PLoS ONE: Association välinen Telomerase käänteistranskriptaasi (tert) rs2736098 polymorfismi ja syöpäriski: Todisteet Case-Control Study of Non-Small-Cell Lung Cancer ja Meta-Analysis

tiivistelmä

Background

yhteinen geneettinen variantti, telomeraasin käänteistranskriptaasin (

TERT

) rs2736098, äskettäin raportoitu liittyvän keuhkosyövän riskiä valkoihoisilla. Lisäksi monet tutkimukset ovat tutkineet rooli tämän polymorfismin etiologiassa syövän eri elimiin. Kuitenkin tulokset liittyvien tapausverrokkitutkimukset pysyvät epäjohdonmukainen.

Methods

arveltu, että geneettinen riski muunnos havaittu valkoihoisilla saattavat vaikuttaa alttiuteen keuhkosyöpä Kiinan väestöstä. Tämän hypoteesin testaamiseksi, joka on tapauskontrollitutkimuksessa lukien 539 ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC) tapaukset ja 627 syöpää vapaa tarkastukset tehtiin. Lisäksi tutkia yhdistyksen välillä rs2736098 ja syövän riskiä, ​​meta-analyysi, joka perustuu aiemmin julkaistu tutkimuksia ja meidän tapauskontrollitutkimuksessa suoritettiin myös.

Tulokset

Monimuuttujatestaus logistinen regressio osoitti, että yksilöt kuljettaa A-alleelin tai AA-genotyyppi osoittivat huomattavasti kohonnut riski NSCLC verrattuna kuljettavat G-alleeli tai GG-genotyyppi (A vs. G: OR = 1,21, 95% CI = 1,02-1,43,

P

= 0,028; AA vs. GG: OR = 1,48, 95% CI = 1,05-2,09,

P

= 0,025). Lisäksi tämä yhdistys oli vahvempi keskuudessa adenokarsinooma tapauksissa (AA vs. GG: OR = 1,67, 95% CI = 1,12-2,50,

P

= 0,013: A vs. G: OR = 1,28, 95% CI = 1,05-1,57,

P

= 0,016). Meta-analyysissä, rajatapaus Merkitsevä yhteys rs2736098 polymorfismin ja yleistä syöpäriskiä havaittiin (AA vs. GG: OR = 1,25, 95% CI = 1,07-1,46; AA vs. AG + GG: OR = 1,22, 95 % CI = 1,06-1,41; lisäaine malli: OR = 1,10, 95% CI = 1,02-1,18), ja edelleen stratifications osoittivat kohtalaisen lisääntynyt riski keuhkojen ja virtsarakon syövän, Aasian etnisyys ja sairaala perustuvat tutkimukset.

Johtopäätökset

Tuloksemme viittaavat siihen, että rs2736098 polymorfismi voi edistää keuhkosyövän riskiä, ​​erityisesti adenokarsinooma, Kiinan väestöstä. Lisäksi, nykyinen meta-analyysi osoittaa, että tämä geneettinen variantti vain heikosti liittyy yleisesti syövän riskiä. Kuitenkin rs2736098 polymorfismi voi vaikuttaa yksilön alttiuteen keuhko- ja virtsarakon syöpä. Lisätutkimuksia tarvitaan vahvistamaan havaintomme.

Citation: Wu H, Qiao N, Wang Y, Jiang M, Wang S, Wang C, et al. (2013) välisestä assosiaatiosta Telomerase käänteistranskriptaasia (

TERT

) rs2736098 polymorfismi ja syöpäriski: Todisteet Case-Control Study of Non-Small-Cell Lung Cancer ja meta-analyysi. PLoS ONE 8 (11): e76372. doi: 10,1371 /journal.pone.0076372

Editor: Neil A. Bhowmick, Cedars Sinai Medical Center, Yhdysvallat

vastaanotettu: 28 kesäkuu 2013; Hyväksytty: 26 elokuu 2013; Julkaistu: 19 marraskuu 2013

Copyright: © 2013 Wu et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat Natural Science Foundation Shandongin maakunnassa [ZR2012HM083]. https://www.sdstc.gov.cn/. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

maailmanlaajuisesti keuhkosyöpä oli johtava syy syöpäkuolemista miehillä ja toiseksi yleisin syy syöpäkuolemista naisilla vuonna 2008. maantieteellisesti ja ajallisesti kuvioita keuhkosyövän ilmaantuvuuden määräytyvät pitkälti tupakan kulutusta. Keuhkosyöpä noususta maissa, kuten Kiinassa ja monissa muissa maissa Aasiassa ja Afrikassa, missä tupakointi on edelleen joko lisätä tai merkkejä vakautta [1]. Noin 80% 1,3 miljardista tupakoijilla eri puolilla maailmaa elää matala- ja keskituloisissa maissa, joissa yli 300 miljoonaa pelkästään Kiinassa [2]. Ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC), joka sisältää kaksi histologista tyyppiä, levyepiteelisyöpä (SQC) ja adenokarsinooma (ADC), osuus on lähes 85% kaikista keuhkosyöpää. Vaikka huomattavaa terapeuttista edistystä, ennuste NSCLC potilaiden edelleen huono [3].

kehitys keuhkosyöpä näyttää olevan tulosta monimutkaisesta vuorovaikutuksesta ympäristöaltisteiden ja geneettiset tekijät. Äskettäin riippumaton genomin laajuinen yhdistys tutkimukset (GWAS) [4] – [9] ovat osoittaneet, että yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) kolmessa erillisessä kromosomialueita (5p15, 6p21, ja 15q25), jotka sisältävät geenit, jotka säätelevät asetyylikoliinin niko- reseptorin ( nAChR) ja telomeraasi tuotanto, liittyvät merkittävästi keuhkosyövän riskiä. 5p15.33, ratkaiseva genomisen alueen telomere biologian, sisältää kaksi hyvin tunnettuja geenejä: telomeraasin käänteistranskriptaasia (

TERT-

) ja halkio transmembraaninen 1 kaltainen (

CLPTM1L

). TERT proteiini on telomeraasin katalyyttinen alayksikkö, joka elongates telomeerit ja toimii keskeisenä säätelijänä telomeraasiaktiivisuuden. Telomeres, joka koostuu TTAGGG toistoja joka issa lyhentäminen jokaisen solun replikaatiosykli, on jo kauan tiedetty olevan olennainen säilyttämisen kromosomi eheyden [10]. Koska telomerase ja valvonta telomeeripituuden liittyvät läheisesti kehittämiseen monien kasvaintyypit, tieteellinen huomio on keskittynyt mahdollisuus suunnata telomeraasia ja telomeerivasta sitovat proteiinit hoitostrategioita syöpää vastaan ​​[11], [12]. Viime aikoina on raportoitu, että geneettisiä variantteja on 5p15.33 lokuksen, joka sisältää

TERT

geenin (koodaa katalyyttinen alayksikkö telomeraasin), ovat mukana herkkyyden monien kasvaintyypeissä [13], [ ,,,0],14].

yhteinen geneettinen variantti,

TERT

rs2736098, joka sijaitsee kromosomissa 5p15.33, äskettäin tunnistettiin alttius lokus keuhkosyöpään on yhdistetty analyysi Islannin ja Euroopan näytejoukoille [15]. Viime aikoina korealainen väestötutkimuksessa 720 keuhkosyöpäpotilaita ja 720 tervettä verrokkia paljasti, että

TERT

variantti genotyyppi liittyy merkittävästi lisääntynyt riski sairastua keuhkosyöpään [16]. Koska merkitystä tämän genomin alueella (5p15.33) kasvaimen biologiaan ja tarve tarkistaa näiden järjestöjen eri väestöryhmien eri ancestries, me arveltu, että vaara geneettinen variantti (rs2736098) tunnistetaan aikaisempien tutkimusten valkoihoisia ja Korean väestö voi mahdollisesti vaikuttaa alttius keuhkosyöpä Kiinan Han väestö. Tämän hypoteesin testaamiseksi, me genotyyppi SNP rs2736098 ja analysoitiin sen yhdessä keuhkosyövän riskiä on tapauskontrollitutkimuksessa 539 NSCLC tapauksissa ja 627 syöpää vapaa valvontaa sovitettava iän ja sukupuolen mukaan Kiinan Han väestö.

Lisäksi, monet tutkimukset ovat tutkineet rooli tämän polymorfismin etiologiassa syövän eri elinten, mukaan lukien virtsarakon, maksa ja rintojen [17] – [27]. Kuitenkin tulokset liittyvien julkaistu tapausverrokkitutkimukset jäädä ristiriitaisia ​​sijaan ratkaisevia. Siksi tutkimaan edelleen assosiaatiota

TERT

rs2736098 polymorfismi ja syövän riskiä, ​​meta-analyysi, joka perustuu aiemmin julkaistu tutkimuksia ja meidän tapauskontrollitutkimuksessa suoritettiin myös.

Materiaalit ja menetelmät

tapauskontrollitutkimuksessa

Tutkimuskanta.

Jos haluat jättää mahdollisista vaikutuksista etnisyyden, kaikkia aineita tässä tutkimuksessa olivat geneettisesti jotka eivät liity etnisten Han kiinalaisia. Tapaukset mukana 539 vastikään diagnosoitu NSCLC potilaat, jotka otettiin Qilu sairaalan Shandong University (Jinan, Kiina) välillä 2010 ja 2012. Näistä pienisoluista keuhkosyöpää, 293 potilaalla oli adenokarsinoomat (ADC) ja 246 oli okasolusyöpää (SQC). Samaan aikaan 627 syöpää vapaa tarkastuksia valittiin samassa sairaalassa ja oli taajuus-sovitettu tapauksiin iän ja sukupuolen mukaan. Koehenkilöt, jotka olivat sukulaisia ​​tai oli historia maligniteetin ja muiden merkittävien tautien jätettiin pois tästä tutkimuksesta. Lisäksi strukturoitu kyselylomake täytetty jokaisen tapauksen ja valvonta koulutetun Haastattelija keräämään demografisia tietoja ja muita tärkeitä tietoja, kuten ikä, sukupuoli, ja tupakoinnista. Ne henkilöt, jotka savustettu 1 savuke päivässä ja 1 vuosi määriteltiin tupakoimattomien; muuten, potilaat pidettiin tupakoitsijoita. Kaikki osallistujat olivat selostaneet tutkimuksen ja kirjallinen suostumus saatiin kullekin osallistujalle. Tämä tutkimus suoritettiin alla hyväksymisestä eettisten toimikuntien Qilu sairaalan sidoksissa Shandong University.

DNA: n eristämistä ja SNP genotyypitys.

verinäytteet kerättiin kaikki osallistujat aikaan rekrytointi. Genominen DNA uutettiin ääreisverenkierron saatu kunkin osallistujan käyttäen DNA Extraction Kit (Tiangen Biotech (Beijing) Co., Ltd.) mukaan valmistajan protokollaa.

TERT

SNP rs2736098 oli genotyyppi käyttäen TaqMan menetelmää 96-kuoppalevyille ja lukea kanssa Sequence Detection Software (SDS, versio 1.4) Applied Biosystems (ABI) 7500 Real-Time PCR System.

tilastollinen analyysi.

Pearson χ

2 testiä käytettiin arvioimaan eroja jakaumat valittujen ominaisuuksien välillä tapausten ja valvontaa. Hyvyys-of-fit χ

2 koe tehtiin arvioimaan Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) kontrolleissa. Monimuuttuja regressioanalyysimme käytettiin arvioitaessa kertoimet suhde (syrjäisimmillä alueilla) ja niiden 95% luottamusväli (CI) varten vaikutuksen rs2736098 polymorfismin vaikutus NSCLC riskiä. Lisäksi ositettu analysoitaessa histologisia tyyppejä olivat edelleen suoritettiin arvioimaan roolia rs2736098 NSCLC riskiä. Kaikki tilastolliset testit olivat kaksipuolisia, ja tilastollinen merkitsevyys hyväksyttiin

P

0,05.

Meta-analyysi

tunnistaminen ja kelpoisuuden asiaa koskevat tutkimukset.

Jotta voitaisiin edelleen tutkia assosiaatiota

TERT

rs2736098 polymorfismi ja syövän riskiä, ​​meta-analyysi, joka perustuu aiemmin julkaistu tutkimuksia ja meidän tapauskontrollitutkimuksessa suoritettiin. Haimme PubMed ja ISI Web of Science tietokantoja kaikille artikkeleita assosiaatiota

TERT

rs2736098 polymorfismi ja syövän riskiä (viimeinen etsiä päivityksen 05 kesäkuu 2013). Seuraavat hakutermejä käytettiin yksinään ja yhdessä toistensa kanssa: ”telomeraasin käänteistranskriptaasi tai

TERT

tai 5p15.33″, ”polymorfismi tai variantti tai muunnelma”, ja ”syöpä tai kohdunkaulan tai kasvain”. Haku rajattiin Englanti kielen paperit ja ihmisillä tehdyt tutkimukset. Lisäksi olemme seulotaan viiteluetteloihin kaikille mukana, arviot ja meta-analyysit. Kun useita julkaisuja laatia samoilla tai päällekkäisiä tietoja, valitsimme viimeisin julkaisu eniten aiheita. Tutkimukset mukana meidän meta-analyysissä oli täytettävä seuraavat kriteereillä: (1) arviointi

TERT

rs2736098 polymorfismi ja syövän riskiä; (2) tapaus-verrokki suunnittelu; (3) riittävän genotyyppitietoja laskemiseksi kertoimet suhdeluvut (OR), jossa 95%: n luottamusväli (CI); ja (4) kirjoitettu Englanti. Tärkeimmät syyt sulkeminen sisältyvät tutkimukset (1) puuttuminen vertailuryhmällä; (2) kaksoiskappaleet aikaisemmin julkaistu; (3) arvostelut, kommentit tai pääkirjoitukset; ja (4) puute käyttökelpoista tietoa genotyypin taajuuksilla.

Data louhinta.

Kaksi tutkijat (Wu H ja Wang Y) uuttaa tietoa kaikista hyväksyttävistä julkaisuista itsenäisesti mukaisesti sisällyttämällä luetellut kriteerit edellä. Erimielisyydet ratkaistiin keskustelemalla kunnes päästiin yhteisymmärrykseen kunkin lähetyksessä. Esillä olevassa tutkimuksessa, on seuraavat ominaisuudet kerättiin: ensimmäisen tekijän sukunimi, julkaisuvuosi, alkuperämaa, etnisyyden, syöpä tyyppi, lähde kontrolliryhmien (väestöpohjainen tai sairaalan perustuvan valvonnan), genotyypin menetelmää, ja taajuudet genotyyppien tapauksissa ja valvontaa. For tutkimuksia kuuluvien tutkittavien eri etnisten ryhmien, genotyyppi taajuudet ja muut tiedot poimittiin erikseen kullekin etninen ryhmä mahdollisuuksien [21].

Tilastollinen analyysi.

Ensin arvioitiin Hardy-Weinberg tasapainon (HWE) kontrollien kussakin tutkimuksessa. Vahvuus assosiaation

TERT

rs2736098 polymorfismi ja syövän riskiä arvioitiin kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmät alueet), jossa 95%: n luottamusväli (CI). Yhdistetty syrjäisimmillä alueilla laskettiin homozygoottisia vertailu (AA vs. GG), heterotsygoottinen vertailu (AG vs. GG), hallitseva geneettinen malli (AA + AG vs. GG), resessiivinen geneettinen malli (AA vs. AG + GG), ja lisäaine geneettinen malli (2 * AA + AG vs. 2 * GG + AG). Kerrostunut analyysit tehtiin syövän tyyppi (jos syöpä tyyppi sisälsi alle kaksi yksittäisten tutkimusten, se yhdistettiin osaksi ”muita syöpiä ’ryhmä), etnisyys ja lähde valvontaa. Arviointi meta-analyysin tulokset sisältyi tarkastelun heterogeenisyys, analyysin herkkyys, ja kokeeseen julkaisu bias. Heterogeenisyys tarkastettiin chi-neliö-pohjainen Q-testi [28]. Jos tuloksena heterogeenisyys testi oli

P

0,05, niin yhdistettyä syrjäisimpien laskettiin käyttämällä satunnaisia ​​vaikutuksia malli (jäljempänä Dersimonian ja Laird menetelmä) [29]. Muussa tapauksessa, jos tuloksena heterogeenisyys testi oli

P

0,05, kiinteän vaikutusten malli valittiin (Mantel-Haenszel menetelmä) [30]. Käytimme myös

I

2

tilastotieto tehokkaasti testata heterogeenisyys, jossa

I

2

25%, 25-75% ja 75% eli alhainen , kohtalainen ja korkea asteen epäjohdonmukaisuus, vastaavasti [31], [32]. Lisäksi herkkyys analyysit tehtiin jättämällä kunkin tutkimuksen heijastamaan yksittäisten tietojen yhteenveto syrjäisimpien alueiden. Lopuksi, kirjallisuus julkaisu bias arvioitiin käyttäen Begg n suppilo juoni ja Egger testi (

P

0,05 pidettiin merkittävä julkaisu bias) [33], [34]. Kaikki tilastolliset analyysit suoritettiin käyttäen STATA ohjelmistoa (versio 12.0, Stata Corporation, College Station, TX).

Tulokset

tulokset tapauskontrollitutkimuksessa

Väestön ominaispiirteet .

ominaisuudet tapausten ja kontrollien on esitetty taulukossa 1. kaikkiaan 539 NSCLC tapauksissa ja 627 syöpää vapaa tarkastukset otettiin tässä tutkimuksessa. Ei ollut merkittäviä eroja jakaumat sukupuoleen (

P

= 0,403) ja ikä (

P

= 0,688) välillä tapauksessa ja kontrolliryhmiin. Urokset edusti 79,7% kontrolliryhmän ja 77,7% asian ryhmään. Niistä 539 NSCLC tapauksissa 293 (54,4%) oli adenokarsinoomia, ja 246 (45,6%) oli okasolusyöpää. Noin 51,8% tapauksista tupakoi, verrattuna 43,1% hallintalaitteiden (

P

= 0,003).

välisestä assosiaatiosta

TERT

rs2736098 polymorfismi ja NSCLC riski .

tiedot genotyypin taajuudet ja yhdistyksen välinen

TERT

rs2736098 polymorfismia NSCLC riski on esitetty taulukossa 2. jakautuminen genotyyppien joukossa verrokeilla oli mukaisesti Hardy-Weinberg tasapaino (

P

= 0,361). Monimuuttujakalibrointi logistinen regressiomalli osoitti, että yksilöillä, joilla A-alleelin tai AA-genotyyppi näytteille merkittävästi kohonnut NSCLC verrattuna kuljettavat G-alleeli tai GG genotyypin säätämisen jälkeen iän, sukupuolen ja tupakointi (A vs. G: OR = 1,21, 95% CI = 1,02-1,43,

P

= 0,028; AA vs. GG: OR = 1,48, 95% CI = 1,05-2,09,

P

= 0,025).

assosiaatio

TERT

rs2736098 polymorfismia NSCLC riski oli edelleen tutkittiin kerrostetaan aiheiden mukaan kasvainhistologiaa. Kun analysoidaan mukaan histologinen tyyppi, vaikutus

TERT

rs2736098 polymorfismin vaikutus NSCLC riski oli merkittävä adenokarsinoomille (A vs. G: OR = 1,28, 95% CI = 1,05-1,57,

P

= 0,016; AA vs. GG: OR = 1,67, 95% CI = 1,12-2,50,

P

= 0,013), mutta ei okasolusyöpää (A vs. G: OR = 1,11 , 95% CI = +0,89-1,38,

P

= 0,363; AA vs. GG: OR = 1,23, 95% CI = 0,78-1,94,

P

= 0,375; AA + AG vs . GG: OR = 1,12, 95% CI = 0,82-1,52,

P

= 0,487) (taulukko 2).

tulokset meta-analyysin

tutkimus ominaisuudet .

Kuva S1 esittää kirjallisuudesta ja tutkimus valintamenettelyt. Yksitoista artikkelia [16] – [26] 12 tapausverrokkitutkimukset plus Tässä tutkimuksessa oli mukana yhteensä 10044 syöpätapauksista ja 12480 valvonta, lopulta sisällytetty tähän meta-analyysiin. Nämä 13 tutkimuksiin osallistui 3 keuhkosyöpä tutkimuksissa 2 virtsarakon syöpä tutkimukset, 2 maksasolusyövän (HCC) tutkimukset, ja 6 muuta syöpään tutkimuksista (mukaan lukien rintasyövän ja kohdunkaulan syöpä, muun muassa). Oli 5 väestöpohjainen tutkimukset ja 8 sairaala perustuvat tutkimukset. Neljä tutkimukset tehtiin Euroopan jälkeläisiä, ja 9 tutkimusta tehtiin Aasian jälkeläisiä. Genotyyppi jakaumat kontrolleissa kaikkien tutkimusten olivat yhtä mieltä HWE, lukuun ottamatta 2 tutkimukset (

P

0,05) [21], [24], joka testattiin edelleen Herkkyysanalyyseissä. Taulukossa 3 on ominaisuuksiltaan mukana tutkimuksissa.

Main meta-analyysin tuloksia.

Kaiken kuten taulukossa 4, rajatapaus merkittävää yhteyttä ei havaittu

TERT

rs2736098 polymorfismi ja yleinen syövän riski homozygoottisia verrattuna (AA vs. GG: OR = 1,25, 95% CI = 1,07-1,46), resessiivinen geneettinen malli (AA vs. AG + GG: OR = 1,22, 95% CI = 1,06-1,41) ja lisäaine geneettinen malli (2 * AA + AG vs. 2 * GG + AG: OR = 1,10, 95% CI = 1,02-1,18) (kuva 1 ja kuva 2), mutta ei tilastollisesti merkitsevä yhteys oli löytyy heterozygoottiset verrattuna (AG vs. GG: OR = 1,02, 95% CI = 0,97-1,08) tai hallitseva geneettinen malli (AA + AG vs. GG: OR = 1,08, 95% CI = ,99-+1,18).

neliöt ja vaakasuorat viivat vastaavat tutkimuksittain OR ja 95%: n luottamusväli. Alueella neliöiden heijastaa tutkimuksen-ominaispaino (käänteistä varianssi). Timantit ovat yhteenveto OR ja 95%: n luottamusväli. Rs2736098 polymorfismi oli heikosti liittyy suurentunut riski syövän lisäaineen mallissa.

rs2736098 polymorfismi liittyy suurentunut riski syövän homozygoottisia verrattuna (AA vs. GG).

alaryhmäanalyysissä mukaan syöpätyypin, merkittävästi suurentunut riski havaittiin keuhkosyöpä (AA vs. GG: OR = 1,65, 95% CI = 1,34-2,04, hallitseva malli: OR = 1,20, 95% CI = 1,05-1,37; väistyvä malli: OR = 1,58, 95% CI = 1,30-1,92; lisäaine malli: OR = 1,24, 95% CI = 1,12-1,36) ja virtsarakon syöpä (AA vs. GG: OR = 1,55, 95% CI = 1,11-2,15; väistyvä malli: OR = 1,50, 95% CI = 1,01-2,22; lisäaine malli: OR = 1,19, 95% CI = 1,04-1,35). Ei kuitenkaan todisteita yhdistyksen havaittu geneettistä mallia välillä

TERT

rs2736098 polymorfismi ja riski HCC tai muita syöpiä. Kun stratifioitu etnisyys, merkittävästi suurentunut riski havaittiin Aasian väestöstä (AA vs.GG: OR = 1,39, 95% CI = 1,23-1,57, hallitseva malli: OR = 1,14, 95% CI = 1,05-1,24; väistyvä malli: OR = 1,34, 95% CI = 1,19-1,52; lisäaine malli: OR = 1,15, 95% CI = 1,09-1,21) kaikissa geneettisissä malleissa testattu, lukuun ottamatta heterozygoottiset vertailu (AG vs. GG: OR = 1,07, 95% CI = 0,99-1,15). Tästä huolimatta ei ollut yhteyttä havaittu Euroopan väestöstä. Vuonna alaryhmäanalyysi lähde valvonnan merkittävästi suurentunut riski havaittiin sairaalassa perustuvat tutkimukset (AA vs. GG: OR = 1,31, 95% CI = 1,12-1,54, hallitseva malli: OR = 1,13, 95% CI = 1,00 -1,26; väistyvä malli: OR = 1,26, 95% CI = 1,09-1,45; lisäaine malli: OR = 1,13, 95% CI = 1,04-1,22), mutta ei havaittu populaation perustuvat tutkimukset. Tärkeimmät tulokset meta-analyysi ja heterogeenisyys koe on esitetty taulukossa 4.

Test epäyhtenäisyys.

yleistä vertailuja, merkittävä heterogeenisyys havaittiin neljässä geneettinen mallia (AA vs. . GG:

P

het

. = 0,001,

I

2 = 63,0%; AA + AG vs. GG:

P

het.

= 0,010,

I

2 = 54,3%; AA vs. AG + GG:

P

het

. = 0,002,

I

2 = 61,3%; 2 * AA + AG vs. 2 * GG + AG:

P

het

. = 0,001,

I

2 = 64,8%). Kuitenkin heterogeenisyys supistunut selvästi jälkeen kerrostumista, erityisesti alaryhmiin keuhkosyövän (AA vs.GG:

P

het

. = 0,829,

I

2 = 0,0%; AG vs.GG:

P

het

. = 0,969,

I

2 = 0,0%; hallitseva malli:

P

het

. = 0,976,

I

2 = 0,0%; väistyvä malli:

P

het.

= 0,841,

Olen

2 = 0,0%; lisäainetta malli:

P

het

. = 0,936,

I

2 = 0,0%) ja virtsarakon syöpä (AA vs.GG:

P

het.

= 0,275,

I

2 = 16,1%; AG vs.GG:

P

het

. = 0,448,

I

2 = 0,0%; hallitseva malli:

P

het

. = 0,831,

I

2 = 0,0%; väistyvä malli:

P

het

. = 0,169,

I

2 = 47,1%; lisäainetta malli:

P

het.

= 0,598,

I

2 = 0,0%). Kun stratifioitu etnisyys, heterogeenisyys ei havaittu alaryhmiin Aasian ja Euroopan populaatiot (

P

het.

0,05 kaikissa geneettinen vertailuissa) (taulukko 4).

Herkkyys analyysi.

Herkkyysanalyyseissä, vaikutus kunkin tutkimuksen yhdistettyihin OR tarkastettiin erikseen toistamalla meta-analyysissä, kun jätetään pois kunkin tutkimuksen. Vaikka genotyyppi jakaumia valvonnan ryhmien opintojen Gago-Dominguez et ai. [21] ja Zhang et ai. [24] ei noudata Hardy-Weinberg tasapainon vastaavien yhdistettyjen OR ja Tutkimusten välisten heterogeenisyys eivät olleet merkittäviä muuttunut tai ilman näiden kahden tutkimuksen. Herkkyysanalyysit osoittivat, että kaksi riippumatonta tutkimusta Savage et al. [17] ja Liu et al. [18] olivat tärkeimpiä alkuperä heterogeenisyys yleisen vertailuissa (kuva 3). Heterogeenisuus oli tosiasiallisesti vähentynyt tai poistettu, jolle ei näiden kahden tutkimuksen (AA vs. GG: OR = 1,35, 95% CI = 1,22-1,50,

P

het

. = 0,158,

I

2 = 30,3%; hallitseva malli: OR = 1,12, 95% CI = 1,05-1,20,

P

het

. = 0,119,

Olen

2 = 35,0%; lisäainetta malli: OR = 1,14, 95% CI = 1,09-1,19,

P

het

. = 0,142,

I

2 = 32,1%). Lisäksi yksikään yhdistettyjen syrjäisimpien alueiden vaikutti merkittävästi yksittäisen tutkimus viittaa siihen, että tulokset meta-analyysissä olivat suhteellisen vakaat.

Tulokset laskettiin jättämällä kukin tutkimuksessa (vasen sarake) puolestaan. Meta-analyysi random-vaikutus arvioita on käytetty. Bars, 95% CI.

Julkaisu bias arviointi.

Begg n suppilo juoni ja Egger testi tehtiin arvioimaan julkaisemisen bias kirjallisuudessa. Kuten kuvassa 4, Kuva S2 ja kuva S3, muodot suppilon tontteja ei ilmennyt näyttöä ilmeinen epäsymmetrian vertailu malliin. Lisäksi Egger testi Lisäksi tarjotaan tilastollista näyttöä suppilon juoni symmetria (

P

Egger n

= 0,795 AA vs. GG;

P

Egger n

= 0,220 AG vs. GG

P

Egger n

= 0,123 varten hallitseva mallia;

P

Egger n

= 0,913 varten väistyvä malli ja

P

Egger n

= 0,290 varten lisäaineen malli) (taulukko 4). Tulokset eivät osoita todisteita julkaisun puolueellisuudesta.

Jokainen piste edustaa erillistä tutkimusta osoitettuun -alueella. Log [tai], luonnollinen logaritmi riskisuhde. Vaakasuora viiva, keskimääräinen vaikutus koko.

Keskustelu

Tässä tutkimuksessa selvitimme yhdistys

TERT

rs2736098 polymorfismi kanssa riski NSCLC kiinalaisessa han väestöstä. Lisäksi johtamiseksi tarkempi arvio yhdistyksen välinen polymorfismin ja syövän riskiä, ​​meta-analyysi, joka perustuu aiemmin julkaistu tutkimuksia ja meidän tapauskontrollitutkimuksessa suoritettiin myös. Meidän monimuuttuja logistinen regressiomalli osoitti, että yksilöillä, joilla A-alleelin tai AA-genotyyppi näytteille merkittävästi kohonnut NSCLC verrattuna kuljettavat G-alleelin tai GG genotyyppejä oikaisun jälkeen ikä, sukupuoli ja tupakoinnista. Vuonna alaryhmäanalyysi histologinen tyyppi, lisääntynyt syöpäriskiä havaittiin adenokarsinooman muttei okasolusyöpää alla homotsygootti vertailua ja lisäaineen geneettinen malli. Lisäksi

TERT

rs2736098 variantin alleelin osoitti marginaalisesti merkittävää yhteyttä yleistä syöpäriskiä.

TERT

rs2736098 polymorfismi on kartoitettu kromosomin 5p15. 33. Kromosomi 5p15.33 lokus sisältää kaksi tunnettua geenien, telomeraasin käänteistranskriptaasin (

TERT-

) ja halkio transmembraaninen 1 kaltainen (

CLPTM1L

), jotka ovat sekaantuneet karsinogeneesissä. Telomeraasin ilmaistaan ​​eniten kasvainten lähes kaikki syöpiin, mukaan lukien keuhkoihin. Telomerase on suhteellisen spesifinen syövän kohde, kuten normaalit kehon solut ilmentävät vähän tai ei lainkaan telomeraasin useimpien niiden elinkaaren [11]. Telomere toimintahäiriö kasvaimen aloittamista osuus monessa kromosomi epävakauden ihmisen syövissä [35]. Syöpäsolut on osoitettu riippuu kahdesta telomere huolto mekanismeja saada rajoittamattoman leviämisen kapasiteettia. Yleensä telomeraasiaktiivisuuden on tärkein mekanismi telomere huoltoa. Kuitenkin 10% -20% ihmisen kasvaimista aktivoida vaihtoehtoisin telomere pidentämällä [36]. Vahvistukseen kromosomaalisen alueen 5p15.33, jotka sisältävät

TERT

, on yksi yleisimmistä geneettisiä tapahtumia alkuvaiheessa ei-pienisoluinen keuhkosyöpä [37]. Lisäksi on raportoitu, että telomeeripituuden voi liittyä riski sairastua keuhkosyöpään [38] – [40]. Tiedetään vain vähän taustalla biologinen mekanismi tai toiminnallista merkitystä tämän polymorfismin. Vaikka rs2736098 on synonyymi polymorfismi, tämä

TERT

SNP on osoitettu liittyvän telomeeripituuden [15].

Useat tutkimukset ovat tutkineet rooli tämän polymorfismin etiologiassa syövän eri elimiin, mukaan lukien virtsarakon, maksa, ja rinta-, mm. Kuitenkin tulokset liittyvien julkaistu tapausverrokkitutkimukset pysyvät epäjohdonmukaisia ​​[16] – [27] .Esimerkiksi, Zhang et al. [24] totesi, että rs2736098 [A] alleelin edistänyt merkittävästi HCC riskiä. Kuitenkin, Ding et al. [20] ei havaittu assosiaatio

TERT

rs2736098 polymorfismi klo 5p15.33 ja riski HCC. Kahdessa väestöpohjainen tapaus-verrokki-tutkimuksissa erikseen keskuudessa ei-latinalaisamerikkalainen valkoiset (NHW) ja aasialaisilla,

TERT

rs2736098 polymorfismi osoitti merkittävää yhteyttä virtsarakon syöpäriski ei latinalaisamerikkalainen valkoiset. Kuitenkin yhdistys samaa suuruusluokkaa ei havaittu Aasian väestöstä [21]. Puolalaisessa tutkimuksessa 1995 rintasyövistä ja 2296 tarkastukset, Savage et al. [17] ei löytänyt näyttöä siitä, että

TERT

rs2736098 polymorfismi 5p15.33 liittyi rintasyövän riskiä. Kuitenkin ositettu analyysi, tämä muunnos osoitti näyttöä olla mukana pienempi riski sairastua rintasyöpään yksilöiden, joiden suvussa on rintasyöpää. Vaikka on vaikea selittää kiistelty tulokset näissä tutkimuksissa, erilaiset geneettiset taustat, syöpätyyppeihin ja tutkimusasetelma saattaa edistää poikkeamia. Mielenkiintoista, meidän tapauskontrollitutkimuksessa osoitti, että AA homozygoottisia in

TERT

rs2736098 osoitti merkittävästi lisääntynyt riski sairastua NSCLC (OR = 1,48, 95% CI = 1,05-2,09,

P

= 0,025), etenkin adenokarsinooma (OR = 1,67, 95% CI = 1,12-2,50,

P

= 0,013), verrattuna niihin, jotka kantavat GG-genotyyppi. Homotsygoottinen AA alleelit voidaan korreloida lisääntynyt keuhkojen adenokarsinooma alttius. Tulokset meidän tapauskontrollitutkimuksessa tuki 5p15.33 (

tert- CLPTM1L

) kuin alttius alue keuhkosyövän Kiinan väestöstä [41], [42]. Viime aikoina Kiinan naisväestön tutkimuksessa 501 syöpätapauksista ja 576 syöpää vapaa tarkastuksia myös, että variantti alleelin rs2736098 merkitsevästi liittyy suurentunut riski sairastua keuhkosyöpään, erityisesti keuhkojen adenokarsinooman [25]. Vaikka taustalla biologisten mekanismien edelleen suureksi osaksi tuntemattomia, tasauspyörästö ilmaus

TERT

välillä on havaittu adenokarsinooma ja muiden histologinen karsinoomia keuhkosyöpään [43] – [45].

Nykyisessä meta analyysi, rajatapaus merkitsevästi yhteydessä tämän polymorfismin ja syövän riskiä havaittiin yleisen analyysin, jossa ilmeinen Tutkimusten välisten heterogeenisuus. Kuitenkin, kun stratifioituna kasvain sivustoja, alaryhmiin keuhkosyövän ja virtsarakon syöpä ei näytteille heterogeenisuus, mikä viittaa siihen, että eri kasvain sivustot saattavat olla potentiaalinen epäyhtenäisyys. Samoin kun kerrostamiselintä etnisyys, heterogeenisyys pitkälti vähennetty sekä Aasian ja Euroopan populaatiot, mikä viittaa siihen, että etnisyys voi osittain selittää heterogeenisyys. Siksi voidaan olettaa, että heterogeenisuus olemassa pääasiassa eroista johtuen alkuperään ja kasvaimen tyyppejä. Lisäksi kun alaryhmäanalyysi etnisyys, huomasimme, että yksilöillä, joilla A-alleelin tai AA ja AA /AG genotyypit

TERT

rs2736098 polymorfismi olivat todennäköisemmin näytteille lisääntynyt syöpäriski aasialaiset mutta ei eurooppalaisten keskuudessa , mahdollisesti siksi, että geneettisen taustan eroista eri populaatioissa. Muun johdonmukaisen hypoteesi ehdottaa, että

TERT

rs2736098 polymorfismi, synonyymi yhden nukleotidin polymorfismi, on vain merkki SNP muiden funktionaalisten varianttien

TERT

tai muiden lähistöllä geenien. Kuitenkin tämän hypoteesin vielä testata. Lisäksi erilaiset tutkimus malleja ja riittämätön säädöt sekoittavat tekijät saattavat selittää jossakin määrin ristiriitaisia ​​tuloksia eri syöpätyyppejä ja eri populaatioissa.

Vastaa