PLoS ONE: assosiaatioiden XPD Asp312Asn polymorfismi ja vaara Pään ja kaulan alueen syöpä: Meta-analyysi perustuu 7122 aiheet
tiivistelmä
Background
tutkimiseksi yhdistyksen välillä
XPD
Asp312Asn polymorfismi ja pään ja kaulan alueen syöpä riskiä läpi tämän meta-analyysissä.
Methods
suorittaa meta-analyysi 9 julkaistu tapausverrokkitutkimukset lukien 2670 potilaalla on pään ja kaulan syövän ja 4452 tarkastuksia. Kertoimet suhde (OR), jossa on 95%: n luottamusväli (CI) levitettiin arvioimaan yhdistyksen välillä
XPD
Asp312Asn polymorfismi ja pään ja kaulan alueen syövän riskiä.
Tulokset
Kaiken mitään merkittävää yhdistyksen välillä
XPD
Asp312Asn polymorfismi ja pään ja kaulan alueen syövän riskiä todettiin tässä meta-analyysi (Asn /Asn vs. Asp /Asp: OR = 0,95, 95% CI = 0,80-1,13
P
= 0,550,
P
heterogeenisyys = 0,126; Asp /Asn vs. Asp /Asp: OR = 1,11, 95% CI = 0,99-1,24,
P
= 0,065,
P
heterogeenisyys = 0,663; Asn /Asn + Asp /Asn vs. Asp /Asp: OR = 1,07, 95% CI = 0,97-1,19,
P
= 0,189,
P
heterogeenisyys = 0,627; Asn /Asn vs. Asp /Asp + Asp /Asn: OR = 0,87, 95% CI = 0,68-1,10,
P
= 0,243,
P
heterogeenisyys = 0,089). Vuonna alaryhmäanalyysi HWE, etnisyys, ja tutkimuksen suunnittelu, ei ollut vielä merkittävää yhteyttä havaittiin kaikissa geneettinen malleissa.
Johtopäätökset
Tämä meta-analyysi osoittaa, että
XPD
Asp312Asn polymorfismi voi olla riskitekijä kehittää pään ja kaulan alueen syöpä.
Citation: Hu YY, Yuan H, Jiang GB, Chen N, Wen L, Leng WD, et al. (2012) assosiaatioiden
XPD
Asp312Asn polymorfismi ja vaara Pään ja kaulan alueen syöpä: meta-analyysi Perustuu 7122 aiheet. PLoS ONE 7 (4): e35220. doi: 10,1371 /journal.pone.0035220
Editor: Brock C. Christensen, Dartmouth College, Yhdysvallat
vastaanotettu: 26 lokakuu 2011; Hyväksytty: 12 maaliskuu 2012; Julkaistu: 20 huhtikuu 2012
Copyright: © 2012 Hu et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.
Rahoitus: Tämä työ osittain tuettu avustuksin Medical Development Foundation of Health Department of Jiangsun maakunnassa (H200811) ja Natural Science Foundation of Jiangsu korkeakouluista (08KJB320008). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.
Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.
Johdanto
Pään ja kaulan syöpien (HNC) muodostavat noin 5% kaikista syövistä Yhdysvalloissa kirjattua, ja esiintyvyys on lisääntymässä useimmissa kehittyneissä maissa ja kehitysmaissa. Nämä syövät on arvioitu olevan noin kuusi kertaa yleisempää tupakoivilla kuin tupakoimattomilla ja ovat yleisimpiä miehillä yli 50 vuotta vanha [1], [2], mikä lisää noin 15 kertaa, jos tupakoitsijat ovat myös raskaita juovat [ ,,,0],3], [4]. Vaikka monia toimenpiteitä oli tehty parantamaan diagnoosin ja hoitoja, ennuste oli edelleen huono.
Monet ympäristötekijät, kuten säteily, ruokavalio, tupakointi, ja sisäiset tai ulkoiset estrogeenit, liittyy DNA-vaurioita. Korjaamatta tai misrepaired DNA tuloksia geenimutaatioita, kromosomaalisia muutoksia, ja perimän epävakaisuuden. Useat tutkimukset ovat osoittaneet, että geenien DNA: n korjaukseen on keskeinen tehtävä suojella mutaatioita. Potilaat, joilla on tiettyjä syöpiä ovat vähentäneet kapasiteettia DNA: n korjaukseen. Samoin entsyymien nukleotidi leikkaaminen korjaus (NER) reitti on liitetty syöpään. Yhdistykset välillä polymorfismien useista DNA korjaavien geenien ja riskeistä useiden syöpätyyppien on laajalti tutkittu. Useat epidemiologiset syöpä tutkimukset ovat keskittyneet yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) in geenien NER reitin kuten
XPD
,
ERCC1
, ja
XPC
[5]. XPD proteiini on DNA-helikaasi ja se on olennainen osa TFIIH transkriptiotekijän monimutkainen. Jotkut tutkimukset ovat osoittaneet, että
XPD
polymorfismien voi liittyä alentunut DNA korjaukseen vuoksi mahdolliseen vähentämiseen helikaasiaktiivisuutta [6], [7]. Yksi yhteinen
XPD
polymorfismit koodaavien alueiden on Asp312Asn eksonissa 10. toiminnallinen merkitys ei ole vielä täysin selvä, vaikka aminohappo mutaatiot eksonin 10 synnyttää menetys happaman tähteen ja täydellinen muutos sähköisen konfiguraation aminohappo [8], [9].
ensimmäinen tutkimus välistä suhdetta HNC ja
XPD
Asp312Asn polymorfismin tehtiin Sturgis et al. [10]. He löysivät rajatapaus merkitsevästi yhteydessä
XPD
Asp312Asn polymorfismin ja HNC. Sittemmin paljon tutkimukset ovat vahvistaneet tai kumota tämän toteamuksen [11] – [18]. Vuonna 2010 Tuoreen meta-analyysi tehtiin Flores-Obando et al. [19] osoitti, että lisääntynyt HNC riski liittyy
XPD
Asp312Asn polymorfismi. Huomionarvoista, että meta-analyysiin sisältyi viisi tutkimusta tehtiin valkoihoinen väestö ja yksi Aasian väestöstä [10] – [15]. Nykyään yhdeksän tapausverrokkitutkimukset on
XPD
Asp312Asn polymorfismia HNC riski on julkaistu. Kattava meta-analyysi on tarpeen antaa päivitetyn lähestymistapa yleisestä suhteesta. Alaryhmäanalyyseissa suoritettiin myös Kaukasian ja aasialaisilla tutkia etnisyyden-konkreettisia vaikutuksia.
Methods
Haku strategia
PubMed tietokannasta etsittiin termejä ”pään ja kaulan alueen syöpä ”,” suun syöpä ”,” suun ja nielun syöpä ”,” kurkunpään syöpä ”,” nielun syöpä ”,” XPD ”,” Leikkauskorjauksessa rajat täydentää ryhmä 2 ”,” polymorfismi ”, ja yhdistettyjä lausekkeita kaikkien geneettiset tutkimukset suhde
XPD
polymorfismia HNC riskejä vuodesta 2000, jolloin ensimmäinen tutkimus yhdistyksen välillä
XPD
Asp312Asn polymorfismia HNC riski oli raportoitu, lokakuuhun 2011. myös käyttänyt ”liittyviä artikkeleita ”vaihtoehto PubMed tunnistaa lisätutkimuksia samasta aiheesta. viiteluetteloiden haettuja artikkeleita myös seulottiin. Kaikki valitut tutkimukset täyttää seuraavat kolme kriteeriä: (a) tapauskontrollitutkimuksessa on
XPD
Asp312Asn polymorfismi ja HNC riski, (b) riittävät julkaistut tiedot arvioimiseksi kerroinsuhde (OR), jossa 95%: n luottamusväli (CI); (C) useita julkaisuja raportointia samoihin tietoihin tai päällekkäisiä tietoja, suurin tai viimeisin julkaisu valittiin [20].
Data louhinta
Kaksi tutkijat (Hu ja Yuan) itsenäisesti uutettu seuraavat tiedot kustakin mukana julkaisu: ensimmäisen tekijän nimi, julkaisu tiedot, lähteet hallintalaitteiden, rotuun laskeutuminen tutkimuspopulaatiosta (luokitellaan joko Aasian tai valkoihoinen), genotyypitysmenetelmää, useissa tapauksissa tapausten ja kontrollien eri genotyypit, ja Hardy-Weinberg tasapaino (HWE).
tilastollinen
Raakaöljy syrjäisimpien 95% CI laskettiin arvioida vahvuus korrelaatio
XPD
Asp312Asn polymorfismia ja HNC riski. Yhdistetty syrjäisimmillä alueilla tehtiin codominant malli (Asn /Asn vs. Asp /Asp, Asp /Asn vs. Asp /Asp), hallitseva malli (Asn /Asn + Asp /Asn vs. Asp /Asp), ja resessiivinen malli (Asn /Asn vs. Asp /Asp + Asp /Asn), tässä järjestyksessä. Vuonna Alaryhmäanalyysissä, tilastollinen analyysi tehtiin aasialaiset ja valkoihoiset. Heterogeenisuus olettamus arvioitiin chi-neliö perustuva Q-testi [21]. Yhdistetty OR arviointi Kunkin tutkimuksen laskettiin kiinteiden vaikutusten malli (Mantel-Haenszel menetelmä), kun
P
0,10. Muutoin random-vaikutusten malli (jäljempänä Dersimonian ja Laird menetelmää) käytettiin [22]. Mahdollista julkaisu bias arvioitiin muutetulla Egger n lineaarisen regression testi, joka ehdottamat Harbord et al. [23]. Tilastollinen analyysi suoritettiin käyttäen STATA versio 11.0 (Stata Corporation, College Station, TX, USA) ja Review hallinta (V.4.2, Oxford, Englanti), käyttäen kaksipuolista P-arvot, jossa
P
0,05 pidettiin tilastollisesti merkitsevä.
tulokset
tutkimus ominainen
Tämä meta-analyysi ohjaavat PRISMA lausuman (tarkistuslista S1). Kaikkiaan 49 asiaankuuluvien tutkimusten tunnistettiin (kuvio 1). Sen jälkeen huolellisesti tarkistaa, yhdeksän oikeutettuja tapausverrokkitutkimukset suhdetta
XPD
Asp312Asn polymorfismi ja HNC riski kuuluivat tähän meta-analyysi [10] – [18]. Taulukossa 1 esitetään tärkeimmät ominaisuudet Näiden tutkimusten. Seitsemän tutkimuksissa mukana valkoihoinen väestö [10] – [12], [14] – [16], [18], kun taas kaksi tutkimusta mukana aasialaiset [13], [17]. Monipuolinen genotyypitysmenetelmiä käytettiin, kuten PCR-SSCP, PCR-RFLP, Taqman, reaaliaikainen PCR ja SEB PCR. Kaikki tutkimukset osoittivat, että genotyypin jakauma valvonnan vastasi HWE yhtä lukuun ottamatta [17].
Meta-analyysi
tärkeimmät tulokset meta-analyysi ja heterogeenisyys testi on esitetty taulukossa 2. Kaiken kaikkiaan mitään merkittävää suhde havaittiin
XPD
Asp312Asn polymorfismia HNC riski koko väestön (Asn /Asn vs. Asp /Asp: OR = 0,95, 95% CI = 0,80-1,13,
P
= 0,550,
P
heterogeenisyys = 0,126; Asp /Asn vs. Asp /Asp: OR = 1,11, 95% CI = 0,99-1,24
P
= 0,065,
P
heterogeenisyys = 0,663; Asn /Asn + Asp /Asn vs. Asp /Asp: OR = 1,07, 95% CI = 0,97-1,19,
P
= 0,189,
P
heterogeenisyys = 0,627; Asn /Asn vs. Asp /Asp + Asp /Asn: OR = 0,87, 95% CI = ,68-+1,10,
P
= 0,243,
P
heterogeenisyys = 0,089). Samoin sitä seuraavana analyysiin HWE tutkimuksissa ei ollut yhteyttä välillä havaittiin
XPD
Asp312Asn polymorfismia HNC riski (Asn /Asn vs. Asp /Asp: OR = 0,95, 95% CI = 0,80-1,14
P
= 0,593,
P
heterogeenisyys = 0,120; Asp /Asn vs. Asp /Asp: OR = 1,11, 95% CI = 0,99-1,24,
P
= 0,089,
P
heterogeenisyys = 0,586; Asn /Asn + Asp /Asn vs. Asp /Asp: OR = 1,07, 95% CI = 0,96-1,19,
P
= 0,219,
P
heterogeenisyys = 0,528; Asn /Asn vs. Asp /Asp + Asp /Asn: OR = 0,82, 95% CI = 0,69-1,11,
P
= 0,278,
P
heterogeenisyys = 0,082). Lopuksi kerrostunut analyysi alkuperään ja tutkimuksen suunnittelu, myös ei löytänyt mitään merkittävää yhdistyksen välillä
XPD
Asp312Asn polymorfismin ja HNC.
Herkkyystarkastelu
yksittäinen tutkimus mukana meta-analyysissä poistettiin joka kerta heijastamaan yksittäisten aineisto Yhdistettyyn syrjäisimmille alueille. Analyysin tulokset osoittavat rajatapaus lisääntynyt riski jälkeen ilman tutkimuksia, Asp /Asn vs. Asp /Asp malli [14], [16], [18] (kuva 2). Toinen vastaavien yhdistettyjen syrjäisimpien ei olennaisesti muuttunut (tuloksia ei ole esitetty), mikä osoittaa, että tuloksemme ovat tilastollisesti varmana.
Julkaisu bias
suppilo juoni ja muutettu Egger testi tehtiin arvioimiseksi julkaisemisen bias kirjallisuutta. Muodot suppilo tonteista kaikki geneettiset malleissa ei ilmennyt näyttöä ilmeinen epäsymmetria. Kuvassa 3 muodot suppilon kuvaajia codominant malli (Asp /Asn vs. Asp /Asp), joita käytetään tutkimuksissa tutkia kaikki populaatiot. Tuloksena tuki lisäksi analyysin kautta muutettu Egger testeissä. Mitään merkittävää julkaisu bias todettiin tässä meta-analyysissä (
P
= 0,093 Asn /Asn vs. Asp /Asp;
P
= 0,370 Asp /Asn vs. Asp /Asp;
P
= 0,173 Asn /Asn + Asp /Asn vs. Asp /Asp;
P
= 0,215 Asn /Asn vs. Asp /Asp + Asp /Asn).
Jokainen piste edustaa erillistä tutkimusta osoitetun -alueella.
keskustelu
Nykyään geneettinen alttius syöpään on herättänyt kasvavaa huomiota tutkimuksen geenipolymorfismien kasvaimien syntyyn liittyvien.
XPD
geeni on kartoitettu kromosomiin 19q13.3 ja se koostuu 23 eksonista. Ituradan mutaatioita
XPD
geeni voi aiheuttaa xeroderma pigmentosum ja muita sairauksia. XPD proteiini on mukana transkriptio-kytketty NER, ja on olennainen jäsen pohjapinta transkriptiotekijän BTF2 /TFIIH monimutkainen.
Asp Asn muutos asemassa 312 XPD muuttaa sähköinen konfiguraatio aminohapon ja muuttuu vuorovaikutus XPD proteiinin ja sen helikaasia aktivaattori [6]. Wolfe et al. osoittivat, että 312 kodoni polymorfismien merkittävästi vähennä konstitutiivisen ERCC2 mRNA-tasoja, erityisesti tupakoitsijoilla [24]. Hou et ai. raportoitu, että
XPD
312 varianttia alleeli voi liittyä alennettua korjausta aromaattisia DNA additiotuotteiden [25]. Matullo et ai. ehdotti, että altistuminen ympäristön syöpää kuten polysyklisiä aromaattisia hiilivetyjä (PAH), myös nopeuttaa syövän kehitystä kodonin 312 variantti alleelin
XPD
[26].
väliset korrelaatiot polymorfismien ja jotkut syöpäriski on tutkittu, mutta tulokset ovat edelleen kiistanalaisia.
XPD
Asp312Asn polymorfismin on todettu lisäävän riskiä virtsarakon syövän ja keuhkosyövän, mutta se ei ole liitetty rintasyövän [27] – [29].
Ensimmäisessä tutkimuksessa, julkaistiin vuonna 2002, paljasti rajatapaus korrelaatio
XPD
Asp312Asn polymorfismia HNC riski codominant malli (Asn /Asn vs. Asp /Asp: OR, 1,41; 95% CI: 1,01-1,97) [10] . Tähän mennessä ei ole päästy yksimielisyyteen siitä korrelaatio
XPD
Asp312Asn polymorfismi ja HNC riski. Majumder et ai. [13] todettiin, että muunnos genotyyppi (Asn /Asn) kodonissa 312 on
XPD
liittyy lisääntynyt syöpäriski keskuudessa nopeasti ja väli- asetyloijille (OR = 1,9, 95% CI = 1,2-2,9). Kuitenkin muut tutkimukset osoittivat, että HNC riski ei merkittävästi liittyvä
XPD
Asp312Asn polymorfismi. Ji et ai. [17] havaitsivat, että OR ja Asp312Asn polymorfismin genotyyppi Asp /Asn on 1,94 (95% CI = 0,92-4,08) suhteessa Asp /Asp-genotyyppi. Matullo et ai. [11], An et al. [12], Harth et ai. [14], Abbasi et ai. [15], ja Jelonek et al. [16] Lisäksi on raportoitu samanlaisia riskejä HNC.
Tämä meta-analyysi yhdeksän tukikelpoisten tutkimuksista, mukaan lukien 2670 tapaukset ja 4452 valvonta keskittyi XPD Asp312Asn polymorfismia HNC riski, suoritettiin johtamiseksi tarkemman arvion yhdistys, mutta ei merkittävää yhdistys löytyi koko väestöstä, kun kaikki tutkimukset yhdistettiin. Vastaavasti mitään merkittävää yhdistys todettiin kaikissa geneettisten mallien aikana tyytyväinen analyysin perusteella HWE, etnisyyden ja tutkimuksen suunnittelu. Meidän toteamus ei ole mukaisesti aikaisemmin julkaisemat Flores-Obando ym [19]. Marginaalisesti merkittävää yhteyttä ei havaittu
XPD
Asp312Asn heterotsygoottinen ja yhdistetyt variantit ja HNC tutkimuksessaan. Paljon suuremmat otoskoko Tutkimuksemme voi selittää tämän eron suhteessa edelliseen tutkimukseen.
Huolimatta huomattavista ponnisteluista testata Mahdollinen yhteys
XPD
Asp312Asn polymorfismia HNC riski, joitakin rajoituksia olisi käsiteltävä. Ensinnäkin, nämä tulokset perustuvat oikaisematon arvioihin että puuttuu alkuperäiset tiedot voivat tutkimuksista, mikä rajoittaa vaikutusten arviointiin geenin-geeni ja geeni-ympäristön vuorovaikutukset aikana HNC kehitystä. Toiseksi, otoskoko on vielä suhteellisen pieni. Näin ollen meidän ei ole tarpeeksi tilastotietoja löytää todellisen suhde
XPD
Asp312Asn polymorfismi ja HNC riski. Lopuksi, kunkin geenin tiedetään olevan kohtalaisesti vaikutus HNC kehitykseen. Yhdistelmät tietyn genotyypin voivat olla erotteleva riskitekijöinä kuin yhden lokuksen genotyyppiä. Meidän meta-analyysi, kytkentäepätasapaino- (LD) ja haplotyyppianalyysissä ei ole tehty. Huolimatta näistä rajoituksista, ei julkaistu bias havaittu, ja suuri joukko aiheita edelleen merkittävästi taata tilastollinen voima analyysi.
Näin ollen, vaikka nämä rajoitukset, meidän meta-analyysin mukaan
XPD
Asp312Asn polymorfismia ei saa liittyä HNC kehitykseen. Tulevaisuudessa laajamittainen tapaus-verrokki ja väestöpohjaiset yhdistys tutkimukset ovat tarpeen vahvistaa havaittujen riskien olevassa meta-analyysi ja tutkia mahdollisuuksia geeni-geeni ja geeni-ympäristö vuorovaikutukset
XPD
Asp312Asn polymorfismi ja HNC syöpä.
tukeminen Information
tarkistuslista S1.
PRISMA 2009 tarkistuslista.
doi: 10,1371 /journal.pone.0035220.s001
(DOC) B
Kiitokset
Kiitämme kaikkia, jotka auttoivat tässä tutkimuksessa.