Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

MikroRNA (miRNA) ovat pieniä RNA-molekyylejä, jotka säätelevät ilmentymistä vastaavan lähetti-RNA: iden (mRNA: t). Yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) in miRNA voi edistää syöpäalttiutta johtuen muutoksista microRNA ominaisuuksien ja /tai kypsymistä. Esillä Tutkimuksessa tarkasteltiin yhdistyksen kahden miRNA polymorfismien (miR-499 rs3746444 ja miR-149 rs2292832) ja maha (GI) syöpäriskiä.

Menetelmät /Principal Havainnot

Teimme etsimään tapausverrokkitutkimukset PubMed, Wiley Online Library, Web of Science ja CNKI tietokantaan. Yksitoista rs3746444 tutkimukset ja kuusi rs2292832 tutkimuksia mukana meidän meta-analyysi. Ainoa ilmeinen assosiaatio miR-499 polymorfismi ja peräsuolen syövän alttiuden havaittiin homotsygoottinen verrattuna (GG vs. AA: OR = 1,66, 95% CI: 1,02-2,70,

P

h = 0,10,

P

= 0,04). Ei arvioe fi kallistuksen yhdistys löydettiin alaryhmäanalyysissä varten etnisyyden ja riskien hepatosellulaaristen ja mahasyövän. Marginaalisesti koholla GI syöpäriskiä löydettiin väistyvä malli miR-149 (TT vs. TC + CC: OR = 1,15, 95% CI: 1,03-1,30,

P

h = 0,68,

P

= 0,02). Kerrostetaan tulokset etnisyyden paljasti hieman assosiaatio väistyvä malli ja Aasian väestöstä (TT vs. TC + CC: OR = 1,14, 95% CI: 1,01-1,29,

P

h = 0,79

P

= 0,03).

Johtopäätökset /merkitys

Tämä meta-analyysi osoittaa, että miR-499 voi liittyä riski peräsuolen syöpään. MiR-149 voi antaa heille hieman kohonnut alttius ruoansulatuskanavan syöpään, erityisesti aasialaiset.

Citation: Li L, Sheng Y, Lv L, Gao J (2013) Association between Two MicroRNA variantit (miR-499, miR-149) ja Ruoansulatuskanava Cancer Risk: meta-analyysi. PLoS ONE 8 (11): e81967. doi: 10,1371 /journal.pone.0081967

Editor: Steven George Rozen, Duke-NUS, Singapore

vastaanotettu: 16 huhtikuu 2013; Hyväksytty: 18 lokakuu 2013; Julkaistu: 29 marraskuu 2013

Copyright: © 2013 Li et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat keskeinen hanke Chongqing Medical Science Foundation (20111055) ja National Natural Science Foundation of China (81101827). Rahoittajat oli rooli tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

MikroRNA (miRNA) ovat osajoukko lyhyt, endogeenisten ei-koodaavat RNA: t, jotka avainasemassa säätelyssä ilmaisun monien solun proteiinien. On arvioitu, että yksi miRNA voi mahdollisesti kohdistaa satoja mRNA: iden ja että lähes 30% proteiinia koodaavan geenien ihmisen genomin voidaan säädellä miRNA [1]. Tähän mennessä yli 1200 miRNA sekvenssit on tunnistettu ihmisillä; kuitenkin tiettyjä toimintoja ei ole vielä tunnistettu useimmat näistä sekvensseistä. MiRNA voi toimia vapauttamisen tärkeitä geenejä, jotka ovat avainasemassa kasvainten synnyssä, kasvainten kehittymiseen, ja angiogeneesissä tai voi olla onkogeeniset tai tuumorisuppressoriproteiinia rooleja [2]. MiRNA jotka sijaitsevat kromosomialueita monistettavien syövät voivat toimia onkogeenien, kun taas miRNA sijaitsevat alueilla, jotka on poistettu syöpiä voidaan toimia tuumorisuppressoreilla [3,4]. Todisteet on myös osoittanut, että maailmanlaajuista vähentämistä miRNA käsittely lisää syöpäalttiutta, ja miRNA profilointi on käytetty onnistuneesti luokitella kasvainten [4,5].

Yhden nukleotidin polymorfismien (SNP: t) tai mutaatioita miRNA sekvenssit voivat muuttaa miRNA ilmentyminen ja /tai kypsymisen, muuttamisen lisäksi vaikutuksia miRNA niiden kohdegeenien. SNP: t ovat yleisin geneettisen vaihtelun ja liittyy väestön monimuotoisuuden, alttius sairauksille ja yksilöllisestä vasteesta lääkkeen [6]. SNP voi häiritä miRNA-kohde vuorovaikutus, jolloin vapauttamisen kohdegeenin ilmentymisen, kuten on esitetty ei-pienisoluinen keuhkosyöpä [7]. Hoffman et ai. paljasti, että miR-196a-2 saattaisi olla potentiaalisesti kasvaimia synnyttävän rooli rinta kasvainten synnyssä, ja toiminnallinen geneettinen muunnos kypsän alueen miR-196a-2 voisi toimia uutena biomarkkeri rintasyövän alttius [8]. Muissa tutkimuksessa Zeng et al. todettu, että rs2910164 SNP miR-146a liittyi kohonnut mahalaukun syövän riski Kiinan väestöstä [9]. Sen sijaan yksikään 40 miRNA liittyvää geenipolymorfismien tunnistettiin itsenäisinä ennustetekijöitä markkereita Korean potilaille, joilla on kirurgisesti resektoitiin kolorektaalisyöpä [10].

rooli geneettisten varianttien miRNA GI syöpäalttiutta vielä tunneta laajalti . Useat viimeaikaiset raportit tunnistetaan yhdistyksen kahden geneettisen miRNA variantteja (miR-499 rs3746444 ja miR-149 rs2292832) ja maha-suolikanavan syöpä. Esimerkiksi Xiang et ai. totesi, että yksilöiden miRNA-499 GG genotyypin olivat noin kolminkertaiseksi alttiimpia maksasolusyövän (HCC) (OR = 3,63, 95% CI: 1,545-8,532) kuin yksilöiden AA genotyyppi [11]. Sen sijaan, Kim et ai. osoitti, että yksilöiden AG + GG genotyypin MIR-499 A G rs3746444 variantti on merkitsevästi pienempi riski HCC kuin yksilöiden AA genotyyppi. Potilaat, joilla MIR-149C T CT ja CT + CC genotyypit on huomattavasti pienempi riski HCC (CT; AOR = 0,542, 95% CI: 0,332-0,886, CT + CC; AOR = 0,536, 95% CI: 0.335- 0,858) [12]. Tutkimus Taiwanissa ei havaittu huomattavia yhdistyksen välillä miRNA149 geenipolymorfismien ja riski suusyövän [13]. Nämä tulokset ovat ristiriitaisia ​​ja epäluotettavia. Siksi teimme meta-analyysi kaikista hyväksyttävistä tutkimuksia saadakseen tarkemman arvion yhdistyksen näiden kahden SNP ja maha-suolikanavan syöpien.

Materiaalit ja menetelmät

Julkaisu etsi

Haimme PubMed, Wiley Online Library, Web of Science ja CNKI tietokanta julkaistut tutkimukset välillä 1. tammikuuta 2000, ja 1. tammikuuta 2013. haku rajattiin ihmiseen. Avainsanoja käytetään haku sisältyvät: ”microRNA tai miRNA”, ”syöpä tai kasvain, geeni tai polymorfismi tai muunnelma” ja ”miR-499 tai rs3746444, miR-149 tai rs2292832”. Vain julkaistut tutkimukset kokotekstiartikkeleita olivat mukana. Kaikissa tutkimuksissa vastaavat kelpoisuusehdot mukana meidän meta-analyysi.

ja poissulkukriteereitä

sisällytettyjen tutkimusten meta-analyysin täyttivät seuraavat kriteerit: 1) Tutkimus suunniteltiin tapauskontrollitutkimuksessa, 2) välinen yhteys luki- 499 polymorfiana miR-149 polymorfismi ja maha syöpäriski tutkittiin ja 3) tutkimus sisälsi riittävästi tietoja laskennan kertoimet suhteet ja vastaavat 95% luottamusväli (syrjäisimmille alueille, 95% CI). Non-artikkelia, ei-tapausverrokkitutkimukset, tutkimuksia, jotka monistaa aikaisemmat julkaisut, tutkimukset, joissa syöpäsolut ja tutkimukset tutkivat eläinmalleissa suljettiin pois.

Data louhinta

uutetaan tarvittavat tiedot siitä lopull voivat artikkeleita itsenäisesti käyttäen kriteereillä yllä. Seuraavat tiedot uutettiin kustakin sisällytit: nimi ensimmäisen tekijän, julkaisuvuosi, alkuperämaa, potilaan etnisyys (valkoihoinen, Aasian tai muu), syöpä tyyppi, genotyyppaus menetelmässä tapausten kokonaismäärä ja valvonnan määrä genotyyppi tapausten ja kontrollien ja

P

-arvot Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) ja kontrolliryhmiin.

Laadunarviointi

laatu tutkimuksissa oli itsenäisesti arvioitiin käyttäen ennalta määrättyjä kriteerejä, uutettiin ja muutettu aiemmista tutkimuksista [14,15,38] (taulukko 1). Nämä tulokset perustuivat perinteiseen epidemiologisten seikkojen ja syövän genetiikka kysymyksiä. Tulokset vaihtelivat alimmillaan nollan ja korkeimmillaan 18 kanssa korkeammat pisteet esitettiin parempaa laatua. Nämä artiklat pisteytys 12 luokiteltiin ”” huonolaatuista ” ’, sekä esineet pisteytys ≥12 pidettiin” korkealaatuisina ”.

Peruste

Pisteet

Lähde tapauksissa valitut väestöstä tai syöpä rekisterin 3 Valitaan hospital2 valitaan patologia arkistoista, mutta ilman description1 Ei kuvattu 0Source valvonnan Population-based3 verenluovuttajia tai volunteers2 Hospital-pohjainen (syöpä-vapaa potilasta) 1 Ei described0Case-ohjaus ottelu sovitettava iän ja sukupuolen 3 Ei sovitettava iän ja gender0Specimens käytetään määritettäessä genotyypit Valkosolujen tai normaaleissa kudoksissa 3 kasvain kudosten tai kuorinnan soluihin tissue0Hardy-Weinberg tasapaino valvonnan Hardy-Weinberg tasapainoon 3 Hardy-Weinberg disequilibrium0Total otoskoko 10003 500 ja 10002 200 ja 5001 2000Table 1. Asteikko laadun arviointiin.

CSV Lataa CSV

Tilastolliset menetelmät

Käytimme Cochrane Review Manager Versio 5.1 (https://ims.cochrane.org/revman/download) ja Stata /SE ohjelmisto 12,0 (Stata Corporation, College Station, Texas) analysoimaan tietoja kunkin tutkimuksen. Syrjäisimmillä alueilla ja 95% CI laskettiin laskemiseksi vahvuus yhdistyksen kahden SNP (miR-499 rs3746444, miR-149 rs2292832) ja alttius GI syöpään käyttäen raportoitu alleeli ja genotyyppi taajuudet tapauksissa ja valvontaa. Yhdistetty syrjäisimmillä alueilla laskettiin geneettisen mallit (G vs. A), homotsygoottinen vertailu (GG vs. AA), heterotsygoottinen vertailu (AG vs. AA), hallitseva malli (GG + AG versus AA), ja resessiivinen malli (GG vs. AG + AA ), kuten miR-149. Alaryhmäanalyyseissa tehtiin rotuun laskeutuminen ja kasvaimen tyyppi.

merkitys Yhdistettyjen syrjäisimpien alueiden määritettiin käyttämällä Z-testi; P-arvo 0,05 katsottiin tilastollisesti merkitsevä. Chi-neliö-pohjainen Q-testi suoritettiin tarkistaa heterogeenisuus. P-arvo on suurempi kuin 0,10 Q-testi osoittaa mitään merkittävää heterogeenisuus tutkimuksia, mikä salli kiinteiden vaikutusten malli voidaan laskea yhdistetyn OR. Jos P-arvo Q testien on alle 0,10, satunnainen vaikutusten malli voisi olla sopivampi.

I

2 indeksi ilmoittaa prosentteina tutkimustenväliseen vaihtelua, joka johtuu heterogeenisyys.

I

2 arvoja 25, 50 ja 75% käytettiin todisteena alhainen, kohtalainen, ja korkea heterogeenisyys, vastaavasti. Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) arvioitiin tutkimusta varten käyttämällä Chi-neliö testi kontrolliryhmissä. P-arvo 0,05 pidettiin osoituksena poikkeamat HWE. Lisäksi julkaisu bias arvioitiin käyttäen Egger n lineaarinen regressio menetelmä ja Begg n suppilo juoni (tilastollista merkitsevyyttä de fi ned kuten

P

0,05).

Tulokset

Ominaisuudet tutkimuksissa

Niistä 69 tutkimusten alussa määriteltyihin, 5 tutkimukset olivat arvioita, 9 tutkimukset olivat meta-analyysit, 24 tutkimuksia ei siitä GI syöpiä, ja 19 tutkimukset eivät ole vertailuryhmällä. Siksi 12 tapausverrokkitutkimukset kuuluivat tähän meta-analyysiin. Vuokaavio Kuvassa 1 on yhteenveto tämän kirjallisuuskatsauksen prosessia. Kaikkiaan 11 tutkimusten [11-13,16-23] liittyy 3275 tapausta ja 3794 verrokkia lopulta analysoitiin miR-499, ja 6 tutkimukset [12,13,21-24] liittyy 2413 tapausta ja 2457 tarkastuksia analysoitiin miR -149. Kaksi miR-499 tutkimuksissa tutkittiin valkoihoisilla ja yhdeksässä tutkimuksessa tutkittiin aasialaiset. Vain yksi miR-149 tutkimuksessa tutkittiin valkoihoisilla, kun taas 5 tutkimuksissa tutkittu aasialaiset. Mietimme potilaalla on suusyövän erillisinä ryhmä ja yhdistetään nämä potilaita kvantitatiivisen analyysin itsenäisesti. Kaikki valvonnan tutkimukset olivat syöpä vapaa ja sovitettu sukupuolen ja iän mukaan. Ominaisuudet Valittujen tutkimusten yhteenveto on esitetty taulukossa 2 ja genotyyppi taajuuden jako on esitetty taulukossa S1. Hardyn-Weinberg tasapaino testi kontrolliryhmissä oli esitetty taulukossa S2.

Tekijän

Year

Alkuperä

Cancer tyyppi

Ohjaus lähde

genotyypin menetelmä

SNP

Case /ohjaus

HWE valvontaa | Laadukkat score

Xiang2012AsianHCCHBPCR-RFLPrs3746444100/1000.2810Zhou2012AsianHCCHBPCR-RFLPrs3746444186/4830.1014Kim2012AsianHCCPBPCR-RFLPrs3746444159/2010.2713PBPCR-RFLPrs2292832159/2010.3413Akkiz 2011CaucasianHCCHBPCR-RFLPrs3746444222 /2220.0313Ahn 2012AsianGCPBPCR-RFLPrs3746444461/4470.8213PBPCR-RFLPrs2292832461/4470.9713Okubo2010AsianGCHBPCR-RFLPrs3746444552/6970.049Vinci2012CaucasianCRCNRHRMArs3746444160/1780.0210NRHRMArs2292832160/1780.9113Min2011AsianCRCPBPCR-RFLPrs3746444446/5020.4514PBPCR-RFLPrs2292832446/5020.9514Srivastava2010AsianGBCPBPCR-RFLPrs3746444230/2300.5615Chu2012AsianOSCCHBPCR-RFLPrs3746444470/4250.9711HBPCR-RFLPrs2292832470/425 0.018Umar 2012AsianESCCPBPCR-RFLPrs3746444289/3090.0813Zhang2012AsianCRCNRPCR-RFLPrs2292832435/4430.5813GCNRPCR-RFLPrs2292832274/2690.6913Table 2. Ominaisuudet 12 tapausverrokkitutkimukset Mir-499 ja miR-149.

CRC: kolorektaalisyövän; ESCC: ruokatorven okasolusyöpä; GBC: sappirakon syöpä; GC: mahasyöpä; HCC: hepatosellulaarinen syöpä; OSCC: suuontelon levy- syöpä; HWE: Hardy-Weinberg tasapainon verrokkiryhmien PCR-RFLP: polymeraasiketjureaktio-restriktiofragmentin pituuden polymorfismi; HRMA: korkean resoluution sulamisanalyysikokeita; HB: sairaalan johdolla; PB: Väestöpohjaisissa; NR: ei ilmoiteta. CSV Lataa CSV

Meta-analyysin tulokset

Ei ollut todisteita yhdistyksen välisen miR-499 A G-polymorfismi ja GI syöpiä geneettisistä malleista ja alleeli kontrastia, kun kaikki syöpätyyppejä olivat tarkasteltava yhdessä meta-analyysi (kaikki

P

-arvot 0,05, taulukko 3). Kuitenkin, kuten on esitetty taulukossa 3, riski paksusuolen syövän oli lisääntynyt homotsygootti verrattuna, kun analyysi ositettiin kasvaimen tyyppi (GG versus AA: OR = 1,66, 95% CI: 1,02-2,70,

P

h = 0,10,

P

= 0,04) (taulukko 3). Emme voineet tunnistaa merkittävä assosiaatio miR-499 rs3746444 polymorfismi ja maksan syöpä (G vs. V: OR = 1,12, 95% CI: 0,77-1,62,

P

h = 0,004,

P

= 0,55; GG + AG versus AA: OR = 1,09, 95% CI: 0,73-1,64,

P

h = 0,02,

P

= 0,67 ; GG vs. AG + AA: OR = 1,26, 95% CI: 0,92-1,73,

P

h = 0,11,

P

= 0,14; GG vs. AA: OR = 1,27 , 95% CI: 0.60- 2.69,

P

h = 0,04,

P

= 0,54; AG versus AA: OR = 0,99, 95% CI: 0,78-1,26,

P

h = 0,16,

P

= 0,96) (taulukko 3). Samoin vaikutus oli myös ei-merkitsevä mahasyövän ryhmä. Etninen myös otettu huomioon, että alaryhmäanalyysissä. Ei ollut merkittävää yhteyttä välillä miR-499 rs3746444 polymorfismi ja GI syöpäriski neljän geneettisten mallien ja alleeli kontrastin aasialaisilla [(G vs.: OR = 1,11, 95% CI: 0,91-1,35,

P

h 0,0001,

P

= 0,30), (GG + AG versus AA: OR = 1,09, 95% CI: +0,88-+1,35,

P

h = 0,0003,

P

= 0,41), (GG vs. AG + AA: OR = 1,27, 95% CI: 0,99-1,63,

P

h = 0,10,

P

= 0,06), (GG vs. AA: OR = 1,26, 95% CI: 0,84-1,89,

P

h = 0,03,

P

= 0,27) (AG versus AA: OR = 1,06, 95% CI: 0,87-1,28,

P

h = 0,006,

P

= 0,57)]. Samanlainen tulos havaittiin myös valkoihoisista (G vs. V: OR = 1,20, 95% CI: 0,97-1,48,

P

h = 0,29,

P

= 0,09) ( taulukko 3).

MiR-499

GG vs AA

AG vs AA

G vs

GG + AG vs AA

GGVS AG + AA

NOR (95% CI)

P

Hor (95% CI)

P

Hor (95% CI)

P

h

OR (95% CI)

P

Hor (95% CI)

P

hTotal111.33 (0.96,1.85) 0,031 .02 (0.85,1.21) 0.0061.13 (0.96,1.33) 0.00011.08 (0.90,1.30) 0.0011.34 (0.99,1.80) 0.04Cancer typeHCC41.27 (0.60,2.69) 0.040.99 (0.78,1.26 ) 0.161.12 (0.77,1.62) 0.0041.09(0.73,1.64)0.021.26(0.92,1.73)0.11GC21.28(0.85,1.93)0.420.92(0.76,1.11)0.481.01(0.87,1.18)0.220.96(0.80,1.15)0.311.31(0.87,1.96)0.47CRC21.66(1.02,2.70)0.120.94(0.74,1.20) 0.101.14 (0.94,1.37) 0.161.05 (0.83,1.31) 0.961.64(0.61,4.43)0.05Others31.39(0.51,3.78)0.021.21(0.74,1.97)0.0071.25(0.75,2.00)0.00011.23(0.72,2.11)0.00051.33(0.55,3.21)0.04EthnicityCaucasian21.59(0.79,3.16)0.090.80(0.56,1.14)0.261.20(0.97,1.48)0.291.05(0.76,1.43)0.951.69(0.76,3.78)0.03Asian91.26(0.84,1.89)0.031.06(0.87,1.28)0.0061.11(0.91,1.35) 0.00011.09(0.88,1.35)0.00031.27(0.99,1.63)0.10MiR-149TT vs CCTC vs CCT vs CTT + TC vs CCTT vs TC + CCNOR (95% CI)

P

Hor (95% CI)

P

Hor (95% CI )

P

Hor (95% CI)

P

Hor (95%CI)

P

hTotal71.02(0.84,1.24)0.790.83(0.69,1.00)0.991.06(0.97,1.16)0.810.92(0.77,1.10)0.981.15(1.03,1.30)0.68Cancer typeCRC31.07(0.81,1.42)0.620.86(0.66,1.11)1.001.06(0.94,1.21)0.980.94(0.74,1.20)0.991.16(0.97,1.38)0.63GC20.99(0.70,1.40)0.980.79(0.56,1.12)0.631.07(0.92,1.25)0.880.89(0.64,1.24)0.791.18(0.96,1.45)0.61Others20.95(0.62,1.46)0.170.82(0.52,1.30)0.541.07(0.76,1.51)0.090.90(0.59,1.36)0.311.11(0.87,1.42)0.10EthnicityAsian60.99(0.81,1.21)0.850.83(0.67,1.02)0.981.06(0.97,1.16)0.710.91(0.75,1.11)0.951.14(1.01,1.29)0.69Table 3. Meta-analyysi miR-499 ja miR-149 ruoansulatuskanavan syöpään herkkyys.

P

h:

P

arvo Q-testi heterogeenisuus test.Random -effects mallia käytettiin, kun P-arvo 0,10 heterogeenisyyden testissä; muuten, kiinteiden vaikutusten mallia käytettiin. CSV Lataa CSV

Mir-149, oli hieman kasvanut syöpäriski on väistyvä malli (TT vs. TC + CC: OR = 1,15, 95% CI: 1,03-1,30,

P

h = 0,68,

P

= 0,02). Lievä yhdistys todettiin myös aasialaisilla on väistyvä malli (TT vs. TC + CC: OR = 1,14, 95% CI: 1,01-1,29,

P

h = 0,69,

P

= 0,03) (kuvio 2). Ei kuitenkaan ole merkittäviä esiintynyt eroja MIR-149 polymorfismi ja peräsuolen syövän ja mahasyövän tahansa geneettisen mallien kun analyysi stratifioitiin syöpätyypin. Tulokset on esitetty taulukossa 3.

B: Forest juoni syöpään liittyvän riskin miR-149 (TT vs TC + CC) eri etnisyys.

Test heterogeenisyys ja herkkyysanalyysin

Ei ollut merkittävä heterogeenisyys tutkimuksissa miR-499. Sitten arvioitiin lähde heterogeenisyys kaikissa vertailuissa ja alaryhmiä. Sen jälkeen kerrostuneisuuden erilaisuuteen väheni selvästi alaryhmissä HCC, GC, CRC (

P

h 0,10 ja I

2 50% useimmissa geneettinen vertailuissa) (taulukko 3) . Edelleen, meta-regressio käytettiin tutkimuksessamme. Kuten taulukosta 4, kaikki tekijät poimittu julkaisuja, kuten genotyypitysmenetelmää (PCR-RFLP tai HRMA), lähde ohjaus (sairaaloiden tai väestöön perustuva), koko (yli 500 sata kokonaismäärä tai muu,

P

of HWE (

P

0,05 tai muuten) ei lähde heterogeenisyys.

tekijät

GG vs AA

AG vs AA

G vS

GG + AG vs AA

GG vs AG + AA

lähde control0.110.100.080.070.13Genotyping method0.300.210.560.900.11Size0.320.560.600.930.29HWE0.580.370.850.830.44Table 4. tulokset Meta-regressio rs3746444 (P).

CSV Lataa CSV

Sitten herkkyys analyysi. Poistimme yhden tutkimuksen yleisestä Yhdistetyn analyysin aina tarkistaa vaikutuksen poistetun datajoukon yleistä syrjäisimmillä alueilla. mir-499, yhdessä tutkimuksessa [13] muutti Tutkimusten välisten heterogeenisuus aineellisesti (AG vs. AA: Ph nousi +0,004-+0,34, GG + AG vs. AA: Ph nousi 0,001-0,15). Sen jälkeen poissulkeminen toisessa tutkimuksessa [18] meidän tutkimuksessa Tutkimusten välisten heterogeenisuus ja yhdistettiin syrjäisimpien muuttunut merkittävästi. Tulokset homozygoottisia vertailun (GG vs AA) muutettiin OR = 1,33, 95% CI: +0,96-+1,85,

P

h = 0,003,

P

= 0,09 OR = 1,45, 95% CI: 1,06-1,99,

P

h = 0,08,

P

= 0,02. Tulokset peittyvästi mallin (GG vs AG + AA) muutettiin OR = 1,34, 95% CI: 0,99-1,80,

P

h = 0,04,

P

= 0,06 OR = 1,43, 95% CI: 1,16-1,76,

P

h = 0,11,

P

= 0,0006 (kuva 3). Varovaisuutta tulee noudattaa, jos tarkastellessa näiden kahden vertailun. Mir-149, The Tutkimusten välisten heterogeenisuus ja yhdistettiin syrjäisimpien ei olennaisesti muuttunut.

. Ennen poissulkeminen tutkimuksessa Umar et al: n tutkimuksessa. B. Kun poissulkeminen Umar et al: n tutkimuksessa.

Julkaisu bias

Käytimme Egger testi ja Begg testi käyttää julkaisun bias kirjallisuutta millään vertailussa malli kaksi SNP. Tulos Egger testissä ei havaittu tilastollisesti merkittävää näyttöä julkaistavaksi bias kahden SNP (kaikki

P

-arvot 0,05, taulukko S3). Eikä selvää epäsymmetria havaittu Begg n suppiloon tontteja (mir-499 rs3746444, AG vs. AA, miR-149 (TC vs. CC) (kuva 4).

Jokainen piste edustaa erillistä tutkimusta osoitetut yhdistys. Log (tai), luonnollisen logaritmin OR. Vaakaviiva tarkoittaa vaikutus koko. V: miR-499 (AG vs. AA), B: miR-149 (TC vs. CC).

keskustelu

SNP: t ovat yleisimpiä geneettisiä sekvenssimuuntelun ihmisen genomin. Nämä vaihtelut voivat vaikuttaa koodaus ja silmukointi miRNA sekvenssit, jotka voivat vaikuttaa syöpäalttiutta populaatiossa [25]. SNP miRNA voi vaikuttaa miRNA toiminto moduloimalla transkriptiota ensisijaisen transkriptio pri-miRNA ja pre-miRNA käsittely ja kypsymisen tai miRNA-miRNA vuorovaikutukset, mahdollisesti myötävaikuttaa syöpäalttiutta [26]. Jotkin tapausverrokkitutkimukset ja meta-analyysit ovat paljastaneet yhteyksiä syövän riskien ja geneettiset vaihtelut miRNA-koodaavat alueet. Yksi meta-analyysi kertoi, että miR-196a2 rs11614913 polymorfismi voi lisätä alttiutta ruoansulatuskanavan syöpiin [34]. MIR-146a rs2910164 ja miR-196a2 rs11614913 polymorfismien ei saa liittyä riski maksasolusyövän [35]. CC genotyyppi on-miR-146a rs2910164 polymorfismi havaittiin liittyvän lisääntynyt riski rintasyövän eurooppalaiset [36]. Mitään merkittävää assosiaatioita miR-146a G /C polymorfismin ja syövän riskiä havaittu, kun tukikelpoisten tutkimukset yhdistettiin osaksi meta-analyysi [37]. Tässä tutkimuksessa, suoritimme meta-analyysi kaikista käytettävissä julkaistut tutkimukset tutkia assosiaatiota miR-499 polymorfismi (rs2910164) ja miR-149 polymorfismi (rs292832) ja alttius ruoansulatuskanavan syöpään selventämiseksi ristiriitaisia ​​tuloksia aiemmista raporteista.

MiR-499 ansaitsee lisähuomiota ihanteellisena biomarkkerina syövän synnyn johtuen sen osallistumisesta biologisissa prosesseissa, kuten solujen vanhenemista, apoptoosin, tulehdusta ja immuunivasteen, jotka kaikki ovat ratkaisevia kehittymistä ja etenemistä syövän [27-29]. Aikaisempi tutkimus paksusuolisyövän todettu, että yli-ilmentyminen miRNA- 499 voi helpottaa siirtymistä ja hyökkäys syöpäsolujen in vitro, sekä etäpesäkkeiden keuhkoihin ja maksaan in vivo. Lisäksi tämä tutkimus havaitsi forkhead laatikko O4 (FOXO4) ja ohjelmoidun solukuoleman 4 (PDCD4) suorina toiminnallinen kohteina miRNA499 [30]. Johtuen Umar er al. (ESCC) on vaikutusta kokoajana Syrjäisimpien alueiden homozygoottisia vertailua ja peittyvästi malli, tulokset meta-analyysi on saattanut vaikuttaa. Geeni-ympäristö vuorovaikutus (tupakoitsijoita, tupakka chewers, juovat, työperäinen altistuminen) voi olla tärkein tekijä. Enemmän hyvin suunniteltu perustuvat tutkimukset suurempi otoskoko tarvitaan selkeä -alueella. Vuonna alaryhmäanalyysi syöpätyypin, Umar er al. (ESCC) ei ole vaikutusta CRC, HCC ja GC. Joten tulokset olivat vakiintunut. Meidän meta-analyysi osoitti lisääntynyt paksusuolisyövän riskin henkilöillä, jotka ovat homotsygoottisia miR-499 polymorfismi. Tämä oli ensimmäinen meta-analyysi löytää että miR-499 vaikuttaa paksunsuolen syöpään altistava. Emme kuitenkaan ei löytänyt mitään korrelaatiota miR-499 polymorfismi ja muiden syöpien, kuten maksasyövän ja mahasyövän.

MiR-149: n on osoitettu toimivan sekä tuumorisuppressorina [31] ja onkogeenin [32] kehittämiseen useita erityyppisiä kiinteitä kasvaimia. MiR-149 voi toimia tuumorisuppressori mahalaukun syövän solujen ja on tärkeä rooli estämään

ZBTB2

. Siksi downregulation miR-149 edistää mahasyövässä solujen lisääntymisen ja solusyklin etenemisen [33]. Kuitenkin toinen tutkimus osoitti, että kumpikaan homozygoottien eikä heterotsygooteilla mutatoitunut miR-149 genotyyppien osoitti kohonnut peräsuolen ja mahasyövän [23]. Esillä meta-analyysissä selvitettiin assosiaatiota miR-149 C T polymorfismin ja yleisen syöpäriskin resessiivinen mallissa (TT vs. TC + CC: OR = 1,15, 95% CI: 1,03-1,30,

P

h = 0,68,

P

= 0,02). Lisäksi marginaalisesti suurentunut riski todettiin aasialaisilla on väistyvä malleissa (TT vs. TC + CC: OR = 1,14, 95% CI: 1,01-1,29,

P

h = 0,79,

P

= 0,03). Nämä kaksi seikkaa olivat poikkeaa edellisestä meta-analyysi. Emme kuitenkaan ei löytänyt yhdistyksen välillä miR-149 C T polymorfismin ja maha- ja peräsuolen syövät, muun syöpätyyppeihin. Koska vain yksi tutkimuksessa tutkittiin valkoihoisilla, emme pystyneet allas syrjäisimmille alueille.

Tämä meta-analyysi (3275 tapausta ja 3794 säädöt miR-499, 2413 tapauksia ja 2457 säädöt miR-149), joka voi tarjota sopivan tilastollinen voima ja vahvistaa luotettavuutta tuloksia. Kuitenkin, joitakin rajoituksia olisi käsiteltävä. Ensinnäkin vain julkaistujen tutkimusten kuuluivat tähän meta-analyysissä, julkaisemattomat tiedot ja meneillään olevia tutkimuksia ei ole haettu, mikä on saattanut puolueellinen tuloksemme. Toiseksi puute riittävästi hyväksyttäviä tutkimusten rajoittanut ositettu analyysi ylimääräisiä syöpien, kuten ruokatorven okasolusyöpä, sappirakon syöpä ja suuontelon squamous syöpä. Kolmanneksi mahdollisia geeni-geeni vuorovaikutus ja geeni-ympäristö vuorovaikutus arvioitiin tässä meta-analyysi, koska riittäviä tietoja voidaan uuttaa mukana tutkimuksissa. Neljänneksi, kuten useimmat meta-analyysit, tuloksia on tulkittava varoen, sillä ilmeinen Tutkimusten välisten heterogeenisyys joitakin vertailuja. Con fi rming roolia miR-499 rs3746444 polymorfismia miR-149 in GI syöpäriski vaatii lisäksi suuri tutkimuksia eri väestöissä ja eri syöpätyyppien.

Näin ollen, vaikka rajoitettu satunnaistetuissa kontrolloiduissa kokeissa tietoja saatavilla erityistä vertailujen miR-499 polymorfismi (rs2910164) voidaan liittää lisääntynyt alttius peräsuolen syöpä. MIR-149 polymorfismi (rs292832) voivat marginaalisesti edistää ruoansulatuskanavan syöpään alttius, perustuu yhdistetyt tutkimukset, erityisesti aasialaiset. Kuitenkin suurempia hyvin suunniteltu tutkimuksia aiheita saman etnisen taustan ja biologisia ominaisuuksia on perusteltua vahvistaa nämä tulokset.

tukeminen Information

tarkistuslista S1.

PRISMA tarkistuslista.

doi: 10,1371 /journal.pone.0081967.s001

(DOC) B Kuva S1.

syöttää tietoja Cochrane Review Manager koneluettavassa muodossa.

doi: 10,1371 /journal.pone.0081967.s002

(RM5) B Taulukko S1.

genotyypit jakelu tutkimusten mukana rs3746444 ja rs2292832.

doi: 10,1371 /journal.pone.0081967.s003

(DOC) B Taulukko S2.

Hardy-Weinberg Equilibrium Test rs3746444 ja rs2292832 kontrolliryhmissä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0081967.s004

(DOC) B Taulukko S3.

Egger testi ja Begg testi julkaisun puolueellisuudesta.

doi: 10,1371 /journal.pone.0081967.s005

(DOC) B Taulukko S4.

luettelo 69 tutkimuksista harkita ja syyt osallisuuden tai syrjäytymisen.

doi: 10,1371 /journal.pone.0081967.s006

(DOC) B