Krooninen sairaus

tiivistelmä

Eturauhassyöpä (PCA) on edelleen yksi yleisin syy syöpään liittyvän kuoleman miehillä Yhdysvalloissa. Laajalti käytetty prostataspesifisen antigeenin (PSA) seulonta rajoittaa alhainen spesifisyys. Diagnostinen arvo muiden biomarkkerit kuten RAS yhdistys verkkotunnuksen perheen proteiini 1 A (RASSF1A) promoottori metylaatio eturauhassyövässä ja suhde RASSF1A metylaatio ja patologisia piirteitä tai kasvain vaiheessa on vahvistamatta. Siksi meta-analyysi julkaistut tutkimukset tehtiin ymmärtää yhdistyksen välillä RASSF1A metylaatio ja eturauhassyöpää. Kaikkiaan 16 tutkimuksessa, joihin osallistui 1431 tapauksia ja 565 valvonta yhdistettiin satunnainen vaikutus mallia tässä tutkimuksessa. Kertoimet suhde (OR) on RASSF1A metylaation PCA tapauksessa kontrolleihin verrattuna, oli 14,73 95% CI = 7,58-28,61. Kerrostunut analyysit osoittivat johdonmukaisesti samanlainen riski eri näytteestä tyyppejä ja metylointi analyysimenetelmiä. Lisäksi RASSF1A metylaatio liittyy korkea Gleason OR = 2,35, 95% CI: 1,56-3,53. Lisäksi yhdistettiin spesifisyys kaikki mukana tutkimuksissa oli 0,87 (95% CI: 0,72-0,94), ja yhdistetyt herkkyys oli 0,76 (95% CI: ,55-0,89). Spesifisyys kunkin alaryhmän ositettu näyte tyypin pysyi yli 0,84 ja herkkyyttä myös pysynyt yli 0,60. Nämä tulokset viittaavat siihen, että RASSF1A promoottorin metylaation olisi mahdollinen biomarkkereiden PCA diagnosoinnissa ja hoidossa.

Citation: Pan J, Chen J, Zhang B, Chen X, Huang B, Zhuang J, et al. (2013) välisestä assosiaatiosta RASSF1A Promoottori Metylointi ja Eturauhassyöpä: järjestelmällinen katsaus ja meta-analyysi. PLoS ONE 8 (9): e75283. doi: 10,1371 /journal.pone.0075283

Editor: Ken Mills, Belfastin yliopisto, Iso-Britannia

vastaanotettu: toukokuu 20, 2013; Hyväksytty: 14 elokuu 2013; Julkaistu: 20 syyskuu 2013

Copyright: © 2013 Pan et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat avustusta China National Natural Science Foundation (81272809); Tuetaan tieteen ja teknologian suunnittelu projekti Guangdongin (2011B050400021) ja Guangdong Key Laboratory of Urology, ensimmäinen Affiliated sairaala Guangzhou lääketieteellisen yliopiston (2010A060801016). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Eturauhassyöpä on edelleen yksi yleisin syy syöpään liittyvän kuoleman miehillä Yhdysvalloissa, arviolta 29720 kuolemantapausta ennustettu vuonna 2013 [1,2]. Eturauhassyöpä on parannettavissa, jos havaitaan varhaisessa vaiheessa mukaan eturauhasen ja eturauhasen antigeenin (PSA) seerumissa [3]. Herkkyydellä 80%, PSA lisää merkittävästi varhainen diagnoosi eturauhassyöpä, mutta PSA on vain 20%: n spesifisyys, mikä voi johtaa tarpeettomiin koepaloja ja ylihoito [4]. Siksi diagnoosi ja hoito ovat sekoitti puute syöpää erityisiä diagnostisia menetelmiä voidaan käyttää aikana alkuvaiheessa tauti. Novel lähestymistapoja lopullista havaitsemista ja valvontaa tämän syövän kiireellisesti.

Molecular tutkimukset ovat paljastaneet merkittäviä tapahtumia eturauhassyövän kehitykseen ja etenemiseen sekä uusien biomarkkereiden voi parantaa eturauhassyövän diagnoosia [5]. Poikkeava DNA: n metylaatio geenin promoottorit on ominaista syöpäsoluja, ja useita geenejä epigeneettiseltä muuttaa syövän erityisellä tavalla. GSTP1 geeni promoottori metylaatio on laajalti tunnettu useita riippumattomia ryhmiä ja on todettu olevan olla diagnostista arvoa eturauhassyövässä [6,7]. Tähän mennessä yli sata geenejä raportoidaan metylointi tavoitteet eturauhassyövän, joka voi edustaa lupaavaa tapa seurata esiintymistä ja etenemiseen syövän [7-9]. Äskettäin seuraavan sukupolven sekvensointi perustuvat tutkimukset ovat kartoittaneet myös uusia kandidaattigeenit [10]. Kromosomaalinen alue 3p21 edellyttää usein tappio (heterotsygoottinen ja homotsygoottinen) useita kasvaintyypeissä, RAS yhdistys verkkotunnuksen perheen proteiini 1 A (RASSF1A) geeni sijaitsee tällä alueella, on otaksuttu kasvain vaimennin, joka jakaa suuren sekvenssihomologia tunnetun hiiren proteiini (Nore1) [11,12]. Tutkimukset ehdottaa rooli RASSF1 kuin efektori, joka etenee apoptoottisen vaikutuksia RAS sitoutumalla RAS on guanosiinitrifosfaatin riippuvaisella tavalla [13]. Hypermetylaatiota CpG-saarekkeiden sisällä RASSF1A promoottorialueen ovat merkittävä syy menetyksen ilmaisun [14]. Monissa kiinteitä kasvaimia, metylaatio RASSF1A on tunnistettu ja sen taajuus vaihtelee välillä 30% ja 50% [12]. Siksi RASSF1A metylointi vaikuttaa sen tuumorisuppressoriproteiinia roolista ja liittyy epäedullinen ennusteeseen [15,16].

Huolimatta useista yksittäisistä tutkimuksia eturauhassyöpäpotilailla, diagnostinen arvo RASSF1A metylaatiostatuksen eturauhassyövässä ja suhde RASSF1A metylaatio ja patologisia piirteitä tai kasvain vaiheessa edelleen kiistanalainen. Siksi Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli suorittaa meta-analyysi ennustetekijöiden arvosta RASSF1A metylaatiostatuksen eturauhassyövässä, ja suhde RASSF1A metylaatio ja patologinen vaiheessa Gleason pisteet, ja PSA taso. Olemme myös arvioinut herkkyys ja spesifisyys RASSF1A metylaation kehon nesteissä ja kudoksissa eturauhassyövän havaitsemiseen.

Materiaalit ja menetelmät

Tutkimus Selection

Aiemmin julkaissut artikkeleita että tutkittu RASSF1 promoottori DNA: n metylaatio eturauhassyövässä tunnistettiin kautta sähköinen haku PubMed käyttäen seuraavia avainsanoja; Eturauhassyöpä, PCA RAS yhdistys domain perhe protein1A, ja RASSF1A. Lisätutkimukset havaittiin kautta viiteluettelot tunnistettujen artikkeleita. Vain tutkimuksia julkaistaan ​​koko teksti artikkeleita Englanti olivat mukana tässä tutkimuksessa. Viimeinen haku suoritettiin maaliskuu 2013.

ja poissulkukriteereitä

Tutkimukset valittiin analysoitavaksi, jos ne täyttävät seuraavat kriteerit (1): mittaus DNA: n metylaation jollakin seuraavista näytteistä : veri, plasma, seerumi, virtsa tai eturauhasen kudoksia; (2) aiheita jokaisessa Tutkimukseen eturauhassyövän potilaiden ja ei-syöpä valvontaa; (3) Tiedot sisällytettiin analyysiin vain, jos koko artikkelin teksti oli Englanti. Hylkäämisperusteet olivat: (1) RASSF1A metylointi suorittaa vain solulinjoissa; (2) ei raakadataa saatavilla tai ei hakea lähtötietojen (3) tarkastelun paperit.

Tiedonkeruu

Jokaisessa tutkimuksessa kaksi riippumatonta tutkijat uutetaan seuraavat tiedot, jotka kuuluvat tekijän sukunimi, julkaisuvuosi, maan, rodun, tyyppi tapauksissa ja valvontaa. Lisäksi tietoja kerättiin myös tyypin suhteen määritysmenetelmän (esimerkiksi PCR), syöpä kliinisessä vaiheessa luokitusta, PSA, Gleason pisteet, alukkeiden sijainti, CpG sijainti ja alukkeita sekvenssi. Yksityiskohdat on esitetty taulukossa 1, Taulukko S2 ja Taulukko S3. Ennen teimme herkkyys ja analyysien tapauksessa ja ohjaus metylaation tiedot esitettiin taulukkomuodossa. Niistä mukana tutkimuksissa kahta ryhmää määrätty valvonta: normaali valvonta ja potilaat, joilla oli negatiivinen koepaloja mutta oli muita sairauksia kuten eturauhasen hyvänlaatuisen liikakasvun (BPH). Vain koepala vahvisti PCa ja eturauhasen korkean luokan intraepiteelisiin neoplasia (HGPIN) käsiteltiin tapausta. Siksi tosi positiivinen (TP) näytteet ainoastaan ​​niitä, jotka oli metylaatio indeksitapauksen, kun taas väärä negatiivinen (FN) on ilmoittanut ole metylaation keskuudessa tapauksessa näytteet. Samat määritelmät annetaan väärä positiivinen (FP) ja tosi negatiivinen (TN) kontrolleissa (taulukko S1).

Tekijän

Maa

Year

Näytteet Tool Menetelmät

Case

Ohjaus

Case Met

Case Umet

Ohjaus Met

Ohjaus Umet

1.Hoque et alUSA2005UrineQMSPPCaBPH /OCD tai Normal

# 38 (73,1%) 1410 (11,0%) 812. Roupret et alFrance2007UrineQMSPPCaNormal

# 74 (77,9%) 213 (7,9%) 353.Bastian et alPortugal2008SerumMSPPCaNormal

# 3 (1,4%) 2070 (0) 354.Roupret et alUK2008BloodQMSPPCaBPH41 (97,6%) 15 (22,7%) 175 .Maruyama et alUSA2002TissueMSPPCaBPH /Normaali * (7) 54 (53,5%) 475 (15,6%) 276.Kang et alKorea2004TissueMSPPCa /HGPINNormal

# 40 (78,4%) 110 (0) 207.Jeronimo et alPortugal2004TissueQMSPPCa /HGPINBPH117 (99,2% ) 128 (93,3%) 28.Yegnasubramanian et alUSA2004TissueQMSPPCaNormal * (12) 70 (95,9%) 30 (0) 259.Singal et alUSA2004TissueMSPPCaBPH40 (49,4%) 418 (19,0%) 3410.Woodson et alUSA2004TissueQMSPPCa /HGPINNormal * (11) 23 (67,6%) 110 (0) 1111.Florl et alGermany2004TissueMSPPCaNormal

# 88 (77,9%) 2519 (52,8%) 1712.Bastian et alGermany2005TissueQMSPPCaBPH36 (67,9%) 174 (28,6%) 1013.Cho et alKorea2007TissueMSPPCaBPH155 (86,6%) 247 (23,3%) 2314.Kawamoto et alJapan2007TissueMSPPCaBPH97 (74,0%) 3412 (18,5%) 5315.Syeed et alIndia2010TissueMSPPCaBPH17 (34,0%) 337 (15,6%) 3816.Vasiljevic et aluk /China2011TissuePYROPCaBPH44 (91,7%) 42 (6,9%) 27Table 1. Ominaisuudet sisältämien tutkimusten meta-analyysissä.

BPH, hyvänlaatuinen eturauhasen liikakasvu; MSP, Methlation-Specific PCR; QMSP, kvantitatiivinen reaaliaikainen metylaatiospesifisen PCR; PYRO, pyrosekvensointi; Met, metylointi; Umet, ei metylaatio; PCA Eturauhassyöpä; HGPIN, High Grade Postatic epiteelinsisäisen neoplasian, OCD, muut syöpäsairaus; * Suluissa valvonnassa sarake kertoo vastaaviin normaaleihin kudoksiin; # Osoittaa normaalia eturauhasen kudosta miehille ilman näyttöä eturauhassyövän. CSV Lataa CSV

Meta-analyysi ja tilastollinen analyysi.

Ristitulosuhde (OR), jossa vastaava 95% CI käytettiin tutkimaan eroja taajuutta RASSF1A metylaation välillä eturauhassyövän tapauksessa ja valvontaa. Samoin yhdistyksen välillä RASSF1A metylaatio ja eturauhassyövän patologinen vaiheessa Gleason pisteet, ja PSA-arvot tutkittiin. Arvioida heterogeenisuus tutkimuksissa, tilastollinen testi heterogeenisuus suoritettiin. Jos tutkimukset osoitettiin olevan homogeeninen P 0,05 Q-tilastot, yhteenveto OR laskettiin jonka kiinteiden vaikutusten malli, muuten satunnainen vaikutusten malli valittiin. Lisäksi ositettu analyysit suorittaa myös näytteitä ja menetelmät, meta-regressio käytettiin tutkittaessa heterogeenisyys lähde, ja herkkyysanalyysi, jonka yksi tutkimuksen meta-analyysi poistetaan joka kerta määrittää vaikutuksen yksilön datajoukon yleistä yhdistettyä OR, arvioimiseksi suoritettiin vakautta. Mahdollista julkaisu bias tutkittiin visuaalisesti suppilon kuvaajaa, jossa log [OR] vastaan ​​sen keskivirhe (SE), ja epäsymmetria testattiin Egger testi. Lopuksi trim-ja täyttö menetelmää käytettiin vetää vakaa johtopäätös. Tämä meta-analyysi suoritettiin käyttäen ohjelmistoa STATA 11.0. Kaikki p-arvot perustuvat kaksipuolisen testejä ja p 0,05 katsottiin tilastollisesti merkitsevä.

Herkkyys ja spesifisyys analysoitiin käyttämällä satunnaisia ​​vaikutusten mallien ja tässä analyysissa, sekä nesteen ja kudoksen alaryhmää käsitelty. Hyödynsimme yhteenvedossa vastaanottava ominaiskäyrän (S-ROC) käyrä, arvioida, onko vaihtelua kynnyksen määritelmä positiivinen tulos tuotti yhdistyksen välillä herkkyys ja arvot eri tutkimuksissa. Arvio regressioanalyysin log-riskisuhde kustakin tutkimuksen summa logits tosi-positiivisten ja väärien positiivisten käytössä S-ROC laskelmat. Kun regressio näiden määrien oli tyhjä, itsenäinen analyysit yhdistettyjen herkkyys ja käyttämällä yhtenäisiä menetelmiä binaaritietoja hyväksyttiin. Näissä olosuhteissa analysoitiin log-kertoimet mittakaavassa (esim varten erityispiirteet, vaikutus koko käytettiin log (Spec /(1-Spec)). Kaikki analyysit tehtiin STATA 11.0.

Tulokset

tutkimus ominaisuudet

yhteensä 16 tukikelpoisten tutkimuksessa, joihin osallistui 1431 tapauksia ja 565 valvontaa sisältyivät yhdistetyssä analyysit perustuvat kriteereillä [15-30]. ominaisuudet näistä tutkimuksista on esitetty yhteenvetona taulukossa 1. Niistä 16 tutkimuksissa, 12 tutkimuksessa käytettiin kudosnäytteitä ja 4 tunnettu siitä, kehon nesteet, kuten veri, virtsa mm. Metyloitunut RASSF1A tasot seurattiin käyttämällä joko metylaatiospesifisen PCR: llä (MSP), kvantitatiivinen metylaatio PCR (QMSP) tai pyrosekvensointi. Kaikki tapaukset olivat biopsialla vahvisti PCa tai HGPIN, kun tarkastukset rajoittuivat joko BPH, terveillä koehenkilöillä tai ne, joilla oli urogenitaalinen syöpä (virtsarakon syöpä) ja terveen eturauhasen. näytteet 11 tutkimukset olivat lähinnä aiheista valkoihoinen rotu, kun taas neljä tutkimusta ominaista näytteitä Aasian väestöstä, yksi tutkimukseen kuului potilaita useista kilpailuista peräisin eri maanosista. Eturauhasen syöpiä vahvistettiin patologisesti kaikissa tutkimuksissa.

Association between RASSF1A promoottorin metylaation ja patologinen vaiheessa Gleason pisteet, ja PSA-tasot PCA tapauksissa

Tarkat random-vaikutusten malli, yhdistetyssä OR of RASSF1A metylaation eturauhassyövässä tapauksissa verrattuna ei-syöpä valvontaa, oli 14,73 95% CI = 7,58-28,61 (taulukko 2). Vuonna ositettu analyysi näyte, merkittävästi lisääntynyt riski liittyi RASSF1A metylaation sekä nesteen näytteistä (OR = 26.27, 95% CI = 7,79-88,61) ja kudoksissa (OR = 12,28, 95% CI = 5,86-25,76). Kuten ositettu analyysi menetelmällä, merkittävästi suurentunut riski todettiin myös MSP (OR 6,75, 95% CI = 3,42-13,22) ja QMSP (OR = 31.50, 95% CI = 10,95-90,62) (kuvio 1A). Olemme myös analysoinut suhdetta patologinen vaiheessa Gleason pisteet, ja PSA-tasot PCa tapauksissa ja RASSF1A metylaatio. Seitsemän tutkimukset [17,19,21-23,25,26] oli riittävästi tietoa suorittaa tämän analyysin (taulukko S2), löysimme mitään merkittävää yhdistyksen välillä ryhmien kanssa sopivan malleja lukuunottamatta Gleason (OR = 2,35, 95% CI: 1,56-3,53, I

2 = 32,3%). Tiedot on esitetty taulukossa 3.

muuttujat

p

OR (95% CI) B heterogeenisuus Test (I

2, p-arvo) B RASSF1ATotal1614.73 (7,58-28,61) 75,5%, 0.000Sample TypeFluid426.27 (7,79-88,61) 56,6%, 0.075Tissue1212.28 (5,86-25,76) 75,5%, 0.000MethodQMSP731.50 (10,95-90,62) 61,8%, 0.015MSP86.75 ( 3,42-13,22) 67,9%, 0.003Pyrosequencing1148.50 (25,45-866,36) NATable 2. ositus analyysit RASSF1A metylaation ja eturauhassyövän riskiä.

MSP, metylaatiospesifistä PCR; QMSP, Quantitative reaaliaikainen metylaatiospesifisen PCR; OR, Odds Ratio, CI, luottamusväli;

Useat tutkimukset; NA, ei koske. CSV Lataa CSV

(A) Forest käyrä 16 tutkimukset osoittivat, että RASSF1A metylaatio liittyi PCa riskiä ositettu analyysi menetelmillä. (B) Forest juoni jälkeen herkkyysanalyysissä poistamisen 6 osoittivat saman riskin ilman heterogeenisuus (p = 0,089). Timantti symboli edustaa yleinen arvio meta-analyysi ja sen CI (luottamusväli), kun taas sen keskelle on sijoitettu arvo kokonaisvaikutus arvio. Diamond leveys kuvaa leveys koko CI.

Clinicopathology

Luokka

OR (95% CI) B heterogeenisuus testi (I

2, P-arvo)

Julkaisu bias testi (P-arvo) B Gleason scoreGS≥72.35 (1,56-3,53) 32,3%, 0.1820.40GS 7PSA levelsPSA 4 2,19 (0,27-17,76) 67,4%, 0.0460.04PSA≤4Pathological stageⅢ ⅳ2.01 ( 0,77-5,23) 68,4%, 0.0070.73Ⅰ ⅱTable 3. Association between RASSF1A promoottorin metylaation ja patologinen vaiheessa Gleason pisteet, ja PSA-tasot PCA tapauksissa.

OR, Odds Ratio; CI, luottamusväli; PSA, eturauhasen antigeenin; GS Gleason pisteet. CSV Lataa CSV

tulokset meta-regressio osoitti, että kehitys syrjäisimmillä alueilla korreloivat metyloinnin havaitsemismenetelmiä, jonka osuus osan heterogeenisuus (kerroin = -1,69, p = 0,024, oikaistu R

2 = 47.41% ), kuitenkin muut tekijät, kuten näytetyypeille (p = 0,525), julkaisuvuosi (p = 0,608), ja alkuperä potilaista (p = 0,847) eivät voisi selittää heterogeenisyys. Olemme myös Toteutettujen herkkyysanalyysien määrittämiseksi vaikutuksia jättämällä yhden tutkimuksen kokonaisvaikutus jossa kuusi riippumattomien tutkimusten havaittiin käyttöön joitakin lähde heterogeenisyys. Niinpä kun me suljettu kuusi tutkimuksia, todennäköisesti käyttöön korkeat heterogeenisyys johtuu erityyppisten tapausten ja kontrollien, havaitsimme lasku heterogeenisuus (p = 0,089) ja vakaa päätelmä (OR = 14.45, 95% CI = 8,35-25,01) ( Kuva 1B).

Emme havainneet mitään julkaisu bias (Egger testi; p = 0,066), ja edelleen vahvistanut tämän havainnon toteuttamalla leikata-ja-täyttö menetelmällä. Meta-analyysin kanssa tai ilman trim-ja-täyttö tapa ei tehdä erilaisia ​​johtopäätöksiä, mikä osoittaa, että tulokset olivat tilastollisesti varmana. Egger testi ehdotti ole julkaistu bias (P 0. 05) tutkimuksissa yhdistyksen välillä RASSF1A metylaatio ja patologinen vaiheessa tai Gleason (taulukko 3).

spesifisyys ja herkkyys RASSF1A promoottorin metylaation käyttäen erityyppisiä näytteiden

yhdistetty spesifisyys kaikki mukana tutkimuksissa oli 0,87 (95% CI: 0,72-0,94), ja yhdistetyt herkkyys oli 0,76 (95% CI: 0,55-+0,89). Perinteisten biomarkkereiden, herkkyys PSA vaihtelivat, mutta spesifisyys oli yleensä alhainen, noin 20%, mikä viittasi siihen, että RASSF1A metylointi testi on paljon suurempi spesifisyys kuin PSA-testi. P-arvo heterogeenisuus oli 0,001, osoittaa merkittävää heterogeenisyyttä. Ei ollut todisteita julkaisemisesta bias (p = 0,13). Lisäksi olemme luokitellaan kaikki näytteet kahteen ryhmään sen mukaan näytteen tyyppi (neste /kudosta). Niistä nesteen tutkimuksista (virtsa /veri /plasma), yhdistettyjen herkkyys ja spesifisyys oli 0,60 (95% CI: ,08-0,96) ja 0,93 (95% CI: 0,75-0,98), tässä järjestyksessä. Kudosten tutkimukset, yhdistetyt herkkyys ja spesifisyys oli 0,79 (95% CI: 0,64-0,89) ja 0,84 (95% CI: 0,63-0,94), vastaavasti, ja S-ROC-käyrä on esitetty kuviossa 2.

SENS: Herkkyys, SPEC: Spesifisyys, AUC: AUC-arvo.

keskustelu

tulokset meidän meta-analyysi osoitti, että RASSF1A metylaatio eturauhassyövässä merkittävästi liittynyt syöpäriskiä kun seurataan virtsassa, veressä tai kudosnäytteitä. Se oli myös liittyy lisääntynyt riski korkean Gleason. Yhdistetty spesifisyys (0,87) on RASSF1A oli paljon suurempi kuin spesifisyyttä PSA (20%). Lisäksi spesifisyys kunkin alaryhmän ositettu näyte tyypin pysyi yli 0,84 ja herkkyys RASSF1A pysyi myös korkealla 0,60. Nämä tulokset viittaavat siihen, RASSF1A promoottori metylaatio olisi arvokas biomarkkereiden diagnosoinnissa PCa.

DNA: n metylaatio on yhteinen mekanismi inaktivoimaan kasvaimen synnyssä syövät [10]. Seuranta poikkeava metylaatiovyöhykkeiden ovat auttaneet havaitsemisessa kasvainsolujen kliinisistä näytteistä kuten kudosbiopsioista tai kehon nesteistä. RASSF1A on oletettu tuumorisuppressorigeenin ja sillä on tärkeä rooli säätelyssä eri ihmisen kasvaimissa. Aiemmat raportit osoittivat, että geneettinen vaihtelu RASSF1A vaikuttaa eturauhassyövän alttiuden ja taajuus RASSF1A metylaatio havaittiin olevan merkitsevästi suurempi potilaiden ryhmässä verrattuna ohjaus [13]. Edelleen vahvistaa RASSF1A promoottori metylaatiostatuksen PCA potilaan diagnoosin, toteutimme meta-analyysi 16 tutkimuksessa, joihin osallistui 1431 tapauksia ja 565 valvontaa johtaa tarkemman arvion yhdistyksen. Tuloksemme ehdotti, että RASSF1A metylaatio on mahdollinen riskitekijä PCA kuin havaittu sekä kehon nesteen ja kudoksissa. Taajuus RASSF1A metylaation PCa tapauksissa oli 14,73 kertaa korkeampi kuin verrokeilla. Lisäksi johtuen eroista tapausten ja kontrollien välillä tutkimuksia, suoritimme herkkyysanalyyseja ja poistaa valitsemalla tutkimuksia, jotta tiedot saadaan homogeeninen ja havaittu mitään merkittäviä muutoksia johtopäätöksemme. Tärkeää on, usein metylaatio RASSF1A geenin osoitti merkittävää yhdistysten Gleason pisteet, vaikka se ei korreloinut patologinen vaiheessa tai PSA tasoa tässä tutkimuksessa.

Kuten aikaisemmin, PSA-testi oli vaihteleva herkkyys ja huono spesifisyys (noin 20%) [1]. Testit, jotka tarjoavat suurempi spesifisyys sijasta herkkyyttä ja täydentää PSA testaus on nykyinen vaatimus. Lupaavasti, tuloksemme osoittavat, että RASSF1A metylointi testaus on potentiaalia täydentää PSA koska sen korkea spesifisyys. Täällä uskomme vaiheittainen malli on enemmän hyötyä, jos PSA-testi on aluksi käyttää tunnistamaan potilaita, joilla on kohonnut PSA-arvot, jonka jälkeen RASSF1A metylaation testi lisätä totta positiivisuutta. Potilaat, joilla on negatiivinen RASSF1A testi voidaan sijoittaa valpas odottaa, kun taas yksilöiden myönteisiä tuloksia voidaan suositella koepaloja. Siten vaiheittainen vähentää huomattavasti tarpeettomasti koepalan suositukset perustuvat yksinomaan PSA-testauksen.

Tämä tutkimus on useita rajoituksia. Ensinnäkin heterogeenisuus menetelmiin kuten MSP, Q-MSP ja pyrosekvensointi seurata geenin promoottori metylaatio. Selvitysten perusteella, se on hyödyllistä, jos yhteisymmärrykseen voitaisiin saapunut standardin testaus. Sekvensointi pohjaiset tekniikat ovat yleensä katsotaan olevan ylivoimainen suorituskyky verrattuna menetelmiin, joissa käytetään PCR yksin. Nopeasti nopeutumiseen käyttäen seuraavan sukupolven sekvensointi (NGS) määritykset seurata genomista ja epigenomic muutokset varmasti tullessaan edistysaskeleista tällä alalla [31]. Voidaan ennakoida kattavien diagnostisten testien joka samanaikaisesti mittaavat transkriptio ilmaisun ja DNA metylaatiomuutokset paneelin biomarkkereiden tunnistamisen lisäksi geneettisiä poikkeamia kuten geenifuusioissa ja kopioluvun vaihtelut kullekin potilaalle [32]. Nykyinen tutkimus yhdessä muiden kanssa auttaa esivalinnassa biomarkkerit suuren potentiaalin annetaan erityistä huomiota, kun analysoidaan NGS tuloksia, jotka yleensä tuottaa pitkä lista metyloitu alueilla. Seuraavaksi monipuolinen näyte tyyppejä käytetään näissä tutkimuksissa, jotka sisältävät plasma, seerumi, virtsa, kokoveri ja kudoksia on potentiaalinen epäyhtenäisyys. Tässäkin kehittäminen korkean suorituskyvyn vankka määritysten korkea herkkyys ja spesifisyys voidaan saada helpotusta lähitulevaisuudessa.

Johtopäätös

Tämä meta-analyysi osoitti, että RASSF1A metylaatio eturauhassyövässä liittyi syöpäriski eri tutkimuspopulaatiossa. RASSF1A on lupaava biomarkkereiden seulontaan ja tunnistamiseen PCa varsinkin kun yhdessä PSA-testi alentaa nopeuden tarpeettomien koepaloja. Jatkotutkimuksissa suurempia näyte kohortti ja uudet määritykset perustuvat seuraavan sukupolven sekvensointi lähestymistapoja auttaa entisestään vahvistamaan havaintojemme.

tukeminen Information

Taulukko S1.

Ominaisuudet sisältämien tutkimusten meta-analyysi.

doi: 10,1371 /journal.pone.0075283.s001

(XLSX) B Taulukko S2.

Tiedot sisältämien tutkimusten meta-analyysi: Association between RASSF1A promoottorin metylaation ja patologinen vaiheessa Gleason pisteet, ja PSA-arvot.

doi: 10,1371 /journal.pone.0075283.s002

(XLSX) B Taulukko S3.

Yhteenveto alukesekvenssien käytetty metylaation tutkimuksessa RASSF1A.

doi: 10,1371 /journal.pone.0075283.s003

(XLSX) B

Kiitokset

Haluamme kiittää tohtori Srinivasan Yegnasubramanian (Johns Hopkins University) tarjoamiseksi liittyvä raakadataa ja Dr. Saravana Mohan Dhanasekaran (University of Michigan) keskusteltavaksi ja käsikirjoituksen valmistelu.