PLoS ONE: Korkean tason HOOK3 Expression on itsenäinen ennustaja huonon ennusteen Associated kanssa Perimän epävakaus Eturauhassyöpä

tiivistelmä

Hook mikrohaaroihin tethering proteiini 3 (HOOK3) on adapteri proteiini mikrotubulusten riippuvaisten solunsisäistä rakkula ja proteiinia kaupan. Sen arvioimiseksi roolin HOOK3 eturauhassyövässä analysoimme HOOK3 ilme immunohistokemiallisesti on TMA joka sisältää yli 12400 eturauhasen syöpiä. Tuloksia verrattiin kasvaimen fenotyypin ja PSA toistumisen sekä poikkeamia mahdollisesti määrittämällä tarkoituksenmukaiset molekyyli alatyyppejä kuten ERG asema ja deleetioita 3p13, 5q21, 6q15 ja PTEN. HOOK3 Immunovärjäyksen oli negatiivinen normaaleissa onteloerityssolut eturauhasen epiteelin, kun taas 53,3% on 10572 tulkittavia syöpien osoitti HOOK3 ilmaisua, jota pidettiin alhainen 36,4% ja korkea 16,9%: ssa tapauksista. Korkean tason HOOK3 ilmentyminen oli yhteydessä kehittynyt kasvain vaiheessa korkean Gleason pisteet, korkea leviämisen indeksi, positiivinen imusolmuke vaiheessa, ja PSA toistumisen (p 0,0001 kutakin). Prognostisia rooli HOOK3 ilmentymisen oli riippumaton perustettu kliinis-patologisten parametrit sekä ennen leikkausta ja leikkauksen jälkeisiä asetukset. Vertailut molekyylitason ominaisuuksia suoritettiin tehdä johtopäätöksiä mahdollisista toiminta HOOK3 eturauhasen. Vahva yhdessä kaikkien tutkittu poistot on sopusoinnussa rooli HOOK3 ylläpitämiseksi genomista eheys tukemalla asianmukaisen sentrosomimäärän kokoonpanoon. Löytäminen HOOK3 ilmentyminen 74% ERG positiivinen, mutta vain 38% ERG negatiivinen syöpiä (p 0,0001) ehdottaa lisäksi toiminnallisia vuorovaikutuksia näiden geenien. Lopuksi tulokset Tutkimuksemme tunnistaa HOOK3 vahvana ehdokkaana prognostinen markkeri ja mahdollinen rooli ylläpitää genomista eheys eturauhassyövässä, mikä voi olla mahdollisuudet sisällyttämistä kliiniseen rutiinia määrityksissä.

Citation: Melling N, Harutyunyan L, Hube-Magg C, Kluth M, Simon R, Lebok P, et ai. (2015) korkean tason HOOK3 Expression on itsenäinen ennustaja huonon ennusteen Associated kanssa perimän epävakaisuuden eturauhassyövässä. PLoS ONE 10 (7): e0134614. doi: 10,1371 /journal.pone.0134614

Editor: Zoran Culig, Innsbruck Medical University, Itävalta

vastaanotettu: 28 huhtikuu 2015; Hyväksytty: 10. heinäkuuta 2015 Julkaistu: 31 heinäkuu 2015

Copyright: © 2015 Melling et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään

Data Saatavuus: kaikki asiaankuuluvat tiedot kuuluvat paperin ja sen tukeminen Information tiedostoja.

rahoitus: kirjoittajat eivät tuki ja rahoitus raportoida.

kilpailevat edut: kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä olemassa.

Johdanto

Eturauhassyöpä on yleisin syöpä miehillä länsimaissa [1]. Vaikka useimmat kasvaimet ovat melko veltto kliinisen kurssin, eturauhassyöpä edustaa vielä kolmanneksi yleisin syy syövän liittyvän kuoleman miehillä. Perustettu ennustetekijöiden parametrit ovat Gleason luokalla kasvain määrin koepaloja, ennen leikkausta eturauhasen antigeenin (PSA), ja kliininen vaihe. Vaikka tilastollisesti voimakkaita, ne eivät riitä optimaalisen yksilöllisen kohtelun päätöksiä. On toivottavaa, että ymmärrettäisiin paremmin taudin biologian johtaa lopulta tunnistamiseen soveltaa kliinisesti molekyylimarkkereiden jotka mahdollistavat luotettavamman ennusteen eturauhassyövän aggressiivisuuden yksittäisillä potilailla.

Perheen ihmisen koukku mikrotubulia kiinniottamiseksi proteiineja (Koukut) käsittää kolme homologeja, HOOK1, HOOK2, ja HOOK3, joka ilmentyy runsaasti ihmisen soluissa. Koukut toimivat adaptoriproteiineja osallisena laittomaan kalvovesikkeleiden ja proteiini kompleksit pitkin mikrotubuluskimppujen välillä Golgin laitteeseen, sentrosomien [2-5], endosomeista [6] ja lysosomeihin [7]. Syöpä merkittävä rooli on ehdotettu erityisesti HOOK3 useista tutkimuksista löytää toistuvia muutoksia geenin. Esimerkiksi yhdessä tutkimuksessa raportoitu HOOK3: RET fuusio tapauksessa papillaarisen kilpirauhassyöpä, joka osoittautui onkogeenisen hiirimallissa ksenograftin syöpä mallin [8]. Toisessa tutkimuksessa havaittiin proteiini muuttavaa mutaatiota Tuntematon merkitys 2 48 ohutsuolen neuroendokriinisiä kasvaimia [9]. Lisäksi HOOK3 geeni sijaitsee 8p11, yhteinen keskeytyskohta monissa ihmisen kasvainten tyypit, mukaan lukien eturauhassyöpä [10,11]. Niinpä inaktivoivat rikkoutuminen mikä vähentää ilmentymistä HOOK3 havaittiin huomattava osa (9,0%) kasvaimia [11] tutkimuksessa 77 eturauhasen syöpiä.

Nämä havainnot sai meidät tutkimaan malleja HOOK3 ilmaisun eturauhassyövässä tarkemmin. Otimme hyödyntää myös ennestään kudoksen mikrosiru (TMA), joka sisältää 12000 eturauhassyöpä yksilöitä liitetty tietokantaan kliinistä seurantaa ja laaja molekyylitason tietoa. Meidän havainnot osoittavat, että korkea HOOK3 proteiinin ilmentymisen liittyy vahvasti haitallisia kasvaimen fenotyypin ja varhaisen PSA toistumista ja voivat itsenäisesti ennustaa huono tulos eturauhassyöpä.

Materiaalit ja menetelmät

Potilaat

eturauhasen näytteet olivat saatavilla 12427 potilaista, joille tehdään leikkaus välillä 1992 ja 2012 laitoksella urologian ja Martini Klinikat yliopiston Medical Center Hamburg-Eppendorf. Seuranta oli saatavilla kaikkiaan 12344 potilasta mediaani seuranta-36 kuukautta (vaihteluväli: 1-241 kuukautta, taulukko 1). Prostataspesifisen antigeenin (PSA) arvot mitattiin leikkauksen jälkeen, ja PSA toistumisen määritettiin ajankohtana, jolloin leikkauksen jälkeen PSA oli vähintään 0.2ng /ml ja lisäämällä myöhemmissä mittauksissa. Kaikki eturauhasnäytteissä analysoitiin standardin mukaisesti, mukaan luettuna täydellinen upottaminen koko eturauhasen histologista analyysiä [12]. TMA valmistusprosessi on selostettu aikaisemmin yksityiskohtaisesti [13]. Lyhyesti, yksi 0.6mm ydin otettiin edustajan kudoksesta korttelin päässä kullekin potilaalle. Kudokset jaettiin 27 TMA lohkoja, joista kukin sisältää 144-522 kasvainnäytteestä. Sisäisen valvonnan, kukin TMA lohko sisälsi myös erilaisia ​​kontrollisilkkipaperia, sisältää normaalit eturauhasen kudosta. Molekyyli tietokanta liitetty tähän TMA sisälsi tuloksia ERG ilmaisun 10678 [14], ERG hajota FISH analyysi 7099 (laajentunut [15]), poisto tila 5q21 (CHD1) in 7932 (laajeni [16]), 6q15 (MAP3K7) in 6069 (laajeni [17]), PTEN (10q23) in 6704 (laajeni [18]), 3p13 (FOXP1) in 7081 (laajeni [19]) syövät, ja Ki67 merkintöjä indeksi (Ki67LI) dataa 4426 syöpiä (laajentunut [20]).

Ethics selvitys

Käyttö arkistoituja diagnostisten jääneeseen kudosten valmistukseen kudossiruina ja niiden analysointi tutkimustarkoituksiin kuin sekä potilaan tietojen analysointi on hyväksynyt paikallisia lakeja (HmbKHG, §12,1) ja paikallisen eettisen komitean (Ethics provision Ärztekammer Hamburg, WF-049/09 ja PV3652). Paikallisten lakien, tietoisen suostumuksen ei tarvittu tätä tutkimusta varten. Potilastietoja /tiedot nimettömiksi ja de-tunnistettu ennen analyysiä. Kaikki työt on tehty noudattaen Helsingin julistuksen.

immunohistokemia

juuri leikattu TMA kohdat immunovärjättiin yhden päivän ja yhdessä kokeessa. Objektilasit parafiini ja altistetaan lämmön aiheuttamalle antigeenin haku 5 minuuttia autoklaavissa 121 ° C: ssa pH: ssa 7,8 Tris-EDTA-sitraattipuskuria. Affiniteettipuhdistettuja primaarista vasta-ainetta HPA024756 esiin proteiinia vastaan ​​HOOK homologi 3 rekombinanttiproteiinin epitooppi allekirjoituksen tunniste (KEEIAQRCHELDMQVAALQEEKSSLLAENQVLMERLNQSDSIEDPNSPAGRRHLQLQTQLEQLQEETFRLEA) (kanin polyklonaalinen vasta-aine, Sigma, St. Louis, MO, USA; laimennus 1: 150) käytettiin 37 ° C: ssa 60 minuutin ajan. Vasta- aineen validoitiin valmistaja, koska se esiintyi yksi vyöhyke ennustettu koko (83,1 kD) on western blot. Sitoutunut vasta-aine visualisoitiin sitten käyttämällä EnVision Kit (Dako, Glostrup, Tanska) mukaan val- mistajan suuntiin [15]. Vasta-aine on yleensä värjätään kasvaimen sytoplasmaan kaikissa soluissa (100%) tietyn kudoksen päällä. Värjäytymisvoimakkuus kaikista tapauksista oli siten semikvantitatiivisesti arvioitiin kolmeen ryhmään: negatiivinen, pieni (heikko tai kohtalainen) ja korkea (voimakas värjäytyminen intensiteetti).

Tilastot

Tilastolliset laskelmat suoritettiin JMP 10.0. 2 ohjelmisto (SAS Institute Inc., NC, USA). Virhematriiseja ja chi²-testi tehtiin etsimään assosiaatioita molekyyli parametrit ja kasvaimen fenotyypin. Eloonjäämiskäyrät laskettiin Kaplan-Meier. Log-Rank testiä sovellettiin havaita merkittäviä eroja ryhmien välillä. Varianssianalyysi (ANOVA) testiä sovellettiin etsiä assosiaatioita solujen lisääntymisen ja HOOK3 värjäystä. Coxin suhteellisen vaarat regressioanalyysi suoritettiin testata tilastollisen riippumattomuuden ja merkityksen välillä patologinen, molekyyli- ja kliinisten muuttujien. Erilliset analyysit suoritettiin käyttäen eri parametriryhmittelyt saatavilla joko ennen tai jälkeen eturauhasen.

Tulokset

Tekniset näkökohdat

yhteensä 10572 (85,0%) kasvaimen näytteistä oli interpretable meidän TMA-analyysi. Luopumissyitä informatiivinen tapauksissa (1855 läiskät, 15,0%) sisälsi puute kudoksen paikkoja TMA osassa tai puuttuminen yksiselitteistä syövän kudoksen TMA paikalla.

HOOK3 ilmentymistä normaalissa ja syöpä- eturauhasen solujen

kuvat ovat negatiivisia ja positiivisia HOOK3 immunovärjäyksin esitetään kuvassa 1. HOOK3 immunovärjäyksellä paikallistettiin solujen sytoplasmassa (kuvio 1c insertti). Normaaleissa kudoksissa, jotka ovat peräisin eturauhasen syöpä potilaista, ei esiintynyt värjäytyminen strooman ja onteloerityssolut, kun taas pohjapinta solut värjätään positiivinen (** kuvassa 1 d). Positiivinen HOOK3 immunovärjäys nähtiin 5636 meidän 10572 (53,3%) tulkittavissa eturauhasen syöpiä ja katsottiin alhainen 36,4% (kuvio 1 b) ja korkea 16,9% syövistä (kuva 1c).

(a) negatiivinen , (b) lievää (c) korkea intensiteetti värjäytymisen 10x, sisäkkeet 300x suurennus ja (d) negatiivinen normaalit onteloerityssolut ja positiivisia tyvisolujen (*) yhdessä korkean tason positiiviset syöpäkudoksen (**) samassa ytimeen 150x suurennuksella.

Assosiaatio TMPRSS2: ERG fuusio tila ja ERG proteiinin ilmentymistä

Sen arvioimiseksi, HOOK3 ilmentyminen liittyy TMPRSS2: ERG fuusio eturauhassyövissä, käytimme aikaisempien tutkimusten (laajentunut [14,15]. tiedot TMPRSS2: ERG fuusio tila saadaan FISH ollut saatavissa 6302 ja immunohistokemiallisesti peräisin 9370 kasvaimista arvioitavissa HOOK3 immunovärjäystä. tiedot sekä ERG FISH ja IHC oli saatavilla 6076 syövistä , ja samanlaiset tulokset (ERG IHC positiivinen ja tauon FISH tai ERG IHC negatiivinen ja puuttuvat tauon FISH) löydettiin 5811 ja 6076 (95,6%) syöpiä. Positiivinen HOOK3 immunovärjäyksellä liittyi TMPRSS2: ERG uudelleenjärjestelyn ja ERG positiivisuuden eturauhasen syöpiä. HOOK3 immunovärjäys nähtiin 74,3% ja 76,1% syövistä kanssa TMPRSS2: ERG fuusio havaita IHC ja FISH, mutta löytyy vain 38,2% syövistä ilman ERG värjäystä ja 44,1% syövistä ilman ERG uudelleenjärjestelyjä havaita FISH (p 0,0001 kukin , kuvio 2).

IHC = immunohistokemia; FISH = fluoresenssi in situ -hybridisaatio.

Association kasvaimen fenotyypin

Kun kaikki karsinoomien analysoida yhteisesti, korkean tason HOOK3 ilmentyminen oli merkittävästi sidoksissa kehittyneiden patologinen kasvain vaiheessa, korkea Gleason luokalla, imusolmukemetastaaseja (p 0,0001 kutakin) ja kirurgiset marginaali positiivisuutta (p = 0,0003). Mitään korrelaatiota ei havaittu korkean ennen leikkausta PSA-tasot (p = 0,7594; taulukko 2). Alaryhmäanalyysissä ERG-negatiivisia että positiivisia syöpiä paljasti samanlaiset tulokset (S1 ja S2 taulukot).

Association muiden keskeisten genomisen poistot

Aikaisemmat tutkimukset ovat osoittaneet, sillä erillistä molekyylien alaryhmiä eturauhasen syöpiä määritelty TMPRSS2: ERG fuusiot ja useita genomista poistot. Toiset ja meistä ovat aiemmin kuvattu voimakas yhteys PTEN ja 3p13 deleetiot ERG positiivisuutta ja 5q21 ja 6q15 poistojen ERG negatiivisuus [16-19]. Niin tutkia, onko HOOK3 ilmaisu saattaa liittyy erityisesti yksi näistä genomisen deleetion HOOK3 tietoja verrattiin ennestään havainnot PTEN (10q23), 3p13 (FOXP1), 6q15 (MAP3K7) ja 5q21 (CHD1) deleetioita. Analyysissä kaikki kasvaimet, HOOK3 ilmentymistä merkittävästi liittyy kaikkiin deleetioiden edellä mainitut (PTEN, 5q21 ja 3p13 (p 0,0001 kutakin), 6q15 (p = 0,003); kuvio 3a). Yhdistykset vaihtelivat kun Alaryhmäanalyysi tehtiin ERG negatiivinen (kuvio 3b) ja ERG positiivisia syöpiä (Kuva 3c). Täällä HOOK3 värjäytyminen korreloivat voimakkaasti deleetioita PTEN (p 0,0001 sekä ERG negatiivisia ja positiivisia syövät), 6q15 (molemmat p 0,0001) ja 5q21 (p 0,0001, p = 0,01 vastaavasti), mutta ei 3p13 deleetiot (p = 0,10 ja p = 0,73 vastaavasti).

(a) kaikki syövät, (b) ERG-negatiivinen, c) ERG-positiivisia osajoukko.

Assosiaatio kasvainsoluproliferaation ( Ki67 merkinnät index) B

Strong HOOK3 värjäytyminen oli merkittävästi sidoksissa kiihtyi soluproliferaatiota mitattuna Ki67LI kaikissa syövät sekä lomakelajitelmana syöpiä identtisillä Gleason (≤3 + 3, 3 + 4, 4+ 3, ja ≥4 +4, p 0,0001 jokainen, taulukko 3).

Association PSA toistumisen

seuranta oli saatavilla 9916 potilaalla on tulkittavissa HOOK3 immunovärjäyty- päälle TMA. Yksi merkittävä assosiaatio korkean tason HOOK3 ilmaisun ja varhaisen PSA toistumisen havaittiin, kun kaikki kasvaimet analysoitiin ja myös alaryhmäanalyyseissa ERG negatiivisia ja positiivisia syöpiä (p 0,0001 kutakin, kuvion 4a-4e).

(a) kaikista syövistä (n = 9540), (b) ERG-negatiivinen (ERG

-) syövät (n = 4732), (c) ERG-positiivisia (ERG

+) syövät (n = 3678 ), (d)

PTEN

poistamattomia (PTEN

norm) syöpiä (n = 4349), (e)

PTEN

poistetaan syöpiä (n = 1037).

monimuuttuja-analyysi

neljä erilaista monimuuttuja analyysit tehtiin arvioidaan kliinistä merkitystä HOOK3 sen erilaisissa skenaarioissa (taulukko 4). Skenaario 1 arvioi kaikkien leikkauksesta käytettävissä muuttujat, kuten patologiset kasvain vaiheessa patologinen imusolmuke tila (PN), kirurgiset marginaali tila, leikkausta edeltävän PSA-arvo ja patologinen Gleason arvosana jälkeen saatu morfologista arvio koko resekoitu eturauhasen. Skenaariossa 2, kaikki leikkauksen jälkeen käytettävissä olevat parametrit lukuun imusolmukestatuksesta sisällytettiin. Rationaalinen Tämä ratkaisu valittiin, että varoitus ja laajuudesta imusolmukedissektiossa ei ole vakioitu kirurgisessa hoidossa eturauhassyövän ja että ilman PN monimuuttujamenetelmin voi merkittävästi lisätä tapauksessa numeroita. Kaksi muuta skenaariota tarkoituksena on ollut mallin ennen leikkausta tilanteen niin paljon kuin mahdollista. Skenaario 3 mukana HOOK3 ilme, ennen leikkausta PSA, kliininen kasvain vaiheessa (CT vaihe) ja Gleason arvosana saatuna eturauhasen yksilö. Koska leikkauksen jälkeisen vakaa päätös kasvainten Gleason arvosana on ”parempi” kuin ennen leikkausta määritetty Gleason grade (ottaa näyte virheet ja näin ollen alle määrittämisensä yli kolmasosa tapauksista [21]), toinen monimuuttujamenetelmin lisättiin. Skenaariossa 4, ennen leikkausta Gleason arvosana saatu alkuperäisen koepalan yhdistettiin ennen leikkausta PSA, CT vaiheessa ja HOOK3 ilme. HOOK3 osoittautui riippumaton ennustetekijöiden parametri kaikissa skenaarioissa, kun kaikki kasvaimia ja myös alaryhmiä ERG negatiivisten ja ERG kasvaimia analysoitiin (taulukko 4). HOOK3 osoittautui riippumaton prognosticator riippumatta testattujen skenaarion tai alaryhmä (kaikki syövät: p = 0,0003 skenaariossa 1, p 0,0001 skenaariossa 2-4; ERG negatiivinen syövät: p = 0,0002 skenaariossa 1, p 0,0001 skenaariossa 2-4; ERG positiivinen syövät: p = 0,0381 skenaariossa 1, p = 0,0433 skenaariossa 2, p = 0,0006 skenaariossa 3, p 0,0001 skenaariossa 4).

keskustelu

tämän tutkimuksen tulokset osoittavat, että korkean tason HOOK3 ilme on itsenäinen ennustaja alussa PSA uusiutumisen eturauhassyövässä.

immunohistokemiallinen analyysi paljasti sytoplasmista HOOK3 värjäystä 85,0% ja 10.572 analysoitavissa eturauhasen syöpiä. Normaali eturauhanen epiteelin tyypillisesti osoittivat negatiivista tai heikkoa immunovärjääminen onteloerityssolut, kun taas pohjapinta ja stroomasolujen ei värjäytyä HOOK3. Että lisääntyvää HOOK3 vastaavuuksia syöpä aggressiivisuus on yhdenmukainen oleellista merkitystä HOOK3 säätelyn eturauhassyövän kehitykseen ja etenemiseen. Tiedot Human Protein Atlas (www.proteinatlas.org) näyttäisi osoittavan, että HOOK3 voidaan jopa säädetään muissa syöpätyyppejä, mukaan lukien peräsuolen syöpä, kohdun limakalvon syöpä, gliooma, keuhkosyöpä, lymfooma, ja kilpirauhasen syöpä [22].

vahva assosiaatio korkean tason HOOK3 ilmentymisen haitallisia kasvain ominaisuuksia, kuten pitkälle, korkea Gleason asteen, solmukohtien etäpesäkkeitä ja PSA toistumisen puoltaa käytännön merkitystä HOOK3 mittauksen ennusteen arvioinnissa. Tämä vahva HOOK3 ilmaisu liittyivät ennustetekijöiden merkitystä jopa osajoukko syöpien kätkeminen PTEN poistoja-yksi vahvimmista tunnetuista ennustetekijöiden markkereita eturauhassyövässä [18,23,24] -TÄYDENNYSKOULUTUS korostaa kliinisesti merkittävää roolia HOOK3 testaus. Tämä on sitäkin suuremmalla syyllä, koska ennustetekijöiden vaikutus HOOK3 oli myös riippumaton kliinisten ja patologisten parametrit. Laaja monimuuttuja mallinnus ehdottaa lisäksi, että HOOK3 saattaa olla kliinisesti käyttökelpoinen prognostinen markkeri sekä pre- ja postoperatiivinen skenaarioita. Ottaen huomioon, että kliininen biomarkkereiden on analysoitava biopsialaitteet ja ennen käsittelyä koskevia päätöksiä tehdään, on huomionarvoista, että lähestymistapamme analysoida molekyyli- ominaisuudet minuutti TMA kudosnäyte mitataan 0,6 mm halkaisijaltaan tarkasti mallien molekyylitason analyysit ydin neulabiopsiat jos toisiinsa määriä kudosten arvioidaan. Kuten TMA näytteitä ei juuri otettu ”pahin” alue kunkin kasvaimen vaan satunnaisesti sisällä edustavasta syöpä alue, meidän TMA paikka voisi olla mahdollisimman edustava ja ”pahin” alue kliinisen syövän tunnistettu joukko syöpä koepaloja.

ei tiedetä, kuinka HOOK3 voi edistää syövän kehittymisen ja etenemisen. Emme suorita omia toiminnallisia kokeita, mutta suuri määrä eturauhasen syöpiä mukana meidän projektin yhdessä laaja molekyylitason tietoa meidän kasvaimiin meille mahdollisuuden tehdä joitakin päätelmiä otaksuttu syöpää asiaankuuluvat roolit HOOK3 ”in silico”. Tämä lähestymistapa ”toiminnallinen molekyyliepidemiologiset” ensimmäinen osoitti, että HOOK3 ilmentyminen liittyy vahvasti klassista parametrien perimän epävakaisuuden, kuten esiintyvyys kromosomihäviämiä sekä kohonnut solujen lisääntymistä. Poistot eräiden pienten ja suurten kromosomialueita ovat tunnusmerkki eturauhassyöpää. Tietoja seuraavan sukupolven sekvensointi tutkimukset osoittavat, että nämä deleetiot ovat yleisempiä kuin mitään mutaatioita spesifisten koodaavien geenien ja monet näistä deleetioita on liitetty joko ERG positiivinen (ts PTEN ja 3p13) tai ERG negatiivinen syöpä (ts 6q15 ja 5q23). Tämä korkea HOOK3 ilmentyminen liittyy muita yleisemmin kaikkien analysoitiin poistot korostetaan mahdollinen osallistuminen HOOK3 on sääntelymekanismeissa genomista eheys. Tämä on yhdenmukainen aiemman työn, jotka osoittavat HOOK3 on merkitystä virheetön toiminta sentrosomien, koska se on välttämätöntä liikenteen ja dynaaminen kokoonpano centrosomal proteiinien [3,4]. Sekä kaataa ja kohdunulkoinen yliekspressio HOOK3 in solulinjassa malleissa seurauksena vaarantunut centrosomal toiminnot [3], hajanainen Golgin laite, häiritsi huonosti organisoitu mikrotubulusverkoston, ja lisääntynyt osa soluista on kaksi tai useampia ytimiä [5]. Lisäksi sentrosomimäärän poikkeavuuksia on yhdistetty aneuploidiaan eturauhassyövän ennen [25].

in silico lähestymistavan lisäksi osoittanut, että HOOK3 yliekspressio on vahvasti sidoksissa ERG aktivointia. Yli puolet kaikista eturauhasen syöpiä, erityisesti nuorten potilaiden, kuljettaa geenifuusioita yhdistää androgeenisäädellyn TMPRSS2-geenin kanssa transkriptiotekijä ERG [14,26]. Nämä genomista uudelleenjärjestelyt johtavat androgeeni-odotuksiin yliekspressio ERG kärsivillä soluissa [27] ja siten muuttunut ilmentyminen yli 1600 geenit eturauhasen epiteelisolujen [28]. On kuitenkin epätodennäköistä, että korkeat HOOK3 tasot ERG positiivisia syöpiä ohjaavat suoran aktivoinnin, koska HOOK3 promoottorialue puuttuu ERG sitoutumiskohtia. Vaihtoehtoiset selitykset positiivisen yhdistyksen HOOK3 ja ERG ilmaisu sisältäisi on välitön tai välillinen vuorovaikutus näiden kahden proteiineja. Se voi, esimerkiksi olla mahdollista, että HOOK3 -responsible kuljetusta varten centrosomal proteiinien-vuorovaikutuksessa centrosomal proteiineja, kuten integriini-sitoutuvan kinaasin (ILK), joka on asiaan toiminnalliset kumppani ERG [29,30]. ILK ja ERG on osoitettu yhteistoiminnallisesti ajaa pahanlaatuisiksi ja epiteelin-mesenkymaalitransitioon eturauhassyövässä [31].

Yhteenvetona Tutkimuksemme antaa näyttöä, että HOOK3 on itsenäinen prognosticator eturauhassyövässä. Meillä on siis ehdottaa, että HOOK3 ilmentymisanalyysiä on potentiaalia kliiniseen rutiinikäyttöön-joko yksin, tai todennäköisemmin, yhdessä muiden biomarkkerit. Meidän laajamittainen kudos microarray lähestymistapa jatkaa osoittautuu erittäin tärkeä edellytys jatkuvasti sopivien prognostisia biomarkkereita. Laajamittainen molekyyli tietokantoihin liittyvät suuriin TMA mahdollistaa myös rajoitettu toiminta-analyysejä ”in silico”.

tukeminen Information

S1 Taulukko. Kliinis-patologinen yhdistys HOOK3 immuunivärjäyty- ERG negatiivinen osajoukko.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0134614.s001

(DOC)

S2 Taulukko. Kliinis-patologinen yhdistys HOOK3 immuunivärjäyty- ERG positiivinen osajoukko.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0134614.s002

(DOC) B

Kiitokset

Kiitämme Janett Lüttgens , Sünje Seekamp ja Inge Brandt erinomaisen teknistä tukea.

Vastaa