Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Tämän tutkimuksen tavoitteena oli tutkia suhteita

kitinaasi 3 kaltainen 1

(

CHI3L1

) yhden nukleotidin polymorfismit (SNP: t ) ja haplotypes kehittymiseen kohdun kohdunkaulasyövän taiwanilaisnaisilla. SNP taajuudet ja haplotypes myös korreloi ennusteeseen viittaavia muuttujien kohdunkaulan syövän uusiutuminen, ja potilaan selviytymistä.

Menetelmät ja tärkeimmät havainnot

Yhdeksänkymmentäyhdeksän potilailla, joilla on kohdunkaulan syöpä ja 61 valmiiksi -cancerous vaurioita kohdunkaulan verrattiin 310 terveillä verrokeilla. Kolme SNP: rs6691378 (-1371, G /A), rs10399805 (-247, G /A) ja rs4950928 (-131, C /G) promoottorialueen, ja yksi SNP rs880633 (+2950, ​​T /C) eksonissa 5 analysoitiin reaaliaikainen polymeraasiketjureaktio ja genotyypin määritystä. Tulokset osoittivat, että mutantti homotsygoottinen genotyyppi AA

CHI3L1

SNP rs6691378 ja AA rs10399805, ja haplotyyppien AACC ja AACT lisääntynyt riski sairastua syövän esiasteista ja kohdunkaulan syöpä. Potilaat näitä riskejä haplotypes oli korkeampi kuin vaiheen I kasvaimet, suurempia kasvaimia, ja emättimen hyökkäystä. Vuonna logistinen regressiomalli, ne myös yleensä huono selviytyminen tapahtuma [

p

= 0,078; kerroinsuhde (OR): 2,99, 95%: n luottamusväli (CI): 0,89-10,08] ja suurempi todennäköisyys uusiutumisen tapahtuman (

p

= 0,081; OR: 3,07, 95% CI: 0,87-10,81) . Oli merkittävä assosiaatio

CHI3L1

riski haplotyyppien ja todennäköisyys toistumisen (

p

= 0,002; riskisuhde: 6,21, 95% CI: 1,90-20,41), ja marginaalisesti yhdistyksen välillä riskin haplotypes ja kokonaiselinaikaa (

p

= 0,051; riskisuhde: 3,76, 95% CI: 0,99-14,29) että potilailla, joilla on SCC, käyttämällä Coxin suhteellista riskin malliin.

Johtopäätös

CHI3L1

SNP rs6691378 ja rs10399805 ja

CHI3L1

haplotyyppien kaikki korreloivat kehittämistä kohdunkaulan syövän esiasteista ja kohdunkaulan syöpä. Kohdunkaulan syövän potilaiden kanssa

CHI3L1

haplotypes AACC tai AACT oli huono ennusteeseen viittaavia ominaisuuksia ja huono toistuminen ja eloonjäämisen tapahtumia. Näiden riskien haplotypes liittyi korkeampi uusiutumisen, erityisesti potilailla, joilla on SCC.

Citation: Lin Y-S, Liu Y-F, Chou Y-E, Yang S-F, Chien M-H, Wu C-H, et al. (2014) korrelaatio

kitinaasiaktiivisuuden 3-Like 1

yhden emäksen monimuotoisuus ja Haplotyypit kanssa kohdun kohdunkaulasyövän Taiwanin Naiset. PLoS ONE 9 (9): e104038. doi: 10,1371 /journal.pone.0104038

Editor: Xuefeng Liu, Georgetown University, Yhdysvallat

vastaanotettu 5 maaliskuuta 2014; Hyväksytty: 04 heinäkuu 2014; Julkaistu: 09 syyskuu 2014

Copyright: © 2014 Lin et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Data Saatavuus: Tällä kirjoittajat vahvistavat, että kaikki tiedot taustalla olevat havainnot ovat täysin saatavilla rajoituksetta. Kaikki tiedot sisältyvät paperin.

Rahoitus: Tämä tutkimus tukivat tutkimuksen avustuksia Chung Shan Medical University Hospital (CSH-2013-D-001, CSH-2014-D-003), Taiwan National Science Council (NSC 102-2314-B-040-014-MY3) ja Chung Shan Medical University Hospital ja Chi-Mei Foundation Medical Center (CSMU-CMMC-102-02). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Chitinase3-like1 (CHI3L1) on glykoproteiini, jota koodaa

kitinaasi 3 kaltainen 1

(

CHI3L1

) geeni sijaitsee ihmisen kromosomissa 1q32.1 [1] . Tämä glykoproteiini on usein kutsutaan YKL-40 tai ihmisen ruston glykoproteiini- 39 (HC gp-39), ja sen tiedetään olevan tulehdusta sytokiini kitinaasia [2], [3]. Se on erittyvä proteiini, jonka molekyylipaino on 40 kD, ja se tunnistetaan N-terminaalinen sekvensointi on tyrosiini (lyhennettynä Y), lysiini (K), ja leusiini (L) [4]. Se on tunnustettu kasvutekijänä sidekudoksen solujen ja muuttoliikkeen edistävä tekijä endoteelisolujen, ja tuotetaan erilaisia ​​soluja kuten syöpäsoluja, aktivoitu makrofagit ja neutrofiilit. On myös tunnettua rooli tulehduksen, solujen lisääntymisen, anti-apoptoosin, stimulaatio angiogeneesin, ja säätely ekstrasellulaarisen kudosten uudismuodostusta [2], [5] – [7].

Kjærgaard et al. käytetyt väestöpohjaisen ennakoiva tutkimus Tanskan väestön tutkia geneettisiä variantteja

CHI3L1

että vaikutus YKL-40 tasoa, ja että kahdeksan yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) ja

CHI3L1

geeni liittyy plasman YKL-40 tasoa väestössä [8]. Nämä

CHI3L1

SNP: t sisältyvät rs10399805 (-247, G /A) ja rs4950928 (-131, C /G) promoottorialueen, ja rs880633 (+2950, ​​T /C): n eksonissa 5 jne. On kuitenkin , Thomsen et al., myös käyttämällä Tanskan väestöä kansainvälisessä MONICA (seuranta trendejä ja tekijöitä sydän- ja verisuonisairauksien) hanke, osoitti, että 12SNPs liittyivät seerumin YKL-40 tasoa [9]. Nämä

CHI3L1

SNP mukana rs6691378 (-1371, G /A), rs4950928, ja rs880633 jne

Kohdun kohdunkaulan syöpä on viides yleisin maligniteetti naisten Taiwanissa, ja Ikävakioitu esiintyvyys vuonna 2009 11,86 per 100000 naisia ​​mukaan Terveyden edistämisen hallinto terveysministeriön ja hyvinvoinnin. Sen Ikävakioitu kuolleisuus oli 3,72 100000 naisia ​​vuonna 2011, joten se seitsemäs top syy syövän kuolemaan taiwanilaisnaisilla.

yhden emäksen monimuotoisuus voi vaikuttaa promoottorin aktiivisuutta, geenien ilmentyminen, lähetti-RNA konformaatio (vakaus) , ja solukomponenttien lokalisointi mRNA ja /tai proteiineja, ja todennäköisesti aiheuttaa sairauksia [10]. Useat viimeaikaiset tutkimukset ovat osoittaneet, että geneettiset variaatiot

CHI3L1

SNP vaikuttaa yksilöiden välisiä seerumin YKL-40 tasoa sekä alttius atopia, sarkoidoosi, astma, ja keuhkojen toiminta [11] – [14] . Esikäsittely seerumin YKL-40 on myös raportoitu olevan koholla kohdunkaulan syövän [15]. Tähän mennessä yksikään tutkimus korreloivat

CHI3L1

SNP kohdunkaulan syövän taiwanilaisnaisilla. Jos lähtökohtana että geenipolymorfismien tai haplotyyppien

CHI3L1

geeni vaikuttaa YKL-40 ilmentyminen kohdunkaulan syövän, tässä tutkimuksessa tutkittiin jakelu

CHI3L1

geenipolymorfismien ja haplotyyppien keskuudessa potilailla, joilla on kohdunkaulan syövän ja syövän esiasteista ja normaalit kontrollit määrittelemään rooliaan kohdunkaulan syövän syntymistä taiwanilaisnaisilla. SNP taajuudet tai haplotyyppien

CHI3L1

olivat edelleen liittyy ennusteeseen viittaavia muuttujia kohdunkaulan syöpä, syövän uusiutumiseen ja potilaiden eloonjäämisen. Tämä tutkimus osoitti merkittävää yhteenliittymien

CHI3L1

SNP ja haplotypes kehittämisen kanssa syövän esiasteista ja kohdunkaulan syöpä kohdunkaulan, ja paljasti, että

CHI3L1

haplotypes liittyivät ennustetta kohdunkaulan syöpäpotilailla.

Materiaalit ja menetelmät

Väestö

neljä seitsemänkymmentä naisia, mukaan lukien 99 potilasta, joilla kohdunkaulan syöpä, 61 potilaalla on syövän esiasteista kohdunkaulan, ja 310 normaalit kontrollit, värvättiin peräkkäin tähän tutkimukseen. Potilaat, joilla invasiivisen kohdunkaulan syövän oli kliinisesti lavastettuja perustuu 2009 International Federation of Gynecology and Obstetrics luokittelu ja saivat normaalin hoito-osastolla Naistenklinikka Chung Shan Medical University Hospital, Taiwan, maaliskuusta 1999 lokakuussa 2012. potilaiden joissa syövän esiasteista, joka vain käsitti kohdunkaulan dysplasiaan (korkealaatuisesta levyepiteelikarsinooma intraepiteliaalisia vaurioita) tässä tutkimuksessa ja keskivaikea ja vaikea dysplasia sekä karsinooma in situ, kävi colposcopy ohjaama kohdunkaulan booli koepala, suuri silmukka leikkaamisella muutos vyöhyke, yhteensä vatsan kohdunpoisto, tai koko emättimen kohdunpoisto. 310 terveisiin verrokkeihin Papanicolaou tahroja olivat edelleen todentaa colposcopy aikana yleinen kokeet poliklinikalla meidän sairaalassa. Iät naisten kohdunkaulan kohdunkaulan syöpä, syövän esiasteista, ja normaalit kontrollit olivat 53,6 ± 12,0, 42,7 ± 12,7, ja 44,7 ± 9,8 (keskiarvo ± SD) vuotta, vastaavasti. Kaikki olivat taiwanilaisnaisilla jotka asuivat Keski Taiwanissa. Chung Shan Medical University Hospital Institutional Review Board hyväksyi tämän tutkimuksen (CSMUH IRB: CS12218, CS12219, CS14014), ja ilmoitti kirjallinen suostumus saatiin kunkin yksittäisen.

valinta

kitinaasi 3 kaltainen 1

geenipolymorfismien

kolme SNP: rs6691378 (-1371, G /A), rs10399805 (-247, G /A), ja rs4950928 (-131, C /G) promoottorialueella ja yksi SNP rs880633 (+2950, ​​T /C) eksonin 5 valittiin perustuu Kiinan HapMap (Han-kiinalaisia ​​Pekingissä, Kiina) tiedot ja tutkimukset Thomsen et al. ja Kjærgaard et ai. [12], [16]. Vähäinen alleelifrekvenssien (MAFs) näistä SNP: t olivat ≥5%.

Veren näytteen keräys- ja genomisen DNA: n uutto

yhteensä 160 verinäytteitä kerättiin potilailla, joilla on kohdunkaulan kohdunkaulan syöpä ja ne, joilla on syövän esiasteista, ja 310 verinäytteitä saatiin kontrolleihin. Genominen DNA uutettiin EDTA antikoaguloidusta laskimoverta käyttäen QIAamp DNA veren mini (Qiagen, Valencia, CA, USA), joka perustuu valmistajan protokollaa. DNA liuotettiin Tris-etyleeni-puskurissa (10 mmol /l Tris ja 1 mmol /l EDTA; pH 7,8) ja kvantitoitiin sitten mittaus OD260. Lopullinen valmiste säilytettiin -20 ° C: ssa ja käytetään mallien polymeraasiketjureaktio (PCR).

Yhden nukleotidin polymorfismien reaaliaikaisella-PCR ja genotyypityksen

Allelic syrjintä on rs6691378 ( -1371, G /A), rs10399805 (-247, G /A), rs4950928 (-131, C /G), ja rs880633 (+2950, ​​T /C) polymorfismit arvioitiin käyttäen ABI StepOne Real-Time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA), ja analysoitiin SDS-version 3.0 ohjelmistolla (Applied Biosystems) käyttäen TaqMan-määritystä. 10 ui lopputilavuus jokaista reaktio sisälsi 5 ui TaqMan genotyypin Master Mix, 0,25 ui TaqMan koetinseosta, ja 10 ng genomista DNA: ta. Reaaliaikainen PCR sisältyy ensimmäinen denaturaatiovaiheen 95 ° C: ssa 10 minuuttia, minkä jälkeen 40 sykliä 95 ° C 15 sekunnin ajan ja sitten 60 ° C: ssa yhden minuutin ajan.

Tilastollinen analyysi

analyysi varianssi (ANOVA) käytettiin analysoimaan ikäjakauma tutkimuspopulaation ja verrokkien. Scheffen testiä käytettiin post hoc -analyysissä.

Hardy-Weinberg tasapaino käytettiin analysoimaan genotyyppi jakaumat rs6691378, rs10399805, rs4950928 ja rs880633 normaalissa valvonta (vapausasteen = 2). Chi-square tai Fisherin tarkkaa testiä käytettiin tutkimaan välisiä suhteita taajuudet

CHI3L1

geenin SNP, alleelit, ja haplotyyppien ja kohdunkaulan neoplasian (mukaan lukien kohdunkaulan syöpä ja syövän esiasteista), samoin erilaisina ennusteeseen viittaavia parametreja, mukaan luettuna kliininen vaihe (I tai ≥II), histopatologisia tyyppejä, kuten okasolusyöpä (SCC) tai adenokarsinooma, solujen luokittelu (no, tai kohtalainen ja huono eriyttäminen), invaasio syvyys kohdunkaulan stroman (≤10 mm 10 mm: n strooman invaasio syvyys), kasvaimen halkaisija (≤4 tai 4 cm), parametrium ja emättimen hyökkäyksen, ja lantion imusolmuke etäpesäke havaittu leikkauksen aikana.

logistinen regressiomalli tai useita logistinen regressio olivat käytetään analysoida toistuvia vertailuja SNP genotyyppien

CHI3L1

geenipolymorfismien ennen ja jälkeen valvoa iän välillä potilaiden kohdunkaulan neoplasian ja valvontaa, tai potilailla, joilla on kohdunkaulan syöpä tai syövän esiasteista ja valvontaa. Ei ikäjakauma sopeutettiin alleelin vertailuja (alleelin määrä kunkin alleelin kunkin alaryhmän vastasi kaksitahoinen lukumäärän Homotsygoottisen genotyyppien plus yksi-kertainen määrä heterotsygoottista genotyyppiä, siksi emme voi analysoida ikäjakauma aiheista alaryhmiä, esimerkiksi määrän G alleelien = 2 * lukumäärä GG alleelien + 1 * määrä GA alleelien) tai haplotyyppi jakelu (mielivaltainen uudelleenluokittelu). Näytteen koko arvioitiin voimalla (1-β), 0,8 ja α, 0,05, ja valtuudet laskettiin kun vertailuja joukossa alaryhmien olivat tilastollisesti merkitykset (

p

0,05) asianmukainen otoskoko käyttäen WinPepi ohjelmisto, versio 10.0.

logistiikkaregressiomallin käytettiin myös korreloivan eri ennusteeseen viittaavia parametreja ja

CHI3L1

polymorfismien kanssa syövän uusiutumiseen tapahtuman tai potilaan selviytymistä tapahtuma. Coxin suhteellisen riskin malliin käytettiin vaikutusten arvioimiseksi

CHI3L1

haplotypes todennäköisyydestä toistumisen tai kokonaiselinaika oikaisun jälkeen eri ennusteeseen viittaavia parametreja monimuuttujamenetelmin suhteessa uusiutumiseen tai elinaika. Kun seuranta-ajan sisällytettiin selviytymisen tai toistumista analyysin mukaan potilaat ilmoittautunut eloonjäämiseen analyysi mukaan lukien 5 vuoden pysyvyys tai todennäköisyys toistumisen välillä ensisijaisen leikkauksen ja kuoleman tai toistumista tai tutkimuksen päättyessä (lokakuu 2013) Kaplan-Meier malli ja monimuuttuja ja yhden muuttujan Coxin regressiomallien. Merkittävä ero oli asetettu

p

0,05. Tilastolliset analyysit lukien kerroinsuhde (OR) ja odotusarvo (AOR, kontrolloiden ikää) ja niiden 95%: n luottamusväli (CI) laskettiin SPSS, versio 12.0 ja WinPepi Software, versio 10.0.

Tulokset

ikäjakauma tutkimushenkilöillä oli merkitsevästi erilainen potilaiden kohdunkaulan syöpää ja ne, joilla syövän esiasteista (53,6 ± 12,0 vs. 42,7 ± 12,7 vuotta,

p

0,001 ) ja näiden kanssa kohdunkaulan syövän ja säätimet (53,6 ± 12,0 vs. 44,7 ± 9,8 vuotta,

p

0,001), mutta ei näiden kanssa syövän esiasteista ja säätimet (42,7 ± 12,7 vs. . 44,7 ± 9,8 vuotta,

p

= 0,407). Genotyyppi jakaumat rs6691378, rs10399805, rs4950928 ja rs880633 tapasi Hardy-Weinberg tasapaino, jota sovellettiin tavanomaista valvontaa.

Association of

kitinaasi 3 kaltainen 1

geenipolymorfismien kohdunkaulan neoplasia

oli merkitseviä eroja jakaumat SNP rs6691378 ja rs10399805 että

CHI3L1

geenin välissä naisten kohdunkaulan neoplasian ja normaalin valvonnan (

p

0,001 ja

p

0,001, vastaavasti) (taulukko 1). Ei kuitenkaan ole tällaista havaittu eroja rs4950928 ja rs880633. Mutantti homotsygoottinen genotyyppi AA SNP rs6691378 oli eri jaettu naisten kohdunkaulan neoplasian ja säätimet verrattuna villin homotsygoottinen genotyyppi GG ja heterotsygoottinen genotyyppi GA (

p

0,001). Muita määrääviä iän, naisten kanssa mutantti homotsygoottinen AA suorittaa suurempi riski sairastua kohdun neoplasiaa verrattuna villin genotyyppi GG (AOR: 3,53, 95% CI: 1,71-7,35) tai GG /GA (AOR: 3,40, 95% CI: 1,69-6,85) (taulukko 1). Mutantti homotsygoottinen genotyyppi AA SNP rs10399805 myös eri jaettu välillä, joilla kohdunkaulan neoplasian ja säätimet verrattuna villin GG ja heterotsygoottinen GA (

p

0,001). Sen jälkeen kontrolloidaan ikä, naisten mutantti homotsygoottinen AA oli suurempi riski sairastua kohdun neoplasiaa verrattuna villin genotyyppi GG (AOR: 3,68, 95% CI: 1,71-7,87) tai GG /GA (AOR: 3,60, 95% CI: 1,82-7,52).

Kun kohdun neoplasiaa ryhmä jaettu edelleen alaryhmiin invasiivisen syövän ja syövän esiasteista, merkittäviä eroja oli olemassa jakaumat SNP rs6691378 ja rs10399805 että

CHI3L1

geeni naisilla kohdunkaulan kohdunkaulan syöpä ja syövän esiasteista ja normaali naiset (

p

= 0,002 ja

p

= 0,003; Ptaulukko 2). Ei kuitenkaan ole tällaista havaittu eroja rs4950928 ja rs880633. Mutantti homotsygoottisia genotyypit kummankin SNP näytteillä eri jakelua keskuudessa potilailla, joilla on kohdunkaulan kohdunkaulan syöpä ja syövän esiasteista, ja säätimet verrattuna villin homotsygoottisia ja heterotsygoottinen genotyyppien (

p

0,001 ja

p

0,001, vastaavasti, taulukko 2). Säätämisen jälkeen ikä, mutantti homotsygoottinen AA sekä SNP rs6691378 ja rs10399805 paitsi lisäsi riskiä sairastua invasiivisen kohdunkaulan syövän (AOR: 2,37, 95% CI: 1,04-5,38 ja AOR: 2,82, 95% CI: 1,20-6,58, vastaavasti), mutta myös syövän esiasteista (AOR: 5,26, 95% CI: 2,22-12,50 ja AOR: 4,83, 95% CI: 1,90-12,35, vastaavasti) verrattuna GG /GA (taulukko 2).

Analyysi alleelifrekvenssien

kitinaasi 3-like-1-

polymorfismit tutkimuskohortissa

analysointi alleelifrekvenssien neljän

CHI3L1

geenin polymorfismien 470 kerätyt näytteet, alleelifrekvenssien in

CHI3L1

SNP rs6691378 ja rs10399805 polymorfismien olivat eri jaetaan naisten kohdunkaulan kohdunkaulan syöpä, joilla on syövän esiasteista, ja normaali potilailla (

p

= 0,008 ja

p

= 0,012, vastaavasti) (taulukko 3). Ei ollut tällaisia ​​eroja SNP rs4950928 ja rs880633. Mutanttialleelit A ja A SNP rs6691378 ja rs10399805 lisääntynyt ja taipumus lisätä riskiä sairastua kohdunkaulan syövän esiasteista (OR: 1,66, 95% CI: 1,11-2,49 ja OR: 1,48, 95% CI: 0,98-2,25, vastaavasti; taulukko 3). He myös lisääntynyt riski sairastua invasiivisen kohdunkaulan syövän (OR: 1,51, 95% CI: 1,08-2,12 ja OR: 1,60, 95% CI: 1,14-2,25, vastaavasti, taulukko 3).

haplotyyppien

kitinaasi 3 kaltainen 1

SNP perustuu taiwanilaisnaisilla ja niiden osallistuminen kohdunkaulan syövän

perustuu sijainnit analysoitu variantteja (rs6691378, rs10399805, rs4950928 ja rs880663), olevaa

CHI3L1

geenin, sijainnit genotyyppi variantteja, ja niiden pareittain kytkentäepätasapaino- kuvioita piirrettiin (kuvio 1). Koska mutantti homotsygoottinen AA ja AA:

CHI3L1

SNP rs6691378 ja rs10399805 lisääntynyt riski sairastua kohdunkaulan syövän esiasteista tai kohdunkaulan syöpä, haplotyyppien niitä sisältäviä (AACC ja AACT) pidettiin riski alaryhmä, kun taas muut haplotypes (eli GGCC, GGCT, GGGC, GGGT, GACC, GACT, AGCC, ja AGCT) pidettiin kontrollina alaryhmä. Yksilöiden haplotypes AACC ja AACT oli suurentunut riski sairastua kohdun neoplasiaa (

p

= 0,002). Kun kohdun neoplasiaa ryhmä jaettu edelleen alaryhmiin invasiivisen syövän ja syövän esiasteista, merkittäviä eroja olemassa jakaumat

CHI3L1

haplotypes naisilla kohdunkaulan kohdunkaulan syöpä ja syövän esiasteista ja valvontaa (

p

= 0,01). Naiset, joilla AACC tai AACT haplotypes oli suurempi riski kehittää invasiivisen kohdunkaulan syövän (OR: 1,60, 95% CI: 1,13-2,26, taulukko 4).

(A) Kaavamainen esitys

CHI3L1

(gene ID: 1116) osoittaa sijainnit analysoitiin variantteja (rs6691378, rs10399805, rs4950928, ja rs880663). Musta ja valkoiset laatikot osoittavat un käännetty ja koodaavat alueet, vastaavasti. Eksoni numero merkitty alla eksonien ja variantti paikoissa alkaa translaation aloituspaikasta. (B) Yksi havaittu haploblock että pareittain LD mitattu on D’leimattu ja väritetty harmaalla mittakaavaa väestötietoja vuodesta han-kiinalaisten Peking, Kiina (CHB) on HapMap 3.

Association of

kitinaasi 3 kaltainen 1

geenipolymorfismien ja haplotyyppien kanssa ennusteeseen viittaavia muuttujia kohdunkaulan syöpä, syövän uusiutumiseen ja potilaiden eloonjäämisen

ei ollut assosiaatioita

CHI3L1

geenipolymorfismien ja ennusteeseen viittaavia muuttujia kohdunkaulan syöpä, syövän uusiutumiseen ja potilaiden eloonjäämisen. Kun

CHI3L1

haplotypes otettiin mukaan analyysiin, ne liittyivät kliinisessä vaiheessa (

p

= 0,040, OR: 2,31, 95% CI: 0,95-5,72; ≥ vaiheen II vs . I vaiheeseen, taulukko 5), kasvaimen halkaisija (

p

= 0,054; OR: 2,19, 95% CI: 0,90-5,43; 4 cm vs. ≤4 cm) ja emättimen invaasio (

p

= 0,024; OR: 2,66, 95% CI: 0,98-6,83; hyökkäys vs. no hyökkäys). Lisäksi merkittävät yhdistysten tuli vielä selvempi keskuudessa

CHI3L1

riski haplotypes ja kliinisessä vaiheessa (

p

= 0,009; OR: 3,29, 95% CI: 1,18-9,63; ≥ vaiheen II vs. I vaiheeseen, taulukko 5), kasvaimen halkaisija (

p

= 0,029; OR: 2,75, 95% CI: 0,99-8,04; 4 cm vs. ≤4 cm), ja emättimen invaasio (

p

= 0,004; OR: 4,10, 95% CI: 1,40-11,62; hyökkäys vs. ei hyökkäys) SCC yksilöitä, mutta ei adenokarsinooman kudoksissa.

Kohdunkaulan syöpää sairastavilla potilailla

CHI3L1

riski haplotypes taipumusta huonoihin eloonjäämisen tapahtuma (logistinen regressiomalli;

p

= 0,078; OR: 2,99, 95% CI: 0,89-10,08, taulukko 6). Kuitenkin solun luokittelu 2/3 (

p

= 0.049; OR: 5.47, 95% CI: 1,01-29,78) ja positiivinen lantion imusolmuke etäpesäke (

p

= 0,002; OR: 5,58 , 95% CI: 1,92-12,63) olivat riippumattomia ennustavia tekijöitä elossaololuku tapahtumaan. Viiden vuoden elossaolo oli 66,1% potilaiden kanssa

CHI3L1

riski haplotypes, ja tämä nousi 88,1% niille muiden haplotypes. Kuitenkin, se ei voinut päästä tilastollista merkitystä (

p

= 0,21; OR: 1,68, 95% CI: 0,73-3,85, taulukko 7). Lisäksi

CHI3L1

haplotypes oli myös taipumus liittyä suurempi todennäköisyys uusiutumisen tapahtuman (

p

= 0,081; OR: 3,07, 95% CI: 0,87-10,81, taulukko 6) . Cell luokittelu 2/3 (

p

= 0,015; OR: 8.73, 95% CI: 1,52-50,29) ja positiivinen lantion imusolmuke etäpesäke (

p

= 0,001; OR: 6,52, 95 % CI: 2,25-18,93) olivat riippumattomia ennustavia tekijöitä syövän uusiutumiseen tapahtumaan. Kohdunkaulan syöpää sairastavien potilaiden SCC,

CHI3L1

riski haplotypes lisäsi riskiä toistumisen tapahtuman (

p

= 0,011; OR: 7,50, 95% CI: 1,60-35,16) ja pyrki nousemaan riski huono selviytyminen tapahtuman (

p

= 0,051; OR: 4,36, 95% CI: 0,99-19,14), vuonna logistinen regressiomalli. Syvä invaasio syvyys ja ≥stage II myös lisääntynyt riski toistumisen tapahtuman (

p

= 0,04; OR: 4,61, 95% CI: 1,08-19,74 ja

p

= 0,047; OR: 6.17 , 95% CI: 1,03-37,04, vastaavasti). Positiivinen lantion imusolmuke etäpesäke lisäsi riskiä toistumisen tapahtuman (

p

= 0,012; OR: 4,49, 95% CI: 1,40-14,46) ja taipumus lisätä riskiä köyhien eloonjäämisen tapahtuman (

p

= 0,058, OR: 3,10, 95% CI: 0,96-10,00).

Only solujen luokittelu todettiin olevan itsenäisesti ennusta yleisen selviytymisen monimuuttujamenetelmin (

p

= 0,037, riskisuhde: 5,59, 95% CI: 1,11-28,57, taulukko 7). Kuitenkin

CHI3L1

riski haplotyyppien, syvyys strooman hyökkäystä, solujen luokittelu ja lantion imusolmuke etäpesäke olivat riippumattomia ennustavia tekijöitä todennäköisyys toistumisen (taulukko 8). Monimuuttuja analyysi todennäköisyys toistumisen ja eloonjäämisaste potilaiden SCC,

CHI3L1

riski haplotypes osoitti merkittävää yhteyttä todennäköisyys toistumisen (

p

= 0,002; riskisuhde: 6,21 , 95% CI: 1,90-20,41) ja marginaalinen yhdessä kokonaiselinaikaa (

p

= 0,051; riskisuhde: 3,76, 95% CI: 0,99-14,29) keskuudessa ennusteeseen viittaavia parametreja ja

CHI3L1

haplotypes käyttämällä Coxin suhteellisten riskien mallia (taulukko 8). Nämä löydökset eivät osoitettu potilailla, joilla adenokarsinooma.

Keskustelu

Parhaan tietomme mukaan esillä oleva tutkimus on ensimmäinen, osoittaa merkittävää yhdistyksen välillä

CHI3L1

geenipolymorfismien ja alttiutta kohdun kohdunkaulan syöpä. Molemmat mutantti homotsygoottinen genotyypit AA ja AA promoottorialueissa -1371 ja -247 on

CHI3L1

SNP rs6691378 ja rs10399805 paitsi lisäsi alttiutta syövän esiasteista mutta myös kohdunkaulan syöpä kohdunkaulan jälkeenkin kontrolloi ikä. Ei ole tällaista eroja havaittiin rs4950928 (-131, promoottorialueen) ja rs880633 (+2950, ​​eksoni 5). Useat tutkimukset

CHI3L1

SNP ovat dokumentoineet, että geneettinen muunnelmia

CHI3L1

vaikuttaa kiertävän YKL-40 tasoa, sekä terveillä aikuisilla ja potilailla, joilla on sairauksia [17] – [20]. Kajergarred et ai. ja Thomsen et al. osoittaneet säätelyvaikutukset joidenkin promoottorin SNP, kuten rs6691378, rs10399805, ja rs4950928, plasman YKL-40 tasoa Tanskan väestössä [21], [22]. Vähäinen alleeli rs10399805 on raportoitu parantaa sitoutumista CCAAT edistäjän-sitovan proteiinin (C /EBFα) geenin promoottorin ja lisätä

CHI3L1

transkription siten lisätä plasman YKL-40 tasoa [23], [ ,,,0],24]. Sen sijaan, Zheng et ai. ei havaittu merkittävää yhteyttä välillä SNP rs10399805 ja YKL-40 tasoa kiinalaisessa väestöstä [17]. Eri tutkimuksessa populaatiot voivat vaikuttaa tuloksiin. Verlaan et ai. paljasti, että rs10399805 ja rs4950928 moduloida

CHI3L1

transkription ja promoottori polymorfismien

CHI3L1

ja liittyy astmaan [25]. Useimmat altistavia geenejä yhteisiä taudit eivät keskeisessä asemassa altistavien taudin, mutta toimivat vasteenmuuntajat sisäiseen tai ulkoiseen ympäristöön liittyvät tekijät [26], [27].

YKL-40-proteiinin koodaa

CHI3L1

, ja SNP

CHI3L1

promoottori on liittynyt kohonnut seerumin YKL-40 tasoa [20], [28], ja ero geenien ilmentyminen [28] ja transkriptipitoisuuksissa [29]. YKL-40 on raportoitu aloittaa mitogeeniaktivoidun proteiinikinaasin (MAPK) ja phosphoinoside-3-kinaasi (PI3K) signalointireittejä, jotka johtavat lisääntyneeseen soluproliferaation sidekudoksen-kudoksen soluihin [30]. Hiirihomologi YKL-40 on rintojen regressio proteiinin 39 kDa (BRP-39), joka on kuvattu ekspressoituvan syöpäsoluissa, ja YKL-40 /BRP-39 on osoitettu olevan merkittävä rooli solujen lisääntymistä, selviytyminen, ja kudoksen uudelleen [30] – [32]. Seerumin YKL-40 voidaan erittää täysin aktivoitu makrofagit liittyvät kasvain ja voidaan tuottaa itse kasvainsoluihin tai ei-pahanlaatuisia soluja, kuten aktivoitujen neutrofiilien ja fibroblastien, kondrosyyttien, ja synoviaalisolujen [32] – [34]. Kasvainsolut on raportoitu ilmaista ja tuottaa YKL-40 rinta- ja paksusuolen syövän [35], kun taas kasvaimeen liittyvät makrofagit, mutta ei kasvainsoluja, on raportoitu erittävän YKL-40 keuhkosyövän [36]. Mitsuhashi et ai. havaittu, että esikäsittely seerumin YKL-40 ovat koholla kohdunkaulan syövän, vaikka alkuvaiheessa [15]. Koska

CHI3L1

SNP vaikuttaa YKL-40 ilme, he voivat myöhemmin vaikuttaa kehitykseen sairauksien kuten kohdunkaulan syöpä.

MAFs in rs6691378, rs10399805, ja rs4950928 on

CHI3L1

promoottorit taiwanilaisnaisilla nykyisessä tutkimuksessa (27,4%, 25,5%, ja 18,1%, tässä järjestyksessä) ovat samanlaiset kuin Han Kiinan Peking, Kiina (HCB, 25,6%, 25,6%, ja 17,1%, tässä järjestyksessä ), jotka perustuvat National Center for Biotechnology Information (NCBI) SNP tietokanta (dbSNP). MAF in rs880633 (33,9%) eksonin 5

CHI3L1

geeni on myös samanlainen kuin HCB (35,6%), joka myös perustuu dbSNP. Lisäksi mutantti alleeli A SNP rs6691378 lisääntynyt riski sairastua kohdunkaulan syövän esiasteista ja kohdunkaulan syöpä. Vaikka mutantti alleeli A SNP rs10399805 myös lisääntynyt alttius kohdunkaulan syöpä, sen vaikutus kehitykseen syövän esiasteista ei ollut niin vahva kuin A SNP rs6691378. Voidakseen soveltaa haplotyyppien, pareittain kytkentäepätasapaino- kuvioita luotiin näille SNP, ja tulokset osoittivat, että rs6691378 on vahva kanssa kytkentäepätasapainossa rs10399805 (D ’= 0,94). Mutantti homotsygoottinen AA sekä AA

CHI3L1

SNP rs6691378 ja rs10399805 liittyi kohdunkaulan syövän synnyn. Siten

CHI3L1

haplotyyppien voidaan käyttää edelleen korrelaation kehittämiseen ja ennusteeseen viittaavia muuttujat kohdunkaulan syövän ja potilaan ennustetta.

Ei vain alleelin jakelu

CHI3L1

SNP: t, mutta myös

CHI3L1

riski haplotypes, AACC ja AACT, korreloi alttius kohdunkaulan syövän esiasteista ja kohdunkaulan syöpä esillä olevassa tutkimuksessa. On olemassa muutamia olemassa olevat tutkimukset, jotka ovat raportoineet suhteet

CHI3L1

haplotyyppien sairauksia. Zhao et ai. paljasti merkitseviä kolmen SNP promoottorialueen

CHI3L1

geeni (rs6691378, -1371, rs10399805, -247 ja rs4950928, -131) skitsofreniaan [28]. Lisäksi ne on rakennettu näiden kolmen SNP: t, kuten

CHI3L1

haplotyyppien ja totesi, että

CHI3L1

haplotyyppien osallisena skitsofrenian herkkyys liittyi muuttuneeseen ekspressiotasot geenin. Geneettiset variaatiot jotka muuttavat ilmaus

CHI3L1

voivat vaikuttaa joitakin keskeisiä prosesseja, jotka ovat

CHI3L1

-dosage riippuvainen. Yksi on AKT-välitteinen signaalireitin kautta PI3K-riippuvainen fosforylaatio [30]. Tämä AKT polku on liittynyt solujen eloonjäänti [37], [38], ja ne voivat säädellä sytokiinin indusoimaa soluvasteita [39]. Kuitenkin, Zheng et ai. ei pystytty osoittamaan suhdetta

CHI3L1

yhteinen haplotypes ja sepelvaltimotauti tai sen vakavuuden [17].

Mitsuhashi et al. osoittivat, että seerumin YKL-40 taso on paras biomarkkereiden kohdun kohdunkaulan syöpä verrattuna SCC antigeenejä, CA-125, CA19-9, ja C-reaktiivinen proteiini [15]. Esikäsittely YKL-40 tasot olivat merkitsevästi korreloivat FIGO vaiheessa ja uusiutuminen tai pysyviä tautistatuksen, kun taas korrelaatiot imusolmukestatuksesta ja kasvaimen koko oli marginaalinen kohdunkaulan adenokarsinooma. Coxin regressioanalyysi osoitti, että kohonnut YKL-40 tasot liittyvät uusiutunut tai itsepintainen taudin kohdunkaulan adenokarsinooma [15]. YKL-40 on ehdotettu rooli solujen lisääntymisen, erilaistumisen, ja suojaamaan soluja apoptoottisia signaaleja, ja laki solunulkoiseen kudosten uudismuodostusta [30], [40]. Raportoitu kiihotusaineena angiogeneesin kasvaimissa, YKL-40 on oletettuja olla mukana syövän etäpesäkkeiden [41], [42]. Esillä oleva tutkimus oletetaan, että

CHI3L1

SNP tai haplotypes vaikuttaa ilmaus YKL-40. Analysoidaan välisiä suhteita

CHI3L1

SNP tai haplotypes, ennusteeseen viittaavia muuttujia, syövän uusiutumiseen ja potilaiden eloonjäämisen, emme voineet osoittaa mitään merkittävää yhdistyksen välillä

CHI3L1

SNP ja nämä ominaisuudet.