -genotyypitystulosten päässä -massaspektrometrianalyysiä me satunnaisesti valittu 100 näytettä suoraan sekvensointiin, ja tulos oli 100% sopusoinnussa.

rakentaminen reportteri plasmidien

Koska huomattava yhdistys havaittiin polymorfismin rs2735383C /G ja CRC riski, kaksi toimittaja sisältävien plasmidien rs2735383G tai rs2735383C alleeli oli rakennettu vaikutuksen arvioimiseksi tämän polymorfismin sen geenien ilmentyminen

in vitro

. Täyspitkän ihmisen

NBS1

3′-UTR reunustavat SNP rs2735383 polymorfia syntetisoitiin Genewiz Company ja sitten kloonattiin psi-CHECK2 perusvektoriin (kuvio 1A). Kaksi Tuloksena syntyneiden rakenteiden psi-CHECK2-

NBS1

-rs2735383C ja psi-CHECK2-

NBS1

-rs2735383G olivat kaikki uudelleen sekvensoitiin sekvenssin vahvistamiseksi ja eheyden kunkin konstruktin insertit.

lusiferaasin aktiivisuus rs2735383 variantin alleelin lusiferaasireportterigeenin, joissa

NBS1

3′-UTR kotransfektoitiin tai ilman HSA-miR-509-5p jäljittelee tai HSA-miR-509-5p estäjien HCT116-solut (A) ja HT-29-soluja (B). Renilla lusiferaasiaktiivisuus mitattiin ja normalisoitiin tulikärpäsen lusiferaasi. Kuusi rinnakkaista tehtiin kullekin ryhmälle, ja koe toistettiin ainakin kolme kertaa. Tiedot ovat keskiarvo ± keskivirhe keskiarvon; **

P

0,01. (C)

NBS1

mRNA ilmentymistasoon kasvain kudosnäytteitä kolorektaalisyövän yksilöiden eri rs2735383 variantti alleelit genotyyppi (11 rs2735383GG, 13 rs2735383GC ja 5 rs2735383CC); tiedot ovat keskiarvo ± keskivirhe keskiarvon normalisoituivat

GAPDH

,

P

= 0,027. (D) HSA-miR-509-5p mRNA: n ekspression 29 peräsuolen syöpä kudoksiin ryhmitelty rs2735383 C /G genotyyppien. HSA-miR-509-5p mRNA: n ekspressio laskettiin suhteessa ilmentymisen

U6

mRNA. Tiedot ovat keskiarvo ± keskivirhe keskiarvon,

P

= 0,345.

Transient transfektiot ja Lusiferaasimäärityksiä

Koska keskeinen rooli 3′-UTR in geeni, me ennusti rs2735383C /G-polymorfismi 3′-UTR meidän bioinformatiikan analyysi (https://snpinfo.niehs.nih.gov/). Tulos osoitti, että muuntaminen CG 3′-UTR rs2735383 polymorfismi aiheuttaa uusia sitoutumiskohta mikroRNA HSA-miR-629, on-miR-499-5p, ja on-miR-509-5p. N lyhytaikaisen transfektion määrityksessä, paksu- ja solulinjoja, eli HCT116 ja HT-29-ympättiin 1 x 10

5 solua per kuoppa 24-kuoppaisille levyille (BD Biosciences, Bedford, MA). Lusiferaasi määritykset suoritettiin kuten aiemmin on kuvattu [28]. Lusiferaasiaktiivisuuden analyysiä, 800 ng psi-CHECK2-

NBS1

-3′- UTR vektorit kotransfektoitiin 40pmol microRNA jäljittelee (HSA-miR-629, HSA-miR-499-5p, ja HSA-miR-509 -5p) ja tai ilman 40pmol inhibiittorit Lipofectamine 2000 (Invitrogen, Carlsbad, CA) valmistajan ohjeiden mukaisesti. Transfektion jälkeen 24 tuntia, solut kerättiin ja renilla lusiferaasiaktiivisuus mitattiin Dual-Luciferase Reporter Assay System (Promega, Madison, WI) (Promega). Kolme toisistaan ​​riippumatonta koetta tehtiin kullekin plasmidirakenteen.

Quantitative Real-Time PCR (qRT-PCR) B

29 CRC kudosten eri rs2735383 genotyypit tehtiin välisen korrelaation tutkimiseksi

NBS1

mRNA-tasojen ja rs2735383C /G-polymorfismi. Kokonais-RNA eristettiin käyttämällä Trizol-reagenssia (Invitrogen Inc., USA) ja käänteisfaasi-cDNA: ksi käyttäen oligo-dT-aluketta. Suoritimme ABI Prism 7500 Sequence Detection järjestelmä arvioi

NBS1

ja

GAPDH

mRNA-tasot perustuvat SYBR-Green menetelmän. Jälkimmäinen käytettiin sisäisenä kvantitatiivinen ohjaus ja

NBS1

ilmentymistason normalisoitiin

GAPDH

. Taqman MicroRNA Analyysit (Applied Biosystems) käytettiin havaitsemaan HSA-miR-509-5p ilmaisun mukaan valmistajien protokollaa ja yleisesti ilmaistu

U6

pieni ydin- RNA käytettiin sisäisenä kontrollina.

tilastollinen analyysi

erot frekvenssijakautuman valittujen demografiset muuttujat sekä rs2735383C /G-alleeli genotyyppien tapausten ja kontrollien välillä arvioitiin chi-neliö kokeet. Hardyn-Weinberg tasapaino (HWE) syöpä-vapaa valvontaa genotyyppi jakaumia testattiin jonka hyvyys fit chi-neliö testi. Vahvuus yhdistyksen välisen rs2735383C /G-polymorfismi ja CRC syöpäriskin arvioitiin kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmät alueet), jossa 95%: n luottamusväli (CI) käyttäen ehdoton logistista regressiota ja ikä- ja sukupuoli. Konsernin vertailu analysoitiin Studentin t-testiä (kaksipuolinen). Kerrostunut analyysi suoritettiin myös alaryhmiin iän, sukupuolen tai muiden ominaisuuksien (tupakointi, alkoholin juominen tila, BMI, vaihe ja suvussa) arvioida stratum muuttuja liittyvät syrjäisimpien alueiden joukossa

NBS1

genotyypit. Yksisuuntainen ANOVA käytettiin arvioimaan eroja lusiferaasireportteri- toimintaa ja vaikutusta rs2735383C /G

NBS1

ilmaus keskuudessa CRC potilailla. Tilastollinen teho laskettiin käyttämällä PS Software (https://biostat.mc.vanderbilt.edu/twiki/bin/view/Main/PowerSampleSize). Kaikki testit olivat kaksipuolisia käyttämällä SAS-ohjelmistoa (versio 9.1, SAS Institute, Cary, NC). Tilastollisesti merkitsevä taso määriteltiin

P

0,05.

Tulokset

genotyypit ja CRC riski

Tutkimuksessa me genotyyppi neljä yhteistä polymorfismit ( rs1805794G /C, 31129G /A, 924T /C ja rs2735383C /G) on

NBS1

geenin 1076 CRC potilaiden ja 1263 terveillä verrokeilla. Genotyyppi taajuudet näiden polymorfismien tarkastukset olivat yhdenmukaisia ​​HWE (

P

0,05 kaikille). Genotyyppi jakaumat

NBS1

polymorfismit tapauksista ja valvonnan löytö ja validointi asetettu esitetään taulukossa 2. Merkittävä yhdessä CRC riski havaittiin rs2735383C /G muttei muita polymorfismit molempien populaatiot (

P

10

-4 rs2735383C /G löytö set ja

P

= 0,039 varten rs2735383C /G validointi asetettu). Kuten osoitti taulukossa 2, yksilöiden rs2735383CC genotyypit olivat tilastollisesti merkitseviä suurempi riski kuin harjoittajille rs2735383GG + GC genotyypit (oikaistu OR = 1,52; 95% CI = 1,20-1,99,

P

10

-4 löytämisen säädetty ja OR = 1,60; 95% CI = 1,11-2,37,

P

= 0,025 validointia asetettu). Lisäksi merkittävää yhteyttä ei havaittu rs2735383 polymorfismien ja CRC riski yhdistettynä kahden populaatioiden (

P

10

-4).

suoritetaan lisäksi osituksen analyysit arvioida vaikutuksia rs2735383C /G genotyyppien CRC riski iän, sukupuolen, tupakointi, alkoholin kulutus ja suvussa syövän löytö asetettu. Kuten osoitti taulukossa 3, merkittävästi lisääntynyt riski CRC liittyvä polymorfismi oli selvempi keskuudessa alaryhmien juovat. Verrattuna rs2735383GG ja GC genotyypit, CC-genotyyppi oli 2,2-kertainen riski CRC juovat (OR = 1,70, 95% CI = 1,51-2,88,

P

= 0,004). Kuitenkin, ei ollut tilastollisesti eroa jakaumia muiden valittujen muuttujien ja CRC riskiä.

vaikutus

NBS1

rs2735383C /G-polymorfismin vaikutus transkriptioaktiviteettia

rakensimme lusiferaasireportterista vektoreita käyttämällä psi-CHECK2 vektorin kanssa joko rs2735383C tai rs2735383G alleeli transfektoimaan lyhytaikaisesti HCT116 ja HT-29-solujen HSA-miR-629, HSA-miR-499-5p, ja HSA-miR-509- 5p, vastaavasti. Tutkimme, onko microRNA on alleelispesifisen vaikutus

NBS1

ilmentymistä CRC soluissa. Tulos osoitti, että CRC-soluihin väliaikaisesti kotransfektoitiin HSA-miR-509 matkii ja vektorit, jotka sisältävät rs2735383C alleelin merkittävästi vähentynyt lusiferaasivaikutusta, verrattuna soluihin vektoreilla, jotka sisältävät rs2735383G alleelin (

P

0,05 vuonna HCT116-soluissa ja HT-29-soluja, kuvio 1 B). Ei kuitenkaan havaittu merkittävää eroa välillä tämän polymorfismin ja transkription toimintaa HSA-miR-629 ja HSA-miR-499-5p CRC soluissa. Nämä tiedot osoittivat, että rs2735383C /G voi vaikuttaa transkriptioon

NBS1

vaikuttamalla sitoutumiskohdan mikroRNA on

NBS1

3′-UTR.

ry rs2735383C /G polymorfismi kanssa

NBS1

mRNA ilmaisu

tutki vielä

NBS1

ilmentymistä 29 CRC kudoksissa eri rs2735383C /G genotyyppien by qRT-PCR. Kuten kuviossa 1C, huomasimme, että potilailla, joilla on rs2735383CC homozygoottisia genotyyppi oli huomattavasti pienempi

NBS1

mRNA (keskiarvo ± keskivirhe: 0,161 ± 0,037) kuin potilailla, joilla on GC (0,363 ± 0,047) tai GG ( 0,400 ± 0,050, ANOVA testi:

P

= 0,026) genotyypit. Lisäksi, QRT-PCR käytettiin lisäksi tutkia, HSA-miR-509-5p ilmentyy konstitutiivisesti CRC kudosnäytteistä. Kuten kuviossa 1D, HSA-miR-509-5p on konstitutiivisesti CRC kudoksissa; vaikkei ollut mitään merkittävää yhdistyksen välillä taustan ilmaisun HSA-miR-509-5p ja

NBS1

rs2735383C /G genotyyppien tuumorikudoksissa kerätty CRC potilaista (

P

= 0,345).

keskustelu

CRC syövän syntymistä on monitekijäinen. Ei vain ympäristön riskitekijöiden lisäksi myös geneettiset tekijät saattavat keskeinen rooli etiologiassa CRC. Tässä sairaalan johdolla tapauskontrollitutkimuksessa, tutkimme rooli neljä yhteistä

NBS1

SNP alttius CRC Kiinan väestö. Huomasimme, että HSA-miR-509-5p voisi sitoutuvat tiukasti 3′-UTR

NBS1

sisältävän rs2735383C alleelin, negatiivisesti säännellään taso

NBS1

. Lisäksi seuraavassa kerrostunut analyysit, vaikutti siltä, ​​että suuri riski vaikutus tämän polymorfismin näkyi erityisesti keskuudessa alaryhmien juovat.

NBS1

on keskeinen säädin, joka osallistuu DSB korjaus suuntaamalla MRN proteiinikompleksi sivustoille DNA-vaurioita ja edistää sen DNA: ta sitova ja nukleaasiaktiivisuus. Tärkein funktionaalisia domeeneja

NBS1

DNA vaurioita vastausten käsittää konservoituneen forkhead liittyvää (FHA) domain ja rintasyövän karboksipään (BRCT) domain, jotka ovat tärkeitä tunnustamista ja korjaukseen poikkeava DNA [ ,,,0],29-31]. Lukuisat raportit ovat korostaneet mahdollisesti ratkaisevaa roolia

NBS1

, tärkeä osa MRN monimutkaista, ylläpitämisessä genomista vakautta ja estää kasvaimia prosesseja rekrytoimalla korjaus- ja tarkistuspiste proteiinit aikana DNA taukojen [32, 33]. Siten mutaatiot

NBS1

voivat vaikuttaa toimintaan

NBS1

ja proteiini-proteiini-vuorovaikutuksen, ja edelleen mahdollisesti lisätä alttiutta syöpään. Yksi yleisimmin tutkittu polymorfismien, rs1805794G /C sijaitsee BRCT toimialueen ja vaikuttaa muodostumista BRCA1 liittyvän genomin valvonta kompleksi (BASC), vaikka sitoutuminen BRCA1, joka vastaa havaitsemiseksi ja korjaus poikkeava DNA rakenteita [ ,,,0],29]. Useita rivejä on tutkittu assosiaatio polymorfismin ja useita syöpiä [22, 34-37]. Kuitenkin yhdistyksen välillä

NBS1

rs1805794G /C variantti genotyyppien ja syövän riski ei ole yhtäpitävä erilaisissa syövissä ja etnisen ryhmän. Esimerkkinä, P. Widlak havaittu, että rs1805794 variantti genotyypit eivät liittyneet alttiutta CRC puolalaisessa väestöstä [37]. Samoin nykyisen tulokset ovat sopusoinnussa edellä mainitun tutkimuksen että polymorfismi rs1805794G /C ei liity riskiä CRC Kiinan väestöstä.

Tietääksemme

NBS1

31129G /A ja 924T /C mukana tutkimuksessamme harvoin tutkittu ihmisen kasvaimissa [22, 25]. Ja emme tarkkailla suhde näiden kahden SNP ja CRC riski. Kuten rs2735383C /G-polymorfismi, se sijaitsee 3′-UTR

NBS1

geeni. Useat tutkimukset ovat tutkineet rs2735383C /G-polymorfismi syöpään alttius. Meta-analyysi perustuu kolmeentoista voivat tutkimusten mukaan lukien 7561 tapaukset ja 8432 verrokeilla tutkittu, että merkittävää assosioitunut polymorfismeilla

NBS1

geeni ja virtsarakon syöpään [38, 39], rintasyövän [40], imukudoksen pahanlaatuisia kasvaimia [41]. Viime aikoina on oletettu, että edellä mainitut polymorfismin rs2735383C /G voisi edistää keuhkosyövän riskiä. Enemmän kiinnostavaa, toinen kiinalainen tutkimus keskuudessa 575 keuhkosyöpää ja 575 valvontaa kertoi rs2735383C /G-polymorfismi ei ollut yhteydessä alttiuteen sairastua keuhkosyöpään [42]. Tutkimuksessamme rs2735383C /G-polymorfismi merkitsevästi yhteydessä CRC riski. Lisäksi kerrostuminen analyysit osoittivat, että lisääntynyt riski liittyy variantti alleeli oli selvempi juominen tilan. Lisäksi toiminnallinen analyysi osoitti, että nukleotidisubstituutioita G: stä C aiheuttaa uusia sitoutumiskohdan mikroRNA HSA-miR-509-5p, mikä vaikuttaa transkriptionaalista aktiivisuutta

NBS1

in

vitro

, joka on yhdenmukainen aiempien havaintojen [24]. Yhdessä nämä havainnot viittaavat siihen, että dynormal ilmentyminen

NBS1

johtuvat geneettisestä variantit

NBS1

vaikuttavat näin ollen NBS1 proteiinin ja muiden korjataan proteiinien vuorovaikutuksessa DNA: n korjaukseen prosesseja, mikä voi moduloida CRC herkkyys.

Tämä on ensimmäinen tutkimus, joka meidän kattavasti tutkineet assosiaatiot

NBS1

SNP ja riski CRC. Meillä oli melko suuri otoskoko varten tapauskontrollitutkimuksessa. Lisäksi se, että genotyyppi taajuudet kontrollien joukossa sopivat Hardy-Weinberg epätasapainoon laki ehdotti satunnaisuuden aihe valinta. Ja olemme saaneet 91% tutkimuksen teho (kaksipuolinen testi, α = 0,05) havaitsemiseksi OR = 1,52 varten rs2735383CC genotyyppien (joka esiintyi on 16.14% kontrollien) verrattuna rs2735383GC + GG genotyyppien löytö joukko, joka on saattanut parantaa huomionarvoista meidän havainto.

Yhteenvetona Tutkimuksemme osoittaa, että polymorfismi rs2735383C /G

NBS1

geeni voi olla geneettinen alttius tekijä riskin CRC Kiinan väestöstä. Lisäksi meidän havainnot vaatisi suurempaa tapausverrokkitutkimukset ja hyvin suunniteltu Mekaaniset tutkimukset tarkistaa.

Vastaa