PLoS One: A-alleelin at rs13419896 of EPAS1 liittyy Enhanced Expression ja huono ennuste for Non-pienisoluinen keuhkosyöpä
tiivistelmä
Hypoksia-indusoituva tekijä-2α (HIF-2α, tai EPAS1) on tärkeä syövän etenemistä, ja on otaksuttu biomarkkeri huono ennuste ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC). Kuitenkin molekyylitason mekanismeista EPAS1 yliekspressio ei vielä täysin ymmärretä. Selvitimme rooli yhden nukleotidin polymorfismi (SNP), rs13419896 sijaitsevat introni 1
EPAS1
geenin säätelyyn sen ilmaisua. Bioinformatiikan analyysit ehdotti, että alue sisältää rs13419896 SNP on rooli sääntelyn
EPAS1
geenien ilmentyminen ja SNP muuttaa sitoutumisaktiivisuutta transkriptiotekijöiden.
In vitro
analyysit osoittivat, että fragmentti, joka sisältää SNP lokuksessa toimivat säätelyalue ja että fragmentti
alleeli näytti korkeampi transaktivaation aktiivisuus kuin yksi
G
, erityisesti, kun läsnä on yli-ilmentynyt c-Fos tai c-jun. Lisäksi NSCLC potilaiden kanssa
alleeli näytti huonompi ennuste kuin ne, joilla on
G
klo SNP jälkeenkin säätö eri muuttujia. Lopuksi geneettistä vaihtelua
EPAS1
geeni voi johtaa vaihtelua sen geeniekspressiotasot ajaa syövän etenemisestä ja toimivat ennustetyövälineenä merkkiaine NSCLC.
Citation: Putra AC , Eguchi H, Lee KL, Yamane Y, Gustine E, Isobe T, et ai. (2015)
alleelin rs13419896 on
EPAS1
liittyy Enhanced Expression ja huono ennuste for Non-pienisoluinen keuhkosyöpä. PLoS ONE 10 (8): e0134496. doi: 10,1371 /journal.pone.0134496
Editor: Tiffany Seagroves, University of Tennessee Health Science Center, Yhdysvallat