Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

On vielä avoin kysymys, kuinka ennustaa peräsuolen syövän riskiä ennen morfologiset muutokset näkyvät paksusuolessa.

tavoite

tarkoituksena oli tutkia poikkeavuuksia kromosomeissa 1, 2 ja 4 perifeerisen veren lymfosyyteissä analysoitiin fluoresenssi

in situ

-hybridisaatiotekniikkaa keinona arvioida todennäköisyyttä kolorektaalisyövän.

Methods

sairaala-pohjainen tapauskontrollitutkimuksessa sisältyi 20 paksusuolensyöpä potilaista ja 18 sairaalan perustuvia tarkastuksia . Tietoja mahdollisista covariates kerättiin haastattelun. Taajuus vakaa ja epävakaa kromosomipoikkeamia kromosomissa 1, 2 ja 4 arvioitiin fluoresenssi

in situ

-hybridisaatiotekniikkaa.

Tulokset

peräsuolen syöpäpotilaita, verrattuna valvonta, oli suhteellisesti korkeampi taajuus kromosomin 1 translokaatioita (mediaani: 3,5 vs. 1,0 /1000 solua, p = 0,006), vakaa poikkeamia (3,8 vs. 1,0 /1000 solua, p = 0,007) ja yhteensä poikkeamia (p = 0,009). Ei ollut eroja havaittu kromosomien 2 ja 4. Tulokset osoittavat kasvua kertoimella, jolla paksusuolen syövän noin 50-80% liittyy oli kasvua 1/1000 solujen määrän kromosomin 1 poikkeavuuksia.

Johtopäätökset

tuloksista ilmeni, että taajuus kromosomipoikkeavuuksien, varsinkin translokaatioita kromosomi 1, näyttää olevan lupaava menetelmä näyttää paksusuolen syövän riskiä. Lisäksi meidän tutkimus osoittaa kohtuullisuutta käytön biomarkkerit kuten kromosomin 1 poikkeavuuksia ääreisverenkierron lymfosyyttien seulonnassa ehkäisyohjelmat yksilöille korkeammissa paksusuolen syövän riskiä tunnistaa ne, joilla on lisääntynyt riski ja vaativat useammin tutkimuksia, esim. by sigmoidoskopiaa.

Citation: Galas A, Miszczyk J (2016) Aberrations kromosomijaksosta 1 mahdollisena Predictor on kerroinsuhde Colon Cancer – tulokset Krakovan tapauskontrollitutkimuksessa. PLoS ONE 11 (1): e0147658. doi: 10,1371 /journal.pone.0147658

Editor: Lanjing Zhang, University Medical Center Princeton /Rutgers Robert Wood Johnson Medical School, Yhdysvallat |

vastaanotettu: 31 elokuu 2015; Hyväksytty: 06 tammikuu 2016; Julkaistu: 29 tammikuu 2016

Copyright: © 2016 Galas, Miszczyk. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Data Saatavuus: Kaikki asiaankuuluvat tiedot ovat paperi- ja sen tukeminen Information tiedostoja.

Rahoitus: Tämä tutkimusprojekti rahoittivat National Science Centre, Puola vuosina 2010-2013 (nro NN404034039) – päätutkija Aleksander Galas LKT. Esitetty tulokset osittain tukevat tiedot tiede ja koulutus projektin (nro 2P05D05329) -the päätutkija professori Wieslaw Jedrychowski, LKT. Osa näistä tutkimuksista tehtiin osana laajennetun tarkastelun 250 kV röntgenkuvat at IFJ PAN sytogeneettisessä ja molekyylitason menetelmiä ja olivat osittain tukee Grant joulukuu 2013/09 /D /NZ7 /00324 National Science Centre , Puola, päätutkija Justyna Miszczyk, PhD.

kilpailevat edut: kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

peräsuolen syöpä (CRC) on yksi kärkikolmikkoon yleisimpiä syöpiä diagnosoidaan korkean tulotason maiden ja useimmissa keskitulotason maissa. Se edistää myös suuri määrä syöpäkuolemista maailmanlaajuisesti. On suuri elin tietoa suhteessa riskitekijöitä CRC ja suurin osa heistä viittaavat rooliin elämäntavan pääasiallisena vaikuttavana tekijänä, vaikka useat tutkimukset pystynyt osoittamaan syy-yhteyttä [1]. Geneettinen alttius on arvioitu osaltaan noin 35% CRC tapauksista [2]. Suurin osa tutkimuksista, jotka yrittivät arvioida muutoksia vastaavan kehittämisestä kolorektaalisyövän keskittynyt geneettisiin ominaisuuksiin havaittu syöpäkudoksessa. Mutaatiot adenomatoottisen polypoosin coli (APC) -geenin, MLH1, MSH2, PMS2 ja MSH6 epäsuhta korjaavien geenien ja CpG-saarekkeen methylator fenotyyppi (CIMP) on tunnistettu ja kuvattu hyvin [3]. Lisäksi, osallistuminen TP53, TGFB1, ja mitogeeni-aktivoitu proteiinikinaasi (MAPK) signalointireittien havaittiin johtavan etenemisen CRC vuoksi menetystä solujen kasvun ja erilaistumisen valvontaa, ja apoptoosin [3,4]. Genomin laajuinen yhdistys tutkimukset (GWAS) suorittaa vuodesta 2007 ovat epäonnistuneet löytää yhteinen geneettinen variantti vastaa kehittämisestä satunnaista peräsuolen syöpä. Vaikka jotkin näistä tutkimuksista ovat löytäneet joitakin yhden emäksen monimuotoisuus (SNP), ne eivät osoittautuneet syy-yhteyteen ja havaitun liittyvä kasvu CRC riski oli vaatimatonta (lisäystä 5% ja 30%) [5]. On näyttöä siitä lisääntynyt riski perinnöllinen CRC joukossa ensimmäinen sukulaisten [6], mutta vähän tiedetään ennustettaessa riski kehittää satunnaista peräsuolen syöpä terveet yksilöt, joilla ei ole suvussa CRC.

CRC kehittyy seurauksena paikallisen kudoksen muutokset [7], mutta on vielä avoin kysymys, miten ennustaa syöpäriskin ennen morfologiset muutokset näkyvät paksusuolessa. Juuri tästä syystä olemme tutkineet kertoimella CRC liittyy kromosomivaurioita mitattiin perifeerisen veren lymfosyyteissä (PBL).

Tällä hetkellä ei ole vakiintunut kromosomi riskinarviointia merkkiaine CRC. Eräs viimeaikainen tutkimus, julkaistu vuonna 2013 Chen [8], on osoittanut, että suurin osa hypermetyloitunut geenien epäillään olevan epigeneettisestä tapahtuma, joka hiljentää tuumorisuppressorigeeneille CRC. Nämä geenit sijoitetaan kromosomiin 1. Tulokset toisen tutkimuksen kahdeksankymmentäkolme CRC potilaista viittasi 1q31.3-32.1 (EEF1AL12) on alueella, joka voi kertyä vähintään yksi CRC-tuumorisuppressorigeenin [9]. Xiao et ai. tutki yhteinen kromosomaalisia muutoksia satunnaista CRC ja ovat löytäneet kromosomit 1, 2 ja 4 on kromosomi voittoja [10]. Kaikki nämä löydökset, vaikka lupaavia, on havaittu erotuksena terve ja syöpäkudokset, mikä rajoittaa niiden käyttökelpoisuutta ennakoiva biomarkkeri arvioimiseksi riski kehittää CRC. Ottaen huomioon syövän asteittainen kerääntyminen DNA-vaurion aikana vapauttamisen solun prosesseja, nämä tulokset ovat kiinnekohta eivätkä syrji suhdetta perusteella havaittujen geneettisten muutosten kuten syy tai aiheuttaja, varsinkin kun ajallinen ja avaruudellisen epäyhtenäisyyttä geneettisiä muutoksia läsnä CRC [11].

tarkoitus

tämän tapauskontrollitutkimuksessa oli tutkia kromosomipoikkeavuuksiin (CA) kromosomien 1, 2 ja 4 mitattuna ilmeisesti terveet solut (PBL) fluoresenssi

in situ

-hybridisaatio (FISH) tekniikka auttaa ennustamaan kertoimella kehittää CRC. Koska ruokailutottumukset tiedetään olevan yksi tärkeimmistä tekijöitä satunnaista CRC, hedelmien ja vihannesten kulutus on pidettävä tärkeimpinä sekoittava muuttuja tässä suhteessa.

Materiaalit ja menetelmät

Tutkimusasetelma ja näyte

sairaaloiden tapauskontrollitutkimuksessa mukana CRC tuotujen potilaiden I puheenjohtajalle General Surgery ja osasto Gastroenterologinen kirurgia, Jagiellonian University Medical College, Puolan Krakovassa, ja valvonta käsitellään johtuvat muista syistä (jotka eivät liity syövän) yliopistollisessa sairaalassa Krakovassa. Suunnittelu Tutkimus on kuvattu muualla [12,13]. Lyhyesti, osallistujat olivat vasta diagnosoitujen tapausten satunnaista adenokarsinooma joko paksusuolen tai peräsuolen ja vahvistettiin histopatologisesti. Inclusion olivat: ikä jopa 75 vuotta, valkoihoinen, joka on kotoisin Puolasta, ohjattava kirurginen hoito CRC (syöpätapauksista) tai jonkin tilan hoitamiseksi liity syöpä (valvonta). Seuraavaksi seuraavat poissulkukriteereitä toteutettiin: sädehoidon tai kemoterapian ennen verinäytteen, läsnäolo viestintä (sanallinen yhteyttä) ongelmia ja /tai aistien, diagnoosi johdetun syövän lokalisoitu paksu- tai peräsuolen (ts kaukainen etäpesäke paksusuolen) , diagnoosi ensisijainen syövän muuta kuin peräsuolen, toistuvat syövän, leikattiin (ennen rekrytointia) ruoansulatuskanavan, suoritettujen tai diagnoosi krooninen sairaus ruoansulatuskanavassa (divertikuliitti, ärtyvän suolen oireyhtymä, akuutti tai krooninen mahahaava, akuutti /krooninen haimatulehdus) , diabetes (mitä tahansa), munuaisten vajaatoiminta, ja maksan vajaatoiminta. Lisäksi koehenkilöt raportoivat on ruoansulatuskanavan oireita aikana 5-vuotta ennen haastattelua oli myös suljettu pois.

Ensisijainen tapauskontrollitutkimuksessa suunniteltiin olevan 80 aiheita yhteensä geneettisiä tutkimuksia ja suunniteltiin käyttämään vastaava strategia (tapaukset ja kontrollit sovitettu mukaan sukupuolen ja iän +/- 5 vuotta). Kun sisäänmenon koehenkilöt pyydettiin osallistumaan geneettisen osa hanketta. Sen jälkeen kirjallinen suostumus saatiin, haastattelu tehtiin ja verinäytteet otettiin. Out of 80 potilasta 2 jätettiin pois johtuen poissulkemisperusteiden jotka paljastuivat kun verinäytteen ottamisesta (syövän diagnoosin aiemmin ulkomailla asuvien lapsuudessa). Protokollan mukaan jokaisen potilaan pyydettiin toimittamaan kahden verinäytteen klassisen kromosomipoikkeavuustesti arviointi, kaksi sisarkormatidinvaihdokset (SCE) ja lisäksi neljä näytettä fluoresenssitutkimukseen

in situ

-hybridisaatio (kaksi arvioitaessa nykyisten tila, ja kaksi säteilytys). Noin puolella potilaista kerätään verinäytteet eivät olleet riittäviä (johtuen vähäisestä tilavuus) kaikille suunnitelluille geneettisen testauksen. Tulokset kromosomipoikkeavuuksien arvioi klassinen sytogeneettinen menetelmä julkaistiin Tutkimuksen ensisijainen monografia [14]. Tulokset SCE arvioinnin siitä seuraava joukko 38 aiheita, johon sisältyi joukko näytteitä toisesta 24 aiheista lähtöisin samanlaista tutkimushankkeessa julkaistiin myös [12]. Lopuksi, toinen joukko 38 verinäytteitä (20 paksusuolen syöpätapausta ja 18 kontrollit) olivat saatavilla myös FISH tekniikka arvioida läsnäolo ja taajuus kromosomi 1, 2 ja 4 poikkeavuuksia. Vaikka sisällyttämiskriteerit ensisijaisen Tutkimukseen paksusuolen ja peräsuolen syöpätapausta, vain paksusuoli (ICD-X: C18) syöpätapausta osallistui FISH osassa. Koko tutkimus on tehty noudattaen eettisiä periaatteita Helsingin julistuksen ja hyväksyi bioeettiset komitean Jagiellonian University (numero KBET /115 /B /2011).

Työkalut ja tiedonkeruu

Tutkittavat haastateltiin heidän ruokailutottumuksiin, demografisia ominaisuuksia, ja muita mahdollisia covariates. Kliiniset tiedot kerättiin sairaalasta potilastietoja. Ruokatottumukset arvioitiin semikvantitiivinen ruokailutiheyskyselyn kyselyn (SFFQ). Kaikkiaan 148-ruokavalion eriä käytettiin myös kysymyksiä tuoreiden hedelmien (kesä /talviaika), salaatteja ja tuoreita ja keitettyjä vihanneksia, ja jokaisen ruoan tai juoman kohde, tavanomaiseen kulutukseen annoskoko oli määritelty standardoituja valokuvia. Koulutettu haastattelijat keräsivät tietoa tavanomaisen (vakinainen) kulutus yli 1 vuoden ajan kalenterivuosittain vuodenaikoina. Sen arvioimiseksi vakinaista ruokailutottumuksiin, CRC tapausta kysyttiin heidän ruokailutottumuksiin kerrallaan 5 vuotta ennen puhkeamista ruoansulatuskanavan oireet (jos sellainen on) tai ennen alkua diagnostinen prosessi. Voimassaolon ja toistettavuus kyselylomakkeen arvioitiin ja julkaistu muualla [15].

sytogeneenisuustutkimuksiin

Verenkeruu ja metafaasissa leviämisen valmistelu.

Verinäytteet kerättiin phlebotomy osaksi litium-heparinisoi- vacutainers, koodattu, ja sitten nopeasti kuljetetaan laboratorioon H. Niewodniczanski Ydinfysiikka- Puolan tiedeakatemian Krakovassa, Puolassa (IFJ PAN) ennen lääketieteellisiä toimenpiteitä. Lyhyesti, kokoveri (1,6 ml) lisättiin 15 ml: aan RPMI 1640 elatusaineessa, jota oli täydennetty 20% lämmöllä inaktivoitua naudan sikiön seerumia, L-glutamiinia (2 mM) ja antibiootteja (100 U /ml penisilliiniä ja 100 g /ml streptomysiiniä). Lymfosyytit stimuloitiin fytohemagglutiniini (PHA) ja viljeltiin 72 tuntia, 37 ° C: ssa 5% CO

2: ssa kosteutetussa inkubaattorissa. Kaksi tuntia ennen loppua Viljelyn 200 ui Kolkisiinia liuosta (pysähtyä jakautuvien solujen metafaasissa) lisättiin. Seuraavaksi soluja käsiteltiin hypotonisella KCl ja kiinnitettiin 3: 1 metanoli /etikkahappo. Metaphase levitteet valmistettiin pudottamalla kiinnitetyt solut (1-2 tippaa) puhtaan dioja. Objektilasit kuivattiin sitten huoneen lämpötilassa (RT) ja varastoidaan -20 ° C: ssa pakastimessa.

Värjäys.

yksityiskohdat FISH menetelmä on kuvattu muualla [16]. Lyhyesti, värjäys suoritettiin protokollan mukaisesti, jonka edustaja valmistajan koettimien (Cytocell LPP124, Whole Kromosomi Paint Combination 1, 2, 4). Dioja kuivattiin huoneenlämpötilassa 15-20 minuuttia ja tarkistetaan riittävien kromosomi levittää määrittämään soveltuvuus näytteen varten

in situ

hybridisaatiomenettelytavalla. Objektilasit upotettiin suolaliuoksella (SSC) 2 minuutin ajan 37 ° C: ssa, inkuboitiin pepsiiniliuosta huoneenlämpötilassa 5 minuuttia ja laitettiin fosfaattipuskuroituun suolaliuokseen (PBS), huoneenlämpötilassa 3 minuutin ajan. Levyjä pidettiin kuivattu sarjassa etanolia kylpyjä (70%, 90%, 100%) RT: ssa 1 minuutin ajan kullekin ja kuivattiin 10-15 minuuttia huoneenlämpötilassa. Sitten 10 ui koetinta (lämmitettiin RT) asetettiin dia ja kansi-liukastui kanssa 22×22 mm lasipäällyslevyn varmistaa hyvä kattavuus. Reunat kannen slip suljettiin liimalla. Denaturoimiseksi kalvot ne on otettu 75 ° C: ssa 8 minuutin ajan. Sitten levyt pantiin 37 ° C: ssa vähintään 24 tunnin hybridisaation. Hybridisaation jälkeiset, liima ja peitelasit poistettiin ja objektilasit pestiin Wash Buffer I 72 ° C: ssa 2 minuuttia ja sitten nopeasti siirretään Wash Buffer II 1 minuutin ajan RT: ssä. Objektilasit dehydratoitiin uudelleen sarjassa etanolia kylpyjä (70%, 90%, 100%) RT kukin 1 minuutin ajan ja kuivattiin huoneenlämpötilassa. Seuraavaksi 10 ui 4,6-diamino-2-fenyyli (DAPI) levitettiin ja dioja oli kansi-liukastui ja säilytetään pimeässä lämpötilassa 4- 10 ° C: ssa tutkimukseen saakka. Levyjä näkyviksi fluoresenssimikroskopian. Nestemäinen koetin sekoitus koko kromosomin maalaus antureista 1, 2 ja 4, 3 väriä, 3 koetin-yhdistelmä, Cytocell Oy käytettiin.

Scoring.

Metaphase leviää valmistettiin kaikkiaan 38 aiheista. Ainakin 1000 metafaasien pisteytettiin kullekin 22 tutkimukseen osallistuneista ja jäljellä alle 1000 (4 henkilöllä on alle 500 metafaasia sijoitettiin) johtuen alhaisesta leviämisen indeksin tuloksena pienempi määrä metafaasissa leviää. Metaphase levitteet pisteytettiin sokkona varten erilaisista vahingoista, johon kuului vakaa (translokaatioita, poistot ja lisäykset) (kuviot 1 ja 2) ja epävakaa (acentric fragmentteja) vaurioita kromosomeissa 1, 2, ja 4. taajuus kromosomivauriosta laskettiin ja ilmaisi 1000 metafaaseja (solut). Analyysit on tehty näyttämään eroja kaikenlaiset vahingot ja ryhmän stabiilin vahinkoja sekä että kromosomipoikkeavuuksien kokonaismäärä.

kromosomiparia 1 on maalattu punainen, 2 (vihreä) ja 4 (keltainen ).

Tilastolliset menetelmät

Näytteiden koko näkökohdat.

odotetaan tarkkailla keskimääräisen esiintyvyyden kromosomipoikkeavuuksien noin 3/1000 solujen peräsuolen syövän ja noin 1/1000 kontrolliryhmässä (SD = 2/1000 solut). Olettaen alfa = 0,05 ja voima tavoite = 0,90 jouduimme tutkimaan 23 henkilöä per ryhmä. Olettaen voima tavoite = 0,80 vaadittu otoskoko oli 17 ryhmää kohti. Lukumäärä verinäytteiden alennettiin se oli ensisijaisesti suunnitellut tutkimuksessamme, mutta siellä oli vielä 20 ja 18 verinäytettä käytettävissä tapauksissa ja valvontaa, vastaavasti, siksi uskotaan, että näytteen antaisi meille mahdollisuuden vastata tutkimuksemme kysymyksiin.

tilastot ja analysointi.

Vaikka tutkimuksessa oli tarkoitus olla tapausten ja kontrollien sovitettu iän ja sukupuolen, saatavuus verinäytteiden aiheutti että useita aiheita erosivat eri ryhmien. Tarkempi tilasto on toimittanut mediaanit ja rajat muun kvartiili alue (IQR). Koska otoskoko oli suhteellisen pieni ja kyvyttömyys hylätä nollahypoteesin suhteen vastaavuus normaalijakaumaa voidaan määrittää näytteen koon, erot CRC potilaiden ja verrokkien testattiin nonparametric U-Mann-Whitneyn testi jatkuvien muuttujien . Chi-square testiä käytettiin kategorinen ja Cochran-Armitage testi järjestysluku muuttujia. Kerroinsuhde (OR) saatu logistinen regressio käytettiin arvioimaan kertoimet (likiarvon riski) CRC liittyy usein poikkeavuuksia. Seuraavissa malleissa on analysoitu: I) sen univariable mallia; II) malli harkitsee ravinnon rauta (proxy mitta lihan kulutuksen jatkuva) yhtenä kovariaattina; III) malli, jossa tupakointi yhtenä kovariaattina; IV) malli harkitsee hedelmien ja vihannesten kulutusta (Annosten määrä viikoittain, jatkuva) yhtenä kovariaattina; ja V) mallina harkitsee hedelmien ja vihannesten kulutuksen kategoriseksi jonka kolmannekseen yhtenä kovariaattina. Rajallinen määrä covariates on käytetty vuoksi pieni otoskoko, mutta on syytä mainita, että ryhmät olivat varsin vertailukelpoisia mukaan perusominaisuuksia. Analyysit tehtiin jonka Stata /IC 13.1 for Windows (64-bittinen x86-64) StataCorp LP ohjelmisto. Ei ollut puuttuvia tietoja saatavilla näytteessä. Merkitsevyystaso 0,05 käytettiin.

Tulokset

perusominaisuuksia tutkimukseen osallistuneista on esitetty taulukossa 1. mediaani-ikä oli 62 vuotta (ensimmäinen neljännes: 54, kolmas neljännes: 66 ), ja 50%: n ryhmässä oli miehiä. Kontrollit olivat hieman nuorempia, savustettu useammin, kulutetaan enemmän vihanneksia ja hedelmiä, ja oli pienempi määrä rautaa niiden ruokavaliosta. Kukaan ero oli tilastollisesti merkitsevä. CRC potilailla oli merkitsevästi korkeampi taajuus Translokaatiokantajat, vakaa poikkeavuuksien yhteensä poikkeamia kromosomi 1 ei ollut eroja havaittu kromosomi 2 ja kromosomi 4 (taulukko 2).

Koska päätarkoitus tutkimuksen tarkoituksena oli arvioida kertoimella CRC liittyy kromosomivaurioita PBL, olemme päättäneet analysoivat vain kromosomien joilla on eroja CA ryhmien välillä. Muutama säätö kuten myös vihannesten ja hedelmien kulutusta, kasvua CRC kertoimet toiselle siirtämistä (OR = 1,71-1,82 poikki malleissa), vakaa poikkeamia (OR = 1,62-1,75) ja yhteensä poikkeamia (OR = 1,53-1,66) kromosomissa 1 on havaittu. CRC riski myös kasvaa, jos toiselle siirtäminen, vakaa poikkeavuuksien kromosomipoikkeavuuksien kokonaismäärä varten kromosomien 1, 2 ja 4 analysoitiin yhdessä, mutta kasvu riski oli vaatimaton (OR = 1,24-1,46) (taulukko 3). Muita analyysin arvioimaan, millainen vihannesten ja hedelmien kulutus paljasti lasku CRC riski poikki kolmannekseen kulutuksesta malleissa otetaan huomioon joko määrän vakaa poikkeavuuksien varten kromosomien 1, 2 ja 4 tai kromosomipoikkeavuuksien kokonaismäärä näiden kolmen kromosomien (Taulukko 3). Tiedot asettaa taustalla havaintoja on saatavilla S1 File.

Keskustelu

Päätimme käyttää FISH tekniikkaa, koska se koetaan tehokas väline spesifisten kromosomipoikkeavuuksien vuoksi sen suuri herkkyys ja nopeus, jolla määritykset voidaan suorittaa. Tekniikka toimii diagnostiikassa moniin syöpiin [17]. FISH menetelmää käytetään tunnistamaan kromosomin epävakaus biomarkkereita muulla syöpätutkimuksessa [18,19]. Olemme valinneet kromosomi 1, 2 ja 4, koska se edustaa 22,71% miehistä ja 22.34% naisten genomin arvioima kromosomista fyysiset pituudet [16]. On geenejä hMSH2 ja hMLH1 sijaitsee kromosomissa 2p ja 3p [20], ja MYH geeni kromosomissa 1, välillä p32.1 ja p34.3, jotka mutaatiot liittyivät peräsuolen syöpä [21]. Vaikka suurin osa FISH tutkimuksia suoritetaan biopsia materiaalien diagnoosia tai luokittelua kasvaimia, vuonna esiteltiin tutkimuksessa käytimme PBL analysointiin erityisiä kromosomimuutokset joista kromosomien 1, 2 tai 4.

Tutkimus on osoittanut kasvua poikkeamat kromosomi 1, kun määrä Translokaatiokantajat määrä vakaa kromosomipoikkeavuuksien kuten translokaatiot, poistot ja lisäykset sekä kromosomipoikkeavuuksien kokonaismäärä (vakaa ja epävakaa) PBL mahdollisesti liittynyt lisääntyminen kertoimella paksusuolen syöpä. Emme havainneet mitään yhdistys poistoista tai insertiot tälle kromosomi joko niiden katsottiin erikseen tai lukumäärää acentric palasia. Ei ollut eroja havaittu vahinkojen taso kromosomissa 2 ja kromosomi 4 välillä CRC potilaiden ja verrokkien.

On yleinen yksimielisyys siitä, että syöpien, kuten CRC, kehittää seurauksena kertyminen geneettisen vaurion [ ,,,0],3,22,23], siis mitattaessa taajuus kromosomipoikkeavuuksien näyttää olevan hyvä keino ennustamiseksi kertoimella syövän takia geneettisten polymorfismien, xenobiotic aineenvaihduntaa, tehokkuus DNA: n korjaukseen ja rooli genotoksinen stressi. Siten mittasimme taso vahinkoa joukko erityisiä kromosomien PBL. Perifeerinen veri voidaan kerätä helposti aiheista yksinkertaisella phlebotomy ja kiertävien lymfosyyttien joka edustaa hyvää korvike arvioinnin kromosomin muutoksia kudoksissa [24] voidaan helposti korjattu.

taajuus kromosomipoikkeamia PBL on ollut ehdotettu biomarkkerina genotoksisuuden, etenkin ammatillisissa asetukset [25]. Suhde tiheä varmenteiden ja lisääntynyt syöpäriskiä havaittiin Pohjoismaissa Tutkimuksesta ja Italian tutkimuksessa, molemmat osoittavat lähes 2-kertainen nousu syöpäriskiä korkean tertile varmenteiden ja merkittäviä suuntauksia poikki kolmannekseen [26]. Tulokset kollaboraatiotutkimukseksi 11 eri Euroopan ikäluokat paljasti lisääntynyt syöpäriski poikki kolmannekseen, ja lisäksi havaittiin, että läsnäolo rengaskromosomit liittyi noin 2-kertainen nousu syöpäriskiä [27]. Huomattakoon kuitenkin, että kaikki edellä mainitut tutkimuksissa käytettiin CA mitattuna valomikroskoopilla arvioimaan yleisen riskin kaikille syöpätyyppeihin. Muut tutkimukset julkaistu että aikataulussa ehdotti, että korkea varmenteiden oli selvemmin liittynyt ruoansulatuskanavan ruoansulatuskanavan syöpien, erityisesti vatsa ja CRC [28,29].

tulokset viittaavat kasvua paksusuolensyöpä liittyvät kertoimet lisäystä vakaissa CA riippumatta tasosta hedelmien ja vihannesten käyttö ja tupakoinnista. Tämä on linjassa muiden havaintojen osoitti yhdistyksen välillä varmenteiden ja syöpä, joka ei pelkästään vuoksi joitakin ammatillisia riskejä tai tupakoinnista [30], mikä viittaa siihen, että ”laatua” genomin saattaa myös olla merkitystä. On myös jonkin verran näyttöä siitä, että vaikutuksen ravinnon yhdisteiden estämisessä DNA-vaurioita [12,31,32]. Kuten jotkut mallit sekä varmenteiden ja hedelmien ja vihannesten kulutuksen katsottiin, uskomme, että tämä ylimääräinen sopeutus on yksi vahvuuksista meidän tutkimuksessa, ja tukee oletusta, että lisääntynyt varmentajille saattaa liittyä paksusuolensyöpä.

tutkimuksessamme havaitsimme lasku paksusuolensyöpä kertoimella yli kolmannekseen vihannesten ja hedelmien kulutus ja kasvu liittyy CA, mikäli ne analysoitiin yhdessä. Tämä johti kysymykseen mahdollisesta muuttamista vaikutusta vihannesten ja hedelmien kulutuksen CA ja paksusuolen syövän kertoimet. Interaktiotermi välinen varmenteiden ja kulutuksen vihanneksia ja hedelmiä (cutoff kolmannen tertile) ei ollut tilastollisesti merkitsevä joko kromosomin 1 toiselle siirtämistä (p = 0,080) tai kromosomin 1 yhteensä poikkeamia (p = 0,132) tai kaikkien kromosomien 1, 2 ja 4 toiselle siirtäminen (p = 0,174) tai kaikkien koko kromosomi 1, 2 ja 4 poikkeamia (p = 0,287). Siten tutkimuksemme ei selkeästi osoittanut, muunnos vaikutus vihannesten ja hedelmien kulutuksen CA. Olemme kuitenkin sitä mieltä, että se saattaa johtua rajallisen otoskoko, ja siksi tämä kysymys edellyttää lisätutkimuksia.

Testasimme taajuus kromosomipoikkeavuuksien kromosomien 1, 2 ja 4 ennustajana kerroinsuhde peräsuolen syöpä. Tuloksemme osoittavat, että kertoimet syöpään liittyy määrä kasvaa kromosomin 1 toiselle siirtäminen, sekä määrän vakaa poikkeamia, ja näin ollen kokonaismäärä kromosomin 1 poikkeavuuksia. Emme havainneet mitään yhteyttä kromosomien 2 tai 4 ei ole selkeää näyttöä kromosomimarkkerina CRC riskin. Kuitenkin lisäksi roolia kromosomin 1 CRC riski, on myös näyttöä siitä, että kromosomin sisältää ”suurinta hypermetyloitunut geenien, jotka saattavat lisätä riskiä CRC [8]. Kromosomi 1 Lisäksi ehdotettiin, joiden CRC tuumorisuppressorigeeneille [9]. Joissakin viimeaikaisissa tutkimuksissa tutkivat rooli kromosomin tappioita ja voittoja CRC ensisijainen kasvaimia ja niiden synkronisen etäpesäkkeiden osoitti kromosomimuutoksia (tappiot) ja kromosomeissa 1, 17 ja 18, ja voitot kromosomien 7, 8, 13 ja 20 [33]. Toinen tutkimus osoitti voittoja kromosomi 1, ja myös kromosomien 2, 4, 7, 8, 11 [10]. Tutkimuksessamme yritimme arvioida yleistä alttiutta, joka voi olla ”näkyviä” kuin kertymistä vahinkoja kiertävän veren lymfosyyttejä. Ottaen huomioon todisteet siitä, että kromosomi 1 on tärkeitä geenejä, kuten

MUTYH

geeni (sijaitsee 1p34.1) vastaa DNA: n korjaukseen liittyvät kehittämiseen tuttu adenomatoottisen polypoosin sekä

MTHFR

geenin (at 1p36.3), havaintomme roolia tukevat CA mittauksen ennustamiseen CRC kertoimet.

Opinnäytetyön tarkoituksena oli tutkia kromosomin 1, 2 ja 4 poikkeamia liittyvät paksusuolensyöpä kertoimet. Toinen kohta tarvittiin keskustelua on molekyyli sairaus allekirjoitus. Tavoitteena käyttää molekyylitason sairauden allekirjoituksia, mikä käy ilmi molekyylien patologinen epidemiologian, on ”osa-luokitella tauti ennusteiden parantamiseksi taudin esiintyminen ja eteneminen tarkkuus lääketieteen ja kansanterveyden” [34]. Tutkimuksessamme emme pystyneet arvioimaan geneettistä vaihtelua on paksusuolensyöpä kuin syöpäkudokset ei ole saatavilla meille. Psittakoosin sairauksien ehdotti FAP tyyppi koolonsyöpien värvättiin tutkimusta.

Yhteenvetona tuloksemme osoittavat, että taajuus kromosomipoikkeavuuksien, varsinkin translokaatioita kromosomi 1, havaittiin ääreisverenkierron lymfosyyttien fluoresenssin

in situ

-hybridisaatio whole-kromosomin maalaus, näyttää olevan lupaava menetelmä arvioida kerroinsuhde CRC ja voi voittaa rajoituksia tavanomaisia ​​CA analyysi. Lisäksi meidän tutkimus osoittaa kohtuullisuutta käytön biomarkkerit kuten lymfosyyttien CA seulonnassa ehkäisyohjelmat yksilöille korkeammissa paksusuolen syövän riskiä tunnistaa ne, jotka on suurentunut riski ja vaativat useammin tutkimuksia, esim. by sigmoidoskopiaa.

tukeminen Information

S1 File. Datasarjan taustalla havainnot tutkimuksessa.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0147658.s001

(XLS) B

Kiitokset

Kirjoittajat haluavat kiittää Joseph Scrimali kopio-editointi käsikirjoituksen, ja Prasanna Pat varten copy-muokkausta ja arvokkaita kommentteja, ja kaikki henkilökunnan jäsenet hankkeen voimansa tiedonkeruuseen.