Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Useat tutkimukset ovat osoittaneet ennustetekijöiden ja ennustavan mahdollisia molekyylitason markkereita yhdistelmähoidon keuhkosyöpään. Useimmat heistä viittasi kuitenkin käytettävissä alkuvaiheen NSCLC. Tavoitteena tässä tutkimuksessa on korreloida ilmaus useiden mRNA merkkiaineiden bronkoskopia saatu syövän yksilöitä kliiniseen lopputulokseen kehittyneen keuhkosyövän.

Methods

Bronkoskopia syöpä yksilöt otettiin 123 potilasta, joilla radiologisen diagnoosin kehittyneiden keuhkojen kasvain. Out of 123 potilasta 50 oli diagnosoitu okasolusyöpä, 17 adenokarsinooma, 12 NOS, 32 kanssa SCLC ja yksi iso solu neuroendocrinal syöpä. 11 potilaalla muita kasvaimia oli diagnosoitu. Ryhmä oli heterogeeninen suhteessa kliiniseen vaiheeseen, suorituskyky potilaista ja hoidon. Kvantitatiivinen reaaliaikainen PCR suoritettiin ABI 7900 HT kone, jossa Universal Probe Library (Roche) fluoresoivia koettimia. Geenit valittu analyysissä olivat ERCC1, EGFR, BRCA1, CSF1, CA9, DUSP6, STAT1, ErbB3, MMD, FN1, ja CDKN1B.

Tulokset

Yli 50 ng RNA ( määrä pitää riittävänä analyysi) eristettiin 82 ulos 112 keuhkosyöpää yksilöt (73%), mukaan lukien 60/80 (75,0%) NSCLC yksilöitä ja 22/32 (68,7%) SCLC näytteitä. Korkeimmat Cohenin κ kerroin syrjiä pienisoluista, levyepiteelisyöpä ja adenokarsinooma havaittiin CDKN1B, CSF ja EGFR1 (κ = 0,177, p = 0,0041). Monimuuttujafunktiokehitettiin Coxin regressiomallin on osoittanut merkittävää vaikutusta kliinisen vaiheen (p 0,001, RR = 4,19), ERCC1 (p = 0,01, RR = 0,43) ja CA9 (p = 0,03, RR = 2,11) lauseke eloonjäämiseen on ryhmä 60 potilasta NSCLC.

Johtopäätös

Nämä tulokset osoittavat, voidaanko useiden geenin ilmentymisen analyysi bronkoskopia saatu syövän yksilöjen ennustetekijöitä markkereita sädehoidon ja kemoterapia kehittyneiden keuhkosyöpä. Rajoittava tekijä oli suhteellisen suuri osuus näytteistä, joista riittävästi RNA: ta ei voitu eristää.

Citation: Suwinski R, Klusek A, Tyszkiewicz T, Kowalska M, Szczesniak-Klusek B, Gawkowska-Suwinska M, et ai. (2012) Gene Expression alkaen Bronkoskopia Saatiin Kasvainten Näytteet ennustajana tulokset in Advanced Ei voi käyttää Lung Cancer. PLoS ONE 7 (7): e41379. doi: 10,1371 /journal.pone.0041379

Editor: Alfons Navarro, University of Barcelona, ​​Espanja

vastaanotettu 23. huhtikuuta 2012 Hyväksytty: 20 Kesäkuu 2012; Julkaistu: 27 heinäkuu 2012

Copyright: © Suwinski et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus sponsoroi tutkimus avustus NN 403 290636 antamat tiede- ja korkeakouluopetuksesta Puolan. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Useat tutkimukset osoittivat potentiaalia geeniekspressioprofiilit ennustamiseksi tulos ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC) [1] – [8]. Useimmat näistä tutkimuksista viitataan kuitenkin hoidetuista alkuvaiheessa tauti. Saatavuuden ja laadun kasvaimen saatuja näytteitä leikkauksen tekee tästä lähestymistavasta mahdollista, siten eri ennustetekijöitä allekirjoitukset alkuvaiheessa tauti ehdotettiin.

Valitettavasti keuhkokasvaimia diagnosoidaan usein kehittyneissä kliinisessä vaiheessa, jossa sädehoidon ja /tai kemoterapia eivät tärkein hoitovaihtoehtoja. Lisäksi, patologinen diagnoosi pienisoluisen keuhkosyövän (SCLC) vastaista käyttöä kirurgian useimmissa tapauksissa. Näin ollen ennustetekijöiden allekirjoitukset viittaavat hoidetuista potilaista leikkaus saattanut rajoittaa mahdollisesti soveltuvuutta yksilöille ja aineistoja, joissa kemoterapiaa ja /tai kemoterapia on pääasiallinen terapeuttinen vaihtoehto. Voidaan olettaa, että samat geenit altistavat kasvainsolut huonosta erilaistumista, siten taipumus levittämiseen leikkauksen jälkeen, saattaa merkitä parannettu säteilyherkkyyttä ja /tai kemosensitiivisyys lyhyiden solujen muodostumisesta. Tällaiset erot korostavat kysyntää määrityksiä, jotka arvioivat Geeniekspression bronkoskopia saatu kasvain näytteet, ja ne liittyvät ilmaisu kliiniseen lopputulokseen. Kehittäminen prognoosi- allekirjoitukset pitkälle käyttökelvottoman kasvaimia on jäänyt kuitenkin jäljessä samanlainen yrittää kirurgisesti saatu yksilöt [9]. Tämä loi perustan tässä tutkimuksessa.

Methods

Potilaat

Valintakriteerit osallistui potilaita, joilla radiologisesti diagnosoitu keuhkosyöpä kasvain, joka epäiltiin syövän hoitoon. Vain potilaiden keuhkojen pääsee kehittynyt kasvaimia, katsotaan käyttökelvottoman klo alustavan diagnoosin, otettiin huomioon. Tietoisen suostumuksen vaadittiin sisällyttämistä tutkimukseen. Protokolla Tutkimuksen hyväksyi paikallinen bioeettisiä komitean kansallisten määräysten mukaisesti.

Marraskuun 2006 huhtikuu 2009 kasvain näytteet saatiin rutiinikäytössä bronkoskopia 123 potilaalla. Näytteet arvioidaan heti biopsia ja osa näytteestä käytettiin patologiset tutkimukset, kun taas jäljelle jäävä osa säilytettiin geenin ilmentymisen analyysi.

loppu 123 potilasta 50 (40,6%) oli diagnosoitu levyepiteelisyöpä , 17 (13,8%) kanssa adenokarsinooma, 12 (9,7%) ja NOS (ei toisin mainita) NSCLC, 32 (26,0%), pieni keuhkosyöpä ja yksi iso solu neuroendocrinal syöpä. 7 potilaalla muissa elimissä oli diagnosoitu, mukaan lukien 2 lymfoomatapausta ja 5 etäpesäkkeitä. 2 potilaalla kasvain ei näytä olevan pahanlaatuinen, ja 3 tapauksissa lopullista patologinen diagnoosi ei voitu muodostaa.

Yhteenvetona 112 ulos 123 näytettä (91,1%) käytettiin tutkimuksessa. Tämä sisälsi 80 näytettä ei-pienisoluinen keuhkosyöpä, ja 32 pienisoluinen keuhkosyöpä.

Gene Expression Analysis

Kasvaimen näytteet sijoitettiin 5 ml: ssa RNA: n myöhemmin, ja varastoidaan -20 ° C ennen analysointia. Eristäminen RNA: ta suoritettiin RNeasy Midi Kit (Qiagen) tavanomaisten menettelyjen mukaan. Puhdistettu RNA säilytettiin -70 ° C: ssa. Pitoisuus RNA arvioitiin spektrofotometrisesti (260 nm absorptio) käyttäen NanoDrop ND-1000. Laatu RNA arvioitiin kapillaarielektroforeettisesti vuonna Bioanalyzer 2100 (Agilent Technologies) käyttäen RNA 6000 Nano Pitoisuus. Tietty RNA: n hajoamisen arvioitiin arvio RNA Integrity Number (RIN). cDNA syntetisoitiin RNA matriisi käänteistranskriptiolla käyttämällä Omniscript Kit (Qiagen).

kvantitatiivinen reaaliaikainen PCR suoritettiin ABI 7900 HT kone, jossa Universal Probe Library (Roche). Ilmentyminen kohdegeenien normalisoitiin suhteessa kuuden viite geenejä (UBE2D2, PGK1, HADHA, EIF3S10, CCT7 ja B2M).

siihen geenit valittiin analyysi: ERCC1, EGFR, BRCA1, CSF1, CA9, DUSP6, STAT1, ErbB3, MMD, FN1, ja CDKN1B. Tällainen valinta perustui julkaistun ennustetekijöiden allekirjoitukset, joista suurin osa tarkoitetut kirurgiset sarja potilailla, joilla on NSCLC. Taulukossa 1 esitetään yhteenveto todennäköinen toimintamekanismi näiden geenien, samoin kuin odotettu tulos liittyy yli-ilmentyminen geenin. Toteamme, että odotettu tulos viittaa pääasiallisesti alkuvaiheen kasvaimia, eikä potilaille, joilla on edennyt käyttökelvottoman sairaus.

Tilastollinen analyysi

päätavoitteena Analyysin oli luokittelemaan kasvaimet kliinisen ennusteen hyödyntäen tietojen geenien ilmentymisen. Ryhmä oli kuitenkin heterogeeninen suhteessa kasvain patologian, kliinisiä piirteitä ja hoitoa, joka voisi merkittävästi vaikuttaa kliiniseen lopputulokseen, riippumatta geenin ilmentymisen. Siksi tilastolliset menetelmät sallitaan oikaisu sekoittavia kliiniset tekijät.

Vaikutusta geenien ilmentyminen eloonjäämiseen analysoitiin yhden ja usean Coxin regressiomallin. Normalisoitu geenien ilmentyminen oli kaksijakoinen, niin että se merkittiin 0 (alhainen) tai 1 (korkea) käyttäen mediaani ilmaisua merkitys kuin cut-off [2] .Overall eloonjääminen laskettiin aika diagnoosista kuolemaan (sensuroimattomia) tai koska aika diagnoosi viimeiseen seurannan (sensuroitu). Ottaen huomioon valmisteleva Tämän tutkimuksen tarkoitus ja suhteellisen pieni otoskoko, Cox f testiä käytetään arvioimaan merkitystä erojen säilymiseen kahden ryhmän välillä. Tämä testi on suunniteltu analysoimaan pieniä ryhmiä, toisin kuin log-rank-testi, jota käytetään analysointiin suuressa kliinisessä aineistoja.

univariate Cox malli selviytymisen käytettiin laskettaessa suhteellinen riski (RR) kuolemalle kahtia ryhmiä. Vain muuttujia, jotka vaikuttivat merkittävästi tai että osoitti suuntaus merkitys (RR 0,7 tai RR 1,3 ja p 0,15) katsottiin Monimuuttuja malli. Valinta perustuu tilastollisiin suuntauksia on perusteltua kliinisen heterogeenisyys ryhmä, joka aina kateissa, voisi hämilleen mahdollisia ennustetekijöiden vaikutusta geenien ilmentymisen. Monimuuttujafunktiokehitettiin Coxin suhteellinen vaara regressiomallin tunnistanut muuttujia, jotka merkittävästi ja itsenäisesti vaikuttanut selviytymistä. Mallia optimoitu taaksepäin vaiheittain regressio. Muuttujat, jotka merkittävästi ja itsenäisesti vaikuttaneet eloonjäämiseen oli käytetty prognostinen allekirjoitus perustuu tuloksiin Monimuuttuja tutkimuksen.

Koska kliinistä ennustetta ja hallintaan SCLC eroavat kokonaan NSCLC hengissä nämä kaksi ryhmää analysoitiin erikseen.

geenien tunnistamiseksi, jotka voivat syrjiä 3 suuri patologisen alaryhmien (okasolusyöpä, adenokarsinooma ja pienisoluinen keuhkosyöpä) Studentin t-testiä käytettiin alkaessa. Tutkia edelleen mahdollista suhdetta geenien ilmentymistä ja patologinen tyyppi kasvaimen k-means menetelmää käytettiin. Tämä menetelmä edustaa klusterianalyysiä jolla pyritään osio n havainnot k klustereita, jossa kukin havainto kuuluu klusterin lähin keskiarvo [10]. Paras yhdistyksen välillä ilmauksia geenien ja patologinen tyyppi kasvaimen määritettiin käyttäen Cohenin κ kerroin, joka on tilastollinen mitta välisen Räter sopimus kategorisen kohteita [11]. Toteamme, että geenit analysoitiin tässä tutkimuksessa valittiin mahdollisiksi ennustetekijöiden solumyrkkyterapiassa eikä mahdollisia vaikuttavia tekijöitä välillä kasvaintyypeissä.

Tulokset

Laatu RNA

yli 50 ng RNA (määrä pitää riittävänä analyysi) eristettiin 82 ulos 112 keuhkosyöpää yksilöt (73%), mukaan lukien 60/80 (75,0%) NSCLC yksilöitä ja 22/32 (68,7%) SCLC näytteitä. Niistä potilaista, joilla okasolusyöpä riittävästi RNA: ta saatiin 38/50 (76,0%) verrattuna 12/17 (70,6%), adenokarsinooma ja 10/12 (83,3%), NOS: n kanssa NSCLC. Erittäin hyvä RNA eheys (RIN 8-10) saatiin vain 12,3% näytteistä. Nämä osoittavat, että analyysi bronkoskopia saatu Tuumorinäytteet edellyttää lisää optimointia ennen kliinistä toteuttamista. Analyysi, kuten on esitetty, perustui geenien ilmentymisen tila arvioitiin 82 yksilöitä, joilta riittävästi RNA eristettiin (60 NSCLC ja 22 SCLC).

Gene Expression mukaan patologia kasvaimen

Studentin t-testi osoitti, että BRCA1, CDKN1B ja CSF ilme vaihteli merkitsevästi pienisoluinen ja ei-pienisoluinen syöpä (p-arvot 0,01, 0,02 ja 0,02 vastaavasti). Kaksi muuta geenejä (EGFR1, STAT1) ovat osoittaneet suuntaus. (P-arvot 0,07 ja 0,09 vastaavasti). Sitä vastoin ei ole merkittäviä eroja geeni-ilmentymisen välillä ei havaittu okasolusyöpä ja adenokarsinooma, vaikka oli suuntaus BRCA1, CDKN1B ja ERCC1. Korkeimmat Cohenin κ kerroin syrjiä pienisoluista, levyepiteelisyöpä ja adenokarsinooma havaittiin CDKN1B, CSF ja EGFR1 (κ = 0,177, p = 0,0041). Tällainen arvio osoittaa suhteellisen pieni, mutta merkittävä yhdistyksen välillä ilmaisuja näiden geenien ja patologinen tyyppi kasvain.

kliiniset tekijät vs. Survival kohderyhmän

Taulukossa 2 on esitetty kliiniset ominaisuudet 60 potilaalla NSCLC joka oli tuntenut geenin ilmentymisen aseman. Ryhmä oli heterogeeninen suhteessa kliiniseen vaiheeseen, suorituskyky potilaista ja hoidon. Kuten odotettua, suurin osa potilaista oli kehittynyt kliinisissä vaiheissa, mukaan lukien 48% vaiheen IV tauti. Vain 2 yksilöitä (3%) oli vaiheen I-II tauti (molemmat katsottiin pois käytöstä samanaikaisia ​​sairauksia). Kuusikymmentä prosenttia potilaista oli kemoterapiaan (sisplatiini pohjainen dubletti), 57%: lla oli sädehoitoa kokonaan annoksilla, jotka vaihtelivat 20-70 Gy (mediaani 30 Gy). Seuranta-ajan mediaani on 3,6 vuotta).

Stage, suorituskyky tila ja sukupuoli vaikuttavat merkittävästi selviytymisen univariate mallissa, mutta Monimuuttuja-analyysissä vain kliinisessä vaiheessa näytti olevan ja riippumattoman prognostiset merkitystä (RR = 3,56, 95% CI = 1,95-6,45, p = 0,00003). Siksi kliininen vaihe pidettiin edelleen merkittävä tekijä, joka voi sekoittaa mahdollinen ennustetekijöiden merkitystä geenin ilmentymisen.

Univariate Influence of Gene Expression eloonjäämiseen

Taulukko 3 osoittaa vaikutuksen 11 valittujen geenien eloonjäämiseen ryhmässä 60 potilasta NSCLC. Out of 11 geenien vain ilmaus ERCC1 oli merkittävä vaikutus eloonjäämiseen, kun taas ilmaisuja neljän muiden geenien (CA9, erbB3 FN1 ja STAT1) osoitti suuntaus (RR 0,7 tai RR 1,3 ja p 0,015). Korkea ekspressio 3 näiden geenien (CA9, FN1 ja STAT1) liittyi lisääntynyt vaara kuoleman, kun taas yli-ilmentyminen ERCC1 ja ErbB3 oli suojaava vaikutus. Tärkeintä (kuten keskustellaan edelleen) niin tulos on järkevä selitys biologisen toiminnan näiden geenien ja tuloksista julkaistuja tutkimuksia. Heikkous merkitys yksittäisten geenien ilmentyminen hengissä ei ole yllättävää, kun otetaan huomioon kliininen heterogeenisyys ja pieni näyte ryhmään.

tutkimustarkoituksessa rakensimme ennustetekijöiden pisteet, jossa yli-ilmentyminen kunkin riskin geenejä (CA9 , FN1 tai STAT1) merkittiin +1, kun taas yli-ilmentyminen kunkin suojaava geeni (ERCC1 tai ErbB3) merkittiin -1. Tulokset lisättiin. Summa pakkasta merkitään alhainen riski, kun taas summa on nolla tai useamman osoitettua suuri riski. Kuviossa 1 a eloonjäämiseen mukaan tällaisia ​​viisi-geenin allekirjoitus. Ero selviytymistä korkean ja matalan riskin ryhmiin oli merkitsevä (RR = 1,89, p = 0,02). Kun analyysi rajoitettiin 31 potilasta, joilla oli paikallinen sairaus eroa korkean ja matalan riskin ryhmiin edelleen merkittäviä (RR = 2,3, p = 0,03, kuva 1b). Se pysyi merkittävä 29 metastasoivaa tautia sairastavaa potilasta (RR = 2,3, p = 0,03, kuva 1c).

A) 60 potilasta NSCLC. B) 31 potilasta, joilla oli paikallinen sairaus (vaihe I-III). C) 29 Metastasoivassa sairauksia (vaihe IV).

monimuuttujamenetelmin

Viisi geenejä, jotka näyttivät merkittävän tai osoittanut trendi on muuttujan mallin sisällytettiin Monimuuttuja-analyysissä (ERCC1, erbB3, CA9, FN1 ja STAT1). Tällainen analyysi paljasti, että 3 out of 5 geenien (erbB3 FN1 ja STAT1) ei voida pitää itsenäisinä ennustavat tekijät. Yli-ilmentyminen ErbB3 oli yleisempää naisilla, ja näin ollen liittyvät sairauden vaiheessa (pitkälle oli yleisempää miehillä). Samoin yliekspressio FN1 oli yleisempää pisimmällä kliinisen vaiheissa. Yli-ilmentyminen STAT1 korreloi yliekspressioon CA9. Kaksi geeniä jäi merkittävä variantti Monimuuttuja malli, joka ei osuus kasvaimen vaiheesta: ERCC1 (RR = 0,53, 95% luottamusväli 0,30-0,96, p = 0,03) ja CA9 (RR = 1,79, 95% luottamusväli 1,00-3,21, p = 0,05).

Monimuuttuja malli kirjausta myös taudin vaiheesta vahvisti merkittävästi ja riippumaton ennusteen arvioinnissa on ERCC1 ja CA9 ilmaisun (taulukko 4). Prognostisia pisteet rakennettu perustuu tuloksiin monimuuttujamenetelmin oli seuraava:

jossa kliiniseen vaiheeseen, sekä CA9 ja ECCC1 ilmaisuja oli kaksijakoinen ja koodataan 0 tai 1. Arvot yläpuolella mediaani 2,5 merkitään suuri riski . Kuvio 2 havainnollistaa eloonjäämiskäyrien mukaan riskiryhmiin. Ero selviytyminen ryhmien välillä oli erittäin merkitsevä (RR = 4,40, 95% luottamusväli 2,35-8,17, p = 0,00003), ja ero ylitti yhden muuttujan vaikutuksen vaiheen (RR = 3,56).

pienisoluinen keuhkosyöpä

Out of 22 potilasta, joilla SCLC 7 oli rajoitettu ja 15 laajaa sairaus. Laajuus tauti ei ilmeisesti vaikuta merkitsevästi eloonjäämisen (RR-0,95, p = 0,93). Sitä vastoin yli-ilmentyminen 2 geenien näytti merkittävästi vähentää eloonjäämisen (CA9: RR = 1,6, p = 0,04 ja MMD, RR = 1,8, p = 0,03). Kliininen seuraus tästä havainto on kuitenkin kyseenalainen johtuen erittäin pieni koko ja kliinisen heterogeenisuus ryhmän.

Keskustelu

Geenien ilmentyminen on käytetty onnistuneesti luokittelun ja ennusteen ei-pienisoluisen keuhkosyöpä, vaikka viimeaikaiset tarkastelu julkaistut tiedot viittaavat siihen, että tämä lähestymistapa ei ole vielä valmis kliiniseen käyttöön [6]. Useimmat asiaankuuluvat tutkimukset tarkoitetut kirurgiset sarjaan [1] – [8], [12] – [17], jossa on vain muutama, jossa yritettiin analysoida geeniekspressioprofiilien perustuu bronkoskopia saatujen näytteiden [9]. Sitä vastoin arviointi EGFR mutaatioita ennustaviksi määritys tyrosiinikinaasiestäjiksi pitkälle adenokarsinooma keuhkojen pidettiin merkittävä läpimurto, ja Uutena diagnostinen työkalu [18]. Tämä osoittaa, että huolimatta vaikeuksista ja rajoituksista, molekyylimarkkerit todennäköisesti kasvava rooli diagnostiikassa, ennusteen ja ennustaminen pitkälle ei-pienisoluinen keuhkosyöpä.

tulokset Tämän tutkimuksen osoittavat, että analyysi of geeniekspressioprofiilien perustuu bronkoskopia saatu näytteistä on mahdollista, mutta menetelmät, joita käytettiin kysynnän optimointiin. Merkittävä rajoittava tekijä oli suhteellisen suuri osuus näytteistä, joista riittävästi RNA: ta ei voitu eristää. Toinen tekijä, joka vaikutti haitallisten keskeyttäneiden määrän tapauksista oli patologinen diagnoosi ei ollut saatavilla ennen bronkoskopia. Osa potilaista oli siten erilainen diagnoosi kuin ennakoitu perustuu oireisiin, kliinisen tutkimuksen ja kuvantaminen.

yhdestätoista geenien tutkittu korkea ilmentymisen 3 geenien (CA9, FN1 ja STAT1) liittyi lisääntynyt vaara kuoleman, kun taas yli-ilmentyminen ERCC1 ja ErbB3 oli suojaava vaikutus. Tällainen tulos on järkevä tukea biologinen funktio näiden geenien, ja tulokset on valittu julkaistuja tutkimuksia.

ERCC1 näytti olevan voimakkaimmin liittyvän ennusteen esillä olevassa tutkimuksessa. Se vastaa nukleotidin poisto korjaus vaurioitunut DNA. Yli-osalta tämän geenin ilmentyminen voi lisätä vahingon tuumorisolujen säteilyä tai huumeiden ja edistävät ennusteeseen [16]. Tällainen päättely tukivat esillä olevan datan.

CA9 pidetään surrogaattimarkkerina kasvaimen hypoksia. Sädehoito tai sytotoksiset lääkkeet ovat vähemmän tehokkaita hapenpuuteympäristössä siten lisääntynyt ilmentyminen CA9 voivat edistää huonompaan ennusteeseen. Tällainen päättely tukee esillä olevassa tutkimuksessa. Sitä vastoin lisääntynyt ilmentyminen CA9 oli suojaava vaikutus, joka on käytettävissä levy- keuhkosyöpä [2], jotka voivat havainnollistaa mahdolliset erot prognostisten merkitys tietyn geenin kirurgiset ja ei-kirurgiset sarjan.

ErbB3 koodaa jäsen epidermaalisen kasvutekijän reseptorin (EGFR) perheen reseptorityrosiinikinaasit. Korkea tämän geenin ilmentyminen vaikutti korreloi erityisiä klinikalla-patologinen piirteitä Japani keuhkosyövän [15]. Tärkeintä ErbB3 oli yli-ilmentynyt savuton naaraat mutatoitunut EGFR, eli ryhmässä suotuisan ennustetekijöiden ominaisuuksia. Vaikka mitään tietoja EGFR mutaatioita olivat nyt esillä olevassa sarjassa, yli-ilmentyminen ErbB3 oli yleisempää naisilla adenokarsinooma, tukevat siten tulokset japanilainen tutkimus. Koska ennuste naisilla oli parempi, yli-ilmentyminen ErbB3 oli suojaava (mutta ei riippumaton) vaikutus eloonjäämiseen olevassa sarjassa. Mielenkiintoista, vastakkainen vaikutus ErbB3 yli-ilmentyminen (lisääntynyt vaara kuolema) paljastui kirurgisessa tutkimuksessa [1]. Tämä voi jälleen havainnollistaa mahdolliset erot prognostisten merkitys tietyn geenin kirurgiset ja ei-kirurgiset sarjan.

STAT1 on mukana jopa säätelevä geenejä, mikä johtaa lisääntyneen ilmentymisen interferoni stimuloidun Genes. Yli-ilmentyminen STAT1 liittyi parempaan ennusteeseen kirurginen sarjassa [1], mutta ei tässä tutkimuksessa. Esillä analyysi vahvisti, todellakin, että STAT1 yli-ilmentyminen liittyi yli-ilmentyminen muiden geenien (mukaan lukien kaikki 6 viitaten geenit), mutta nettovaikutus tällaista suhdetta oli suuntaus suojaava vaikutus STAT1. Tällainen tulos voidaan selittää voimakas korrelaatio STAT1 ja CA9 ilmeiseksi esillä data.

Vihdoin FN1 tunnetaan rooli solujen tarttumista, kasvua, vaeltamisen ja erilaistumisen. Sen yli-ilmentyminen liittyy stimulaatio ei-pienisoluinen keuhkosyöpä kasvua aktivaation kautta Akt /mTOR /S6-kinaasi ja inaktivoituminen LKB1 /AMP-aktivoitu proteiinikinaasi signaalireitin [17]. Yli-ilmentyminen FN1 liittyi huonompi ennuste esillä sarjassa, mutta se ei näytä olevan hyödyllinen merkkigeeninä tässä analyysissä johtuu korrelaatio kliinisen vaiheen.

ennustetekijöiden pisteet Ehdotettu edellyttää validointi käyttäen riippumatonta aineisto. Toteamme kuitenkin, että toisin kuin tutkimukset, jotka etsivät uuden markkereita, me vain tutkia markkereita tiedetään olevan mahdollisen ennusteen arvioinnissa leikkauksen ympäristössä. Voidaan harkita, siten, että se oli tässä tutkimuksessa, joka vahvisti markkereita antamat muut kirjoittajat on aineisto, joka sisälsi potilaiden pitkälle taudin. Testaus ennustetekijöiden pisteet takautuvasti useammalla homogeeninen potilasryhmissä on tulevaisuutemme tavoite. Myös testaus muut geenit, todennäköisesti, osaltaan parantaa ehdotetun yksinkertaista pisteet.

Yhteenvetona voimme päätellä, että analyysi geeniekspressioprofiilien perustuu bronkoskopia saatujen näytteiden ilmestyi toteutettavissa, mutta menetelmää, joka oli käytetyt vaatii optimoimaan. Kahden geenin allekirjoitus ehdotettu kehittyneiden käyttökelvottoman NSCLC voi näkyä hyödyllinen erityisesti kliinisesti erillisryhmissä.