PLoS ONE: kvantitatiivinen arviointi yhteisen perimä on FOXE1 ja kilpirauhassyöpäpotilailla riski

tiivistelmä

Forkhead laatikko E1 koodaa transkriptiotekijää FOXE1 (tai TTF-2), joka yhdessä Homeobox proteiinin NKX2-1, PAX8 ja HHEX, on keskeinen tarvittavia proteiineja kilpirauhanen muodostumisessa, erilaistumisessa ja toiminta . Äskettäin genomin laajuinen yhdistys tutkimukset ovat tunnistaneet

FOXE1

kuin kilpirauhassyöpä (TC) alttius geenin populaatioissa eurooppalaista syntyperää. Sen jälkeen useita tutkimuksia raportoitu, että rs965513, rs1867277, ja rs71369530 polymorfismi

FOXE1

on liitetty TC riskiä. Kuitenkin syy muunnokset eivät ole tiedossa. Johtamiseksi tarkemman arvion suhteen, meta-analyysi 9828 TC tapauksissa ja 109995 säätimet 14 tapausverrokkitutkimukset suoritettiin. Kaiken merkittäviä tuloksia havaittiin rs965513 (OR = 1,71, 95% CI: 1,59-1,85, P 10

-5), rs1867277 (OR = 1,64, 95% CI: 1,51-1,78, P 10

-5) ja rs71369530 (OR = 2,01, 95% CI: 1,66-2,44, P 10

-5) polymorfismi. Vuonna alaryhmäanalyysi etnisyys, huomasimme, että rs965513 polymorfismi antavat suuri riski valkoihoisten kanssa per-alleeli OR 1,80 (95% CI: 1,69-1,92, P 10

-5) verrattuna Itäaasialaiset 1,35 (95 % CI: 1,09-1,67, p = 0,006). Oli vahvaa näyttöä heterogeenisyys, jotka suurelta osin katosi jaottelu etnisyys. Vuonna alaryhmäanalyysi otoskoko, ja tutkimuksen suunnittelu, merkittävästi lisääntyneitä riskejä havaittiin polymorfismin. Kaiken kaikkiaan tämä meta-analyysi osoitti, että yhteinen muunnelmia

FOXE1

ovat riskitekijä liittyy lisääntynyt TC alttius.

Citation: Zhu H, Xi Q, Liu L, Wang J, Gu M (2014) kvantitatiivinen arviointi yhteisen perimä on

FOXE1

ja kilpirauhassyöpäpotilailla Risk. PLoS ONE 9 (1): e87332. doi: 10,1371 /journal.pone.0087332

Editor: Reiner Albert Veitia, Institut Jacques Monod, Ranska

vastaanotettu: 26 syyskuu 2013; Hyväksytty: 20 joulukuu 2013; Julkaistu: 29 tammikuu 2014

Copyright: © 2014 Zhu et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat National Natural Science Foundation of China (81272722). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

kilpirauhassyöpä (TC) on yleisin hormonitoimintaa maligniteetti, ja osuus 1% kaikista neoplasioihin [1]. TC on luokiteltu histologisesti neljään pääryhmään: papillaarinen (PTC), follikulaarinen (FTC), medullaarinen (MTC) ja erilaistumaton kilpirauhasen karsinoomat. Kaikkea kilpirauhasen kasvaimet ovat PTC (80-85%) tai FTC: n (10-15%) [2]. Vaikka etiologiaa tämä syöpä ei ole hyvin ominaista, kilpirauhassyövän uskotaan olevan monimutkainen sairaus, jossa yhteisiä geneettisiä variantteja sijaitsee matalan penetrance geenit voivat olla vuorovaikutuksessa keskenään ja ympäristön kanssa, vahvistettaessa yksittäisiä herkkyys. Jälkimmäisten joukossa, ionisoiva säteily, erityisesti altistuminen laskeuman radioaktiivisen jodin isotoopit lapsuudessa, voimakkaasti altistaa TC [3]. Osuus genetiikan riskin kilpirauhassyöpä on suurempi kuin minkä tahansa muun syövän, ja vaikutus ulottuu ydinperheen [4], [5]. Tunnistaminen ja lisäarvioinnista geneettistä vaihtelut ovat tärkeitä ymmärtämisen mahdollisia mekanismeja kilpirauhasen karsinogeneesissä.

Äskettäin näyttäviä ennakko tehtiin tunnistamisessa alttiita geenien TC kautta genomin laajuinen yhdistys strategia (GWAS) eurooppalaisten syntyperää [6], [7]. Useat viimeaikaiset tutkimukset ovat tunnistaneet yhden emäksen monimuotoisuus (SNP: t), jotka liittyvät TC riski kromosomeissa 5q24, 8q24, 9q22, ja 14q13 [6], [8] – [10]. Yhteinen geneettinen variantti (rs965513) on

FOXE1

kromosomissa 9q22, on tunnistettu uusi hotspot kilpirauhassyöpä herkkyyden äskettäisessä GWA tutkimus [6], [7].

FOXE1

hallussaan polymorfisen polyalaniiniin ruoansulatuskanavan (rs71369530) distaalinen sen DNA: ta sitovan domeenin, jossa on 11-22 alaniinitähdettä raportoitu, vaikka

FOXE1

14Ala ja

FOXE1

16Ala osuus on yli 98% raportoitu alleelien [11]. Äskettäin Landa et ai. [12] löytäneen vahvaa näyttöä siitä, että yksi SNP sijaitsee promoottorialueen

FOXE1

geeni (rs1867277) oli positiivisessa yhteydessä satunnaista kilpirauhassyöpä alttius. Viime vuosina nämä polymorfismit (rs965513, rs1867277, ja rs71369530)

FOXE1

alueen ja kilpirauhasen syövän riskiä, ​​ovat itsenäisesti saataisi myöhemmissä tutkimuksissa. Kuten McClellan ja kuningas, monet elleivät useimmat geneettisten polymorfismien, joista ilmoitetaan liittyvän yhteisten häiriöitä GWA tutkimuksissa ovat tosiasiallisesti vääriä yhdistysten aiheuttamat hienoisia eroja syntyperä asukkaiden välisiä tutkitaan (väestö kerrostuneisuus) [13]. Tulkinta näistä tutkimuksista on edelleen vaikeuttaa käyttöä eri etnisten väestöryhmien, riittämätön teho, pieni vaikutus polymorfismin vaikutus kilpirauhassyövän riskiä ja fenotyyppinen heterogeenisyys. Lisäksi lisääntyneeseen tutkimukset ovat viime vuosina keskuudessa Aasian väestön on sovitettava yhteen nämä tiedot. Siksi suorittaa meta-analyysi julkaistut tutkimukset selventää tätä epäjohdonmukaisuutta ja luoda kattava kuva suhdetta yhteistä variantteja kromosomissa

FOXE1

ja kilpirauhassyöpä.

Materiaalit ja menetelmät

kirjallisuus hakustrategia ja valintakriteerit

epidemiologiset geneettinen yhdistyksen tutkimuksia on julkaistu ennen loppua marraskuu 2013 kilpirauhassyövän ja polymorfismi

FOXE1

geeni etsittiin tietokonepohjainen haut tietokannoista kuten PubMed, SCOPUS, ISI web tiedon, EMBASE, Cochrane tietokantoja ja CNKI (China National Knowledge Infrastructure) ilman kielirajoituksia. Hakusana yhdistelmät olivat avainsanoja, jotka liittyvät

FOXE1

geeni (esim ”

FOXE1

”, ”

TTF-2

”, ”9q22”, ”rs965513″, ” rs1867277 ”,” rs71369530 ”,” polyalaniiniin traktaatteja ”) yhdessä liittyviä sanoja kilpirauhassyöpä (esim,” kilpirauhasen syöpä ”,” kilpirauhasen karsinooma ”,” kilpirauhasen tuumori ”). Me korvattu yhdellä aikavälillä aina kunnes kaikki mahdollinen yhdistelmä tilassa etsittiin välttämiseksi puuttuu kirjallisuutta. Otsikot ja tiivistelmät mahdollisten esineiden seulottiin määrittää niiden merkitys, ja kaikki selvästi merkityksettömiä tutkimuksia ulkopuolelle. Koko teksti Jäljellä esineiden luettiin onko ne sisälsivät tietoa aihe kiinnostaa. Lisäksi viiteluettelot alkuperäistutkimusten ja katsaukset myös tarkistaa manuaalihakua tunnistaa osuvilla julkaisuihin.

Mukana tutkimuksissa on täytettävä seuraavat kriteerit: (1) arviointi ainakin yksi näistä kolmesta polymorfismien (rs965513, rs1867277, rs71369530) ja kilpirauhassyöpä riskit käyttäen tapaus-verrokki tai kohortti suunnittelu, (2) alkuperäinen paperit, jotka sisältävät riippumattomia tietoja, (3) tunnistaminen kilpirauhassyöpä potilaiden varmistettiin histologisesti tai patologisesti, (4) genotyyppi jakelutietoja tai kerroinsuhde (OR) ja sen 95%: n luottamusväli (CI) ja P-arvon, ja (5) genotyyppi jakelu kontrolliryhmässä on oltava Hardy-Weinberg tasapaino (HWE). Tärkeimmät syyt sulkeminen tutkimukset olivat (1) päällekkäin tiedot, (2) tapauksessa vain tutkimuksia, ja (3) katsaukset.

Data louhinta

Tietoa huolellisesti poimittu kaikista hyväksyttävistä julkaisuja itsenäisesti kaksi kirjoittajaa mukaan pääsyn kriteerit yllä. Jokaisen mukana tutkimuksessa, seuraavat tiedot kustakin uutettiin raportin mukaan kiinteän protokolla: ensimmäinen kirjoittaja, julkaisuvuosi, määrittely ja numerot tapausten ja kontrollien, niiden genotyyppien frekvenssi, ikä, sukupuoli, kansallisuus, HWE tila, lähde ohjaus, histologisia alatyyppejä ja genotyypitysmenetelmää. Review raportit kaksi verrattiin sitten tunnistaa ristiriitaa, ja erot ratkaistiin jatkokeskusteluja kaikkien tekijöille. Tutkimukset eri etnisten ryhmien katsottiin yksittäisiä tutkimuksia analyysimme. Samaan aikaan eri asia verrokkiryhmien yhdessä tutkimuksessa pidettiin riippumattomat tutkimukset. Väline ”Extended-laatupisteet” käytettiin arvioimaan laadun yhdistyksen tutkimuksissa [14]. Yleensä jokainen artikkeli pisteytetään laajennettu laadun asteikko, joka määrittää ne ”korkea”, ”mediaani” tai ”huono” laatu.

Tilastolliset menetelmät

Raakaöljy syrjäisimmät alueet vastaaviin 95% CI arviointiin käytettiin vahvuus välisen assosiaation

FOXE1

polymorfismi ja kilpirauhassyöpä riskejä. Per-alleelin tai riski alleelin arvioitiin. Sitten arvioimme riskit Heterotsygoottisten ja homotsygoottinen genotyyppien TC verrattuna villityypin homozygoottisia [15]. Cochranin χ

2 perustuu Q-tilastot ja I

2 testi [16], [17] Testi suoritettiin arvioimaan mahdollisia heterogeenisuus yhdistetyssä tutkimuksissa. Yleensä I

2 arvojen 25% vastaavat vähän tai ei ollenkaan heterogeenisyys, arvot 25-50% vastaavat kohtalainen heterogeenisyys, ja arvot 50% vastaavat vahva heterogeenisuus tutkimusten välillä. Random-tehosteet ja kiinteän vaikutus yhteenveto toimenpiteitä laskettiin käänteinen-varianssi painotettu keskiarvo tukin riskisuhde [18]. Tulokset random-vaikutusten yhteenveto raportoitu tekstiin, koska siinä otetaan huomioon vaihtelusta tutkimuksissa. 95% CI konstruoitiin käyttäen Woolf menetelmällä [19]. Lähteet heterogeenisyys tutkittiin ositettu meta-analyysit perustuvat etnisyyteen, otoskoko (nro tapauksissa ≥500 tai 500) ja tutkimuksen suunnittelu strategia (GWAS vs. kandidaattigeenifragmenttikloonien). Etninen ryhmä määriteltiin Itäaasialaiset (ts kiinalainen, japani ja korea), ja valkoihoisten (eli ihmiset eurooppalaista alkuperää). Lisäksi etnisyys, otoskoko, ja tutkimuksen suunnittelu (GWAS vs. kandidaattigeenifragmenttikloonien) analysoitiin kovariantteja meta-regressio. Merkitys Yhdistettyjen OR määritettiin Z testi. Julkaisu bias arvioitiin kanssa Egger testi ja Begg testi [20], [21]. Herkkyysanalyysi suoritettiin poistamalla kunkin yksittäisen tutkimuksen vuorotellen kokonaismäärästä ja uudelleen analysointi loput. Analyysi tehtiin käyttäen STATA ohjelmistoversio 10.0 (Stata Corporation, College Station, TX). Kaikki P-arvot olivat kaksipuolista analyysiä ja arvot P 0,05 katsottiin tilastollisesti merkitsevä.

Tulokset

Tutkimus Ominaisuudet

Yhdistetty Haku tuotti 96 viittauksia. Kuvassa S1 esittää tutkimuksen valintaprosessia. Lopuksi, yhteensä 14 tukikelpoisten yhdistyksen tutkimuksia 9828 TC tapauksissa ja 109995 kontrolliraskauksiin [6], [7], [11], [12], [22] – [31], jossa 4 tutkimuksissa genotyypityksen useampia versioita . On 19 aineistoja 12 tutkimuksista 8602 tapauksia ja 102846 valvontaa koskevia rs965513, ja 7 aineistoja 5 tutkimuksia 2017 tapauksia ja 13281 valvontaa koskevia rs1867277. Sillä rs71369530 polymorfismi, 5 aineistoja 4 tutkimukseen osallistui yhteensä 448 tapausta ja 746 valvontaa. Tapauksista 77% oli valkoihoisia, ja 23% oli Itä-Aasian. Yksitoista tutkimuksissa annettiin korkea laatu, ja kolme tutkimusta annettiin mediaani laatua. Ei ”heikkolaatuisia” tutkimuksessa todettiin. Yksityiskohtaiset ominaisuudet tutkimusten mukaan tähän meta-analyysi on esitetty taulukossa 1 (kuva S2).

Association of rs965513 polymorfismi kilpirauhassyöpä

Oli suuria eroja A-alleelin taajuus rs965513 polymorfismin kesken valvonnan eri etnisten ryhmien, jotka vaihtelevat +0,06-,44 (kuva S2). Itä-Aasian valvontaa, A-alleelin frekvenssi oli 0,06 (95% CI: 0,05-0,08), joka oli pienempi kuin valkoihoisilla valvonta (0,39; 95% CI: 0,34-,44). TC riski ja rs965513 polymorfismi, meidän meta-analyysi tuotti yleisen OR 1,71 (95% CI: 1,59-1,85, P 10

-5, kuva 1) tilastollisesti merkitsevä Tutkimusten välisten heterogeenisuus (P = 0,001 ). Runsaasti lisää TC riskejä löydettiin myös niille heterotsygoottinen (OR = 2,17, 95% CI: 1,86-2,57; P 10

-5) ja homotsygoottisia riskin alleelin (OR = 2,95, 95% CI: 2.29- 3,94; P 10

-5) verrattuna villin tyypin genotyyppi.

Koska merkittävä heterogeenisyys ja hakea sen mahdollisia, suoritimme paneeli alaryhmäanalyyseissa etnisyyteen ja otoskoko. Kun tutkimukset stratifioitiin varten etnisyys, merkittäviä riskejä havaittiin valkoihoisilla kaikissa vertailuissa (A alleeli: OR = 1,80, 95% CI: 1,69-1,92, P 10

-5; heterotsygoottinen: OR = 2,60, 95% CI : 2,06-3,02, P 10

-5; homozygoottisia: OR = 3,36, 95% CI: 2,75-4,51, P 10

-5). Samanlaisia ​​merkitseviä havaittiin myös Itäaasialaiset kanssa per-alleeli OR 1,35 (95% CI: 1,09-1,67, p = 0,006). Analyysi rajoittuu 8 tutkimuksia ainakin 500 tapausta, joka olisi vähemmän altis valikoiva julkaisu kuin pienemmät tutkimukset, tuotti OR = 1,75 (95% CI: 1,59-1,93, P 10

-5). Mitä pienempi tutkimuksissa yhteenveto OR rs965513-variantti TC oli 1,67 (95% CI: 1,48-1,88, P 10

-5). Tarkastelemalla tutkimuksen suunnittelu alaryhmiä, OR oli 1,75 (95% CI: 1,61-1,90, P 10

-5) in GWAS verrattuna 1,70 (95% CI: 1,53-1,88, P 10

-5 ) in kandidaattigeenillä tutkimuksissa (taulukko 2). Kun alaryhmäanalyyseissa histologisia tyyppejä tarkasteltiin (6, 833 tapausta ja 47, 384 säätimet 8 tutkimuksista), polymorfismin oli huomattavasti lisääntynyt riski papillaarinen kilpirauhassyövän OR = 1,65 (95% CI: 1,50-1,81, P 10

-5; I

2 = 59%, P

heterogeenisyys = 0,003).

Huomattava heterogeenisuus oli läsnä joukossa 19 aineistoja (P 0,05). Meta-regressioanalyysi, otoskoko (P = 0,68), ja tutkimuksen suunnittelu (P = 0,89), ei merkittävästi selittää tällaista heterogeenisyys. Sen sijaan etnisyys (P = 0,001) korreloi merkitsevästi suuruuteen geneettinen vaikutus.

Association of rs1867277 polymorfismi kilpirauhassyöpä

A-alleelin frekvenssi valkoihoisilla oli 0,40 (95% CI: ,38-+0,43). Käyttäen satunnainen vaikutus mallissa per-alleelin yleistä tai A- muunnos TC oli 1,64 (95% CI: 1,51-1,78, P 10

-5; Kuva S3), jossa on vastaava tuloksia heterotsygoottinen ja homotsygoottinen 1,86 (95% CI: 1,57-2,23, P 10

-5) ja 2,63 (95% CI: 1,98-3,51, P 10

-5), tässä järjestyksessä.

Association of polyAla (rs71369530) polymorfismi kilpirauhassyöpä

kaksi yleisintä alleelit olivat 14-alaniini ja 16-alaniini alleeleja, esiintyvät taajuudella 58,5% ja 32,3% vuonna valkoihoinen valvontaa, vastaavasti. Niistä polyAla (rs71369530) alleeleja, 16-Ala oli alleelit osoittavat korkeampia taajuuksia tapauksissa kuin valvontaa. Yleinen per-alleelin tai 16-Ala variantti täydellistä TC oli 2,01 (95% CI: 1,66-2,44, P 10

-5; Kuva S4),

Herkkyysanalyysit ja julkaisu bias

Herkkyysanalyysi osoitti, että yksikään tutkimuksessa vaikuttaneet yhdistettyjen OR laadullisesti, mikä viittaa siihen, että tulokset meta-analyysissä, ovat stabiileja (kuva S5-S7). Muoto suppilon tontteja oli symmetrinen näiden polymorfismien (Kuva S8-S10). Tilastolliset tulokset eivät vieläkään näytä julkaisu bias näissä tutkimuksissa rs965513 (Egger testi, P = 0,21), rs1867277 (Egger testi, P = 0,92) ja rs71369530 polymorfismi (Egger testi, P = 0,19).

keskustelu

GWAS ovat johtaneet tunnistamiseen useita uusia geneettisiä variantteja liittyy kilpirauhassyöpä riskiä. Useimmat näistä kilpirauhassyövän GWAS ja replikointi tutkimuksia on tehty Euroopan populaatiot [6], [7], [25] – [27], [30] ja vähemmässä määrin Itäaasialaiset [23], [28]. Replikointi alkuperäistä GWAS havaintoja pidetään kultakantaan ilmoittamiseen genotyypin-fenotyypin yhdistyksiä. Lisäksi on olemassa merkittäviä eroja alleelifrekvenssit ja esiintyvyys kilpirauhassyövän eri etnisten väestöryhmien. Sen vuoksi tärkeää arvioida määrällisesti vaikutuksia GWAS-tunnistettu markkereita eri etnistä väestöä ja tutkimaan mahdollisia heterogeenisuus Julkaistujen tietojen. Parhaan tietomme mukaan tämä on ensimmäinen kattava meta-analyysi tarkastelee yhteistä muunnelmia FOXE1 geeni ja sen suhteesta alttiuden kilpirauhassyöpä. Sen vahvuus perustuu kertyminen Julkaistujen tietojen antaen paljon tietoa havaita merkittäviä eroja. Kaikkiaan meta-analyysissä mukana 14 tutkimusta, jossa säädettiin 9828 TC tapauksissa ja 109995 valvontaa. Tuloksemme osoittivat, että 3 polymorfismien (rs965513, rs1867277, rs71369530) on

FOXE1

on riskitekijä TC.

Genetic heterogeenisuus on väistämätön sairaus tunnistamisen strategiaan [32]. Kuten rs965513 polymorfismi tunnistimme etnisyys mahdollisena lähteenä Tutkimusten välisten heterogeenisyyteen alaryhmäanalyysi ja meta-regressio. Vuonna kerrostunut analyysi etnisyys, havaitsimme, että yhdistyksen välillä rs965513 polymorfismin ja riskien TC valkoihoisilla (OR = 1,80) oli voimakkaampi kuin Itä-Aasian väestö (OR = 1,35). Täällä on useita selityksiä tulkita edellä mainitusta ilmiö. Ensinnäkin, etniset erot voivat jakaa näihin erilaisiin tuloksiin, koska C-alleelin jakaumat rs965513 polymorfismin vaihtelee valkoihoisten, ja Itäaasialaiset, joiden esiintyvyys ~37%, ja ~11%: lla [6], [28]. Toisaalta, eri populaatioissa yleensä eri kytkentäepätasapaino- kuvioita. Polymorfismi voi olla tiiviit kytkökset toiseen lähellä syy muunnos yhdessä etninen väestö, mutta ei toisessa [33]. Lisäksi on mahdollista, että vaihtelu tässä lokuksessa on vähäinen vaikutus TC, mutta ympäristötekijät voivat vallita sen edistymistä, ja naamio vaikutukset tämän vaihtelun. Erityiset ympäristötekijät kuten ionisoivan säteilyn ja puutteen jodin saannin, jotka on jo tutkittu paljon viime vuosikymmeninä [34]. Useimmat mukana tutkimuksissa ei pitänyt näitä tärkeitä ympäristötekijöitä. Vielä ei tiedetä, onko elämäntapa ominaisuuksia eri populaatioiden vaikuttaa assosiaatiota polymorfismien ja TC. Harkitsematon tekijät sekoitukset voivat kattaa roolia polymorfismin Aasian populaatioissa.

FOXE1 on tärkeää sekä pituitary- ja thyroid- rauhanen muodostuminen [35], [36] ja on keskellä sääntely verkosto transkriptiotekijöiden ja kofaktoreita, jotka aloittavat kilpirauhanen eriyttämisen alkiovaiheessa [37]. Lisäksi mutaatiot

FOXE1

geenissä aiheuttavat ihmisen oireyhtymiä, jotka liittyvät kilpirauhasen agenesis muun fenotyyppejä [38]. FOXE1 on tarpeen myös ylläpidon eriytetyn tilan kilpirauhasen, koska se on mukana säätelevät transkription kilpirauhasen-spesifisten geenien, kuten esimerkiksi tyroglobuliinin ja thyroperoxidase geenejä. Lisäksi ilmaus

FOXE1

on osoitettu olevan epänormaali kilpirauhasen kasvaimet [39]. 9q22.33 SNP rs965513 ensin raportoitu GWAS TC on Euroopan väestöstä, ja on sittemmin toistettu useissa myöhemmissä tutkimuksissa [6], [7], [28]. On ehdotettu merkitä toiminnallinen vaihtelu lähellä

FOXE1

geeni, joka myötävaikuttaa lisääntynyt riski sairastua kilpirauhasen syöpä. Sitä paitsi, variantti on myös liitetty alhainen pitoisuus seerumissa kilpirauhasta stimuloiva hormoni, ja vapaa tyroksiini [7].

Merkittävä yhdessä TC havaittiin myös

FOXE1

16- Ala ja rs1867277 muunnos esillä olevassa meta-analyysi. Carré et al. raportoitu, että

FOXE1

16-Ala indusoi vahvemman transaktivaatiota tyroglobuliinin promoottorin kuin 14-Ala variantti [40]. Nämä tulokset viittaavat siihen, toiminnallinen seurauksena läsnäolo polyAla laajennuksia ( 14), mutta ei supistusten (≤14). Kuitenkin tuoreessa tutkimuksessa raportoitu vaatimaton transkription heikentyvän 16-Ala

FOXE1

verrattuna funktio 14-Ala variantti, on

FOXE1

reagoivat promoottorit, mikä ei johdu erot DNA sitova [26]. Kun kyseessä on rs1867277, sekvenssin kanssa A-alleelin on osoitettu lisäävän transkriptionaalista aktiivisuutta

FOXE1

-geenin promoottori, jonka rekrytointi leusiinivetoketjun ylävirtaan stimuloivan tekijät 1 ja 2 [12]. Siten on arveltu, että säätely ylöspäin

FOXE1

voisi olla rooli pahanlaatuinen käyttäytymistä kilpirauhassoluja.

tulosten tulkintaan, joitakin rajoituksia tämän meta-analyysissä olisi käsiteltävä . Ensinnäkin tuloksemme perustuivat oikaisemattomaan arvioihin, kun taas tarkemman analyysin tulisi tehdä, jos kaikki yksittäiset raaka tietojen puuttuessa, mikä mahdollistaisi säädön muiden co-variantteja kuten ikä, sukupuoli, savukkeiden kulutusta, ja muut elämäntapa. Toiseksi valtaosa aiheista tutkimuksessa ovat eurooppalaista syntyperää, ja tilastollinen voima analyyseihin muissa etnisissä ryhmissä on rajallinen. Koska otoskoko oli huomattavasti pienempi Itäaasialaiset tutkimuksissa pääasiallisena johtopäätökset käsikirjoitus perustuu analyyseihin keskuudessa valkoihoinen väestö. Jatkotutkimuksissa myös suurempia määriä Itäaasialaiset tai afrikkalaiset selventämiseksi johdonmukaisuuden havainnoista yli etnisten ryhmien. Kolmanneksi, meta-analyysi on eräänlainen retrospektiivinen tutkimus, ja muistaa ja valintaa bias saattaa esiintyä.

Näistä rajoituksista huolimatta tämä meta-analyysi viittaa siihen, että kolme yhteistä muunnelmia

FOXE1

( rs965513, rs1867277, rs71369530) oli merkitsevästi yhteydessä suurentunut TC etenkin valkoihoinen väestö. Kuten tutkimukset muun etnisten populaatiot tällä hetkellä rajoitettu, lisätutkimukset myös laajempi kirjo aiheita tutkia roolia näiden varianttien muissa väestöissä tarvitaan. Lisäksi tulevissa tutkimuksissa suositellaan, että ne mahdolliset geeni-geeni ja geeni-ympäristövuorovaikutusten tässä -alueella.

tukeminen Information

Kuva S1.

Study valintaprosessi.

doi: 10,1371 /journal.pone.0087332.s001

(TIF) B Kuva S2.

Taajuudet riskin alleelien

FOXE1

rs965513 kontrollien joukossa stratifioituna etnisyys. Osasto ”” edustavat outlier.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0087332.s002

(TIF) B Kuva S3.

Forest kuvaaja yhdistys

FOXE1

rs1867277 polymorfismi ja kilpirauhassyöpä riskiä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0087332.s003

(TIF) B Kuva S4.

Forest kuvaaja yhdistys

FOXE1

polyAla variantti (71369530) ja kilpirauhasen syöpäriskiä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0087332.s004

(TIF) B Kuva S5 .

tulos herkkyysanalyyseja varten

FOXE1

rs965513 polymorfismi ja kilpirauhassyöpä riskiä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0087332.s005

(TIF) B Kuva S6.

tulos herkkyysanalyyseja varten

FOXE1

rs1867277 polymorfismi ja kilpirauhassyöpä riskiä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0087332.s006

(TIF) B Kuva S7.

tulos herkkyysanalyyseja varten

FOXE1

rs71369530 polymorfismi ja kilpirauhassyöpä riskiä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0087332.s007

(TIF) B Kuva S8.

Begg n suppilo juoni julkaistavaksi puolueellisuudesta tutkimuksissa

FOXE1

rs965513 polymorfismi ja kilpirauhassyöpä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0087332.s008

(TIF) B Kuva S9 .

Begg n suppilo juoni julkaistavaksi puolueellisuudesta tutkimuksissa

FOXE1

rs1867277 polymorfismi ja kilpirauhassyöpä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0087332.s009

(TIF) B Kuva S10 .

Begg n suppilo juoni julkaistavaksi puolueellisuudesta tutkimuksissa

FOXE1

rs71369530 polymorfismi ja kilpirauhassyöpä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0087332.s010

(TIF) B tarkistuslista S1 .

doi: 10,1371 /journal.pone.0087332.s011

(DOC) B

Vastaa