Krooninen sairaus

tiivistelmä

VEGF-täsmähoitoihin kasvattavat tautivapaa (PFS) ja yleinen (OS) potilailla, joilla on etäpesäkkeitä munuaissyövän (mRCC). Tunnistaminen molekyyli fenotyypit RCC voisi parantaa riskien kerrostuminen ja ennustaminen kliinisen taudinkulku. Me tutkimme, geenispesifiseen DNA hypermetylaation voi ennustaa PFS ja OS keskuudessa potilailla, jotka saavat anti-VEGF-pohjainen terapia. Ensisijainen tuumorikudoksista 18 saaneilla potilailla täsmähoitoihin tutkittiin jälkikäteen käyttäen kvantitatiivista metylaatiospesifistä PCR-analyysi

CST6

,

LAD1

, hsa-

miR

-124-+3, ja hsa-

asennuspalveli-

9-1 CpG saaria. PFS ja OS analysoitiin ensilinjan ja juokseva antiangiogeenista hoitojen avulla log rank tilastoihin. Herkkyys ja spesifisyys määritettiin ennustamiseen ensivaiheen hoidon epäonnistuminen. Hypermetylaatiota

CST6

ja

LAD1

liittyi sekä lyhennetty PFS (log rank p = 0,009 ja p = 0,004) ja OS (p = 0,011 ja p = 0,043). Mediaani PFS havaittu korkean ja matalan metylaatio ryhmät

CST6

ja

LAD1

oli 2,0 vs.11.4 kuukautta.

LAD1

metylaatio oli spesifisyys 1,0 (95% CI 0,65-1,0) ja herkkyys 0,73 (95% CI ,43-+0,90) ennustamiseksi ensivaiheen hoidolle.

CST6

ja

LAD1

metyloinnin ovat ehdokas epigeneettisellä biomarkkerit osoittaa ennennäkemättömän yhdessä PFS ja OS sekä spesifisyys ennustamiseksi hoitovastetta. DNA: n metylaatio merkkejä pitäisi harkita mahdollisen arvioinnin suurempien potilasaineistoihin tulevissa tutkimuksissa.

Citation: Peters I, Dubrowinskaja N, Abbas M, Seidel C, Kogosov M, Scherer R, et al. (2014) DNA Metylointi biomarkkerit Veikkaa etenemisestä vapaa ja eloonjääneiden kokonaismäärästä metastasoitunut munuaissyöpä (mRCC) Käsitelty antiangiogeenisesti Therapies. PLoS ONE 9 (3): e91440. doi: 10,1371 /journal.pone.0091440

Editor: Zhengdong Zhang, Nanjing Medical University, Kiina

vastaanotettu: 07 lokakuu 2013; Hyväksytty: 11 helmikuu 2014; Julkaistu: 14 maaliskuu 2014

Copyright: © 2014 Peters et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Kirjoittajat ei ole tukea tai rahoitusta raportoida.

kilpailevat edut: kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

munuaissyövän (RCC) on yksi top ten syitä syöpäkuolemista teollisuusmaissa [1]. Vaikka viimeaikaiset parannukset täsmähoitoihin johtanut pitkäaikainen eloonjääminen metastasoituneen RCC (mRCC), kokonaistulos on edelleen heikko [2], [3].

Koska eri saatavilla olevista yhdisteistä ja yhä useammat uusia vaikuttavia aineita molekyylirakennetta suunnattu rakenteisiin, kuten verisuonen endoteelin kasvutekijä (VEGF) ja nisäkkään rapamysiinin kohde (mTOR) signalointia [4] optimaalisen sekvenssin kohdennettua hoitoja voi olla olemassa potilaita, mikä voi lisätä selviytymisen mRCC hoitoon. Vaikka ennustemalleja, kuten MSKCC (Memorial Sloan Kettering Cancer Center) ja Heng pisteytys järjestelmiä, on raportoitu olevan riippumattomia ennustajia kliinisistä tuloksista, [5], [6] syrjiä tulosten on edelleen rajallista. Kasvainspesifiset biologisesti perustuvaa muuttujaa on ehdotettu parantamaan näitä kysymyksiä [7].

Useimmat RCC on selkeä solu (ccRCC) histologia ja näytteille toiminnallinen inaktivoitumisen von Hippel-Lindaun (

VHL

) geenin mutaatioiden takia tai epigeneettisiä hiljentäminen noin 80% kasvaimista [8], [9]. Kuitenkin tautivapaa (PFS) ja kokonaiselossaoloaika (OS) potilaista, joilla mRCC ovat riippumattomia menetys

VHL

toiminto [10]. Sen sijaan veren perustuva analyysi yhden nukleotidin polymorfismien (SNP: t), jotka saattavat vaikuttaa sunitinibin kohdegeenien ja ligandit tunnistettiin kaksi polymorfismien

VEGFR3

, jotka liittyvät PFS, mutta ei OS-potilaiden täsmähoitoihin [11 ]. Mittaamalla seerumin hiilihappoanhydraasi IX (CA9) proteiini tasoilla Metastasoitunutta ccRCC potilailla paljasti merkittävästi vähentynyt OS potilailla, joilla on korkeampi CA9 pitoisuus seerumissa [12]. Yksittäinen etu kudos- tai veripohjaisten mittaukset on potilaille hoito on havaittavissa, mutta tarkkuus, herkkyys ja spesifisyys näitä menetelmiä ei ole vielä raportoitu tai validoitu [13].

Vaikka suuri potilasaineistoihin ovat joutuneet exom laajuinen mutaatioanalyysit, vain rajallinen määrä geenejä muista kuin

VHL

ja polybromo 1 (

PBRM1

) on tunnistettu olevan mutaatioita RCC, ja useimmissa on alhainen taajuus [14]. Näin ollen rajallinen määrä usein mutatoituja geenejä vähentää todennäköisyyttä tunnistaa mutaation-pohjainen ennustavat asianmukaiset herkkyys ja spesifisyys. DNA: n metylaatio CpG-saarekkeiden (CGI) kanssa useissa sääntelyn tai tuumorisuppressorigeeneille on todettu toimivaksi korvike mutaatioiden ja on raportoitu olevan yleinen tapahtuma RCC [15]. Lisäksi toiminnallinen menetys

VHL

on todettu yhdistää laajentunut ulkonäkö epigeneettiset muutokset [16], ja kaikki toisen usein mutaatiot liittyvät muuttunut kromatiinin /histoni vakauttaminen tai muuttaminen, mekanismeja liittyy CGI metylaatio ja geenien ilmentyminen [17]. Siksi usein havaitseminen epigeneettiset muutokset RCC erottaa RCC tuumoribiologiassa ja tarjoaa ehdokkaita uusien diagnostisten, prognoosi-, tai ennakoivaa markkereita [18]. CGI metylaation useita geenejä on jo todettu ehdokas prognosticators riippumaton kliinis parametrit [19] – [21]. Kuitenkin epigeneettiset biomarkkereiden ennustamaan kliinistä kulkua mRCC potilaita altistetaan täsmähoitoihin, ovat, parhaan tietomme mukaan ei ole raportoitu.

Oletimme, että CGI metylaatio liittyy hoitovaste, samoin kuten selviytymisen mRCC potilailla, jotka saavat antiangiogeenisesti hoitoa. Olemme tutkineet neljä kandidaattigeenit, joista kolme, kystatiini E /M (

CST6

) ja mikro-RNA-geenien

miR-9-1

ja

miR-124-3,

tunnistettiin äskettäin kasvainspesifisiä CGI hypermetylaation ja mahdollista yhteyttä ennustetta RCC potilaista [19], [21], [22]. Ladinin 1 (

LAD1

) geeni tunnistettiin äskettäin ryhmämme uutena ehdokkaana metylaation merkkiainetta RCC osoittaa Yksiulotteisissa yhdessä haitallisia kliinis parametrit, kuten kasvaimen, imusolmuke etäpesäke, tilan erillisten etäpesäkkeiden ja kehittynyt sairaus (julkaisematon data).

LAD1

koodaa ankkurointi filamentti-proteiinin, joka on osa tyvikalvon, joka todennäköisesti edistää vakautta epiteeli- mesenkymaalinen vuorovaikutus [23].

Tässä tutkimuksessa selvitettiin, onko DNA: n metylaatio merkki voi ennustaa vastetta kohdennettujen antiangiogeeninen terapia mRCC potilaiden ja kuvataan löydettiin kaksi DNA: n metylaation markkereita

CST6

ja

LAD1

CGI kuin ehdokas epigeneettiset ennustavat PFS ja OS mRCC hoitoa saavia täsmähoitoihin.

Materiaalit ja menetelmät

Ethics lausunto

Tietoon perustuva suostumus saatiin kunkin potilaan ja paikallisten eettisten komitea (Ethic komitea; Prof. HD Tröger, Hannover Medical School, Carl-Neuberg-Str. 1, Hannover, Saksa; Study_No: 1213-2011) erikseen hyväksynyt tämän tutkimuksen. Potilaat sopivat kirjallisesti hyödyntämiselle kudosnäytteen perustutkimukseen. Kirjallinen lausunto meidän eettisen komitean tässä tutkimuksessa saatiin.

Potilastiedot ja Hoito-ohjelmat

kliinis tietoja vastaavia kudoksia, ja seurantatietoja myös PFS ja OS sairastavien potilaiden mRCC jotka saivat ensilinjan VEGF-täsmähoitoihin kerättiin marraskuun 2005 ja lokakuun 2011 sairaalaa Hematologia ja Department of Urology ja Urologiset onkologian Hannover Medical School (taulukko 1). MSKCC pisteet tai ECOG-toimintakykyluokka ei ollut saatavilla. Potilaat saivat seuraavat hoitoyhdistelmien in ensilinjan asetus: sunitinibipitoisuutta (n = 12, 67%), sorafenibi (n = 4, 22%), axitinib (n = 1, 5,5%), ja bevasitsumabi (n = 1, 5,5%).

PFS määriteltiin aika alusta ensimmäisenä päivänä systeemisen hoidon havaitsemiseen progressiivisen tapahtuman mukaan RECIST 1.1 kriteerien tietokoneella (TT) skannaus [ ,,,0],24]. OS määriteltiin ajanjakson ensimmäisenä päivänä systeemisen hoidon kunnes potilaan kuolemaan tai sensuroitu viimeisessä seurannassa. Pääteasema ”ei arvioitavissa” taulukossa 1 kuvataan potilaalla on PFS 2 kuukautta johtuu varhainen hoidon lopettamisen aiheuttama myrkyllisyys tai ennenaikaiseen kuolemaan ennen ensimmäistä suositeltu CT hoidon jälkeen aloitettiin. Alkuperäinen TNM luokittelu primaarikasvaimista arvioitu unionin kansainvälisen Cancer Ohjaus 2002 -luokituksen [25]. Potilaiden seurantaan mukana jopa kolme järjestyksessä muutoksiin hoitomallilla.

Termit’prognostic` ja’predictivè käytettiin määritelmän mukaan National Cancer Institute [26].

kudosnäytteet, eristäminen ja bisulfiittikonversion kasvaimen DNA

Riippumaton valvonta histopatologia, tuumorisolun sisältö rutiini patologiset näytteet ja valinta kudosalueiden kudoksen louhinta määritettiin patologi. Myöhemmin sylinterit 1,5 mm pitkä ja 2 mm korkeaa loppumaan peräisin formaliinilla kiinnitys- ja parafinoidut (FFPE) kudosblokeista käyttäen 18 Charrière ydin leima ja altistetaan DNA eristys. Genominen DNA eristettiin käyttäen automatisoitua Magna Pure LC 2.0 järjestelmä ja Magna Pure LC DNA eristyspakkausta II – kudosta (Roche Diagnostics Deutschland, Roche Applied Science, Mannheim, Saksa). Laatu uutettu DNA arvioitiin käyttäen spektrofotometrisesti, geelielektroforeesia, ja kvantitatiivinen PCR, joka oli tunnusomaista saanto, puhtaus, ja arvosana hajoamisen eristetyn DNA. Bisulfiittikonversion DNA suoritettiin käyttäen EZ DNA Metylointi-Gold Kit (Zymo Research Corporation, Irvine CA, USA) ja 1 ug eristettyä DNA: ta. Täysin metyloitu ja muunnetaan DNA, sekä metyloimatonta bisulfiitti-muunnettu DNA valvontaa, käytettiin raportoitu aiemmin [21].

Quantitative Metylaatiospesifinen Reaaliaikainen PCR-analyysi

Quantitative real-time fluorimetrinen 5 ’eksonukleaasi-PCR (qMSP) analyysit suoritettiin määrittämään CGI metylaatio tasot

CST6, LAD1,

HSA

-miR-124-3,

ja hsa-

asennuspalveli- 9-1

. Metyloituvuutta HSA

-miR-124-3

suoritettiin kuten aiemmin on kuvattu [21]. qMSP järjestelmiä laadittiin

CST6, LAD1,

ja hsa-

miR-9-1

käyttäen Beacon Designer ohjelmistoa (PREMIER Biosoft, Palo Alto CA, USA). Pohja kannat tutkittiin CGI sivustoja

CST6, LAD1,

HSA

-miR-124-3,

ja hsa-

miR-9-1

on esitetty taulukossa 2. emäskohdissa viittaavat USCS Genome Browser [27]. QMSP järjestelmät, tunnettu siitä, kuten on kuvattu HSA

-miR-124-3

metylaatio mittaukset [21]. Monista reaaliaikaisen PCR: t suoritettiin ABI 7900HT (Life Technologies, Foster City, USA) 384-kuoppalevyillä, kuten aiemmin on kuvattu [21]. Experimenters oli sokaissut histopatologisen ja kliinisen tilan näytteistä. Suhteellinen metylaatiotasoilla laskettiin analogi ΔΔCt menetelmän normalisoimalla ero CGI metylaatio määritetään reaaliaikainen havaitseminen ja riippumatonta sisäisen valvonnan mittaukset vastaava ero täysin metyloitu DNA vertailunäytteet kuten aiemmin on kuvattu [21], [28 ].

tilastollinen analyysi Survival

Kaplan-Meier tontteja käytettiin esittää suhteellista eloonjäämisen PFS ja OS analyysit seuraavissa dichotomization kasvainten osaksi korkea ja matala metylointi fenotyyppejä. Mediaani selviytyminen ja vastaavat 95% luottamusvälit (CI) on raportoitu. Erot PFS ja OS testattiin käyttämällä log-rank tilastoja ja mediaani eloonjäämissuhteet lasketaan.

P

-arvot 0,05 pidettiin merkittävinä. Mahdollistamiseksi vertailu kirjallisuuteen, yhden muuttujan Coxin regressio analyysit tehtiin arvioimiseksi hazard ratio (t). Laskea herkkyys ja spesifisyys hoidon epäonnistuminen, eli PFS raja-arvo 6 kuukauden käytettiin dichotomization [29] osaksi hoidon vasteen ja ei-vastetta.

Lämpö kartta ja vastaanotin toimivat ominaisuus konstruoitiin käyttäen heatmap2 ja ROCR toiminto R paketti (versio 2.11.0.1), oletusarvo klusterointialgoritmi ja gplot paketti [30].

tulokset

bimodaalis- suhteellisen metylaatiotasoilla että CGI kandidaattigeenien

kvantitatiivinen metylaatio analyysit CGI on

CST6

,

LAD1

, hsa-

miR-124-3,

ja hsa-

miR -9-1

paljasti, että läsnä on bimodaalinen jakauma suhteessa metylaation arvot (kuvio 1A ja D; tietoja ei ole esitetty hsa-

miR-124-3

ja hsa-

miR-9 -1

). Soveltamalla yksi sulku-arvo on 0,02% (vastaa -8,75 että ln mittakaavassa käytetään ytimen tiheyden tonttien kuviossa 1A ja D) suhteellinen metylaation, korkea ja matala metyloidut epigenotypes oli yhdenmukaisesti erottaa kaikille analysoitiin geenien ja käytetään johdonmukainen dichotomization eloonjäämisessä analyysejä.

A ja D. istribution suhteellisen metylaation arvot

CST6

(A) ja

LAD1

(D) mRCC potilailla. Sulku Arvo on esitetty dichotomization. B ja E. Kaplan-Meier tontit etenemisestä vapaan eloonjäämisen mRCC potilaiden kahtia korkea ja matala metylaation

CST6

(B) ja

LAD1

(E). C ja F Kaplan-Meier tontit eloonjäämisaste mRCC potilaiden kahtia korkea ja matala metylaation

CST6

(C) ja

LAD1

(F).

analyysi PFS

Kaplan-Meier ja log rank analyysi PFS korkean ja matalan metyloitu kasvaimia osoitti merkittävän eron sekä

CST6

ja

LAD1

. Korkea metylaatio liittyi mediaanielossaolosta 2,0 kuukautta, verrattuna 11,4 kuukautta potilailla, joilla on alhainen metylaatio (p = 0,009 ja p = 0,004, taulukko 3A). Sen sijaan ei ole

miR-124-3

eikä

miR-9-1

osoitti tilastollista suhdetta PFS (p = 0,339 ja p = 0,319).

analyysi OS

Kaplan-Meier-analyysi ja log rank tilastot osoittivat, että korkea metyloinnin

CST6

ja

LAD1

liittyi heikentynyt OS. Mediaani OS 22,9 ja 3,4 kuukautta (p = 0,011, taulukko 3B) saatiin matalan ja korkean

CST6

metylaatio, vastaavasti. Mediaani OS 16,4 ja 3,4 kuukautta (p = 0,043, taulukko 3B) saatiin matalan ja korkean

LAD1

metylaatio.

Analyysi Herkkyys ja spesifisyys

Määritä herkkyys ja spesifisyys

CST6

ja

LAD1

metylaatio analyysit ennustamiseen ensivaiheen hoidon epäonnistuminen, metylointi arvot kahtia matalan ja korkean metylaation fenotyyppien käyttäen samoja raja-arvo on 0,02% määritellyllä edellä. PFS arvot kahtia käyttäen cutoff 6 kuukautta, parametri, joka on aiemmin ehdotettu paremmin erottamaan hoidon vasteen ja ei-vastetta [29]. Korkea metylaatio

LAD1

ja

CST6

oli ominaista epäonnistunut hoito (kuvio 2A). Kun kyseessä on

LAD1,

kaikki kahdeksan potilasta, joilla on korkea metylaatio oli ei-vastetta. Spesifisyys oli 1,0 (95% CI 0,65-1,0) ja herkkyys 0,73 (95% CI 0,43-0,90) havaitsemiseksi hoidon epäonnistumisen käyttämällä

LAD1

metylointi (taulukko 4), kun taas spesifisyys oli 0,86 (95 % CI +0,49-+0,97) ja herkkyys 0,82 (95% CI ,52-0,95) ja

CST6

metylointi (taulukko 4).

. Lämpö kartta normalisoidut suhteelliset metylaation arvot (luonnollinen logaritmi) havaittiin

LAD1

,

CST6

,

miR-9-1,

ja

miR-124-3

CGI kullekin potilaalle. Pienimmästä suurimpaan metyloinnin arvot koodataan violetti (matala) punaiseen (korkea) sävyjä. Katkoviivalla ja yhtenäiset viivat kuvaavat mediaani ja yksittäiset metylaation arvot, vastaavasti. Potilas numerot annetaan vasemmalla vastaavat numerointi esitetään taulukossa 1. Therapy vastaus (0) ja hoidon epäonnistuminen (1) on merkitty kullekin potilaalle oikealla. Erityisesti kaikki potilaat (no. 1-8) näytteille korkea metylaatio

LAD1

ja 9 10 potilasta (no. 1-9, 14), joilla korkea metylaatio (punaisia) on

CST6

olivat osa ei-responder (1) ryhmä. B. Vastaanotin käyttöominaisuudet (ROC) käyrät havainnollistettu syrjintä metylaation mittauksia ja käyrän alapuolinen alue (AUC) osoittaa, että jopa meidän pieni potilas kohortin, vankka tulos tarkkuuden molempien metylaation markkereita (AUC

CST6

= 0,88 ja AUC

LAD1

= 0,90), voidaan havaita. Herkkyys (tosi positiivisia) on piirretty 1-spesifisyys (vääriä positiivisia).

Keskustelu

kliinisiä tuloksia potilailla, joilla on mRCC ovat parantuneet vuodesta VEGF- kohdennettuja hoitomuotojen ja mTOR-inhibiittorit olivat saatavilla [2], [3]. Kuitenkin kerrostuneisuus käyttävän potilaan biomarkkerit saattaa mahdollistaa paremman käsityksen Lääkeresistenssin ja tunnistaa optimoidun potilaskohtaista sekvenssi antiangiogeeninen hoitoja, parantaa yksilön selviytymistä [7]. Lisäksi sivuvaikutuksia anti-VEGF-pohjaiset hoidot, kuten ripulia, ihottumaa, käsi-jalka-oireyhtymä, kohonnut verenpaine, ja voimattomuus, joka usein vakavia heikentävät elämänlaatua hoidon aikana voidaan minimoida.

Löysimme että DNA hypermetylaatiota

CST6

ja

LAD1

perusterveydenhuollossa RCC kasvainkudoksessa liittyy merkittävästi PFS saavista potilaista anti-VEGF-pohjainen lääkitys kuin ensilinjan hoito ja myös OS potilasta peräkkäin hoidettu anti-VEGF kohdennettuja lääkkeitä ja mTOR inhibiittorit vuonna toisen ja kolmannen linjan hoito. Meidän metylaatio markkereita ennustaa hoidon epäonnistuminen suurella spesifisyydellä ja hyvä herkkyys.

Parhaan tietomme mukaan nämä havainnot ovat ennennäkemättömiä monessa suhteessa, koska aiemmat tutkimukset eivät olleet kudoksessa ja joko toimittaneet merkittävää yhteyttä hoidon vasteen [12] tai ilmoitetaan vain rajallinen tilastollinen teho [11]. Vaikka seerumin mittaukset CA9 tasoilla paljastanut mitään merkittäviä eroja hoidon vasteen ja ei-vastetta [12] analysoinnissa perimä, mahdollisesti vuorovaikutuksessa sunitinibi polku, jonka tunnuksena kaksi

VEGFR3

SNP liittyvän hoidon vasteen ja PFS, mutta ei OS [11]. Tämä tutkimus osoittaa, että yksittäisen biologisen muuttujat voivat vaikuttaa hoitovastetta. Toisaalta, meidän metylointi-pohjainen ehdokas ennustajia ylitetä mittaamiseen geenivarianttien useita tärkeitä näkökohtia. Ensiksi mahdollisen

LAD1

ja

CST6

DNA: n metylaatio-pohjainen markkereita mitattiin tuumorisoluihin, jotka suoraan ilmentävät kasvaimeen ominaisuuksia, jotka voivat edustaa kuljettajien kestävyys ja biologisten aggressiivisuus. Hypermetylaatiota

CST6

ja

LAD1

näytteillä prognoosi- ja ennustearvo tutkimuksessamme ja on otaksuttu biomarkkeri potilaan valinnan. Perustuen kliinisiin tuloksiin tutkimuksessamme, erilaisia ​​terapeuttisia strategioita hypermetyloitunut kasvainten tarvitaan. Kun verkko epigeneettiset muutokset ja biologista käyttäytymistä on Uudenkaupungin, lisää uusia kohteita hoitointerventioiden voidaan tunnistaa.

Onko ero epigeneettiset kudos- ja geneettinen veripohjaisten mittausten osuus sekä epigeneettisiin markkereita liittyneen PFS ja OS mRCC potilaista on mielenkiintoinen kysymys. Gene variantit vain liittyy PFS, korvike päätepisteen hengissä mittauksiin mRCC että on mahdollista rajoitukset [31]. Parhaan tietomme mukaan kudos-pohjainen molekulaarinen merkkiaine ei ole aikaisemmin liittynyt OS. Tilastollisesti näkökulmasta, meidän epigeneettiset Tutkimus toimitetaan korkeampi HRS eloonjäämisessä analyysien ja edellyttäen tasapainoisempi luokittelun vastanneiden ja vastetta kuin tutkimuksesta Garcia-Donas et al. [11], ja siksi yhdessä edistää korkeampi voima tämän tutkimuksen. Ottaen huomioon, että paljon pienempi potilaan kohortissa oli käytettävissä Mittaustemme, meidän havainnot osoittavat, että voimakas vaikutus on mahdollisesti havaittu. Lisäksi otetaan huomioon, että yhä useampi aineita voidaan käyttää hoitoon mRCC, tulevaisuuden tunnistaminen optimaalisen hoitomallilla voitaisiin helpottaa epigeneettisiin markkereita, jotka mahdollistavat hyvän erottaminen potilaita vastanneiden ja vastetta.

Mielenkiintoista, metylaatiotasot kaikkien ehdokas merkkiaineiden selvästi rapistunut osaksi helposti erotettavissa korkea ja matala metylaation ryhmiä, poistaa tarpeen mielivaltaisesti määritellä sulku pistettä dichotomization. Sen vuoksi, ei käytännössä ole päällekkäisyyttä välillä oli vaste ja ei-vastetta esillä olevassa tutkimuksessa. Niinpä meidän

LAD1

ja

CST6

metylaatio analyysit tuottivat suuren erityispiirteet 1,0 ja 0,86 havaitsemiseksi hoidon epäonnistumisen, mikä korostaa olla merkitystä näiden merkkiaineiden mRCC.

Tämä tutkimus voi myös vastata onko DNA: n metylaatio-pohjainen prognosticators edustavat asianmukaisen ennustavat taudin. Molemmat

miR-9-1

ja

miR-124-3

[21], [22] epäonnistui ennustajina koska ei havaittu yhteyttä kanssa PFS tai OS-potilaiden hoitoa. Tämä havainto saattaa selittyä sillä, että mRCC potilaat yleensä kasvot huono ennuste, ja monet kasvaimet osoittavat suurta metylaation varten

miR

geenejä odotetusti ehdokas prognosticators.

riippumattomuus kliinisiä tai laboratorioparametreihin ei voitu määrittää esillä olevassa tutkimuksessa, koska alhainen näytemäärät esti monimuuttujamenetelmin. Vastaavasti asiaa epäilee markkereita voitaisiin yhdistää optimoimaan ennusteita vai onko markkereita näytteille tarpeeton tieto voidaan vastata vain tulevissa tutkimuksissa käyttämällä laajentuneen tutkimuksen ikäryhmät.

Kuitenkin HRS tarkkailtiin kliinisten parametrien potilaiden hoitotuloksiin oli pienempi rajoitettu tarkkuus /erottelukykyä. Tuloksemme pyytää vahvistuksen riippumattomalla validointitutkimuksessa mukaan lukien tutkimus kliinisen pisteytyksen järjestelmien sekoittavien tekijöiden.

Yhteenvetona Tutkimuksessamme tunnistettu

LAD1

ja

CST6

CGI Metylointia kaksi epigeneettisiä markkereita, jotka liittyvät PFS ja OS mRCC potilailla, jotka saavat antiangiogeenisesti hoitoa. Olemme myös osoittaneet, että voidaan parantaa molekyyli ennustuksen hoitovastetta. Tuloksemme edelleen korostaa käsitystä, että epigeneettiseltä muuttunut RCC olemassa, ja uusia erityisiä strategioita voidaan tarvita potilailla, joilla on tällaisia ​​kasvaimia.

Kiitokset

Kiitämme Margrit Hepke ja Christel Reese tekniseen tukeen.