Krooninen sairaus

tiivistelmä

familiaalinen klusterointi paksusuolisyövän esiintyy 15-20%: ssa tapauksista, mutta tunnustettu syöpien hoitamiseksi selittää vain pieni osa tästä taudista. Siten geneettisen perustan useimmille perinnöllisen peräsuolen syöpä on edelleen tuntematon.

EPHB2

on äskettäin ollut mukana ehdokkaaksi tuumorisuppressorigeeniä kolorektaalisyövässä. Tutkimuksen tavoitteena oli arvioida osuus

EPHB2

perinnöllinen peräsuolen syöpä. Me seulottiin ituradan

EPHB2

sekvenssivariantit 116 väestöpohjaisen familiaalinen peräsuolen syövän tapauksissa DNA-sekvensoinnilla. Sitten arvioidaan väestön taajuudet ja tunnettu biologinen toiminta

EPHB2

variantit tunnistetaan. Kolme novel nonsynonymous missense muutoksia havaittiin. Kaksi näistä variantteja (A438T ja G787R) aiheuttavat huomattavia muutoksia tähteisiin, kun taas kolmas johtaa konservatiivinen substituutio karboksiterminaalisen SAM domeeni (V945I). Entinen kaksi vaihtoehtoa löydettiin kerran 116 tapauksessa, kun taas V945I muunnos oli läsnä 2 tapausta. Genotyypitys muulla potilaalla peräsuolen syöpä ja verrokeilla paljasti, että A438T ja G787R edustavat harvinainen

EPHB2

alleeleja.

In vitro

toiminnalliset tutkimukset osoittavat, että G787R korvaaminen, joka sijaitsee kinaasidomeenista, aiheuttaa heikentynyt reseptorikinaasi aktiivisuus ja on siksi patogeeninen, kun taas A438T variantti säilyttää reseptorin toiminta ja todennäköisesti edustaa neutraali polymorfismi. Kasvain kudosta G787R variantti kyseessä ilmenee Heterotsygotian menetys, menetys villityypin alleelin, joka tukee tuumorisuppressoria rooli

EPHB2

harvinaisissa peräsuolen syöpätapausta. Harvinaiset ituradan

EPHB2

variantit voivat edistää murto perinnöllisen kolorektaalisyövän.

Citation: Zogopoulos G, Jorgensen C, Bacani J, Montpetit A, Lepage P, Ferretti V, et al. (2008) Ituradan

EPHB2

Reseptori vaihtoehdot in Familial peräsuolen syövän. PLoS ONE 3 (8): e2885. doi: 10,1371 /journal.pone.0002885

Editor: Jörg Hoheisel, Deutsches Krebsforschungszentrum, Saksa

vastaanotettu: 20 joulukuu 2007; Hyväksytty: 3. heinäkuuta 2008; Julkaistu: 06 elokuu 2008

Copyright: © 2008 Zogopoulos et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat National Cancer Institute, National Institutes of Health alle RFA # CA-96-011 (SG) ja läpi yhteistyösopimuksia jäsenten Colon Cancer Family Registry ja proteaasinestäjien Pohjimmiltaan tämä käsikirjoitus ei välttämättä edusta tai politiikkaa National Cancer Institute tai jollekin yhteistyötahoja tai tutkijat Colon CFR, eikä mainita kauppanimiä, kaupallisia tuotteita, tai organisaatioiden merkitse, että Yhdysvaltojen hallitus tai Colon CFR. Cancer Care Ontario, isäntänä organisaation ARCTIC Genome Project, myöntää, että tämä projekti rahoitettiin osittain Genome Canada kautta Ontario Genomics Institute, Genome Québec, Ministère du Développement ÿconomique et Régional et de la Recherche du Quebec ja Ontario Institute for Cancer Research. GZ on Scholar Society of University kirurgien ja vastaanottajan Terry Fox Foundation Research Fellowship National Cancer Institute of Canada. TJH on vastaanottaja Lääkärin tutkijan palkinto Translational Research Burroughs Wellcome Fund.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

peräsuolen syöpä on yleinen maligniteetti länsimaisessa yhteiskunnassa, jossa on 15-20% tapauksista kehittää perusteella ilmeinen geneettinen taipumus [1]. Kuitenkin tunnustettu familiaalinen kolorektaalisyövän oireyhtymien-Familiaalisen adenomatoottisen polypoosin (FAP), perinnölliset Non-polypoosin peräsuolen syövän (HNPCC) ja

MYH

-Associated polypoosin (MAP) -Selvitys paljon vähemmän kuin kolmasosa perinnöllinen peräsuolen syövän, jättäen ylimääräiset periytyvä komponentti tämän taudin selittämättömiä [1].

suurimmassa peräsuolen syöpiä, mutaatiotapahtumaa aktivointi WNT signalointireitin on keskeinen rooli käynnistämisessä kasvainten synnyssä [2] – [4 ]. Hyperactivation of WNT signaloinnin yleisimmin esiintyy alussa adenooma ja karsinooma-sekvenssin seurauksena inaktivoivat mutaatiot

APC

tuumorisuppressorigeenin tai aktivoimalla onkogeenisten

β-kateniinin

mutaatioita. Nämä geneettiset muutokset johtavat konstitutiivisen aktivaation β-kateniinin /TCF4 kompleksi, joka puolestaan ​​ajaa yliekspressio WNT signalointi tavoitteita. Nämä alavirtaan efektorien WNT koulutusjakson ovat geenit, joiden kriittinen rooli kehitettäessä Kolorektaalituumorien, kuten

EphB

ja

efriini

geenit [5], [6].

rooli

EPHB2

, jäsen Ef reseptorityrosiinikinaasin perhe, koska kasvainsuppressorigeenin peräsuolen syövän synnyn on ehdotettu useita viimeaikaisten havaintojen.

EPHB2

karttoja kromosomialueella (1p36.1) usein poistetaan näissä kasvaimissa [7]. Lisäksi, immunohistokemialliset tutkimukset ovat osoittaneet, että ilmentyminen useiden EphB isoformien usein tukahdutetaan invasiivisia ihmisen paksusuolen ja peräsuolen kasvaimissa [8]. Lisäksi Alazzouzi

et al

. ovat viime aikoina osoittaneet yleisyydestä

EPHB2

lukukehysmutaatioita mikrosatelliitti epävakaa Kolorektaalituumorien ja poikkeava

EPHB2

promoottorin metylaation sekä mikrosatelliitti vakaa ja epävakaa kasvaimet [9]. Menetys EPHB2 ilmaisun Kolorektaalituumorien on myös liitetty huonompi ennuste [10].

Mutaatiotutkimukset inaktivaatio

EPHB2

on yhdistetty eturauhasen syövän synnyn. Huusko

et al.

Äskettäin kuvattu erilaisia ​​

EPHB2

mutaatiot eturauhasen kasvaimia ja solulinjoja [11], ja yhteinen nonsense-mutaatio on liittynyt eturauhassyöpä Afrikkalainen American men joiden suvussa tämän taudin [12]. Nämä havainnot yhdessä vakiintunutta asemaa EphB reseptorien kolorektaalisyövässä, sai meidät oletuksen, että ituradan

EPHB2

mutaatiot voivat selittää ainakin osa geneettisiä muutoksia taustalla selittämätön osa perinnöllinen peräsuolen syöpä, ja voi edustaa uutta syöpää oireyhtymä aiheuttaa geneettinen alttius peräsuolen ja eturauhasen syöpä. Siksi tässä tutkimuksessa olemme seulotaan 116 väestöpohjaiset familiaalinen peräsuolen syöpätapausta ituradan

EPHB2

mutaatioita. 116 probands testattu oli ainakin yksi ylimääräinen vaikutti ensimmäisen asteen sukulainen. Nämä tapaukset olivat microsatellite vakaa kasvaimia, ja ei vastannut diagnostiset kriteerit FAP, HNPCC ja MAP. Olemme myös rikastuttanut sarja henkilöitä, jotka täyttivät edellä kriteereillä ja oli henkilökohtaiseen tai perheen historia eturauhasen syöpä. Tulosten perusteella näyttää, että harvinaiset

EPHB2

alleelien osaltaan pieni osa familiaalinen kolorektaalisyövän.

Materiaalit ja menetelmät

oppiaineista ja DNA-näytteitä

Biospecimens saatiin Ontario Familial peräsuolen syövän Registry (OFCCR), jäsen National Cancer Institute Cooperative Family rekisterit ja peräsuolen syövän Studies (https://epi.grants.cancer.gov/CFR/about_colon.html) [13]. OFCCR sisältää 3770 peräsuolen syöpätapausta diagnosoidaan maakunnassa Ontariossa Kanadassa välillä 1997-2000, joiden ikä aikaan diagnoosi 20 74. Ikään ja sukupuoleen sovitettu verrokeilla, joilla ei ole henkilökohtaista historiaa paksusuolisyövän rekrytoitiin puhelimitse luettelosta satunnaisesti valittujen asuin puhelinnumerot Ontario ja väestöpohjainen verotuspäätöksen Rolls Ontarion valtiovarainministeriön. Oppiaineista lahjoitti Laskimoveren ja perifeeristen valkosolujen eristettiin käyttäen Ficoll-Paque mukaan valmistajan suositusten (Amersham Biosciences, Baie d’Urfé, Quebec, PQ, Kanada). Fenoli-kloroformi-menetelmää käytettiin eristämään genominen DNA lymfosyyttien ja peräsuolen syövän solulinjoista. QIAamp protokollan (Qiagen Inc., Mississauga, Ontario, Kanada) käytettiin poimia genomista DNA: ta parafinoidut kudoksiin. Kaikki oppiaineista allekirjoitettu kirjallinen suostumus osallistua Mount Sinai Hospital tutkimuseettiseltä hyväksytty tutkimukseen.

EPHB2

mutaatio seulonta

Käyttäen automatisoitua sekvensointia (Applied Biosystems 3730xl DNA Analyzer , Foster City, CA, USA), me seulottiin ituradan

EPHB2

(Entrez Gene ID: 2048; RefSeq: NM_004442, NM_017449) sekvenssivariantit 116 perinnöllistä peräsuolen tapauksissa (keskimääräinen ikä diagnoosin 54 vuotta, vaihteluväli 22 74 vuotta, 59 naarasta, 57 urosta). Analyysimme mukana potilaita, joilla henkilökohtainen (n = 6) ja /tai sukuhistorioihin (isä, n = 19; sisarus, n = 23; Sisarpuolen, n = 4) eturauhassyöpää. Potilaat, joilla on FAP, HNPCC tai MAP suljettiin pois. Sarja kolorektaalisyövän solulinjojen (Caco2, Colo320DM, Colo320HSR, HT29, LS513, LS1034, SW837, SW948, SW1417, T84) seulottiin myös. Olemme sekvensoitiin koko koodaavan alueen ja vähintään 50 bp introni on eksoni /introni-rajat. PCR-sekvenssit ja olosuhteet esitetään taulukossa S1. Vaihtoehdot tunnistettu on numeroitu suhteessa RefSeq NM_004442.

A438T, D679N ja G787R alleelifrekvenssit

satunnaisotannalla tapauksissa ja verrokkia päässä OFCCR sarja valittiin tutkimuksia arvioimaan A438T, D679N ja G787R alleeli taajuuksilla. Lymfosyyttien DNA-näytteet ylimääräinen sarja OFCCR tapauksista (n = 364 varten A438T; n = 1160 varten D679N; n = 182 G787R) ja väestö verrokit (n = 384 varten A438T; n = 1133 varten D679N; n = 199 ja G787R) testattiin arvioimaan väestön taajuudet A438T, D679N ja G787R variantteja. Genotyping määrityksiä varten A438T, D679N ja G787R variantteja kehitettiin käyttämällä fluoresenssipolarisaatiota-Single Base Extension (FP-SBE) [14], SNPstream [14] ja RFLP, vastaavasti (taulukko S2).

Koiran ja Loss heterotsygoottisuuden (LOH) Analyysit

testaus eriytymistä perheitä probands kuljettaa A438T ja G787R variantit tehtiin suoralla sekvensoinnilla käyttäen joko lymfosyyttien tai arkistointia DNA parafinoidut kudosblokeista. Heterotsygoottisuuden menetys suoritettiin sekvensoimalla pariksi kasvain /normaali arkistointia DNA-näytteet ja vertaamalla sekvenssiä Autoradiokuvat varten voimakkuuden lasku ei-mutatoidun signaalin verrattuna mutatoidun sekvenssin (taulukko S2). Nämä reaktiot suoritettiin käyttäen Thermo Sequenase Radioaktiivisuusmerkittyä Terminator Cycle Sequencing Kit, mukaan valmistajan protokollan (USB Corporation, Cleveland, Ohio, USA).

biokemiallinen karakterisointi A438T G787R Vaihtoehdot

A438T

ja

G787R

cDNA-sekvenssin variantteja luotiin käyttäen PCR-pohjaisia ​​kohdennetulla mutageneesillä ja RefSeq NM_004442 (Origene Technologies Inc., Rockville, MD, USA) templaattina. PCR-tuotteet kloonattiin pcDNA3 (Invitrogen Canada Inc.), ja sekvenssi varmistettiin. DU145 (lahja Dr. Irene Andrulis, Samuel Lunenfeld Research Institute) kasvatettiin MEM /10% FBS. Solut transfektoitiin lyhytaikaisesti eri

EPHB2

cDNA konstruktit (villityypin,

A438T

, tai

G787R

) lipofektamiinin avulla 2000 (Invitrogen Canada Inc., Burlington, Ontario , Kanada), valmistajan ohjeiden mukaisesti. Viisi tuntia transfektion jälkeen elatusaine vaihdettiin nälkään (MEM /0,5% FBS: ää) 16 tuntia. Sitten soluja stimuloitiin 2 ng /ml preclustered efriini b1-Fc (efriini b1-Fc, R G787R) tunnistimme johtavat biokemiallisesti merkittävä ja mahdollisesti patogeenisten jäännös muutoksia. Jäännös vaikuttaa A438T substituutio sijaitsee ekstrasellulaarisen fibronektiinin tyypin III domeeni [17]. Koska tämä domeeni voi olla mukana ligandin sitova, me olettaisi, että A438T variantti saattanut vähentynyt sitoutumisaktiivisuus ja signalointi toiminto. G787R variantti vaikuttaa tähteen kinaasidomeenin, ja tämä korvaaminen saattaa vaikuttaa siten suoraan reseptorin kinaasi ja biologista aktiivisuutta [18]. Kolmas uusi variantti (V945I) havaittiin kahdella potilaalla, ja johtaa konservatiivinen substituutio äärimmäisen karboksi-terminuksessa SAM domain [19]; emme ole tunnettu tämän alleelin edelleen.

A438T variantti löydettiin potilaalle, joka oli kaksi ensisijaista syöpiä. Hän oli diagnosoitu eturauhasen syöpä ja mikrosatelliittimerkkien vakaa oikeanpuoleista paksusuolen syöpään vuotiaista 61 ja 64 vuotta, vastaavasti (kuvio 1A, perhe 1). Proband isä myös kantoi A438T muunnos ja se on ainoa muu perheenjäsen paksusuolen syöpä, hän oli diagnosoitu mikrosatelliittimerkkien vakaa sigmoidin syöpään iässä 76 vuotta. Niistä 6 muuttumattomina perheenjäseniä testattu tämän missensemutaatio muutos, 3 havaittiin kantamaan A438T variantti (kuvio 1A). Sekvensointi analyysit pariksi kasvain-normaali genomisista DNA-näytteistä paljastui menetys villityypin

EPHB2

alleelin paksusuolensyöpä päässä proband, mutta ei paksusuolen syövän isän (tuloksia ei ole esitetty). Isän kasvain ilmenee LOH variantin, mieluummin kuin villityypin,

EPHB2

alleeli. Tämä jälkimmäinen havainto saattaa heijastaa usein menetys 1p36.1 geenivirhe aikana tuumorigeneesin [7], [8], eikä kohdennettuja inaktivaatiota

EPHB2

lokuksen Loh.

+ /-, kantaja; – /-, Ei-operaattorin; LOH +, peräsuolen kasvain kudos havaittiin ilmeinen Loh, menetys villityypin alleelin; Ca, syöpä.

G787R variantti havaittiin potilaalla diagnoosi peräsuolen syövän iässä 67 vuotta (kuvio 1 B, Family 2). Tämä kasvain osoitti menetys villityypin alleelin (kuvio 2). Potilas kertoi myös historian follikulaarinen tyyppiä kilpirauhassyövän iässä 73 vuotta. Tämä proband valittiin mutaatiota seulonnan takia suvussa paksusuolisyövän on äidin puolelta. Kuitenkin Genotyyppaustulokset paljasti, että G787R variantin alleelin joko peräisin sen isän puolelta tai on seurausta

de novo

mutaatio (kuvio 1 B). Proband tytär on ainoa kantavan tämän variantin, ja hän on tällä hetkellä vaikuta iässä 45 vuotta.

Suhteessa voimakkuuksia guaniinin bändejä Sekvenssointireaktion intensiteetti guaniininukleotidiä osoitteessa kanta 2359 pienenee olennaisesti kasvaimen näytteessä, mikä viittaa menetys villityypin alleelin (G) kasvain, mutta ei viereisen normaalin kudoksen (nuoli näyttää nt. 2359).

arvioineet alleeli taajuudet A438T ja G787R variantteja seulomalla ylimääräinen sarja väestöpohjaisen peräsuolen syöpätapausta ja iän ja sukupuolen vastaaviin kontrolleihin. Genotyypin tulokset viittaavat siihen, että nämä kaksi alleelia ovat harvinaisia ​​muunnoksia (taulukko 1). Kumpikaan variantti havaittiin verrokeilla ja niitä ei tunnistettu muita peräsuolen syöpätapausta. Siksi edelleen arvioimaan mahdollisia patogeeninen rooli A438T ja G787R reseptorin variantit, me ominaista niiden luontaisten tyrosiinikinaasiaktiivisuus.

biokemiallinen luonnehdinta A438T ja G787R isoformit paljasti, että että G787R variantti on toiminnallisesti heikentynyt, kun taas A438T muutos todennäköisesti edustaa neutraali polymorfismi. DU145-solut, jotka eivät ilmennä endogeenista toiminnallinen EPHB2-reseptorin [11], transfektoitiin lyhytaikaisesti joko villityypin EPHB2 reseptorin tai yksi kahdesta variantista. Olemme löytäneet vähentynyt autofosforylaation ja G787R-reseptorin, mutta ei A438T variantti, seuraavat ephrinB1 stimulaatio verrattuna villityypin reseptorin (kuvio 3A). Olemme vahvisti, että G787R reseptori on vähentynyt katalyyttinen aktiivisuus käyttämällä in vitro -kinaasimäärityksessä. Kyky G787R reseptorin autophosphorylate tai fosfory- enolaasi- substraatti oli noin 9 kertaa pienempi kuin villityypin reseptorin (kuvio 3B), mikä osoittaa, että G787R mutaatio muuttaa reseptorin toimintaa, ja ei ole harvinainen neutraali polymorfismi.

paneeli A: Vähentynyt autofosforyloinnin EPHB2 G787R variantin vastauksena ephrinB1 stimulaatiota. DU145-soluja transfektoitiin ohimenevästi cDNA-konstruktit (tyhjä vektori, villityypin, wt, A438T, G787R) ja joko vasemmalle stimuloimaton (-) tai stimuloitu (+) ja preclustered ephrinB1-Fc: ssa 30 minuuttia. EPHB2 immunosaostettiin (IP) ja immunoblotattu (IB) antifosfotyrosiinilla (4G10) arvioida reseptorin autofosforylaatiota. Solulysaatti immunoblotattiin antiEPHB2 sen varmistamiseksi, että oli yhtä suuri transfektion tehokkuutta. Paneeli B: lakkautetaan kinaasiaktiivisuutta EPHB2 G787R variantti. In vitro-kinaasimääritykset suoritettiin käyttäen villityypin EPHB2 tai G787R immunosaostumissa ja enolaasi kuin eksogeenisen substraatin. Ennen kuvausta tai immonoblotting vastaan ​​EPHB2 fosforyloitu proteiinit erotettiin geelielektroforeesilla ja värjättiin Coomassie. Autoradiogrammi, joka näyttää

32PγATP sisällyttäminen EPHB2 ja enolaasi (ylempi paneeli), anti-EPHB2 immunoblottaus (keskimmäinen paneeli) ja yhtäläinen lataaminen enolaasin näkyy (alempi kuva). Taulukossa on esitetty suhteelliset kinaasiaktiivisuuden villityypin EPHB2 reseptorin (asetettu 100%)

vs.

G787R variantti.

Keskustelu

Ef reseptoriperheen on suurin tunnettu alaryhmä reseptorityrosiinikinaaseja. Tämä perhe on edelleen jaettu kahteen erilliseen luokkaan, EphA (A1 A10) ja EphB (B1 B6), joka perustuu niiden Sitoutumisaffiniteetit kaksi kalvoon ankkuroitunut ligandi perheet vastaavien nimet A (A1-A5) ja B (B1 B3) Efrii- [19], [20]. Ligandin sitoutumisen jälkeen, Ef reseptorit aktivoivat solun repulsio- väyliä moduloida solun jakautumista osiin ja määräsi soluvaelluksen erilaisia ​​biologisia prosesseja [19].

Hiiri eläinmallissa tutkimukset ovat osoittaneet, että ohutsuolessa, EphB reseptorit välittävät suoliston kantasolujen lisääntymistä [21] sekä epiteelisolujen muuttoliike ja organisaatio pitkin krypta-villous akselin [5]. Koska menetys mitoosi aktiivisuuden valvonta, epiteelin kuviointi ja kudosrakenne ovat tunnusmerkkejä tumorigeneesin, häiriintyminen normaalia EphB reseptorin ilmentymistä ja toimintaa todennäköisesti edistää peräsuolen syövän synnyn. Konstitutiivinen EphB reseptorin ilmentyminen voi stimuloida kasvaimen aloittamista häiritsemällä proliferatiivisen kantasolujen homeostaasin, ja toissijainen vaimentaminen EphB reseptorin toiminta voi sallia laajeneminen syöpäsolujen, kuin spatiaalinen rajojen asettamat ehjä EphB reseptorin toimintaa asuttaa viereiseen kudokseen rakenteita [5], [6 ], [21]. Tämän tueksi hypoteesin, me ja muut ovat viime aikoina osoittaneet syy rooli EphB inaktivaatiomenetelmät kasvainprogression [22]. Huomasimme, että

EphB2

tai

EphB3

hiljentäminen APC

Min /+ hiirillä johtaa kiihtyi ja aggressiivisempia peräsuolen kasvaimien syntyyn.

Nykyisessä tutkimuksessa olemme seulotaan 116 väestöpohjainen familiaalinen tapauksissa paksusuolisyövän mutaatioita ehdokas tuumorisuppressorigeeniä, EPHB2, ja tunnistettu kolme ehdokasta variantteja (A438T, D679N, G787R), joka karakterisoitiin edelleen. Vaikka A438T alleeli ei havaittu verrokeilla ja todettiin eritellä taudin perhe 1, biokemialliset luonnehdinta osoittaa, että A438T on harvinainen neutraali polymorfismi; emme voi sulkea pois sitä mahdollisuutta, että se vaikuttaa hienovaraisempaa näkökohtia EPHB2 signalointi, kuten muodostumista korkeammat oligomeerien. D679N variantti on aiemmin raportoitu liittyvän eturauhassyöpään [11]. Vaikka se on edelleen mahdollista, että tämä muunnos moduloi taipumusta eturauhassyövän, meidän tiedot viittaavat siihen, että se tapahtuu populaatio taajuudella noin 1% ja että se ei yksinään, lisätä alttiutta peräsuolen syöpä. Havaitsimme D679N alleeli samanlaisessa potilaiden määrä, joilla peräsuolen syöpä ja väestö verrokit. Toisin kuin nämä jälkimmäiset vaihtoehdot, meidän tiedot osoittavat, että G787R variantti on toiminnallisesti on heikentynyt, ja se voi olla harvinainen syynä perinnöllisen peräsuolen syöpä. G787R variantti tunnistettiin potilaalla diagnosoitu peräsuolen syöpä 67-vuotiaita, ja biokemialliset luonnehdinta paljasti, että G787R korvaaminen merkittävästi vähentää reseptorin luontaista kinaasiaktiivisuutta.

On ollut kaksi muuta tutkimukset tutkii panos ituradan

EPHB2

mutaatioita peräsuolen syöpä herkkyys. Oba

et al.

Seuloa

EPHB2

mutaatiot koolontuumoreissa ja vastaavat normaalin paksusuolen kudoksissa 50 potilasta, joilla peräsuolen syöpä, ja tunnistaa intronin 8 muutos yhdessä kasvaimen näyte, joka johtaa hölynpölyä mutaatio. On kuitenkin epäselvää, tämä on somaattinen mutaatio, koska ei ole mitään viitteitä siitä, onko tämä geneettinen muutos havaittiin myös pariksi normaalissa paksusuolen näytteen [23]. Tämä tutkimus havaitsi 15 tapausta, joissa Loh joihin

EPHB2

geenin ja seuloa mutaatioiden jäljellä

EPHB2

alleeli. Koska mutaatiot jäljellä alleelin ei tunnistettu, Oba

et al.

Ehdotti, että

EPHB2

ei ole klassinen tuumorisuppressorigeeniä. Koska vain 50 näytettä todennäköisesti satunnaisia ​​tapauksia kolorektaalisyövästä analysoitiin, kasvain vaimennin rooli

EPHB2

ei voida sulkea pois. Eräässä tuoreessa tutkimuksessa, Kokko

et al.

Raportoitu yhdistys kolme uutta variantteja kolorektaalisyöpä [24]. Ituradan missense muutokset johtavat I361V, R568W, ja D861N havaittiin peräsuolen syöpäpotilailla, mutta ei terveillä verrokeilla. On kuitenkin mahdollista, että nämä kolme vaihtoehtoa ovat harvinaisia ​​neutraaleja polymorfismia, koska biologisen merkityksen varianttien ei arvioitiin käyttäen suoraa funktionaalisissa määrityksissä. Potilaat seulotaan näissä jälkimmäisissä kahdessa tutkimuksessa ei välttämättä ole merkittäviä sukuhistorioistaan ​​paksusuolisyövän. Toisin kuin nämä kaksi aikaisempien tutkimusten meidän tutkimus suunniteltiin nimenomaan arvioimaan roolia ituradan

EPHB2

mutaatioita potilailla, joilla on perinnöllinen peräsuolen syöpä, eikä satunnaisia ​​tapauksia. Huolimatta tutkimuksen suunnittelu eroja, yhdessä nämä kolme tutkimukset viittaavat siihen, että

EPHB2

ituradan mutaatioita eivät ole yleisiä ilmiöitä kolorektaalisyövässä. Lisäselvityksiään suurempi otoskoko tarvitaan vahvistavat tämän havainnon.

Yhteenvetona tunnistaneet ituradan

EPHB2

variantti (G787R) vähentyneeseen biologinen aktiivisuus on peräsuolen syövän potilaan, ja viittaavat siihen, että

EPHB2

mutaatiot edistävät murto perinnöllisen peräsuolen syöpä. Harvinaisuus ituradan

EPHB2

mutaatiot tukee merkittävämpi rooli EPHB2 peräsuolen syövän etenemiseen sijaan kasvaimen aloittamista. Koska EphB reseptorit (EPHB2, EPHB3 ja EPHB4) noudattavat samaa kaavaa transkription hiljentämisen peräsuolen syövät, kaikki EphB reseptori perheenjäsenet todennäköisesti olla sama tehtävä tässä sairaudessa. Siksi EphB perhe todennäköisesti osuus pieni osa geneettinen alttius peräsuolen syöpä, mutta on tärkeä rooli syövän etenemiseen. Vaikka havainnot viittaavat siihen, että

EphB

geeniperheen ei tulisi rutiininomaisesti seuloa ituradan mutaatioiden familiaalinen tapauksissa

EphB

geenit ehdokas tuumorisuppressorien, todennäköisesti osuus harvoin familiaalinen peräsuolen syöpä .

tukeminen Information

Taulukko S1.

doi: 10,1371 /journal.pone.0002885.s001

(0,06 MB DOC) B Taulukko S2.

doi: 10,1371 /journal.pone.0002885.s002

(0,05 MB DOC) B

Kiitokset

Kirjoittajat kiittää tohtori D. Daftary, Ms S. Holter, Ms A. Janson niiden apua tiedonkeruun, ja Ms Joelle Fontaine, Ms T. Selander ja Mount Sinai Hospital Biospecimen Repository tekniseen tukeen.