Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Kasvava tutkimukset ovat osoittaneet yhdistyksen välillä polymorfismit Toll-like-reseptori 9 (

TLR9

) ja alttius syövälle, mutta tulokset pysyivät epäjohdonmukainen.

Menetelmät /Principal havainnot

vaikutuksen arvioimiseksi kolmen valitun SNP (rs352140, rs5743836 ja rs187084) in

TLR9

syövästä, teimme meta analyysi perustuu 11 tapausverrokkitutkimukset, mukaan lukien yhteensä 6585 syöpätapauksista ja 7506 tarkastuksia. Yhteenveto kertoimet suhdeluvut (OR) ja vastaavat 95% luottamusvälit (CI) varten polymorfismien

TLR9

ja syöpäriskiä arvioitiin. Meidän meta-analyysi osoitti, että rs352140 liittyi lisääntynyt syöpäriski, erityisesti valkoihoinen. Ei kuitenkaan merkitsevästi lisääntynyt syöpäriski havaittiin liittyvän rs187084 ja rs5743836 joko yleinen tai alaryhmän arviointi.

Johtopäätökset

Nämä meta-analyysin tulokset osoittavat, että polymorfismeilla

TLR9

voi olla rooli syövän kehittymisessä.

Citation: Zhang L, Qin H, Guan X, Zhang K, Liu Z (2013)

TLR9

geenipolymorfismien ja syöpäriskiä : Evidence from meta-analyysi. PLoS ONE 8 (8): e71785. doi: 10,1371 /journal.pone.0071785

Editor: Georgina L. Hold, University of Aberdeen, Yhdistynyt Kuningaskunta

vastaanotettu: 19 helmikuu 2013; Hyväksytty: 2. heinäkuuta 2013. Julkaistu: 19 elokuu 2013

Copyright: © 2013 Zhang et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat avustusta Cheng Du Medical College (CYZ12-017) ja Fund Project Sichuanin maakunnan Department of Education. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Toll-like-reseptorien (TLR) ilmaistuna pääasiassa antigeenejä esitteleviä soluja, kuuluu perheeseen kuvio tunnustamatta reseptorit (PRRS). Ihmisillä TLR perheeseen kuuluu 10 jäsentä (TLR 1-10) [1]. Se on keskeinen rooli immuunivasteen Mikrobipatogeenien tunnistamalla tietyn mikrobien molekyylikomponentit. Sen jälkeen, kun aktivoitu, TLR aloittaa signalointiryöpyn johtaa stimulaation synnynnäisen ja adaptiivisen immuunivasteen suunnattu hyökkääviä taudinaiheuttajan [2], [3]. Vaikka TLR ovat sekaantuneet kuin ensimmäinen rivi puolustus ihmisen anti-mikrobi vasteita, ne osallistuvat myös patofysiologiaan monien tulehduksellisten ja immuunijärjestelmän sairauksien, kuten syövän [4] – [7].

Human

TLR9

sijaitsee kromosomissa 3p21.3 [8], sisältää kaksi eksonia ja ilmentyy ensisijaisesti B-solujen ja plasmasolumaisten dendriittisolut [9]. Toisin kuin muut jäsenet TLR-geenin perhe, joka muodostaa kalvoon sitoutuneiden hahmontunnistuksen reseptoreihin, TLR9 on lokalisoitu Endoplasmakalvosto kalvo (lepotilassa) tai endosomaaliseen /lysosomaalisen kalvon (jälkeen ligandin stimulaation ja kaupan) [10], [11]. TLR9 tunnistaa metyloimattomia CpG-motiivien läsnä bakteereja ja viruksia [12]. Vaihtoehtoisesti TLR9 toimintojen kautta myeloidinen eriyttäminen primäärivasteen proteiini 88 (MyD88): sta riippuvainen johtava väylä NF-kappa-B (NF-kB) aktivoitumista, sytokiinien eritystä ja tulehdusreaktion [12], [13]. Viime vuosina lukuisia geneettisiä yhdistys tutkimukset ovat tutkineet rooli

TLR9

geenin polymorfismien erilaisten syöpien, mukaan lukien virtsarakon syöpä [14], eturauhassyöpä [15], akuutti lymfaattinen leukemia (ALL) [16], maksasolusyövän (HCC) [17], mahasyöpä [18] – [20], kohdunkaulan syöpä [2], [13], [21], Hodgkinin lymfooma [22], rintasyöpä [23], Burkittin lymfooma [24] , non-Hodgkin-lymfooma [25], kohdun limakalvon syöpä [26], ruokatorven syöpä [20] ja lymfooma [27]. Useimmissa tutkimuksissa keskityttiin kolmeen yhteisestä yhden nukleotidin polymorfismit (SNP: t), mukaan lukien rs352140 (C /T), rs5743836 (T /C) ja rs187084 (C /T) (kutsutaan myös 2848C /T, 1237T /C, ja 1486C /T, vastaavasti). Kuitenkin tulokset pysyivät ristiriitaisia.

Kun otetaan huomioon yksi tutkimus saattaa alimitoitettu havaita yleistä vaikutuksia monimutkaisia ​​sairauksia, kvantitatiivinen synteesi kertyneitä tietoja eri tutkimuksista katsottiin tärkeää antaa todisteita yhdistyksen muunnelmia

TLR9

syöpäriskiä. Niinpä teimme tämän meta-analyysin kertyneitä tietoja arvioida yleistä syöpäriskiä valittujen kolmen SNP

TLR9

ja määrällisesti heterogeenisuus välillä yksittäisistä tutkimuksista sekä tutkimaan, onko olemassa potentiaalisia julkaisun harhaa.

Materiaalit ja menetelmät

Haku strategia

Haimme PubMed ja CNKI (China National Knowledge Infrastructure) kaikille artikkeleita yhdistyksen välillä

TLR9

polymorfismit ja Syöpä riski (päivitetty 20 tammikuu 2013) käyttäen seuraavia termejä: ”Toll kaltainen reseptori 9” tai ”

TLR9

” ja ”syöpä” tai ”kasvain” tai ”syöpä” ja ”polymorfismi” tai ”polymorfismit” tai ”SNP” varten tarvittavat kertomukset. Jotta voitaisiin tunnistaa asiaan julkaisuihin, viitteet mainittu tutkimuspaperit myös skannattu.

ja poissulkukriteereitä

kriteereillä nykyisille meta-analyysi tutkimukset olivat (1) arviointi

TLR9

polymorfismi ja syövän riskiä, ​​(2) ollessa tapauskontrollitutkimuksessa, (3) olemassa olevat käyttökelpoinen genotyypin taajuus (tai tietoja niiden laskemisessa), (4) verrokeilla täytti Hardy-Weinberg tasapainon (HWE), ja (5) tutkimus julkaistiin Englanti tai Kiinan. Tiivistelmiä ja julkaisemattomia raportteja ei pidetty.

Data Extraction

Data uutto itsenäisesti tehnyt kaksi tutkijaa (Zhang LS ja Qin HJ), ja poikkeamat ratkaistiin konsensus sisältää kolmannen tutkija (Zhang K.). Seuraavat ominaisuudet kerättiin kustakin tutkimuksesta: ensimmäinen kirjoittaja, julkaisuvuosi, maa Tutkimuksen väestöstä, etnisyys, syöpätyyppejä, genotyypitysmenetelmiä, useita genotyyppejä, otoskoko, vähäinen alleelin taajuus (MAF) kontrolleissa, ja todisteet Hardy -Weinberg tasapaino (HWE). Hyväksyttävät tutkimukset kerrostuu väestöpohjainen (PB) ja sairaala-pohjainen (HB) mukaan Ohjauslähteen. Kun tutkimukset sisältävät aiheita eri etnisten ryhmien, tiedot poimittiin erikseen kullekin etninen ryhmä.

Methodological Laadunarviointi-

laatu voivat tutkimusten arvioitiin kolme arvioijat (Zhang LS, Guan X. ja Qin HJ) itsenäisesti pisteytys mukaan ”metodologinen laadun arviointiasteikolla (taulukko S2), joka toimitettiin aikaisempien meta-analyysi [28], [29]. Mittakaavassa, viisi kohtaa arvioitiin, mukaan lukien eli edustavuus tapauksissa lähde hallintalaitteiden, toteamiseen asiaan syöpä, otoskoko ja laadunvalvonta genotyypitysmenetelmiä. Laatupisteet vaihteli 0-9 ja korkeat pisteet osoitti hyvää laatua tutkimuksen. Vain tutkimukset tuloksella 6 tai uudempi olivat mukana.

Tilastollinen analyysi

HWE kontrolleissa tutkimusta varten arvioitiin käyttämällä hyvyyttä chi-neliö testi ennen tilastollista analyysiä ja

P

0,05 pidettiin merkittävänä epätasapainoon. Vahvuus assosiaation

TLR9

polymorfismi ja syövän riskiä arvioitiin raakaa kerroinsuhde (OR) ja 95%: n luottamusväli (CI). Pairwise ryhmäeroja syrjäisimpien alueiden analysoitiin ja paras geneettisiä malleja oli tarkoitus määritetään Thakkinstian menetelmän [30]. Sitten aineisto yhdistettiin käyttämällä paras malli. Etnisyys, syöpätyyppeihin ja otoskoko hyväksyttiin suorittamaan kerrostunut analyysin kun tietoja oli saatavilla.

chi-neliö-pohjainen Q testiä käytettiin tarkistaa tilastollisen heterogeenisyys [31]. Jos tulos heterogeenisyys testi oli

P

0,1, sitten syrjäisimpien yhdistettiin mukaan kiinteiden vaikutusten malli (Mantel-Haenszel malli) [32]. Muussa tapauksessa sattumanvaraiset vaikutukset malli (jäljempänä Dersimonian-Laird malli) käytettiin [33]. Tutkitaan lähteitä heterogeenisuus tutkimuksissa teimme logistinen meta-regressioanalyysi, ja arvioi kaikki vertailu mallien frekvenssin vähäinen alleelin verrokeilla, taajuus vähäisiä alleelin tapauksessa henkilöillä, syöpätyyppejä, lähde ohjaus, otoskoko ja etnisyys . Julkaisu bias tarkistettiin käyttäen Begg testi [34] ja Egger testi [35]. Herkkyysanalyysi suoritettiin arvioimaan vakautta tulosta kunkin tutkimuksen puolestaan ​​poistetaan. Kaikki tilastolliset testit suoritettiin ohjelmiston STATA versio 11.0 (Stata Corporation, College Station, TX).

Tulokset

Ominaisuudet Studies

Meidän ensimmäinen haku tunnistettu 43 tutkimukset mukaan että hakusanojen, ja 2 kirjaa lisätään kautta viittaus scan. Seulonnan abstrakti, 24 haettiin tarkempaa arviointia. Tutkittuaan koko tekstin, 10 tutkimukset suljettiin seuraavista syistä, kolme paperit olivat arviot [5], [11], [36], kaksi paperit liittyvät infektioriskin syöpähoidon aikana [37], [38], yksi paperia koskevat tuloksiin AML potilaiden siirtämistä HLA-identtisten sisarusten luovuttajien [39], kaksi paperit puuttui geenien näyttötiheystietoja laskea syrjäisimmille alueille ja 95% CI [40], [41], ja kaksi osa tutkimuksista oli epätasapainoon alkaen HWE kontrolliryhmässä [13], [15]. Yksi artikkeli arvioitiin kaksi SNP (rs352140 ja rs5743836) kanssa Burkittin lymfooma riskiä [24], ja genotyyppi jakelun valvonnassa rs352140 oli ristiriidassa HWE (P 0,05). Siksi me uutettiin koskevat tiedot rs5743836 meidän meta-analyysi. Vain yksi tutkimuksessa arvioitiin rs352139 polymorfismia syöpäalttiutta [17]. Siten tietoja ei ollut saatavilla meta-analyysi. Yksityiskohtainen arviointiprosessi saatettiin kuvassa 1. Tulokset on ’menetelmien laadun arviointiasteikolla ”osoitti, että laatupisteet vaihteli 5,5-8, ja 3 tutkimuksissa ei otettu pisteet alle 6 [18], [19], [ ,,,0],21]. Lopuksi, 11 tapausverrokkitutkimukset sisältävät kolme erillistä SNP (rs352140, rs5743836 ja rs187084) valittiin tähän meta-analyysiin. Tutkimus ominaisuudet olivat yhteenveto taulukossa 1. Kuten taulukosta 1, viisi tutkimukset olivat käytettävissä rs352140 [14], [16], [17], [22], [23], kymmenen tutkimukset olivat saatavilla rs5743836 [16], [20], [22], [24] – [27], ja neljä tutkimukset olivat saatavilla rs187084 [2], [16], [26], [27]. Ne kuuluvat tutkimukset Saksassa, Puolassa, Alankomaissa, Kreikassa, Kroatia, Portugali, Yhdysvallat, Australia, Intia ja Kiina. Useat genotyypin menetelmiä käytettiin, mukaan lukien polymeraasiketjureaktio – restriktiofragmentin pituuden polymorfismi (PCR-RFLP) määrityksessä,-TaqMan-koettimella, kilpailukykyinen Allele-Specific PCR (ASPCR), kaksisuuntainen PCR-monistus spesifisten alleelien (Bi-PASA), tetra- pohjamaali määritykset ja multiplex polymeraasiketjureaktioilla SNaPshot menetelmä (Multiplex PCR SNaPshot).

Quantitative Synthesis

verrokeilla, MMM vaihtelee 0,39-0,66 sisään rs352140, alkaen 0,08-0,38 sisään rs5743836 ja +0,21-0,45 in rs187084. Kaiken kaikkiaan rs352140, rs5743836 ja rs187084, mitään merkittävää eroa syöpiä ja valvonnan havaittiin alleelin verrattuna (kuvio 2, taulukko S4).

. Vertailu

TLR9

rs352140 polymorfismi alleelin vertailu (T-alleelin vs. C-alleelin) syöpäriskiä alaryhmäanalyyseissa etnisyyden alle kiinteiden vaikutusten mallia. B. Vertailu

TLR9

rs187084 polymorfismi alleelin vertailu (C-alleeli vs. T-alleelin) syöpäriskiä alaryhmäanalyyseissa Näytteen koon mukaan random-vaikutus malli. C. vertailu

TLR9

rs5743836 polymorfismi alleelin vertailu (C-alleeli vs. T-alleelin) syöpäriskiä alaryhmäanalyyseissa syöpätyyppien alle random-vaikutus malli. D. vertailu

TLR9

rs5743836 polymorfismi alleelin vertailu (C-alleeli vs. T-alleelin) syöpäriskiä alaryhmäanalyyseissa Näytteen koon mukaan random-vaikutusten malli.

rs352140 arvioitu OR1 (TT vs. CC), OR2 (CT vs. CC) ja OR3 (TT vs. CT) olivat 1,414 (95% CI: 0,854, 2,342), 0,937 (95% CI: 0,746, 1,178) ja 1,309 (95% CI: 0,996, 1,721), ja ne kaikki eivät olleet merkittäviä (

P

arvot olivat 0,178, 0,577 ja 0,053, vastaavasti) (taulukko S3). Niinpä olemme lähinnä yhdistettiin tai alleelin vertailua ja peittyvästi geneettistä mallia alaryhmäanalyysi etnisyys. Yhdistetty tutkimus näkyy, että alleeli T genotyyppi TT oli alttius lisääntyy syöpäriskin (T /C: OR = 1,263, 95% CI: 1,029, 1,551,

P

= 0,026,

P

heterogeenisyys = 0,595; TT vs. CC /CT: OR = 1,397, 95% CI: 1,017, 1,919,

P

= 0,039,

P

heterogeenisyys = 0,766) keskuudessa valkoihoinen, mutta ei Aasian (taulukko S4).

Samoin rs187084 arvioitu OR1 (TT vs. CC), OR2 (CT vs. CC) ja OR3 (TT vs. CT) olivat 1,054 (95% CI : 0,857, 1,296), 0,992 (95% CI: 0,784, 1,255) ja 1,008 (95% CI: 0,797, 1,276), ja ne kaikki eivät olleet merkittäviä (

P

arvot olivat 0,621, 0,946 ja 0,971 , vastaavasti) (taulukko S3). Joten, olemme lähinnä yhdistettiin tai alleelin vertailua ja peittyvästi geneettistä mallia alaryhmäanalyysi otoskoko (tutkimuksissa yli 1000 osallistujaa luokiteltiin ”suuriksi”, ja tutkimukset vähemmän 1000 osallistujaa luokiteltiin ”pienten”). Kuitenkaan mitään merkittävää eroa syöpiä ja valvonnan havaittiin alaryhmäanalyysi otoskoko (kuvio 2, taulukko S4).

Koska puuttuvat alaikäisen alleelin joissakin tutkimuksissa, oli vaikea saada OR1, OR2, ja OR3. Siksi teimme alleelin vertailua ja hallitseva verrattuna arvioida yhdistyksen välillä rs187084 polymorfismin ja syöpäriskiä. Emme kuitenkaan ole löytänyt mitään merkittävää yhteyttä välinen SNP ja syöpäriskin alaryhmäanalyysi syöpätyyppeihin (lymfooma ja muut syövät) (kuvio 2, taulukko S4).

heterogeenisuus Analysis

heterogeenisuus havaittiin keskuudessa tutkimukset yleisen vertailuissa (C vs. T: I

2 = 54,9%,

P

heterogeenisyys = 0,084, hallitseva malli: I

2 = 58,9%,

P

heterogeenisyys = 0,063 varten rs187084; C vs. T: I

2 = 82,6%,

P

heterogeenisyys 0,001, hallitseva malli: I

2 = 85,1%,

P

heterogeenisyys 0,001 rs5743836, vastaavasti) ja alaryhmäanalyysi. Tutkitaan lähteitä heterogeenisuus tutkimuksissa arvioimme alleelin vertailun taajuus vähäinen alleelin verrokeilla, taajuus vähäisiä alleelin tapauksessa henkilöillä, syöpätyyppien, etnisyys ja otoskoko, kun se oli saatavilla. Tämän seurauksena taajuus pieniä alleelin verrokeilla ja rs187084 voisi selittää 82,35%: n heterogeenisyys. Taajuus pieniä alleelin verrokeilla of rs5743836 ja syöpätyyppien voisi selittää kokonaisosuus 62,2% ja heterogeenisyys.

Herkkyysanalyysi ja julkaiseminen Bias

vaikutuksen arvioimiseksi yksittäisten tutkimus yleinen meta-analyysi arvion me jätetty yhdessä tutkimuksessa kerrallaan, ja poisjättäminen minkään yksittäisen tutkimuksen tehnyt mitään merkittävää eroa, mikä viittaa siihen, että tulokset meta-analyysissä olivat vakaat.

Begg n suppilo juoni ja Egger testi suoritettiin arvioimaan julkaisemisen bias valitun kirjallisuuden. Ei ole todisteita julkaisu puolueellisuudesta tutkimuksessamme havaittiin (Begg testi

P

= 0,221, Egger testi

P

= 0,237 varten rs352140; Begg testi

P

= 0,089, Egger n testi

P

= 0,155 varten rs187084; Begg testi

P

= 0,283, Egger testi

P

= 0,613 varten rs5743836, vastaavasti) (kuvio 3).

TLR9

rs352140, B,

TLR9

rs187084, C

TLR9

rs5743836. Jokainen piste edustaa erillistä tutkimusta osoitettuun -alueella. Log OR, luonnollinen logaritmi OR; S. E., keskivirhettä; vaakasuora viiva, keskimääräinen vaikutus koko.

Keskustelu

Tässä tutkimuksessa, suoritimme meta-analyysi tutkia yhdistyksen välillä

TLR9

polymorfismien ja syöpäriski 14091 aiheista. Meidän meta-analyysi tunnistaa, että kohonnut syöpäriski oli tilastollisesti liittyy TT genotyypin väistyvä malli rs352140. Lisäksi suhteen kerrostunut analyysin etnisyys, alleeli T ja genotyypin TT havaittiin lisätä syöpäriskiä sekä alleelin verrattuna ja väistyvä malli keskuudessa valkoihoinen. Ei kuitenkaan ole merkittäviä esiintynyt eroja rs187084 ja rs5743836 polymorfismien ja syövän riskiä joko kokonaisvertailussa tai alaryhmäanalyysissä.

synonyymi rs352140 polymorfismi etsii eksonissa 2

TLR9

. Aiemmat tutkimukset todettiin, että rs352140 TT genotyyppi liittyi korkeampi ilmaus

TLR9

mRNA-tasolla [21], [42] ja tihentynyt IgM + B-solujen [42]. Lisääntynyt ilmentyminen rs352140 T muunnos edeltäjä pahanlaatuisen leesion soluissa yhdistettynä infektion eri taudinaiheuttajia voitaisiin tukea tulehdus ja kohdunkaulan syövän kehityksen [5], [21]. On uskottu, että krooninen tulehdus voi johtaa syövän kehittymisen ja etenemisen [5]. Siksi rs352140 saattavat vaikuttaa synnynnäiseen immuunivasteeseen, tulehdus ja myöhemmin syövän syntymistä. Viime vuosina useat tutkimukset tehtiin arvioimaan yhdistyksen välillä rs352140 polymorfismin ja syövän prosesseja, mutta tulokset olivat ristiriitaisia. Joidenkin tutkimusten yhdistyksen välillä rs352140 polymorfismin ja useita syövän kehitykseen, kuten Hodgkinin lymfooma [22], Burkittin lymfooma [24] ja kohdunkaulan syöpä [21] valkoihoisilla. Tutkimuksissa, virtsarakon syöpä [14], eturauhassyöpä [15], maksasyövän [17], mahasyöpä [19] ja kohdunkaulan syöpä [13] ei löytänyt yhdessä rs352140 polymorfismi keskuudessa Aasian väestöstä. Samanlaisia ​​negatiivisia tuloksia havaittiin akuutti lymfaattinen leukemia [16] ja rintasyövän [23] valkoihoisilla väestöstä. Sen jälkeen analyysin HWE näissä tutkimuksissa, jossa arvioitiin rs352140 polymorfismi yhdessä syöpäriski, löysimme kolme tutkimusta olivat epätasapainoa alkaen HWE verrokeilla [13], [15], [24]. Poikkeama HWE voi johtua geneettisestä syistä, kuten ei-satunnainen pariutumisen tai alleelien viimeaikaiseen mutaatioita, jotka eivät ole saavuttaneet tasapainon, sekä menetelmiin liittyvistä syistä myös puolueellinen valinta aiheita väestöstä tai genotyypityksen virheitä [43] – [45] . Joten, me pudottaa ne kolmessa tutkimuksessa läsnä meta-analyysi. Olemme myös pudottaa tietoja Zhang L [19], Zeng HM. et ai. [18] ja Roszak, A. et ai. [21] niiden alhainen laadun arvioinnissa pisteet johtuen ei koko kuvaukset lähteen valvontaa. Lisäksi entinen tutkimukset osoittivat, että jos testit ei ole tehty kunnolla, koko vääriä positiivisia korko, neljän geneettistä mallia, nousee 0,23 jos aiempaa tyyppiä yksi virhe on 0,05 [30], [46]. Tässä meta-analyysissä, emme löytäneet sopivaa geneettistä mallia mukaan Thakkinstian menetelmän [30]. Siksi päätimme alleeli vertailu ja resessiivinen geneettinen malli arvioimaan assosiaatiota polymorfismin ja syöpäriskin yleistä ja alaryhmä. Havaitsimme, että kohonnut syöpäriski oli tilastollisesti liittyy TT genotyypin väistyvä malli rs352140. Lisäksi suhteen kerrostunut analyysin etnisyys, alleeli T ja genotyypin TT havaittiin lisätä syöpäriskiä alleelin verrattuna ja väistyvä malli valkoihoisilla. Aiemmat tutkimukset paljastivat, että rs352140 polymorfismi voisi vaikuttaa infektion aikana syövän kehityksen [5], [21]. Rajoittamiseksi tietojen sisällyttämisen tutkimuksissa emme ole suorittanut kerrostunut analyysi vaikutuksen tutkimiseksi ympäristötekijät, kuten infektio asema nykyisissä meta-analyysi. Lisätutkimukset arvioitaessa vaikutusta geenin ympäristön vuorovaikutukset tarvitaan laajentaa tietämystä rs352140. Tästä huolimatta tuloksemme kertyneeseen data osoittaa, että rs352140 polymorfismi voi olla rooli syövän kehittymisessä, varsinkin valkoihoisista.

SNP rs5743836, korvaamalla tyrosiini sytosiiniksi, etsii ja promoottorialueen

TLR9

[2]. Tämä SNP ajateltiin liittyvän lisääntynyt transkriptionaalisen aktiivisuuden ja toiminta

TLR9

[22], [47] – [50]. Noack J, et.al [24] havaittiin, että BL-solulinjoissa C-alleeli rs5743836 olivat puute solukuoleman yhteydessä

TLR9

liipaisu, mikä viittaa siihen, että erillisten solukuolema vasteita kun CpG- oligodeoksinukleotideja (CpG ODN) hoidon BL solut voidaan liittää rs5743836. Lisäksi C-alleelin rs5743836 polymorfismin generoi IL6 vastaamisen elementti. Mononukleaarisissa soluissa kantavat CT genotyyppi rs5743836, IL6 ajan säätelee

TLR9

ilmaisua, mikä pahentaa soluvasteiden CpG, kuten IL6 tuotanto ja B-solujen lisääntymisen. Lisäksi, edellinen tutkimus totesi, että C-alleelin rs5743836 luoda oletetun NF-kB sitoutumiskohdan ja sillä on suurempi NF-kB-sitoutumisaffiniteetti, joka johtaa parannetun transkription NF-kB ja johtaa suuremman vapautumisen ja tuotannon pro-inflammatoristen välittäjien [ ,,,0],49]. Siten läsnäolo C-alleelin näyttää johtaneen tehostetun NF-kB aktivaation seuraavat

TLR9

liipaisu ja toimii tärkeä rooli isännän immuunivasteen, tulehdus ja kasvaimen kehittymisen. Vaikka jotkut tutkimukset osoittavat suhde rs5743836 polymorfismi tuumorigeneesiin, todisteita epidemiologisten tutkimusten näyttää kiistanalainen. Useimmat aiemmat tutkimukset eivät osoittaneet mitään yhteyttä välillä rs5743836 polymorfismin ja syövän riskiä [16], [20], [24] – [27], paitsi kolme tutkimusta, jotka suoritetaan non-Hodgkin-lymfooman Portugalista ja Italiasta [25] ja Hodgkinin lymfooma Kreikasta [22]. Tuloksemme kertyneeseen tietoja ei löytänyt mitään merkittävää yhdistyksen välillä rs5743836 polymorfismin ja yleistä syöpäriskiä. Tässä meta-analyysissä, löysimme merkittävä heterogeenisuus tutkimuksia yleistä vertailuissa. Ja taajuus vähäinen alleelin verrokeilla ja syöpätyyppeihin myötävaikuttaa yhteensä osuus 62,2% ja heterogeenisyys. Ottaen huomioon heterogeenisyys osittain lymfooma, suoritimme alaryhmä analyysi vaikutuksen tutkimiseksi syövän tyypistä. Valitettavasti emme löytäneet mitään todisteita Merkitsevä yhteys rs5743836 polymorfismin ja alttius lymfooman. Tuloksemme olivat toisin joidenkin yhden tutkimuksen lymfooma [22], [25]. Tämä ero saattaa johtua kahdesta syystä: (1) geneettinen eroavuudet. Erittäin laaja valikoima MAF havaittiin kesken eri tutkimuksista, jotka voivat muun yksilölliset erot tautiherkkyyteen. (2) altistuminen eri taudin tilasta. Joissakin tutkimuksissa (sairaus), rs5743836 koskee alkuvaiheessa neoplastisten prosessin. Muut tekijät ottaa enemmän merkitystä myöhemmissä vaiheissa, jotka kulminoituvat pahanlaatuisiksi. Polymorfiaetsintä voi olla merkitystä määriteltäessä kohtauksen induktion vakava tulehdus, ja tämä voi sallia muita tekijöitä ottamaan enemmän merkitystä myöhemmin [20], [49]. Olemme myös suorittaneet alaryhmäanalyysi otoskoko ei yhdistyksen välillä rs5743836 polymorfismin ja syöpäriskiä todettiin. Ottaen huomioon merkittävät heterogeenisyys meta-analyysi rs5743836, tulokset tulisi käsitellä varoen. Suuret, monikulttuuriset ja hyvin suunniteltu tutkimuksia tarvitaan vahvistamaan nykyisen tuloksia.

SNP rs187084 sijaitsee edistäjä

TLR9

luotu oletetun SP1 sitoutumiskohta, joka voi olla toiminnallisesti asiaankuuluvat [51]. Variant alleelit rs187084 polymorfismien voi muuttaa toimintakyvyn

TLR9

[21] ja muuttaa vaste bakteeripatogeeneihin siten vaihteleva yksilöiden välisiä tautiherkkyyteen [49]. Useat tutkimukset ovat tutkineet vaikutusta rs187084 ihmisen syöpiin, kuten kohdunkaulan syövän [2], [21], kohdun limakalvon syöpä [26], mahasyöpä [18], akuutti lymfaattinen leukemia [16] ja lymfooma [27], mutta useimmat heistä ei ollut merkittävää yhdistyksiä. Nykyisessä tutkimuksessa, jotka on saatu yhdistämällä tutkimus osoitti myös merkittävää yhdistyksen välillä rs187084 polymorfismien ja syöpäriskiä.

heterogeenisyys, löysimme taajuus vähäinen alleelin tapauksessa koehenkilöillä päälähde epäyhtenäisyys varten rs187084. Vaikka syöpä tyyppejä ja taajuus pieniä alleelin verrokeilla olivat tärkeimmät lähteet epäyhtenäisyys varten rs5743836. Siten lisätutkimukset suurilla verran osallistujia useista erillisistä alueista ja riittävä syöpätyyppeihin olisi suoritettava.

Joitakin rajoituksia tämän meta-analyysi on seurattava. Ensinnäkin useimmat ilmoittautunut tutkimusten mukaan vain yhdistyksen

TLR9

polymorfismien syöpäriskiä ja tarkemman oikaistu tai muihin covariates kuten ikä, suvussa, tartuttaa kunnossa ja ympäristötekijät olivat käytettävissä. Toiseksi tutkimukset arvioitu syövän riski rs352140 ja rs187084 olivat rajalliset. Siten alaryhmä analyysi erityisten syövän tyyppiä ei tehty, koska tiedot ovat riittämättömät. Kolmanneksi, sillä rs5743836 useimmat osallistuu olivat valkoihoiset. Puute tietoja muista eettisistä ryhmä voi johtaa virheellisen tuloksen. Lisäksi alhaisen taajuuden pieniä alleeli, on vaikea analyysiä varten käyttäen mitä tahansa useampia geneettisiä malleja rs5743836. Lopuksi, emme löytäneet sopivaa geneettistä mallia arvioimaan yhdistyksen välillä rs352140 ja syöpäriski mukaan Thakkinstian menetelmällä. Siten tuloksemme johdettu geneettisen mallin rs352140 pitäisi olla kyseenalainen. Huolimatta näistä rajoituksista tämä meta-analyysi menetelmien laadun arviointiin sovellettiin ja kaikkien tutkimusten sisällytetty tähän meta-analyysi tapasimme valintakriteerit selvästi. Alleeli vertailu ja geneettisten mallien vertailu käytettiin arvioimaan syöpäriski kanssa TLR9 polymorfismit. Toiseksi alaryhmiä analyysi etnisyys, syöpätyyppeihin ja otoksen koko oli parempi tietämys

TLR9

polymorfismien ja syöpäriskiä.

Johtopäätöksenä meidän meta-analyysi osoitti, että

TLR9

rs352140 oli liittyy lisääntynyt syöpäriski, erityisesti valkoihoisilla, ehdotti, että polymorfismeilla

TLR9

voi olla rooli syövän kehittymisessä. Koska geneettinen erilaisuudet ja syövän tyyppi olivat tärkeimmät lähteet heterogeenisyyden, on tärkeää, että suurempi ja hyvin suunniteltu monikeskustutkimuksissa perustuu muihin alueen väestölle ja riittävä syöpätyyppeihin olisi tehtävä arvioida uudelleen yhdistys. Lisäksi ylimääräinen tulevissa tutkimuksissa tulisi yhdistää muihin mahdollisia riskitekijöitä laajentaa tutkimuksia.

tukeminen Information

Taulukko S1.

PRISMA 2009 tarkistuslista.

doi: 10,1371 /journal.pone.0071785.s001

(DOC) B Taulukko S2.

Scale menetelmäsyistä laadun arviointiin.

doi: 10,1371 /journal.pone.0071785.s002

(DOC) B Taulukko S3.

Monivertailuja perimän vaikutuksia.

doi: 10,1371 /journal.pone.0071785.s003

(DOC) B Taulukko S4.

Ositettu analyysi

TLR9

polymorfismien syöpäriskiä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0071785.s004

(DOC) B