PLoS ONE: metylointi HOXA9 ja ISL1 ennustaa potilaiden hoitotuloksiin High-Grade ei-invasiivisia virtsarakon syövän
tiivistelmä
Johdanto
Sopimaton DNA: n metylaatio liittyy usein ihmisen kasvainten kehittymiseen, ja erityistapauksissa liittyy kliinisiä tuloksia. Aiemmat raportit DNA: n metylaation matalan /keskitason asteen ei-lihas- invasiivisia virtsarakon syöpä (NMIBC) ovat esittäneet, että tiettyjä malleja DNA metylaatio saattaa olla rooli diagnostisia tai prognostisia biomarkkereita. Ottaen huomioon aggressiivinen ja kliinisesti ennakoimattomuus korkealaatuisesta (HG) NMIBC, ja nykyinen pula parempana hoitovaihtoehto (Bacillus: Calmette-Guerin), uusi metylaatio analyysit voidaan samalla paljastaa biomarkkereita taudin tuloksen, joka saattaisi-kerrostuvat potilaiden ja ohjata kliinisen hoidon alkudiagnoosin.
Methods
promoottori liittyvät CpG-saarekkeen metylaation määritettiin primaarikasvaimen kudoksessa 36 Alkajaisesitelmän korkealaatuista NMIBCs, 12 matala /väli-grade NMIBCs ja 3 normaali virtsarakon valvontaa. Geenit
HOXA9
,
ISL1
,
NKX6-2
,
SPAG6
,
ZIC1
ja
ZNF154
valittiin tutkimuksen perusteella aiempien raporttien ja /tai prognostista apuohjelman matalan /keskitason luokan NMIBC. Metylointi määritettiin pyrosekvensointi natrium-bisulfiitin muunnettu DNA, ja sitten korreloi geenien ilmentyminen käyttäen RT-qPCR. Metylointi oli lisäksi korreloivat kasvaimen käyttäytymisen, mukaan lukien kasvaimen uusiutumisen ja etenemiseen lihasten invasiivisia virtsarakon syöpä tai etäpesäkkeitä.
Tulokset
ISL1
geenien promoottori liittyvä saari oli usein metyloitavaa toistuva ja etenevä korkea-asteen kasvaimet kuin niiden ei-toistuvat kollegansa (60,0%
vs
. 18,2%,
p
= 0,008).
ISL1
ja
HOXA9
verrokkeja korkeammat keskimääräiset metylaatio toistuvia ja progressiivinen kasvainten verrattuna ei-toistuvien kasvainten (43,3%
vs
. 20,9%,
p
= 0,016 ja 34,5%
vs
17,6%,
p
= 0,017, tässä järjestyksessä). Samanaikainen
ISL1 /HOXA9
metylaation HG-NMIBC luotettavasti ennustaa kasvaimen uusiutumisesta ja kehityksestä vuoden kuluessa (positiivinen ennustearvo 91,7%), ja siihen liittyi taudin aiheuttaman kuolleisuuden (DSM).
johtopäätökset
tässä tutkimuksessa raportoida metylaatio eroista ja yhtäläisyyksistä kliinisen alatyyppiä korkealaatuisesta NMIBC. Raportoimme kyvystä metylaation biomarkkereiden, alkudiagnoosin, ennustaa kasvaimen uusiutumisesta ja kehityksestä vuoden kuluessa diagnoosin. Olemme havainneet, että erityinen biomarkkereita luotettavasti ennustaa taudin tulos ja siksi voi opastaa potilasta hoitoon huolimatta arvaamaton kliininen kurssi ja heterogeenisyys korkealaatuisesta NMIBC. Lisätutkimuksia tarvitaan, kuten validointi suuremmassa potilaan kohortin vahvistaa kliininen hyöty metylaation biomarkkereita korkealaatuista NMIBC.
Citation: Kitchen MO, Bryan RT, Haworth KE, Emes RD, Luscombe C, Gommersall L, et ai. (2015) metylointi
HOXA9
ja
ISL1
ennustaa potilaiden hoitotuloksiin High-Grade ei-invasiivisia virtsarakon syövän. PLoS ONE 10 (9): e0137003. doi: 10,1371 /journal.pone.0137003
Editor: Bing-Hua Jiang, Thomas Jefferson University, Yhdysvallat