PLoS ONE: Association between XRCC1 ja XRCC3 polymorfismit kanssa Lung Cancer Risk: Meta-analyysi Case-Control Studies

tiivistelmä

Useat tutkimukset ovat raportoineet yhdistyksen röntgen korjaus rajat täydentävät ryhmä 1 (

XRCC1

) Arg399Gln, Arg194Trp, Arg280His, -77T C, ja röntgen korjaus rajat täydentävät ryhmä 3 (

XRCC3

) T241M polymorfismit keuhkosyöpää riski, mutta tulokset pysyivät kiistanalainen. Siksi teimme meta-analyysi tutkimaan yhdistyksen välillä keuhkosyövän riskiä ja

XRCC1

Arg399Gln (14156 tapausta ja 16667 säätimet 41 tutkimuksista), Arg194Trp (7426 tapausta ja 9603 tarkastuksia 23 tutkimuksista), Arg280His ( 6211 tapauksia ja 6763 tarkastuksia 16 tutkimuksista), -77T C (2487 ​​tapausta ja 2576 tarkastuksia 5 tutkimuksista), ja

XRCC3

T241M (8560 tapausta ja 11557 säätimet 19 tutkimusta) erilaisissa perintö malleja. Huomasimme, että -77T C polymorfismi oli yhteydessä lisääntyneeseen keuhkosyövän riskiä (hallitseva malli: kertoimet annos [OR] = 1,45, 95% luottamusväli [CI] = 1,27-1,66, väistyvä malli: OR = 1,73, 95% CI = 1,14-2,62, lisäaine malli: OR = 1,91, 95% CI = 1,24-1,94), kun kaikki voivat tutkimukset yhdistettiin osaksi meta-analyysi. Vuonna kerrostunut ja herkkä analyysit, laski merkittävästi keuhkosyövän riskiä havaittiin yleisanalyysi (hallitseva malli: OR = 0,83, 95% CI = 0,78-,89; väistyvä malli: OR = 0,90, 95% CI = 0,81-1,00; lisäaine malli : OR = 0,82, 95% CI = 0,74-0,92), valkoihoiset (hallitseva malli: OR = 0,82, 95% CI = 0,76-0,87; väistyvä malli: OR = 0,89, 95% CI = 0,80-0,99; lisäaine malli: OR = 0,81, 95% CI = +0,73-+0,91), ja sairaala-pohjainen valvonta (hallitseva malli: OR = 0,81, 95% CI = 0,76-0,88; väistyvä malli: OR = 0,89, 95% CI = 0,79-1,00; lisäaine malli : OR = 0,80, 95% CI = ,71-0,90) ja

XRCC3

T241M. Kaiken kaikkiaan tämä meta-analyysi osoittaa, että

XRCC1

-77T C esittää lisääntynyt keuhkosyövän riskiä ja

XRCC3

T241M polymorfismi liittyy pienentynyt keuhkosyövän riskiä erityisesti valkoihoisista.

Citation: Huang G, Cai S, Wang W, Zhang Q, Liu A (2013) välisestä assosiaatiosta XRCC1 ja XRCC3 polymorfismit kanssa Lung Cancer Risk: Meta-analyysi Case-Control Studies. PLoS ONE 8 (8): e68457. doi: 10,1371 /journal.pone.0068457

Editor: Xiaoping Miao, MOE Key laboratorio ympäristöä ja terveyttä, School of Public Health, Tongji Medical College, Huazhong tiede ja teknologia, Kiina

vastaanotettu 18 maaliskuuta 2013 Hyväksytty: 31 toukokuu 2013; Julkaistu: 26 elokuu 2013

Copyright: © 2013 Huang et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Kirjoittajat ei ole tukea tai rahoitusta raportoida.

kilpailevat edut: kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Keuhkosyöpä on merkittävä syy syöpään liittyvien kuoleman maailmanlaajuisesti ja yleinen eloonjäämisaste on edelleen erittäin huono [1]. Vaikka tupakointi on suurin syy keuhkosyöpään, vain pieni murto-osa tupakoitsijoita kehittää tätä tautia, mikä viittaa siihen, että muut syyt, kuten geneettinen alttius, saattaa osaltaan vaihtelua yksittäisten keuhkosyövän riski [2], [3]. Geneettinen alttius ympäristö- tai ammattitaudeista uskotaan olevan tärkeä rooli päätettäessä yksilöllisiä eroja syövän kehittymiseen. Tutkimustoiminta on keskitytty polymorfismit DNA-korjaavien geenien tärkeänä osana on alttius koska DNA-korjauksen toiminta ovat kriittisiä suojelemiseksi genomin ja syövän ehkäisyssä [4]. Solutasolla, tarkistuspisteitä voidaan aktivoida pidättämään solusykliä ja transkriptio voidaan säätele korvaamaan vahingon tai solu voi apoptoosin [5]. DNA korjaus on välttämätöntä suojella solun genomi ympäristöhaittoja, kuten tupakansavun [6]. Useat tutkimukset ovat osoittaneet, että alennettua DNA korjaus kapasiteetti liittyy lisääntynyt keuhkosyövän riskiä [7] – [9]. Monet DNA: n korjaukseen geeneissä geneettisten polymorfismien, joilla on potentiaalia moduloida geenien toiminnan ja muuttaa DNA korjauskapasiteettia [10].

DNA korjaukseen polkuja, mukaan lukien nukleotidin Leikkauskorjauksessa (NER), pohja Leikkauskorjauksessa (BER) ja double-lohkon murtuma korjaus (DSBR) on tärkeä rooli korjaamisessa DNA-vaurioita, jotka johtuvat kemiallisten korjauksilla yhden emäksen, kuten metyloituja, hapettunut, tai pienentää emäkset [11], [12]. DNA korjaus entsyymit

XRCC1

keskeisessä asemassa BER koulutusjakson [13], [14].

XRCC1

sijaitsee kromosomissa no. 19q13.2-13.3, ja sen geenituote on osallisena yhden lohkon murtuma korjaus- ja pohjan leikkaaminen korjausmekanismit [15].

XRCC1

koodaa proteiinia, jotka toimivat korjaus yhden säikeen katkoksia. Shen, et al [16] määritellyt kolme koodaus polymorfismien

XRCC

1-geenin kodonien 194 (Arg: stä Trp), 280 (Arg Hänen), ja 399 (Arg Gin). 5’UTR–77T C on uusi polymorfismi tunnistettu

XRCC1

geeni sijaitsee 5’untranslated alueella. Hao et ai. [50] ovat raportoineet, että funktionaalinen SNP -77T C vähentynyt transkriptionaalista aktiivisuutta C-allelecontaining promoottori suuremmalla affiniteetilla SP1 sitova.

DSBR koulutusjakson,

XRCC

3 osallistuvat DNA double säikeen tauko /rekombinaatio korjaus- ja todennäköisesti osallistuu [17] – [19]. DSB ovat yleisin muoto säteilyn aiheuttama DNA-vaurioita [20] ja korjataan kahdella väyliä-homologisen rekombinaation korjaus (HRR) eikä homologista lopun liittymällä [21] – [23]. HRR reitti koostuu vähintään 16-proteiinin komponentteja, mukaan lukien XRCC3. Yhteinen polymorfismi eksonissa 7

XRCC3

geeni saa aikaan aminohapposubstituution kodonissa 241 (Thr241Met), jotka voivat vaikuttaa entsyymin toimintaa ja /tai sen vuorovaikutusta muiden proteiinien mukana DNA-vaurioita ja korjata [24 ].

Molecular epidemiologiset tutkimukset ovat yhdistyksen

XRCC1

Arg399Gln, Arg194Trp, Arg280His, -77T C, ja

XRCC3

T241M keuhkosyöpä riski [25] – [73], mutta tulokset ovat kuitenkin ristiriitaisia ​​sijaan ratkaisevia. Vaikka useita tutkimuksia [81] – [86] aiemmin suoritettu kokoamista analysoi koskien yhdistyksen XRCC1 Arg399Gln, Arg194Trp, Arg280His, -77T C, ja XRCC3 T241M keuhkosyöpään riskiä. Kuitenkin useita julkaistuja tutkimuksia ei sisälly näihin meta-analyysit ja muita alkuperäinen tutkimuksissa suurempi otoskoko on julkaistu sen jälkeen. Tärkeää on, että edellinen meta-analyysit

XRCC1

Arg194Trp, Arg280His, ja Arg399Gln keuhkosyöpä riski ovat osoittaneet ristiriitaisia ​​johtopäätöksiä. Siten yhdistys näiden polymorfisten geenien edelleen tuntematon. Jotta tutkia yhdistyksen välillä

XRCC1

Arg399Gln, Arg194Trp, Arg280His, -77T C, ja

XRCC3

T241M polymorfismien keuhkosyöpää riski, meta-analyysi tehtiin yhteenveto tiedoista . Meta-analyysi on tehokas työkalu yhteenveto eri tutkimuksissa. Se ei voi vain voittaa ongelma pienen koon ja riittämätön tilastollisen tehon geneettiset tutkimukset monimutkaisten ominaisuuksien, mutta myös entistä luotettavampia tuloksia kuin yhden tapauskontrollitutkimuksessa.

Materiaalit ja menetelmät

tunnistaminen ja tukikelpoisuuden asiaankuuluvien tutkimusten

kattava kirjallisuus haku suoritettiin käyttäen PubMed, ISI, ja EMBASE tietokantoja asiaa julkaistut artikkelit (viimeinen etsiä päivitettiin tammi 12, 2013) seuraavin avainsanat ”

XRCC1

”tai”

XRCC3

”,” polymorfismi ”, ja” syöpä ”tai” karsinooma ”yhdistetään” keuhkot ”. Kaikki kelvolliset tutkimukset haettiin, ja niiden kirjallisuusluettelot tarkastettiin muiden asiaan julkaisuihin. Me ulkopuolelle tiedot, jotka olivat julkaisemattomia tai julkaistu vain tiivistelmä. Olemme myös tutustuneet Cochrane asiaankuuluvien artikkeleita. Muita artikkeleita tunnistettiin käsin tutkiva viittaukset tukikelpoisten artikkeleita ja tarkistaa artikkeleita, jotka mahdollisesti on jäänyt alkuperäisessä hakuun. Tekijät otettiin yhteyttä suoraan koskien keskeisiä tietoja ei ilmoiteta alkuperäisessä artikkeleita. Kun samasta näytteestä käytettiin useissa julkaisuissa, vain tutkimuksessa suurin näytekoko oli mukana seuraava tutkittava huolellisesti.

Mukaanottokriteerit

sisältyi tarvittavien tutkimusten ovat täyttäneet seuraavat kriteerit: ( 1) ainoastaan ​​tapausverrokkitutkimukset katsottiin, (2) arvioitiin

XRCC1

Arg399Gln, Arg194Trp, Arg280His, -77T C, ja

XRCC3

T241M polymorfismien ja keuhkosyövän riskiä, ​​ja (3) riittävän julkaistujen tietojen arvioimiseksi kertoimet suhde (OR), jossa 95%: n luottamusväli (CI). Merkittävä syy syrjäytymiseen tutkimusten olivat seuraavat: (1) ei syöpätutkimukseen (2) vain tapauspopulaatio, (3) kaksoiskappale aiempien julkaisu, ja (4) jakelu genotyyppien joukossa valvonta eivät ole Hardy-Weinberg tasapaino (

P

0,01).

Data louhinta

Tietoa huolellisesti poimittu kaikki voivat tutkimuksista itsenäisesti kaksi tutkijaa mukaan pääsyn kriteerit yllä. Seuraavat tiedot kerättiin kunkin tutkimuksen: ensimmäinen tekijän nimi, julkaisuvuosi, alkuperämaan, etnisyyden, lähde hallintalaitteiden, genotyypitysmenetelmää, ottelu, otoskoko ja lukumäärät tapauksissa ja valvonnan

XRCC1

Arg399Gln, Arg194Trp, Arg280His, -77T C, ja

XRCC3

T241M genotyyppien aina kun mahdollista. Etnisyys luokiteltiin ”valkoihoinen”, ”Afrikkalainen”, ja ”Aasian”. Kun tutkimus ei todeta, mitä etnisiä ryhmiä olivat mukana tai jos se oli mahdotonta erottaa osallistujien mukaan fenotyyppiin, näyte kutsutaan nimellä ”mixed väestö”. Emme määritellä mitään vähimmäismäärää potilaita sisällyttää tähän meta-analyysiin. Artikkeleita, jotka on raportoitu eri etnisten ryhmien ja eri maiden tai paikkoihin, me piti niitä eri tutkimuksessa näytteitä kullekin em.

Tilastollinen

Raakaöljy kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmät alueet) ja niiden vastaavat 95% luottamusväli (95% CI) käytettiin arvioimaan vahvuus välisen assosiaation

XRCC1

Arg399Gln, Arg194Trp, Arg280His, -77T C, ja

XRCC3

T241M polymorfismien ja keuhkosyövän riskiä. Yhdistetty syrjäisimmillä alueilla tehtiin hallitseva malli (Arg399Gln: Arg /Gln + Gln /Gln vs. Arg /Arg, Arg194Trp: Arg /Trp + Trp /Trp vs. Arg /Arg, Arg280His: Arg /His + His /His vs. Arg /Arg -77T C: TC + CC vs. TT, ja T241M: TM + MM vs. TT); väistyvä malli (Arg399Gln: Arg /Gln + Arg /Arg vs. Gin /Gin, Arg194Trp: Arg /Trp + Arg /Arg vs. Trp /Trp, Arg280His: Arg /His + Arg /Arg vs. His /His, -77T C: TC + TT vs. CC, ja T241M: TM + TT vs. MM); lisäaine malli (Arg399Gln: Arg /Arg vs. Gin /Gin, Arg194Trp: Arg /Arg vs. Trp /Trp, Arg280His: Arg /Arg vs. His /His, -77T C: TT vs. CC, ja T241M: TT vs. MM), tässä järjestyksessä. Tutkimusten välisten heterogeenisuus arvioitiin laskemalla

Q

-statistic (heterogeenisuus pidettiin tilastollisesti merkitsevä, jos

P

0,10) [74] ja mittaamaan

I

2

arvo, Venetsia kriteerien [75], että

I

2

testi sisältyvät: ”

I

2

25% edustaa ole heterogeenisyys,

I

2

= 25-50% on kohtalainen heterogeenisyys,

I

2

= 50-75% on suuri heterogeenisyys, ja

I

2

75% edustaa äärimmäistä heterogeenisyys ”. Jos tulokset eivät olleet heterogeenisiä, yhdistettyjen syrjäisimpien alueiden laskettiin kiinteän vaikutuksen mallia (käytimme

Q

-statistic, joka edustaa suuruus heterogeenisyys välillä-tutkimukset) [76]. Muussa tapauksessa random-vaikutus mallia käytettiin (kun heterogeenisyys välillä-tutkimukset olivat merkittäviä) [77]. Olemme myös suorittaa alaryhmäanalyyseissa etnisyys (valkoihoinen ja Aasian), lähde valvonta, histologinen tyyppi, sukupuoli, ja tupakoinnin. Lisäksi missä määrin yhdistetyn riskin arvioon saattaa vaikuttaa yksittäisten tutkimusten arvioitiin peräkkäin jättämällä jokaisen tutkimuksen meta-analyysi (jätä-yksi-out herkkyysanalyysi). Tämä lähestymistapa myös kaapata vaikutus vanhimman tai ensimmäinen positiivinen tutkimus (ensimmäinen tutkimus vaikutus). Toiseksi myös sijoittui tutkimuksia mukaan otoskoko, ja sitten toistetaan tämä meta-analyysi. Näytteen koko oli luokiteltu vähintään 200 osallistujaa ja ne, joilla on vähemmän kuin 200 osallistujaa. Cité kriteerit aiemmin kuvattu [78]. Arvioimme Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) tutkimusta varten käyttäen hyvyys fit testi (

χ

2 tai Fisherin tarkka testi) vain kontrolliryhmissä, ja poikkeama pidettiin kun

P

0,01. Begg n suppilo tonttien [79] ja Egger n lineaarisen regression testi [80] arviointiin käytettiin julkaisun bias. Jos julkaisu bias olemassa, Duval ja Tweedie ei-parametriset ”leikata ja täytä” menetelmää käytettiin säätämään sitä. Meta-regressioanalyysi suoritettiin tunnistamaan tärkeimmät lähteet välillä-tutkimusten vaihtelua tuloksiin, lokin avulla syrjäisimpien alueiden kustakin tutkimuksessa riippuvat muuttujat, ja etnisyys, lähde valvonta, ja näytteen kokoa kuin mahdolliset lähteet heterogeenisyys. Kaikki laskelmat tehtiin käyttämällä STATA versio 10.0 (STATA Corporation, College Station, TX).

Tulokset

Literature Etsi ja meta-analyysi tietokannat

merkitykselliset julkaisut haettiin ja alustavasti seulotaan. Kuten on esitetty kuviossa. 1, 248 julkaisua tunnistettiin, joista 132 merkityksettömiä paperit suljettiin pois. Siten 116 julkaisut olivat oikeutettuja. Näistä julkaisuista, 67 artikkelia ulkopuolelle, koska ne olivat tarkastelun artikkeleita, tapausselostukset ja muut polymorfismit on

XRCC1

ja

XRCC3

. Lisäksi genotyyppi jakaumat kontrolleissa kaikkien tukikelpoisten tutkimukset olivat yhtä mieltä HWE. 4 artikkelia [32], [37], [46], [60] jätettiin koska niiden väestön päällekkäin toisen 2 mukana tutkimuksessa [25], [33], [55], [59]. Jotka esitetään taulukossa 1, 45 artikkelit 104 tapausverrokkitutkimukset julkaisuja valittiin lopulliseen meta-analyysi, mukaan lukien 14156 tapaukset ja 16667 säätimet

XRCC1

Arg399Gln (41 tutkimusta), 7426 tapauksia ja 9603 tarkastuksia for Arg194Trp (23 tutkimusta), 6211 tapauksia ja 6763 säätimet Arg280His (16 tutkimusta), 2487 tapauksia ja 2576 säädöt -77T C (5 tutkimusta), ja 8560 tapauksissa ja 11557 säätimet

XRCC3

T241M (19 tutkimusta). Näistä tutkimuksista, viisi tutkimusta sisällytettiin hallitseva mallissa vain siksi, että tarjotaan genotyyppejä TM + MM

verrattuna

TT tai Arg /Gin + Gln /Gin

versus

Arg /Arg kuin koko ja yksi tutkimus oli mukana väistyvä mallissa vain koska se toimitti genotyypin TM + TT

versus

MM. 45 oli väestöpohjainen tutkimukset ja 59 olivat sairaalassa perustuvat tutkimukset. 51 tehtiin valkoihoisista, 46 tehtiin aasialaisilla, ja 6 tutkimusta tehtiin afrikkalaisia. THE säilyi tehtiin sekoitettu etnisyys. Taulukot S1-S5 File S1 listattu etnisyys, HWE, ja numerot tapausten ja säätimet

XRCC

1 Arg399Gln, Arg194Trp, Arg280His, -77T C, ja

XRCC3

T241M. Kaikki tapaukset olivat patologisesti vahvistettiin.

Quantitative synteesi

Taulukossa 2 luetellaan tärkeimmät tulokset meta-analyysi

XRCC1

Arg399Gln polymorfismia keuhkosyövän riskiä. Kun kaikki voivat tutkimukset yhdistettiin osaksi meta-analyysi

XRCC1

Arg399Gln polymorfismi, mitään merkittävää yhdistys löydetty geneettistä mallia. Kuitenkin merkittävä Tutkimusten välisten heterogeenisuus havaittiin geneettistä mallia. Siksi teimme alaryhmäanalyysi etnisyys, histologinen tyyppi, tupakoitsija tavat, sukupuoli, ja lähde valvontaa. Niistä kerrostunut analyysin huomattavasti keuhkosyövän riskiä havaittiin tupakoimattomilla (resessiivinen malli: OR = 1,57, 95% CI = 1,02-2,42,

P

arvo heterogeenisyys testi [

P

h] = 0,026,

I

2 = 49,4%).

Taulukko 2 myös lueteltu tärkeimmät tulokset meta-analyysi

XRCC1

Arg194Trp polymorfismi ja keuhkosyövän riskiä. Kun kaikki voivat tutkimukset yhdistettiin osaksi meta-analyysi

XRCC1

Arg194Trp polymorfismi, huomattavasti keuhkosyövän riskiä havaittiin väistyvä malli (OR = 1,23, 95% CI = 1,05-1,44,

P

h = 0,216,

I

2

= 18,8%) ja lisäaine malli (OR = 1,22, 95% CI = 1,04-1,44,

P

h = 0,107,

I

2

= 28,9%). Niistä kerrostunut analyysit, huomattavasti keuhkosyövän riskiä havaittiin aasialaisilla (resessiivinen malli: OR = 1,22, 95% CI = 1,03-1,45,

P

h = 0,277,

I

2

= 17,5%; lisäainetta malli: OR = 1,22, 95% CI = 1,02-1,45,

P

h = 0,111,

I

2

= 36,0%) ja sairaala-pohjainen valvonta (väistyvä malli: OR = 1,28, 95% CI = 1,03-1,59,

P

h = 0,141,

I

2

= 32,2%).

Taulukko 2 myös lueteltu tärkeimmät tulokset meta-analyysi

XRCC1

Arg280His polymorfismi ja keuhkosyövän riskiä. Kun kaikki voivat tutkimukset yhdistettiin osaksi meta-analyysi

XRCC1

Arg280His polymorfismi, mitään merkittävää yhdistys havaittu geneettistä mallia. Vuonna kerrostunut analyysit, ei ollut vielä merkitsevästi yhteydessä

XRCC1

Arg280His polymorfismi ja keuhkosyövän riskiä.

Taulukko 2 myös lueteltu tärkeimmät tulokset meta-analyysi

XRCC1

-77T C polymorfismin ja keuhkosyövän riskiä. Kun kaikki voivat tutkimukset yhdistettiin osaksi meta-analyysi

XRCC1

-77 T C polymorfismi, merkittävästi lisätä keuhkosyövän riskiä ei havaittu geneettistä mallia (hallitseva malli: OR = 1,45, 95% CI = 1,27-1,66,

P

h = 0,638,

I

2

= 0,0%, Fig. 2; väistyvä malli: OR = 1,73, 95% CI = 1,14 -2,62,

P

h = 0,469,

I

2

= 0,0%, Fig. 3, lisäaine malli: OR = 1,91, 95% CI = 1,24-2,94

P

h = 0,494,

I

2

= 0,0%, Fig. 4).

Taulukko 2 myös lueteltu tärkeimmät tulokset meta-analyysi XRCC3 T241M polymorfismin ja keuhkosyövän riskiä. Kun kaikki voivat tutkimukset yhdistettiin osaksi meta-analyysi XRCC3 T241M polymorfismi, ei ollut näyttöä merkitsevästi yhteydessä keuhkosyövän riskiä ja XRCC3 T241M polymorfismi geneettistä mallia. Vuonna kerrostunut analyysissä ei ollut vielä merkittävää -alueella.

heterogeenisuus ja herkkä analyysi

Ei ollut merkittävää heterogeenisuus näitä tutkimuksia varten hallitseva mallin vertailun (

XRCC1

Arg399Gln:

P

h = 0,009,

XRCC1

Arg194Trp:

P

h = 0,042,

XRCC1

Arg280His:

P

h 0,001 ja

XRCC3

T241M:

P

h = 0,011); väistyvä malli vertailu (

XRCC1

Arg399Gln:

P

h = 0,017 ja

XRCC3

T241M = 0,003); lisäaine malli vertailu (

XRCC1

Arg399Gln:

P

h = 0,003 ja

XRCC

3 T241M 0,001). Sitten arvioimme lähde heterogeenisyys meta-regressioanalyysi. Huomasimme, että lähde valvonta, etnisyyden, ja otoksen koko ei vaikuttanut huomattavan heterogeenisuus meta-analyysi (tietoja ei esitetä). Herkkyys analyysit tehtiin sen määrittämiseksi, onko muutos mukaanottokriteereihin tämän meta-analyysin vaikuttaa tuloksiin. Vaikka otos tapauksissa ja valvontaa kaikissa oikeutettuja tutkimuksissa vaihteli 100 8488, vastaavien yhdistettyjen syrjäisimpien ei laadullisesti muutettu tai ilman tutkimuksen pienen otoksen. Kuitenkin

XRCC1

Arg399Gln polymorfismi, kun tutkimus jätettiin pois, tulokset muutettiin tupakoimattomilla (resessiivinen malli: OR = 1,12, 95% CI = 0,96-1,21,

P

h = 0,114,

I

2

= 32,6%). Sillä

XRCC1

Arg194Trp polymorfismi, kun tutkimus jätettiin pois, tulokset olivat muuttunut myös yleisen analyysin (väistyvä malli: OR = 1,17, 95% CI = 0,99-1,39,

P

h = 0,313,

I

2

= 11,4%; lisäainetta malli: OR = 1,15, 95% CI = 0,97-1,37,

P

h = 0,227,

I

2

= 18,3%), aasialaiset (resessiivinen malli: OR = 1,16, 95% CI = +0,97-+1,38,

P

h = 0,447,

I

2

= 0,0%; lisäainetta malli: OR = 1,14, 95% CI = ,95-+1,37,

P

h = 0,295,

I

2

= 16,1%), sairaala-pohjainen tutkimuksia (väistyvä malli: OR = 1,17, 95% CI = 0,92-1,49,

P

h = 0,241,

I

2

= 21,9%), ja tupakoitsijoiden (hallitseva malli: OR = 0,87, 95% CI = 0,74-1,03,

P

h = 0,409,

I

2 = 0,0%). Sillä

XRCC3

T241M polymorfismi, kun tutkimus jätettiin pois, laski merkittävästi keuhkosyövän riskiä havaittiin yleisanalyysi (hallitseva malli: OR = 0,83, 95% CI = 0,78-0,89,

P

h = 0,302,

I

2 = 13,0%, Fig. 5; väistyvä malli: OR = 0,90, 95% CI = 0,81-1,00,

P

h = 0,507,

I

2 = 0,0%; lisäainetta malli: OR = 0,82, 95% CI = 0,74-0,92,

P

h = 0,278,

I

2 = 16,1%), valkoihoiset (hallitseva malli: OR = 0,82, 95% CI = ,76-0,87,

P

h = 0,248,

I

2 = 20,5%; väistyvä malli: OR = 0,89, 95% CI = ,80-,99,

P

h = 0,427,

I

2 = 6,3%; lisäainetta malli: OR = 0,81, 95% CI = 0,73-0,91,

P

h = 0,277,

I

2 = 18,1%), ja sairaala-pohjainen valvonta (hallitseva malli: OR = 0,81, 95% CI = 0,76-0,88,

P

h = 0,193,

I

2 = 28,2%; väistyvä malli: OR = 0,89, 95% CI = 0,79-1,00,

P

h = 0,213,

I

2 = 25,9%; lisäainetta malli: OR = 0,80 , 95% CI = 0,71-0,90,

P

h = 0,108,

I

2 = 40,6%).

Julkaisu bias

Begg n suppilo juoni ja Egger testi ei paljastunut julkaisu bias

XRCC1

Arg399Gln (

P

= 0,546 varten hallitseva malli,

P

= 0,767 for väistyvä malli, ja

P

= 0,984 additiivisten malli), Arg194Trp (

P

= 0,588 varten hallitseva malli,

P

= 0,416 varten väistyvä malli,

P

= 0,555 additiivisten malli), Arg280His (

P

= 0,439 varten hallitseva malli,

P

= 0,520 varten väistyvä malli,

P

= 0,292 varten lisäaineen mode), -77T C (P = 0,186 varten hallitseva malli, P = 0,162 varten väistyvä malli, P = 0,246 additiivisten mode), vaikka mahdollinen julkaiseminen bias ehdotettiin välillä

XRCC3

T241M polymorfismi ja keuhkosyövän riskiä in hallitseva malli (

P

= 0,012) ja lisäaine malli (

P

= 0,041). Tämä saattaa olla rajoitus tähän meta-analyysissä, sillä tutkimuksissa null havaintojen, etenkin pieni otoskoko, ovat vähemmän todennäköisesti julkaista. Duval ja Tweedie ei-parametriset ”leikata ja täytä” menetelmää käytettiin säätämään julkaistavaksi bias. Meta-analyysi ja ilman ”leikata ja täytä” ei tehdä erilainen päätelmä (Fig. 6), mikä osoittaa, että tulokset olivat tilastollisesti varmana.

Keskustelu

BER ja DSBR pelata tärkeä rooli korjaus DNA aiheuttamista vahingoista kemiallisen korjauksilla yhden emäksen, kuten metyloituja, hapettunut, tai pienentää emäksiä. BER sisältää kaksi suurta prosessit (poisto vaurioituneiden pohja jäämien ja ydin BER reaktio, myös ohjelman osa viilto emäksetön sivuston, yhden nukleotidin aukontäyttö- reaktio, ja tiivistys jäljellä nick). On yleisesti tunnettua, että useat proteiinit ovat mukana nämä vaiheet, joista XRCC1 avainasemassa. XRCC1 toimii tai koordinaattori BER kautta vuorovaikutuksessa poly (ADP-riboosi) polymeraasi, DNA-polymeraasi b, ja DNA-ligaasi III [15], [95]. Neljä koodaus polymorfismit tunnistettiin XRCC1 geenissä kodoneissa 194 (Arg: stä Trp), 280 (Arg Hänen), 399 (Arg Gin), ja -77 T C. Kun taas funktionaalisia vaikutuksia näiden polymorfismien XRCC1 ei ole tunnettu, aminohappo muuttuu evoluution konservoituneet alueet voivat muuttaa sen toimintaa. Erityisesti 399Gln polymorfismi johtuvat guaniinista adeniiniksi nukleotidin esiintyy poly (ADP-riboosi) polymeraasin sitovan domeenin, ja se voi vaikuttaa mutkikkaaksi tai korjausta tehokkuutta. XRCC3 geeni koodaa proteiinia, joka liittyy homologisten rekombinaatiotapahtumia korjaus (HRR) ja kaksinkertainen säikeen katkoksia DNA (DBSS) ja cross-link korjaus nisäkässoluissa [20]. Aikana HRR, The XRCC3 proteiini vuorovaikutuksessa Rad51 proteiinia ja todennäköisesti osaltaan ylläpitää kromosomin vakautta. Yhteinen polymorfismi eksonissa 7 XRCC3 geenin tulokset on aminohapposubstituutio kodonissa 241 (Thr241Met), jotka voivat vaikuttaa entsyymin toimintaa ja /tai sen vuorovaikutusta muiden proteiinien mukana DNA-vaurioita ja korjata [20]. Useat molekyyli epidemiologiset tutkimukset ovat roolin

XRCC1

Arg399Gln, Arg194Trp, Arg280His, -77T C, ja

XRCC3

T241M keuhkosyövän riskiä [25] – [73], mutta tulokset ovat ristiriitaisia ​​sijaan ratkaisevia. Voidakseen ratkaista tämän ristiriidan, meta-analyysi suoritettiin tutkia yhdistyksen välillä

XRCC1

ja

XRCC3

polymorfismien ja keuhkosyövän riskiä, ​​kriittisesti tarkistamalla 41 Tutkimuksia

XRCC1

Arg399Gln, 23 tutkimuksia Arg194Trp, 16 tutkimuksia Arg280His, 5 tutkimuksia -77T C, ja 19 tutkimukset

XRCC3

T241M.

Kaiken meidän meta-analyysi osoittaa, että

XRCC1

-77T C polymorfismi liittyy lisääntynyt keuhkosyövän riskiä, ​​kun kaikki voivat tutkimukset yhdistettiin osaksi meta-analyysi. Muissa ositettu ja herkkyysanalyysien merkittävästi vähentynyt keuhkosyövän riskiä havaittiin valkoihoisista varten XRCC3 T241M, mutta ei aasialaisilla. On otettava huomioon, että näennäinen epäjohdonmukaisuus Näiden tulokset voivat taustalla eroja etnisyys, elämäntapojen ja taudin esiintyvyys sekä mahdolliset rajoitukset suhteellisen pieni otoskoko. Nykyinen tietämys syövän osoittaa monitekijäinen ja monivaiheinen prosessi, johon eri geneettiset muutokset ja useita biologisia reittejä. Näin ollen on epätodennäköistä, että riskitekijät syövän työn erillään toisistaan. Ja sama polymorfismit voivat pelata erilaisia ​​rooleja syövän alttiuden, koska syöpä on monimutkainen multi-geneettinen sairaus, ja erilaiset geneettiset taustat saattaa edistää ristiriita. Ja mikä vielä tärkeämpää, alhaisen penetraation geneettisiä vaikutuksia yhden polymorfismin voivat suurelta osin riippua vuorovaikutuksesta muiden polymorfismien ja /tai tietyn ympäristön altistuminen.

Present meta-analyysin tulokset eivät olleet yhdenmukaisia ​​aiemman meta-analyysi [ ,,,0],81] – [86] on

XRCC1

ja

XRCC3

polymorfismien keuhkosyöpään riskiä. Kiyohara et ai. [81] sisältyy 18 tapausverrokkitutkimukset on XRCC1 Arg399Gln, 9 tutkimuksia Arg194Trp, ja 7 tutkimuksia Arg280His. Niiden tulokset ehdottivat, että

XRCC1

Arg399Gln polymorfismi oli yhteydessä lisääntyneeseen keuhkosyövän riskiä keskuudessa aasialaiset (OR = 1,34, 95% CI = 1,16-1,54) ja Arg194Trp ja Arg280His polymorfiat ei ole liittynyt keuhkosyövän riskiä. Kuitenkin joka tapauksessa, niiden tulokset noin Arg399Gln ja keuhkosyövän riskiä olennaisesti edelleen avoin kenttä aasialaisilla, sillä useissa tutkimuksissa (n = 6) on huomattavasti pienempi kuin mitä tarvitaan, jotta saavutetaan vankkoja päätelmiä [96]. Wang et ai. [82] sisältyy 30 tapausverrokkitutkimukset on XRCC1 Arg399Gln ja 16 tutkimuksia Arg194Trp. Niiden tulokset osoittivat, että tietyt XRCC1 kodonin 399 ja 194 variantti voi vaikuttaa alttiuteen sairastua keuhkosyöpään. Dai et ai. [83] sisältyy 39 tutkimuksia XRCC1 Arg399Gln, 22 tutkimuksia Arg194Trp, ja 12 tutkimuksia Arg280His. Heidän meta-analyysi oli osoittanut, että kodoni 194, kodoni 399 ja -77 T C polymorfismia XRCC1 geenin saattanut vaikuttaa yksilön alttiuteen keuhkosyöpään. Kuitenkin edelleen alaryhmä ja herkkyysanalyysien löysimme XRCC1 Arg399Gln ja Arg194Trp polymorfiat ei ole liittynyt keuhkosyövän riskiä, ​​kun yksi tutkimus jätettiin pois, joten luulimme XRCC1 Arg399Gln ja Arg194Trp polymorfismien voi ei liity keuhkosyövän riskiä. Sun et al. [84] vuonna 2010 sisälsi 14 tapausverrokkitutkimukset on XRCC3 T241M, niiden meta-analyysissä havaittiin, että ei ollut todisteita siitä Merkitsevä yhteys

XRCC3

Thr241Met polymorfismi ja keuhkosyövän riskiä. Zhan et ai. [85] vuonna 2013 mukana 17 tapausverrokkitutkimukset on XRCC3 T241M, niiden meta-analyysi osoitti, ettei ollut todisteita siitä merkittävä korrelaatio XRCC3 Thr241Met polymorfismin ja keuhkosyövän riskiä ositettu analyysi etnisyys, histologia ja tupakoinnista. Xu et ai. [86] vuonna 2013 mukana 17 tapausverrokkitutkimukset on XRCC3 T241M, niiden meta-analyysi kaikki käytettävissä olevat tiedot eivät tue mitään merkittävää yhdistyksen välillä XRCC3 Thr241Met polymorfismi ja keuhkosyövän riskiä missään populaatioissa. Kuitenkin edelleen alaryhmä ja herkkyysanalyysien löysimme XRCC3 T241M polymorfismi oli yhteydessä keuhkosyövän riskiä valkoihoisilla. Vineis et ai. [97] vuonna 2009 mukana vain 3 tapausverrokkitutkimukset on XRCC1 polymorfismia, niiden löytyi XRCC1 -77T C polymorfismi oli yhteydessä keuhkosyövän riskiä. Tutkittuaan lähes kaksinkertaiseksi useampia tutkimuksia kuin edellinen meta-analyysi [81] – [86], tuloksemme näyttää vahvistavan ja perustaa kehitys meta-analyysi

XRCC1

Arg399Gln, Arg194Trp, Arg280His , -77T C, ja T241M polymorfismit että tiedot edellisen meta-analyysi [81] – [86] oli ilmoittanut. Mikä tärkeintä, me huolellisesti herkkyysanalyysien perusteella mukaan otoskoko ja jättää-one-out analyysi, joka toteutettiin erilaisia ​​johtopäätöksiä edelliseen meta-analyysi. Sillä

XRCC1

-77 T C polymorfismi, T C mutaatio parantaa merkittävästi affiniteettia ydinvoiman proteiinin SP1

XRCC1

promoottorialueen, joka voi estää sen transkription [50]. Tähän asti vain viisi tapausverrokkitutkimukset tehtiin yhdistyksen välillä -77 T C polymorfismin ja keuhkosyövän riskiä [47], [50], [53], [59], [61]. Yhdistetty OR Näiden viiden tutkimuksessa verrattiin yhdistetty variantti genotyyppi CT + CC villi genotyyppi TT, oli 1,45 (95% CI 1,27-1,66). Näistä viidestä tutkimuksesta, neljä tehtyjen tutkimusten aasialaiset suuret näytekoko kaikki osoittivat -77 T C polymorfismi merkitsevästi yhteydessä lisääntynyt riski sairastua keuhkosyöpään ja yhteenveto OR oli 1,48 (95% CI 1,28-1,70), joka ehdotti, että -77 T C polymorfismia voidaan osaltaan kehitysmaiden keuhkosyöpään aasialaisilla. Johtuen suhteellisen pieneen otokseen valitusta tutkimuksissa tapauskontrollitutkimuksessa suurempien otoskoko tai useampia keskuksen tutkimuksessa tarvitaan saada vakuuttavia tuloksia. Lisäksi otoskoko oli myös liian pieni

XRCC3

Thr241Met polymorfismi ja keuhkosyövän riskiä aasialaisilla ja afrikkalaisilla. Siten tapaus-control tutkimus suurempien otoskoko tai useampia keskuksen tutkimuksessa tarvitaan saada vakuuttavia tuloksia aasialaisilla ja afrikkalaisilla.

DNA korjaus on tunnettu nimellä ”kaksiteräinen miekka” syövän tutkimuksiin. Epidemiologinen näyttö tukee tätä DNA korjaus kapasiteetti on yksi tekijöitä geneettinen alttius syöpään [87] – [89]. Liu et ai. [98] mukaan XRCC1 -77T C polymorfismi voi olla geneettinen määräävä sairastua rintasyöpään. Kuitenkin muita syöpää kuten mahasyövän, peräsuolen syöpä ja niin edelleen kanssa XRCC1 -77T C polymorfismin jäi epäselväksi. Siksi uusia tutkimuksia tarvitaan saada ratkaisevia tuloksia muun syöpä.

Vastaa