PLoS ONE: arviointi Association of Eight polymorfismit syöpä herkkyys on han-kiinalaisten Väestö

tiivistelmä

Background

tunnistaminen alttiusgeeniyhdistelmiä tiettyjen syöpätyyppien voi antaa tarvittavat tiedot täydellinen kuvaus syöpien hoitamiseksi. Kahdeksan yhden emäksen monimuotoisuus (SNP), rs465498, rs17728461, rs4488809, rs753955, rs13361707, rs9841504, rs2274223, ja rs13042395, raportoi genomin laajuinen yhdistys tutkimukset (GWASs) liittyvän läheisesti alttiuteen sairastua keuhkosyöpään (LC), mahalaukun syöpä (GC) tai ruokatorven syöpä (EY) Han väestöstä Pohjois tai Etelä-Kiinassa. Kuitenkin kiinalaiset Han ihmiset eri maantieteellisillä alueilla voi olla eri geneettisiä taustoja. Tutkimuksen tavoitteena on arvioida geneettisiä kytkentöjä kahdeksan SNP edellä mainitut kolme syöpien riskin Han väestön Luoteis-Kiinan.

Methods

yhteensä 186 syöpää vapaa ohjaimet ja 436 tapausta ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC) (159 tapausta), ei-cardia GC (167 tapausta) tai EY (110 tapausta) oli mukana tässä tutkimuksessa. Chi-square testi ja polytomous logistinen regressio analyysejä käytetään arvioitaessa yhdistyksen kahdeksasta syöpään liittyvien SNP ja kolme syöpien Han Kiinan väestöstä Luoteis-Kiinassa. Logistisen regression tulokset korjattiin häiritsevien tekijöiden ja Benjamini ja Hochberg False Discovery Rate (FDR) menetelmää käytettiin säätämään useita hypoteesitestejä. Association analyyseja tupakointi tai alkoholin juominen tila analysoitiin crossover analyysejä.

Tulokset

Yksi kahdeksasta SNP, rs17728461 liittyi NSCLC alttius (heterotsygoottiseen malli, OR = 0,44, 95% CI = 0,27-0,72,

p

= 0,001). Kaksi SNP, rs753955 ja rs13042395, liittyi riski ei-cardia GC eri geneettisten mallien (

p

0,05). Ei SNP liittyi EY. Crossover analyysit osoittivat, että rs13042395 CT genotyypin yhdistettynä tupakointi tai alkoholin käytöllä voitaisiin entisestään lisätä riskiä ei-cardia GC (

p

0,05).

Johtopäätökset

Nämä tulokset osoittivat, että rs17728461 voi erikseen liittyvän riskin NSCLC. rs753955 ja rs13042395 olivat nimenomaan liittyvät alttiuteen kuin cardia GC Ningxia Han-kiinalaisia. Herkkyys liittyvä polymorfismien luoteisosassa Han-kiinalaiset eivät olleet kovin yhdenmukaisia ​​pohjoisen Han-kiinalaiset tai Etelä Han-kiinalaisia. Validointi Näiden havaintojen toimiva arviointi ja suurempaan joukkoon on edelleen tarpeen.

Citation: Dong Y, Chen J, Chen Z, Tian C, Lu H, Ruan J, et al. (2015) arviointi Association of Eight polymorfismit syöpä herkkyys on han-kiinalaisten Population. PLoS ONE 10 (7): e0132797. doi: 10,1371 /journal.pone.0132797

Toimittaja: Scott M. Langevin, University of Cincinnati College of Medicine, Yhdysvallat

Vastaa