PLoS ONE: Identification of New Candidate Genes and Chemicals liittyvät ruokatorven syöpä käyttäminen Hybrid vuorovaikutusverkosto kemikaalien ja proteiinit

tiivistelmä

Syöpä on vakava sairaus vastaa monia kuolemantapauksia vuosittain sekä kehittyneissä että kehitysmaissa. Yksi syy on se, että mekanismeista kaikkein syöpätyypit ovat edelleen salaperäinen luo loistavan lohkoon suunnittelussa tehokkaita hoitoja. Tässä tutkimuksessa yritimme selvittämään mekanismia taustalla ruokatorven syöpä etsimällä uusia geenejä ja kemikaaleja. Tätä varten, rakensimme hybridi- verkko sisältää sekä proteiineja ja kemikaaleja, ja yleinen olemassa laskennallisen menetelmän aiemmin käytetty tautien tunnistamiseksi geenien tunnistamiseksi uuden ehdokkaan geenien ja kemikaaleja samanaikaisesti. Perustuen jackknife testi, meidän yleistynyt menetelmä suoriutuu tai ainakin toimii samalla tasolla kuin saadaan yleisesti käytetty menetelmä – Random Walk Restart (RWR). Analyysitulokset Lopullisen saatujen geenien ja kemikaaleja osoittaneet, että ne suuresti jaettu geeni ontologian (GO) ehdot ja Kegg sellaisia ​​keinoja suoraa ja epäsuoraa yhdistysten kanssa ruokatorven syöpään. Lisäksi keskusteltiin myös todennäköisyyttä valitun kandidaattigeenejä ja kemikaalit ovat uusia geenejä ja kemikaalien liittyy ruokatorven syöpään.

Citation: Gao YF, Yuan F, Liu J, Li LP, hän YC, Gao RJ, et ai. (2015) uusien Candidate Genes and Chemicals liittyvät ruokatorven syöpä käyttäminen Hybrid Interaction Network of Chemicals ja proteiinit. PLoS ONE 10 (6): e0129474. doi: 10,1371 /journal.pone.0129474

Academic Editor: Ying Xu, University of Georgia, Yhdysvallat

Vastaa