PLoS ONE: korkea LINE-1 hypometylaatio on ainutlaatuinen ominaisuus on varhain alkanut peräsuolen Cancer
tiivistelmä
tavoite
varhain alkanut peräsuolen syöpä (CRC) edustaa kliinisesti selvä muodossa, CRC, joka liittyy usein huonoon ennusteeseen. Metylaatiotasoilla genomista toistojen kuten LINE-1 elementit on itsenäisinä tekijöitä kasvoi syöpään liittyvää kuolleisuutta. Metylaatiostatuksen LINE-1 elementtejä varhain alkanut CRC ei ole analysoitu aikaisemmin.
Suunnittelu
Analysoimme 343 CRC kudosten ja 32 normaalin paksusuolen limakalvon näytteitä, mukaan lukien 2 itsenäistä kohortteja CRC diagnosoitu ≤50 vuotias (n = 188), ryhmä satunnainen CRC 50 vuotta (MSS n = 89; MSI n = 46), ja ryhmä Lynch oireyhtymä CRC (n = 20). Kasvain mismatch korjaus proteiinin ilmentymisen, mikrosatelliittien epävakaus asema, LINE-1 ja
MLH1
metylaatio, somaattinen
BRAF
V600E mutaatio, ja ituradan
MUTYH
mutaatioita arvioitiin.
tulokset
Mean LINE-1 metylaatiotasoilla (± SD) viidessä tutkimuksessa ryhmät olivat varhain alkanut CRC,