Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Tutkimme miten ruumiin koon ja liikunnan vaikutuksen riskiä, ​​että CpG-saarekkeen methylator fenotyyppi (CIMP) kolorektaalisyövässä (CRC).

menetelmät

Alankomaissa seurantatutkimus (n = 120852), riskitekijöitä itse ilmoitettujen lähtötilanteessa vuonna 1986. Sen jälkeen 7,3 vuotta seurannassa, 603 tapausta ja 4631 osa-kohortti jäsenet olivat saatavilla. CIMP tilan mukaan WEISENBERGER markkereita määritettiin käyttämällä metylaatiospesifisiä PCR DNA parafiiniin kasvainkudoksessa. Hazard rate suhteet (HR) ja 95%: n luottamusväli CIMP (27,7%) ja ei-CIMP (72,3%) kasvaimet laskettiin BMI, BMI-vuotiaana 20, BMI muutos, housujen /hame koko, korkeus, ja liikunta .

tulokset

BMI mallinnettu per 5 kg /m

2 nousu liittyi sekä CIMP ja ei-CIMP kasvaimet kuitenkin HRS voitiin vähentää, kun lisäksi oikaistu housujen /hame koko . Housut /hame koko, per 2 koko kasvaa, liittyi sekä kasvain alatyyppejä, jopa oikaistu BMI (CIMP HR: 1,20, 95% CI: 1,01-1,43, ei-CIMP HR: 1,14, 95% CI: 1,04-1,28 ). Korkeus per 5 cm liittyi sekä kasvaimen alatyyppejä, mutta HRS voitiin vähentää, kun ruumiinpainoon suhteutettuna. BMI 20-vuotiailla positiivisesti liittyy suurentunut CIMP kasvainten ja yhdistys oli merkittävästi vähäisempää kuin CIMP kasvaimet (

P

-heterogeneity = 0,01). Fyysinen aktiivisuus käänteisesti liittyvät sekä alatyyppejä, mutta annos-vaste yhdistys havaittiin ainoastaan ​​ei-CIMP kasvaimet (

P

-trend = 0,02).

Johtopäätökset

ruumiin koon, erityisesti Keski adiposity, voi lisätä riskiä sekä CIMP ja ei-CIMP kasvaimia. Kehon rasvan nuorena voi differentiaalisesti vaikuttaa riskiä. Fyysinen aktiivisuus näyttää vähentävän riskiä CRC riippumatta näiden molekyylien alatyypeistä.

Citation: Hughes LAE, Simons CCJM, van den Brandt PA, Goldbohm RA, de Goeij AF, de Bruine AP, et al. (2011) Rungon koko, liikuntaa ja paksusuolisyövän riskin kanssa tai ilman CpG Island Methylator Fenotyyppikuvaus (CIMP). PLoS ONE 6 (4): e18571. doi: 10,1371 /journal.pone.0018571

Editor: Syed A. Aziz, Health Canada, Kanada

vastaanotettu: 15 helmikuu 2011; Hyväksytty: 04 maaliskuu 2011; Julkaistu: 05 huhtikuu 2011

Copyright: © 2011 Hughes et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Hanke rahoittivat World Cancer Research Fund (WCRF), myöntää # 2007/54 Matty P. Weijenberg. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

on hyvin hyväksyttyä, että indikaattorit energiatasapainoon vaikuttavat paksusuolen syövän riskiä (CRC). Korkea painoindeksi (BMI), vyötärönympärys, ja aikuisten aikuisiän pituus ovat selkeitä riskitekijöitä CRC, kun taas liikunta on osoitettu olevan suojaavia [1]. Vaikka CRC on yksi parhaista kuvattujen syöpien geneettisten ja epigeneettiset tapahtumat mukana [2] – [5], tiedetään vähän miten toimenpiteitä Antropometria ja liikunnan liittyvät eri molekyyli- osajoukkoja tämän taudin. Valaisemaan mahdolliset erot riskin välillä molekyylitason alatyyppien CRC voi johtaa ymmärtämään paremmin CRC, hoito ja ennaltaehkäisy. Tämä on erityisen tärkeää, kun maailmanlaajuinen ylipainon ja lihavuuden jatkaa kasvuaan.

Selvä ominaispiirre epigeneettiset epävakautta CRC on CpG-saarekkeen methylator fenotyyppi (CIMP), tunnettu lukuisia promoottori CpG-saarekkeen hypermetyloitunut kasvain suppressor- ja DNA: n korjaukseen geenit [6] – [9]. Tämä puolestaan ​​liittyy transkription vaiennettu geeniekspressiota [10]. Harvat tutkimukset ovat tutkineet yhdistysten välillä indikaattoreiden energiatasapainon ja CIMP asema, ja ne, jotka ovat vain pidetään BMI indikaattorina laitoksen koosta. Kun tapaus-verrokki-asetus, Slattery

et al.

Raportoitu yhdistyksen välillä korkea BMI ja CIMP alhainen, mutta ei CIMP korkea koolontuumoreissa [11], eikä yhdistyksen välillä BMI ja CIMP tilaansa peräsuolen kasvaimissa [12 ]. Voimakasta fyysinen aktiivisuus liittyi sekä CIMP korkea ja CIMP matala koolontuumoreissa, mutta ei peräsuolen kasvaimia [11], [12]. On oletettu, että DNA: n metylaatio on seurausta tulehduksen [13], [14]. Central painoindeksin liittyy myös krooniseen tulehdukseen [15]. Näin ollen, kun otetaan huomioon vyötärön ympärysmittaa riskitekijä CIMP lisäksi BMI on tärkeää. Lisäksi metylaatio on ajateltu olevan varhainen tapahtuma CRC [16], joten kun otetaan huomioon korkeus ja BMI nuorena voi myös olla informatiivinen kuin nämä muuttujat ovat osoitus

kohdussa

ja varhaisissa vastuut [17] .

Käyttämällä mahdollinen Alankomaiden seurantatutkimus ruokavalio ja syöpä (NLCS), tutkimme yhdistyksen välillä BMI, vaatteet kokoa (joka ilmaisee vyötärönympärys) ja liikunnan sekä riski kasvaimen ominaista CIMP . Lisäksi yritetään valaista jos ajoitus altistuminen on tärkeä moduloimiseksi tämän riskin, tutkimme myös yhdistysten mukaan BMI-vuotiaana 20, BMI muutos, ja aikuisten-aikuisiän pituus.

Tulokset

Baseline ja molekyylitason ominaisuudet on kuvattu taulukossa 1. Suhteellisesti CIMP CRC tapaukset olivat todennäköisemmin nainen, on kasvain proksimaalisessa paksusuolessa, ja olla vanhempia kuin ei-CIMP tapauksissa.

Associations välillä toimenpiteitä Antropometria, liikunnan ja CRC riskin mukaan CIMP tila on esitetty taulukossa 2. oikaistu ikä ja sukupuoli, BMI mallinnettu per 5 kg /m

2 kasvu tilastollisesti merkitsevää yhteyttä CIMP kasvaimia (HR 1,29, 95% CI: 1,01-1,66) ja tilastollisesti merkitsevä annos-vastesuhde havaittiin, kun mallinnus kvartiileja BMI (

P

-trend = 0,02). Kuitenkin, kun malleja vastavuoroisesti oikaistu housujen /hame koko, nämä yhdistykset suuresti vaimennettu. BMI oli myös positiivisesti, joskaan ei tilastollisesti merkitsevästi, joka liittyy ei-CIMP kasvaimia. Nämä olivat myös heikennettyjä kun keskenään oikaistu housujen /hame koon. HRS varten CIMP ja ei-CIMP kasvaimet eivät poikkea merkittävästi toisistaan ​​(

P

-heterogeneity = 0,78). BMI 20-vuotiailla mallinnettu per 5 kg /m

2 nousu liittyi suurentunut molemmat alatyyppiä, mutta HRS ei ollut tilastollisesti merkitsevä. Kun BMI vuotiaana 20 mallinnettiin kvartiileina, tilastollisesti merkitsevä suuntaus havaittiin CIMP kasvainten (

P

= 0,03). Tämä suuntaus tuli rajatapaus merkittävä kun malli sopeutettiin housujen /hame koko (

P

-trend = 0,07). Testin heterogeenisyys välillä kasvaimen alatyyppejä oli tilastollisesti merkitsevä suhteessa BMI 20-vuotiaana, vaikka oikaistu housujen /hame koko (

P

-heterogeneity = 0,01). Tilastollisesti merkittävää havaintoja havaittiin suhteessa BMI muutokseen.

Housut /hame koko, mallinnetaan kohti 2 yksikköä koko kasvaa, liittyi sekä CIMP (HR: 1,20, 95% CI: 1,05-1,37 ) ja ei-CIMP kasvaimet (HR: 1,14, 95% CI: 1,05-1,24) jälkeen monimuuttuja säädön, ja näiden järjestöjen pysyivät vaikka malleja vastavuoroisesti oikaistu BMI. Kun housujen /hame koko katsottiin likimääräisinä kvartiileja, testi kehitys oli merkittävä CIMP (p = 0,02) ja raja merkittävät ei-CIMP (

P

= 0,06) kasvaimia, vaikka nämä olivat heikennettyjä kun mallia olivat keskenään oikaistu BMI. Yhdistykset havaittu CIMP ja ei-CIMP kasvaimet eivät olleet tilastollisesti merkitsevästi erilaisia ​​keskenään (

P

-heterogeneity = 0,61).

Korkeus, mallinnettu per 5 cm kasvu liittyi sekä CIMP ( HR: 1,16, 95% CI: 1,01-1,33) ja ei-CIMP (HR: 1,10, 95% CI: 1,00-1,21) kasvaimia jälkeen monimuuttuja säädön. Rajatapaus tilastollisesti merkitsevä suuntaus havaittiin jäämisen riskiä CIMP kasvainten kun korkeus pidettiin kvartiileina (korkein vs. huonoin kvartaali HR: 1,45, 95% CI: 1,03-2,06;

P

= 0,06) (p- heterogeenisyys = 0,98). Yhdistykset olivat vaimenee kun malli on yhteisesti ruumiinpainoon suhteutettuna.

vähäinen liikunta viiteryhmäksi ei ollut käänteinen annos-vaste yhdistyksen välillä liikunnan ja CIMP kasvaimia, vaikka HR keskitason fyysistä aktiivisuus oli tilastollisesti merkitsevä (HR: 0,50, 95% CI: 0,30-0,82) (taulukko 3). Käänteinen yhdistys havaittiin annos-vaste muoti ei-CIMP kasvaimet (väli liikuntaa HR: 0,80, 95% CI: 0,61-1,04; korkea liikunnan HR: 0,69, 95% CI: ,47-,96;

P

-trend = 0,02), mutta yhdistysten kanssa CIMP ja ei-CIMP kasvaimet eivät eroa merkittävästi toisistaan ​​(

P

-heterogeneity = 0,33).

yhdistysten kasvain metylaation indeksin suhteessa antropometristen riskitekijöiden ja liikunnan esitetään taulukossa 4. ei ollut selvää suuntausta suhteessa aste metylaation, mutta kun mallinnetaan kohti 2 yksikön koon kasvu, housujen /hame koko liittyi annoksesta vaste tavalla kasvaimia näyttämällä korkein metylaation (4-7 geenit metyloitu HR: 1,29, 95% CI: 1,06-1,58;

P

-trend = 0,08).

keskustelu

Nämä tiedot viittaavat siihen, että aikuisten elin lihavuudesta ja korkeus voi lisätä riskiä CRC, mutta eivät differentiaalisesti liittyy CIMP ja ei-CIMP kasvaimia. Päinvastoin, BMI-vuotiaana 20 voi olla vahvempi riskitekijä CIMP + kasvaimia. Baseline liikunta näyttää vähentävän riskiä CRC riippumatta CIMP asemasta.

Merkittävä vahvuus Tämän tutkimuksen että selvitimme yhdistysten prospektiivisessa kohortissa ympäristössä. NLCS on lähes täydellinen toteamiseen paksusuolisyövän ja hyvin vähän tappio seuranta. Vaikka määrä koko CRC jälkeen 7,3 vuotta seurannan vuonna NLCS oli huomattava, tapausten määrä kanssa CIMP fenotyyppi oli pieni. Rajoitetulla voima havaita yhdistysten on mahdollista, että jotkut havainnot ovat syntyneet sattumalta. Toinen mahdollinen rajoitus Tämän tutkimuksen että antropometristen muuttujia saatiin itse raportissa. On kuitenkin olemassa monia esimerkkejä kirjallisuudessa osoittaa, että tämä menetelmä on kelvollinen ja luotettava väline arvioitaessa kehon painon ja korkeus kohorttitutkimusten [18] – [21].

Tietääksemme yhdistysten välillä indikaattorit energiatasapainon ja CIMP asema Kolorektaalituumorien on raportoitu vain Slattery

et al.

on tapaus-verrokki asetus [11], [12]. Sen lisäksi, että tutkimuksen suunnittelu, välillä on eroja meidän tutkimuksiin, jotka tulisi ottaa huomioon verrattaessa tuloksia.

NLCS hyödynnettiin WEISENBERGER paneeli geenien määrittelemiseksi CIMP (

CACNA1G, IGF2, NEUROG1, RUNX3

ja

SOCS1

), kun taas tutkimus Slattery

et al.

, hyödynsi Perinteinen paneeli (

MINT1, MINT2, MINT31, p16 ja hMLH1

) , sekä erilaiset raja-arvot määritellään CIMP kasvaimissa [22], [23]. ”Oikea” määritelmä CIMP on edelleen hyvin kiistanalainen aihe, sillä on erinomainen geeni paneeli ja asianmukaiset metylaation havaitsemiseen [12], [24]. Vaikka WEISENBERGER paneeli on validoitu, eri merkkiaineiden metylaatio saattaa olla enemmän tai vähemmän informatiivinen suhteen opiskeluun eri vastuita. Esiintyvyys CIMP että NLCS väestö on suurempi kuin tutkimuksessa Slattery

et al

. (27% vs. 11%) [12]. Kuitenkin ero pohjamaali malleja ja PCR-olosuhteet voivat merkittävästi muuttua herkkyys ja tietyn merkkiaine havaitsemiseksi CIMP CRC [25]. Näin ollen on todennäköistä, että erot esiintyvyyden eivät johtuen eri menetelmiä per se, vaan ero valita alukkeita. MSP analyysit on tehty vuonna NLCS on korkea ilmaisusignaalin, ja myöhemmin, muita yleisemmin CIMP on havaittu. Tässä tutkimuksessa olemme pyrkineet selvittämään havaintomme rakentamalla metylaation indeksi eri katkaisurajapisteet joka sisälsi seitsemän geenejä yleisesti metyloitavaa CRC.

Tässä tutkimuksessa katsottiin paksusuolen ja peräsuolen kasvaimet yhdessä kasvavan tilastollinen voima. Herkkyysanalyysi osoitti, että tämä ei bias havaintomme (tuloksia ei ole esitetty). Lisäksi ehdotamme, että ajatus yhdistää osa-lokalisoinneissa kasvaimet voivat olla hyväksyttäviä tutkittaessa molekyylien päätepisteitä, koska tämä voi auttaa selittämään eroja etiologiassa mukaan Saharan lokalisointi.

Havaitsimme, että BMI liittyvät sekä kasvain CIMP ja ei-CIMP kasvaimet; kuitenkin, kun säätö vaatteet kokoa, nämä yhdistykset katosi. Tämä on päinvastoin kuin tapauksessa, kohortti data viittaa siihen, että BMI liittyy ainoastaan ​​CIMP negatiivinen koolontuumoreissa eikä peräsuolen kasvaimia [11], [12]. Tutkimuksessamme housujen /hame koko näyttää olevan vahva, itsenäinen ennustaja molempien kasvaimen alatyyppejä, jopa oikaistu BMI. Tämä on loogista, koska vyötärönympärys, indikaattori keskeinen adiposity, on vahvempi ennustaja CRC kuin BMI [1], [26]. Kun katsotaan yhdistysten mukaan metylaation indeksin emme noudata selkeää yhdistysten suhteen BMI ja aste promoottorin metylaation kuitenkaan emme havaittu, että housujen /hame koko liittyi korkein metylaation. Että me havaittu assosiaatioita housujen /hame koon ja sekä CIMP ja ei-CIMP kasvaimia viittaa siihen, että keskeinen painoindeksin voivat vaikuttaa CRC riskiä sekä metylaation ja ei-metylaation kautta.

Vaikka hyvin harvat tutkimukset ovat harkita assosiaatioita BMI ja CIMP, useat ovat katsoneet tutkittavien ominaisuuksien samaa reittiä kuin CIMP. Kolorektaalisyöpä on erillinen molekyyli subsets, jotka kehittävät läpi erilaisia ​​reittejä [16]. Polku sahalaitainen adenokarsinooma näyttää ottaa yhden kahdesta pääväylien: perinteinen sahalaitainen polku tai sessile sahalaitainen polku [27]. Alustaan ​​kiinnittyneet hammastettu reitin on ominaista korkea CIMP,

BRAF

V600E mutaatioita, ja lopulta kehittyy mikrosatelliittien epävakaus (MSI) [27]. MSI voi toimia markkerina CIMP tai muiden molekyylien tapahtumia CRC [28], joten se voi olla informatiivinen harkita havainnot tässä tutkimuksessa yhteydessä, että tutkimus. Kaksi tapausverrokkitutkimukset ovat raportoineet, että BMI näyttää liittyvän microsatellite vakaa (MSS) kasvaimia, ja vähemmän MSI kasvaimia [29], [30]. Kumpikaan tutkimuksessa raportoitiin yhdistysten mukaan vyötärönympärys. Hiljattain yhdistetyn analyysin NLCS ja tietoja Melbourne Collaborative seurantatutkimus, havaitsimme vastaavia yhteyksiä, vaikka testi heterogeenisyys välillä kasvain alatyypeistä ei ollut tilastollisesti merkitsevä (Hughes

et al.

Toimitti).

on näyttöä siitä, että varhaisissa altistus vaikuttaa epigeneettisellä liittyviä mekanismeja aikuisten sairauden riskin [31], [32]. Siksi tutkimme myös assosiaatioita BMI-vuotiaana 20, BMI muutos, korkeus ja CIMP tila. Korkeus on merkkiaine koostetussa sikiön ja lapsuuden kokemus, ja voidaan pitää proxy toimenpide tärkeitä ravitsemuksellisia vastuita, jotka vaikuttavat useat hormonaaliset ja metabolisen akselit [17]. Vuonna NLCS, olemme havainneet, että lapsuuden ja nuoruuden energiaa rajoitus liittyy pienentynyt riski CRC myöhemmin elämässä [33], [34], jota tukevat muut väestön perustuvat tutkimukset [35] – [37]. Olemme myös hiljattain raportoitu, että altistuminen ankara energian rajoitus lapsuudessa ja nuoruudessa liittyi vähäinen riski sairastua CIMP kasvain [32]. Lisäksi yhdistetyt tiedot viittaavat siihen, että pitempi yksilöt on suurempi riski sairastua MSI kasvain (Hughes

et al

. Toimitettu). Esillä olevan tutkimuksen, korkeutta ei differentiaalisesti liittyy riski kasvainten kuitenkaan emme tarkkailla merkittävä heterogeenisyys suhteessa BMI 20-vuotiailla ja kasvaimen alatyyppejä. Yhdessä meidän havainnot viittaavat, että kehon kokoon voi differentiaalisesti vaikuttaa CIMP tila aikana eri ikäkausina, saattaa vaikuttaa myöhemmin CRC riski. Yhdistyksen välinen BMI 20-vuotiailla ja CIMP kasvaimia oli vahvempi kuin ei-CIMP kasvaimia, joka on yhdenmukainen aiempien havaintojen vaikean energian rajoittamisen lapsuudessa ja nuoruudessa. Vaikka bootstrap menetelmä on melko konservatiivinen, emme tarkkailla selvää yhteyttä suhteessa BMI 20-vuotiailla ja metylaation hakemisto ja siksi emme voi sulkea pois, että ero yhdessä CIMP tila on sattumalöydös. Hypoteesi, että ajoitus altistuminen voi vaikuttaa epigeneettisellä mekanismit vaatii lisätutkimuksia.

Tätä emme noudata mitään selkeää assosiaatiot BMI muutosta ja riskiä kasvainten oli yllättävää. Tämä saattaa tarkoittaa, että aineenvaihdunnan muutokset rasvakudoksen voi olla tärkeämpää moduloimiseksi riski ajan, mieluummin kuin BMI. Vaihtoehtoisesti otetaan huomioon miehet ja naiset yhdessä ehkä heikennetty nämä havainnot. Campbell

et al.

Raportoivat, että aikuisten painonnousu liittyi CRC miehillä, mutta ei naisilla, ja vain yksittäisten henkilöiden, jotka sai yli 21 kg, koska ikä 20 [29]. Lopuksi tarkastellaan vain kaksi ajankohtina ei voi olla osoitus tosi BMI muutoksen.

Meidän tulokset suhteessa liikunnan tukea niille Slattery

et al.

[11], ja ehdottaa, että korkea tasot päivittäisen liikunnan liittyy alentuneeseen riskiin sekä CIMP ja ei-CIMP kasvaimia. Havainnot suhteen meidän metyloinnin indeksin mukaan fyysinen aktiivisuus voi olla enemmän suojelevia kasvainten kasvaessa metylaatio, mutta lisää tutkimusta tarvitaan ennen lopullisia johtopäätöksiä voidaan tehdä.

Alustavat todisteet viittaavat siihen, että molekyylimarkkereina voidaan luokitella kolorektaalisyövissä erillisiin alatyyppeihin, joilla on vaikutusta sekä etiologian ja ehkäisyn [28]. Vähemmän kasvaimet syntyvät alustaan ​​kiinnittyneiden sahalaitaiset polku verrattuna perinteiseen adenooma polku [27], [38]. Koska ylipaino ja liikalihavuus ovat niin vahvoja riskitekijöitä CRC, on mahdollista, että nämä ehdot voivat differentiaalisesti vaikuttaa riskiä väyliä ja molekyylitason mekanismeja muuta kuin mitä me tässä tutkituista. Lisätutkimuksia tarvitaan selvittämään yhdistyksen välillä indikaattoreiden energiatasapainon ja epigeneettiset mekanismit johtavat CRC; edullisesti tulevaisuuteen kohortin ympäristössä, jossa on monia tapauksia [39]. Lisäksi, kuten alan molekyyli patologisen epidemiologian [40] kehittyessä menetelmästandardisointi ja määritelmiä molekyylitason päätepisteiden olisi käsiteltävä. Tämä tulee erityisen kriittinen, koska enemmän mahdollisuuksia yhdistämistä datan syntyä.

Yhteenvetona havaintomme osoittavat, että toimenpiteet Antropometria heijastaa suuren rungon koko lisäävät kummankin CIMP ja ei-CIMP kasvaimia, ja että rasvaa nuorena voi differentiaalisesti vaikuttaa riskiä. Fyysinen aktiivisuus näyttää vähentävän riskiä CRC riippumatta näiden molekyylien alatyyppejä. Havaintomme toistaa olevan tärkeää terveen kehon painosta suhteessa yleiseen CRC ehkäisyyn.

Materiaalit ja menetelmät

Tutkimus väestön ja muotoilu

NLCS on prospektiivinen kohorttitutkimus että aloitettiin vuonna 1986 tutkimaan yhdistyksen ruokavalion ja syövän kehittymisen. Se sisältää 58279 miestä ja 62573 naiset ikävälillä 55-69 vuotta lähtötilanteessa jotka suorittivat itsehallinnollinen ruokailutiheyskyselyn kyselyyn, johon 150 elintarvikkeita sekä kysymyksiä ruokailutottumuksiin, elämäntapa, terveys, ja väestötiedot. Kuntien rekisterit kaikkialta Alankomaista käytettiin olla tehokas otantakehikon. NLCS käyttää tapaus – kohortti lähestymistapa tietojenkäsittely- ja analysointi; tapauksessa kohteet olivat peräisin koko kohortin, ja määrä henkilötyövuosien vaarassa koko kohortin arvioitiin sub kohortin 5000 miehiä ja naisia, jotka olivat satunnaisesti näytteet koko kohortin lähtötilanteessa. Kaikki sub kohortti jäsenet, jotka ilmoittivat vallalla syöpä (lukuun ottamatta ihosyöpä) lähtötilanteessa jätettiin pois analyyseistä, jättäen 4654. Lisätietoja on NLCS suunnittelu on kuvattu [41] – [43].

Tapahtuma CRC tapaukset olivat tunnistetaan vuosittain tiedostojen yhdistämistä yhdeksään alueelliseen syöpärekisterit ja kansallinen patologia tietokanta (PALGA) [44]. Täydellisyys syöpää seurannan on lähes 100% [45]. Parafiiniin kasvaimen materiaalia CRC potilaista oli irrotettu, kuten aiemmin on kuvattu [46]. Kaikkiaan 734 tapaus CRC potilasta tunnistettiin seurantajakson aikana 7,3 vuotta lähtötilanteessa, lukuun ottamatta ensimmäistä 2 vuoden seurannassa, joista noin PALGA raportin vaurion sekä riittävän DNA oli saatavilla [46].

tutkimusprotokolla hyväksyi Medical eettisten toimikuntien yliopistollisen sairaalan Maastrichtin ja TNO Nutrition. Rekrytointiin, osallistujat ilmoitettiin kirjallisesti lisätietoja tutkimuksesta ja sen tavoitteista. Mukaisesti säännösten tuolloin kirjallinen suostumus saatiin, kun osallistujat palasivat täytetyn perustason kyselyyn. Kasvain kerättiin hyväksynnän jälkeen eettisen hallituksissa Maastrichtin yliopisto, National Cancer Registry, ja PALGA.

toteamiseen riskitekijöiden

Antropometriset muuttujia.

Korkeus ( cm), paino (kg), ja kehon paino 20-vuotiailla (kg) oli itse ilmoitettujen pohjaviivalle kyselyyn. Näistä muuttujista, BMI ja BMI 20-vuotiaana, ja BMI muutos sittemmin laskettiin. Lähtötilanteessa yksilöitä pyydettiin myös ilmoittamaan alavartalon (housujen tai hameen) vaatteet kokoa niiden vaatemerkki (hollantilainen kokoja). Housut /hame koko on osoitettu olevan riittävä proxy toimenpide vyötärönympärys ennustettaessa syövän riski NLCS, ja tiedot siitä, miten vaatteet kokoa vastaa vyötärön mittauksia miehillä ja naisilla tässä alankomaalaisista on julkaistu [47]. BMI, BMI 20-vuotiaana, hame /housut kokoa, ja korkeus oli luokiteltu arvioitu sukupuoleen erityisiä kvartiiliin. Kuten aiemmissa NLCS analyyseissä, BMI muutos luokiteltiin: 0 kg /m

2, 0-4 kg /m

2, 4-8 kg /m

2, ja 8 kg /m

2 [48].

fyysinen aktiivisuus.

Mitä tulee liikunnan ja CRC riski NLCS väestön ammatillista liikunta näyttää olevan tärkeämpi miehille ja vapaa-ajan liikuntaa naisille ennustamiseen riskin (Simons

et al.

toimitti). Siksi käytimme nämä kaksi muuttujaa luoda sukupuoleen tiettyjä ”alhainen”, ”keskitason” ja ”korkean” liikuntaa.

Occupational liikunnan johdettiin tiedot osallistujien ammatillista historiaa. Käyttämällä tietoa työn tyypin ja keston, energian kulutusta ja istuu aika laskettiin pisin ja viimeinen arkiston työn. Energiankulutus perustui luokitus kehittämä Hettinger

et al.

[49] ja erottelee työtä matala, kohtalainen ja korkea aktiivisuus, joka vastaa energiamäärää 8, 8-12 ja 12 kJ /min. Men luokiteltiin osaksi ”matalan” ryhmään, jos heidän ammatillista liikunta oli 8 kj /minuutti, ”keskitason”, jos ne joutuivat 8-12 kJ /minuutti luokka, ja korkea, jos heidän ammatillista liikunta oli 12 kJ /minuutti.

Baseline kuin ammatillista liikuntaa laskettiin kaksi kysymystä. Ensimmäinen (avoin) kysymys oli ”Kuinka monta minuuttia vietät keskimäärin päivässä kävely tai pyöräily työsi, käydä ostoksilla tai ottaa koiran?” Raportoitiin aika päivässä luokiteltiin ≤10, 10-30, 30-60 ja 60 minuuttia päivässä. Toinen kysymys oli ”Kuinka monta tuntia vapaa-aikaa vietät keskimäärin viikossa 1) vapaa pyöräily, kävely, 2) puutarhanhoito /tekee hanttihommia ja 3) urheilu, voimistelu?” Vastaaminen mahdollisuudet eivät koskaan, 1 tunti viikossa, 1-2 tuntia viikossa ja 2 tuntia viikossa. Käytetty aika näitä toimia ja minuuttia vietti päivässä kävely tai pyöräily töihin, käydä ostoksilla tai ottaa koiran laskettiin yhteen saada kokonaiskuva mitta lähtötilanteessa kuin ammatillista liikunnan, jossa luokat 30, 30-60, 60-90 ja 90 minuuttia päivässä. Matala fyysinen aktiivisuus määriteltiin 30 minuuttia /päivä, väli- kuten 30-90 minuuttia /päivä, ja jopa yli 90-minuuttia /päivä.

Promoottori Metylointi Analyysit

CIMP kasvain kudokseen CRC tapauksissa määriteltiin CpG-saarekkeen promoottori hypermetylaatiota vähintään 3 out of 5 metyloinnin markkereita (

CACNA1G, IGF2, NEUROG1, RUNX3

ja

SOCS1

) ehdottamalla tavalla WEISENBERGER

et ai.

[9] määritettiin bisulfiittimodifikaatio 500 ng genomista DNA: ta käyttämällä kaupallisesti saatavilla olevaa kittiä (Zymo Research), ja sen jälkeen metylointi PCR (MSP) [50], [51]. Päätimme käyttää MSP menetelmänä, koska se on tehokas, erityinen eikä vaadi erityisiä laitteita. On osoitettu, että tulokset MSP ovat sopusoinnussa muiden teknologioiden, kuten MethyLightTM [52]. Lisäksi, metylaatiostatuksen kahden muiden geenien,

APC

ja

MLH1

, määritettiin ja lisäsimme ne CIMP markkereita luoda metylaation indeksi seitsemän geenejä.

helpottamiseksi MSP-analyysi DNA: noudetaan formaliinilla kiinnitetyt, parafiiniin upotettujen kudosten DNA amplifioitiin ensin rinnakkaistoimenpiteistä PCR-alukkeita, jotka monistavat bisulfiitti-muunnetun DNA: n, mutta ei edullisesti täydentää metyloituja tai metyloitumattoman DNA: ta. Saatu fragmenttia käytettiin templaattina MSP reaktiota. Kaikki PCR: t suoritettiin hallintalaitteet metyloitumattoman alleelien (DNA normaalista lymfosyytit), metyloituja alleeleja [normaali lymfosyytin DNA käsiteltiin

in vitro

kanssa

Sss

I metyylitransferaasin (New England Biolabs, Ipswich, MA )] ja ohjaus ilman DNA: ta. Kymmenen mikrolitraa kutakin MSP reaktio suoraan ladattiin denaturoivassa 6% polyakryyliamidigeeleillä värjätty etidiumbromidilla ja visualisoitiin UV-valo. MSP analyysit onnistuivat 81%, 79%, 79%, 90%, 83%, 93%, ja 93% pois 734 tapauksissa

CACNA1G, IGF2, NEUROG1, RUNX3, SOCS1

,

MLH1

, ja

APC

vastaavasti.

Tilastolliset analyysit

Data analysoitiin Stata (versio 10, Statacorp, College Station, TX, USA). Coxin suhteellisten riskien analysoinnin tapauskohtaisesti kohortti lähestymistapaa käytettiin saamiseksi hazard ratio (HR) ja 95% luottamusvälit (CI) yhdistyksen välillä toimenpiteiden Antropometria sekä liikunnan ja CRC ominaista CIMP tila. Parantaa tilastollinen voima, me pidetään miesten ja naisten yhdessä. Testit vaikutus muutokseen, sukupuolen eivät olleet tilastollisesti merkitseviä. Suhteellinen vaarat oletus testattiin käyttämällä skaalata Schoenfeld jäännösten ja silmämääräinen tarkastus vaaran käyriä. Jotta voidaan ottaa huomioon ylimääräisiä varianssi käyttöön ottamalla näytteitä subcohort alkaen koko kohortin, keskivirheet arvioitiin käyttäen vankka vaihtoehto. Tilastollinen merkitsevyys testattiin tasolla 0,05.

Kaikille antropometristen muuttujien osalta, kolme mallia pidettiin. Ensimmäinen säädettiin vain ikä ja sukupuoli. Toinen oli lisäksi säätää muuttujia tunnistaa, koska ne liittyvät sekä CRC ja energiatase edellisten kirjallisuudesta. Näihin sisältyy suvussa CRC (kyllä ​​/ei), tupakoinnista (ei tupakoitsija, entinen tupakoitsija, nykyinen tupakoitsija), sosioekonominen asema (koulutustaso: peruskoulun, yläasteella, lukion, ammatillisen korkea-asteen koulu, tai yliopisto ), kokonaisenergian saanti (kcal /vrk), alkoholin nauttiminen (0, 0,1-4, 5-14, 15-29, ≥30 g /vrk), fyysinen aktiivisuus (matala, keskitaso, korkea kuten aiemmin on kuvattu), ja kulutus punaisen lihan, hedelmien, vihannesten ja jyvät (g /vrk). Lopuksi malleja vastavuoroisesti oikaistu muiden antropometrisiä muuttujia. Mallit myös BMI ja BMI 20-vuotiailla olivat keskenään oikaistu hame /housut kokoa, BMI muutos sopeutettiin BMI-vuotiaana 20, housujen /hame koko oikaistiin BMI, ja korkeus oli ruumiinpainoon suhteutettuna.

me mallinnettu liikuntaa ikä- ja sukupuoli, ja lisäksi oikaistuna housujen /hame koko, suvussa CRC (kyllä ​​/ei), tupakointi asema (ei tupakoitsija, entinen tupakoitsija, nykyinen tupakoitsija), sosioekonominen asema (koulutustaso: peruskoulun, yläasteella, lukion, ammatillisen korkea-asteen koulu, tai yliopisto), kokonaisenergian saanti (kcal /vrk), alkoholin nauttiminen (0, 0,1-4, 5-14, 15-29, ≥30 g /vrk ), vaatteet kokoa, ja kulutus punaista lihaa, hedelmiä, vihanneksia, ja kuidun (g /vrk).

Sen arvioimiseksi, miten toimenpiteiden Antropometria ja liikunnan liittyivät laajuudesta promoottorin metylaation CRC kasvaimissa käytimme edellä mainittu metylaatio indeksin luokitella tapauksissa jakaa kolmeen ryhmään: ”0-1 geenejä metyloidut”, ”2-3 geenejä metyloidut”, tai ”4-7 geenejä metyloitu”. Niistä 734 tapauksessa 556 oli riittävät tiedot luokitellaan johonkin kolmesta luokasta. Mallit myös antropometriset muuttujat oikaistiin iän, sukupuolen, ja vastavuoroisesti oikaistu muiden antropometristen muuttujien kuten aikaisemmin on kuvattu, ja malli liikunnan oikaistiin iän ja sukupuolen.

Testit heterogeenisuus tehtiin arvioimaan eroja alatyyppiä kasvaimet (esim

CIMP vs. muu CIMP

) käyttäen kilpailevien riskien menettelyn STATA. Kuitenkin SE ero log-riskisuhteita tältä vaiheessa oletetaan riippumattomuus sekä arvioidun riskisuhteita, mikä yliarvioisi että SE ja näin yliarvioida

P

arvoja niiden erotus. Siksi nämä

P

arvot ja niihin liittyvät luottamusvälit arvioitiin perustuen bootstrapping menetelmää, joka kehitettiin asia kohortti suunnittelu, kuten aiemmin on kuvattu [53]. Kukin bootstrap analyysi perustui 1000 Toistoja.

Kiitokset

Olemme kiitollisuudenvelassa osallistujien tämän tutkimuksen ja kiitän syöpärekisterit (IKA, IKL, IKMN, IKN, IKO, IKR, IKST , IKW, IKZ, ja VIKC) ja Alankomaat Nationwide rekisterin patologia (PALGA). Kiitämme myös S van de Crommert ja J Nelissen niiden apua tietojen syöttö ja tietojen hallinta; Volovics ja A Kester tilastollisiin neuvoja; L Schouten, C de Zwart, M Moll, W van Dijk, M Jansen, ja A Pisters apua; ja H van Montfort, T van Moergastel, L van den Bosch, ja R Schmeitz ohjelmoinnista apua; K Wouters, S Hulsmans, ja A Spiertz laboratoriotutkimuksia apua.