Krooninen sairaus

tiivistelmä

MikroRNA (miRNA) on raportoitu olevan keskeisessä asemassa oncogenesis . Geneettinen vaihtelut miRNA käsittely geenien ja miRNA sitoutumiskohdat voivat vaikuttaa biogeneesille miRNA ja miRNA-mRNA vuorovaikutuksia, joten edistää kasvaimen kehittymisen. Esillä olevassa tutkimuksessa olemme arveltu, että potentiaalisesti toiminnallinen polymorfismeilla miRNA käsittely geenit voivat osaltaan pään ja kaulan syöpä (HNC) alttius. Tämän hypoteesin testaamiseksi, me genotyyppi kolme SNP at miRNA sitoutumiskohtiin miRNA käsittely geenien (rs1057035 in 3’UTR

Dicer

, rs3803012 vuonna 3’UTR

RAN

ja rs10773771 3 ’ UTR

HIWI

), jossa on tapauskontrollitutkimuksessa 397 HNC tapauksissa ja 900 valvontaa sovitettava iän ja sukupuolen kiinaksi. Vaikka yksikään kolmesta SNP oli merkitsevästi yhteydessä kokonaisriski HNC, rs1057035 vuonna 3’UTR

Dicer

liittyi merkittävästi vähentynyt riski suusyövän (TC /CC vs. TT: säätää OR = 0,65, 95% CI = 0,46-0,92). Lisäksi lusiferaasiaktiivisuus määritys osoitti, että rs1057035 versio C-alleeli johti huomattavasti alhaisempi ekspressiotasoja verrattuna T-alleelin, joka voi johtua siitä, että suhteellisen korkea inhibition HSA-miR-574-3p on

Dicer

mRNA . Nämä havainnot osoittivat, että rs1057035 sijaitsee 3’UTR

Dicer

voi lisäävät riskiä suusyövän vaikuttamalla sitoutuminen miRNA osoitteeseen

Dicer

. Laajamittainen ja hyvin suunniteltu tutkimuksia perusteltua vahvistaa havaintomme.

Citation: Ma H, Yuan H, Yuan Z, Yu C, Wang R, Jiang Y, et al. (2012) Genetic Vaihtelut Key MicroRNA Processing Geenit ja vaara Pään ja kaulan alueen syöpä: Case-Control Study in Chinese Population. PLoS ONE 7 (10): e47544. doi: 10,1371 /journal.pone.0047544

Editor: Brock C. Christensen, Geisel School of Medicine Dartmouth, Yhdysvallat

vastaanotettu: toukokuu 23, 2012; Hyväksytty: 12 syyskuu 2012; Julkaistu: 11 lokakuu 2012

Copyright: © Ma et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tuettiin osittain Priority Academic ohjelmasuunnitteluosastoon Jiangsun korkeakouluista (papD) ja Jiangsu Natural Science Foundation (BK2011764). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

pään ja kaulan alueen syöpä (HNC), erityisesti levyepiteelisyövän pään ja kaulan (SCCHN) induktiohoitoon on kuudes yleisin maligniteetti maailmanlaajuisesti, osuus oli arviolta 650 000 uutta syöpätapausta ja 350 000 syöpäkuolemista joka vuosi [1], [2]. HNC sisältää syöpiä, joita esiintyy nenän sivuonteloiden, nenäonteloon, suuonteloon, nielun ja kurkunpään. Tupakan ja alkoholin kulutus on tunnistettu tärkeiksi puolueorganisaatiot of HNC [1], [2]. Lisäksi tutkimukset kertoi myös, että geneettiset tekijät, kuten suvussa ja geneettisiä variantteja useita biologisia reittejä olivat mukana kehittämässä HNC [3]. Kuitenkin tarkka mekanismi kehittää HNC ei ole täysin tutkittu.

MikroRNA (miRNA) ovat luokan ei-koodaus, yksijuosteinen RNA: t ~22 nukleotidien ja toimivat geenin säätävät sitoutumisen kautta 3 ”-untranslated alue (UTR) proteiini-koodaus tekstitystiedostojen puolestaan ​​liipaisu lähetti-RNA hajoamisen tai translaation tukahduttaminen [4], [5]. Tutkimukset ovat osoittaneet, että miRNA ovat mukana erilaisissa biologinen prosessien, myös solusyklin säätelyssä, erilaistumiseen, kehitys, aineenvaihduntaa ja ikääntyminen. Lisäksi miRNA on myös liitetty etiologiaa, etenemistä ja ennuste syövän, ja miRNA ekspressioprofiileja voidaan yksikäsitteisesti tunnistaa syöpätyyppeihin [6], [7]. Biogeneesille miRNA on monimutkainen prosessi, jossa useita proteiineja ja RNA: t [8]. Ensinnäkin, suuri ensisijainen esiasteita miRNA (pri-miRNA) transkriptoidaan pääasiassa RNA-polymeraasi II ja lohkaistaan ​​miRNA esiaste (pre-miRNA), jonka ydin- mikroprosessori kompleksi, joka sisältää DROSHA Rnaasipusku- ja kaksois-RNA sitovan proteiinin DGCR8 [9] . Sitten, pre-miRNA kulkeutua sytoplasmaan kautta avustuksella Ran-GTPaasi ja Exportin-5 (XPO5), jossa se käsitellään edelleen proteiinia monimutkainen lukien Dicer, mikä johtaa tuotannon kaksijuosteisen miRNA duplex. [ ,,,0],10]. Tämän jälkeen yksi osa miRNA sisällytetään RNA aiheuttama hiljentäminen kompleksi (RISC) sisältäen HIWI, GEMIN3 ja GEMIN4, joka välittää ekspressiota kohdegeenien. Kasvava näyttöä siitä, että keskeiset komponentit biosynteesireittiin miRNA tärkeä rooli kehitettäessä tai ennusteeseen ihmisen syövissä kuten HNC [11], [12], [13].

Äskettäin on raportoitu että läsnäolo yhden nukleotidin polymorfismien (SNP) in microRNA geenejä, niiden koneet ja kohde sitoutumiskohtien vaikuttaa alttiuteen syöpiä moduloimalla ekspressiotasot miRNA ja miRNA-mRNA vuorovaikutusta [14]. Niistä jotkut tutkimukset ovat keskittyneet vaikutusta SNP miRNA-sitoutumiskohtia (miRNA-sitova SNP) on miRNA käsittely geenien ja syöpäriskiä. Esimerkiksi yhdessä tutkimuksessa 130 suun syöpää edeltävät leesiot (OPLs) tapaukset ja 136 valvonta totesi, että variantti alleelin rs3742330 vuonna 3’UTR

Dicer

huomattavasti riskiä OPLs amerikkalaiset [15]. Kaksi muuta tutkimuksesta osoitti, että rs11077 vuonna 3’UTR

XPO5

ja rs14035 in 3’UTR

RAN

liittyi riski ruokatorven syöpään [16] tai munuaissyövän [17]. Tähän mennessä ei ole raportti välisestä suhteesta geneettisen vaihtelun miRNA biogeneesissä geenien ja HNC riski. Tässä tutkimuksessa olemme arveltu, että potentiaalisesti toiminnallinen SNP 3’UTR miRNA biogeneesiä geenien saattaa muuttaa HNC riski Kiinan väestön. Tämän hypoteesin testaamiseksi, teimme Genotyyppausanalyysiin kolmen SNP (rs1057035 in

Dicer

, rs3803012 vuonna

RAN

ja rs10773771 in

HIWI

), jossa on tapauskontrollitutkimuksessa 397 HNC syöpätapauksista ja 900 tervettä verrokkia Han kiinalaisten ja arvioida omia ja yhteisiä vaikutus HNC riskiä. Selventää toiminnallista merkitystä valittujen SNP kanssa HNC syöpä, tutkimme myös lusiferaasiaktiivisuutta

Dicer

rs1057035 (T ja C-alleelien) kloonaamalla ja reportterigeenimäärityksessä, vaikutusten arvioimiseksi SNP on sitova erityisen miRNA että 3’UTR

Dicer

.

Materiaalit ja menetelmät

Ethics lausunto

tutkimus hyväksyi Institutional Review board of Nanjingin Medical University. Suunnittelu ja suorituskyky Nykyisessä tutkimuksessa ihmiseen kohdistuvan selvästi kuvattu tutkimus protokollaa. Kaikki osallistujat olivat vapaaehtoisia ja täydentäisi suostumus kirjallisesti ennen osallistuu tähän tutkimukseen.

Tutkimuskanta

Kaikki uudet ja histologisesti varmennettu HNC potilasta peräkkäin rekrytoitiin Jiangsu Dental Hospital ja ensimmäinen Affiliated sairaala Nanjing Medical University, Nanjing, Kiina, tammikuusta 2009 huhtikuu 2011. Poissulkukriteerejä toinen HNC ensisijainen kasvaimia tai metastasized syövän muihin elimiin. 420 tapausta alunperin kosketti osallistumista ja noin 95% tukikelpoisista tapauksista (397 tapausta) suostui osallistumaan tutkimukseen. Cancer-vapaa valvonta taajuus-sovitettu tapauksiin iän (± 5 vuotta) ja sukupuoli valittiin satunnaisesti kohortin yli 30000 osallistujien lähiyhteisön seulontaohjelman kuin tartuntatautien Jiangsun maakunnassa Kiinassa. Kaikki osallistujat olivat geneettisesti liity, etnisten Han kiinalaisia ​​väestöstä. Kun kirjallinen tietoon perustuva suostumus saatiin, strukturoitu kyselylomake koulutettujen haastattelijat keräämään tietoja väestötietojen ja ympäristön altistumisen historiaa, kuten ikä, sukupuoli, tupakointi ja juominen kulutusta. Sen jälkeen haastattelu, noin 5 ml laskimoverta kerättiin verinäyte kultakin osallistujalta. Lopuksi, yhteensä 397 tapausta ja 900 valvontaa päätökseen haastattelun ja lahjoitti verinäytteen.

SNP valinta ja genotyypityksen

Kahdeksan avain miRNA biogeneesin geenejä (

DROSHA

,

DGCR8

,

XPO5

,

Dicer

,

HIWI

,

GEMIN3

,

GEMIN4

ja

RAN

) on valittu mittavan kirjallisuudesta. Jokaista geeniä, ensin käytetään NCBI dbSNP tietokanta (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/rakentaa 131) ja etsi SNP että paikallistaa 3 ’UTR geenien ja löytyi 17 SNP vähäisin alleelin taajuus (MAF ) 0,05 Kiinan väestöstä. Sitten kaksi web-pohjainen analyysityökalujen käytettiin ennustaa, 17 SNP on miRNA sitova (https://snpinfo.niehs.nih.gov/snpfunc.htm; https://miracle.igib.res.in/dbSMR ) [18], [19] ja vain 4 SNP johdonmukainen havaintojen sekä työkaluja säilyi. Näistä SNP (rs11077, rs1057035, rs10773771, ja rs3803012), rs11077 sulkeminen johtui edelleen hakua mirBase tietokanta (https://www.mirbase.org/search.shtml) osoitti, että tämä SNP ei sijaitse sitova alue mistään miRNA. Tämän seurauksena tunnistimme 3 miRNA-sitovaa SNP kolme geeniä (rs1057035 in

Dicer

, rs3803012 vuonna

RAN

ja rs10773771 in

HIWI

). Niistä, rs1057035 ennustettiin vaikutus on-miR-574-3p sitova, rs3803012 vaikuttaminen on-miR-199-3p sitova ja 10773771 vaikuttamisessa on-miR-1264 sitova.

(*, P 0,05; **, P 0,001).

Genominen DNA eristettiin valkosolut laskimoverta proteinaasi K ruoansulatusta ja uutetaan fenoli /kloroformilla. Genotyypin määritystä SNP suoritettiin käyttäen TaqMan alleeliset syrjintää Pitoisuus ABI 7900 järjestelmä (Applied Biosystems, Foster City, CA). Tehtiin genotyypin tietämättä koehenkilöiden tapaus tai valvonta-asema, ja kaksi negatiivisia kontrolleja kussakin 384-kuoppainen formaatti käytettiin laadunvalvontaan. Genotyyppaustulokset Tulokset määritettiin käyttämällä SDS 2,3 Allelic Discrimination Software (Applied Biosystems). Konkordanssi saavutettiin 100%: sta kopioita 5% näytteistä kullekin SNP.

lusiferaasireporttiterilla sen määrittämiseksi vaikutuksen miRNA sitoo Dicer ilmaisun

3’UTR alueella

Dicer

sisältävät otaksutun tunnistuskohdan rs1057035 monistettiin näyte-DNA, kloonataan sitten pMIR-REPORT

TM (Applied Biosystems) vektori Mlul ja Hind III pilkkomisia. Alukkeet olivat: GTAGACGCGTTCAACAGCAAACTTCAGCC (sense) ja TCCAAAGCTTGGCAGGGTATCAGAATCTTT (antisense). Plasmidit, jotka sisältävät eri alleelien rs1057035 luotiin käyttäen kohdennettua mutageneesiä. Kaikki rakenteet, joita käytetään tässä tutkimuksessa oli restriktiokartoitettiin ja sekvensoitiin vahvistamaan aitouden.

TCA-8113 (ihmisen suun levyepiteelisyöpä solulinja) [20], 293T (ihmisen sikiön munuaisen solulinja) ja Hela (ihmisen kohdunkaulansyövän solulinja)-soluja viljeltiin Dulbeccon modifioidussa Eaglen elatusaineessa, jossa oli paljon glukoosia (Gibco), jota oli täydennetty 10% lämmöllä inaktivoitua naudan sikiön seerumia (Gibco) ja 50 ug /ml streptomysiiniä (Gibco) kanssa 37 ° C: ssa inkubaattorissa täydennetty 5% CO2. Soluja ympättiin 1 x 10

5 solua per kuoppa 24-kuoppaisille levyille (BD Biosciences, Bedford, MA). Kaksikymmentäneljä tuntia sen jälkeen, kun pinnoitus, solut transfektoitiin Lipofectamine 2000 mukaisesti valmistajan ehdotuksen (Invitrogen).

Dicer

3’UTR lusiferaasin plasmideja (eri alleelit) ja kemiallisesti syntetisoituja kypsän HSA-miR-574-3p kotransfektoitiin vastaavasti. PRL-SV40 plasmidiin (Promega) kotransfektoitiin kuin normalisoi ohjaus. Kuusi rinnakkaista kunkin ryhmän ja koe toistetaan vähintään kolme kertaa. 24 tunnin inkubaation jälkeen solut kerättiin ja analysoitiin lusiferaasiaktiivisuus kanssa Dual-Luciferase Reporter Assay System (Promega).

Tilastollinen

Hardy-Weinberg tasapaino testattiin hyvyyttä -of-fit χ

2 testiä verrata havaittu genotyypin taajuudet odotettuihin niistä joukossa verrokkien. Jakaumat valittujen demografiset muuttujat, riskitekijät, ja taajuudet variantin genotyyppien välillä tapausten ja valvonta arvioitiin käyttäen χ

2 testiä. Liitot Variantin genotyyppien kanssa HNC riski arvioitiin laskemalla kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja 95%: n luottamusvälit (CI) sekä yhden ja usean logistinen regressio analyysejä. Heterogeenisuus välinen alaryhmien arvioitiin kanssa Chi-square-pohjainen Q testi ja heterogeenisuus katsottiin merkitseväksi kun

P

0,05. Mahdolliset geeni-geeni ja geeni-ympäristö (eli tupakointi ja juominen tila) vuorovaikutukset arvioitiin logistisen regression malleja. Kaikki tilastolliset analyysit suoritettiin Tilastollinen analyysi System ohjelmisto (v.9.1 SAS Institute, Cary, NC). Kaksipuolinen testejä käytettiin yleensä tilastolliseen analyysiin ja

P

0,05 pidettiin sellaisena tilastollisen merkitsevyyden.

Tulokset

Valitut ominaisuudet tapauksissa ja tarkastukset on esitetty taulukossa 1. ei ollut merkittäviä eroja jakaumat iän, sukupuolen ja tupakointi tapausten välillä ja säätimet (

P

= 0,637, 0,263 ja 0,580, tässä järjestyksessä), ja keskimääräinen ikä oli samanlainen (59,98 ± 11,94 vuotta tapauksia ja 60,65 ± 7,99 vuotta kontrollien). Kuten odotettua, enemmän juovat havaittiin tapauksessa ryhmässä verrattuna kontrolliryhmässä (45,1% vs. 32,2%,

P

0,001). Niistä 397 tapauksessa 293 (73,8%) olivat kasvaimen suuontelon, 6 (1,5%) ja nielu, 86 (22,2%) ja kurkunpään ja 10 (2,5%) ja muut. Lisäksi 335 tapausta (84,4%) esittelyyn levyepiteelisyöpä.

SNP olivat Hardy-Weinberg tasapaino (

P

= 0,14 rs1057035 ja

P

= 0,73 rs3803012, vastaavasti) paitsi rs10773771 (

P

= 0,01). Genotyyppi ja alleeli jakaumien

Dicer

rs1057035,

HIWI

rs10773771 ja

RAN

rs3803012 tapauksissa ja valvonta on esitetty taulukossa 2. Yhtenäinen lokus analyysit paljastivat, että genotyyppi jakaumat näiden kolmen polymorfismien eivät olleet merkittävästi erilaiset välillä yleistä tapausten ja kontrollien (

P

= 0,080 varten rs1057035,

P

= 0,397 varten rs3803012 ja

P

= 0,539 varten rs10773771, vastaavasti). Jotta voitaisiin edelleen tutkia muokkaamalla vaikutuksia kolmen muunnelmia riski HNC eri tuumorikohdat teimme kerrostuneisuus analyysin suuontelon ja ei-suuontelon syöpiä. Kuten taulukosta 2, rs1057035 variantti genotyypit liittyi merkitsevästi alentuneeseen suusyövästä (TC vs. TT: säätää OR = 0,65, 95% CI = +0,46-,93 oikaistuna

P

= 0,019; TC /CC vs. TT: säätää OR = 0,65, 95% CI = +0,46-+0,92 oikaistuna

P

= 0,016; lisäaine malli: säätää OR = 0,67, 95% CI = 0,48-0,93; säädettiin

P

= 0,018). Mitään merkitseviä välillä havaittiin genotyyppien kahden muun SNP (rs3803012 A G, rs10773771 G A) ja riski HNC eri sivustoja (taulukko 2).

suoritettiin edelleen kerrostuneisuus analyysi assosiaatiot rs1057035 ja suun syöpäriski iän, sukupuolen, tupakoinnin, alkoholin ja histologia. Kuten on esitetty kuviossa 1, riski vähenee suun liittyvän syövän variantti TC /CC genotyyppien oli merkittävä nuoremmat (säädetty OR = 0,61; 95% CI = 0,38-0,97), naisten (säädetty OR = 0,53; 95% CI = ,30-0,95), tupakoimattomien (oikaistu OR = 0,50; 95% CI = 0,30-0,83) ja ei-juovat (oikaistu OR = 0,54; 95% CI = 0,33-,89), verrattuna TT genotyyppi. Kuitenkin heterogeenisyys testi osoitti, että ei ollut olemassa merkittävää heterogeenisyyttä (

P

0,05) joka toinen stratums. Olemme myös arvioitiin vaikutuksen lisäämällä alkoholia, tupakointi ja sukupuoli on syrjäisimpien alueiden ja totesi, että nämä eivät eronneet toisistaan, jos nämä muuttujat sisällytettiin malleja tai ei sisälly (taulukko S1). Lisäksi mitään merkittävää tulosta havaittiin geeni-geeni tai geeni-ympäristössä (eli tupakoinnista ja alkoholin tila) yhteisvaikutuksia (tuloksia ei ole esitetty).

Koska rs1057035 osoitti merkittäviä yhdessä suun kautta syöpäriski ja ennustettiin paikantaa on oletetun miRNA sitoutumiskohta (HSA-miR-574-3p), on mielenkiintoista testata rs1057035 vaikuttaa kohdentamista HSA-miR-574-3p on

Dicer

mRNA in vitro. Niinpä syntyy toimittaja geenit

Dicer

3’UTR (C tai T-alleelin) että kotransfektoitiin kemiallisesti syntetisoituja kypsän HSA-miR-574-3p in Tca8113 suun levyepiteelisyöpä solulinjat. Kuten kuviossa 2 on esitetty, transfektoimalla HSA-miR-574-3p inhiboi merkittävästi ekspressiota reportteri kuljettaa rs1057035 C-alleeli, mutta ei T-alleelin (293T-solulinja: 0,057 ± 0,002 C-alleelin versus 0,333 ± 0,089 ja T-alleelin

P

= 0,032; Hela solulinjaa: 0,041 ± 0,007 C-alleelin versus 0,357 ± 0,257 varten T-alleelin,

P

= 0,030; Tca8113 solulinjaa: 0,072 ± 0,067 C-alleelin versus 0,833 ± 0,120 T-alleelin,

P

0,001). Tulokset viittasivat siihen, että rs1057035 variantti alleeli voi differentiaalisesti vaikuttaa kohdentamista HSA-miR-574-3p jotta 3’UTR

Dicer

suun syöpäsoluja.

Keskustelu

tässä tapauskontrollitutkimuksessa 397 HNC potilaiden ja 900 syöpää vapaa valvontaa kiinalainen väestö, tutkimme yhdistysten kolmesta SNP 3’UTR miRNA biosynteesigeeniklusterin ja riski HNC. Vaikka emme löytäneet näyttöä pääasiallinen vaikutus kunkin SNP yleiseen HNC riski, alaryhmä analyysi HNC osoitti, että variantti genotyypin rs1057035 liittyi riski HNC ilmenevien suuontelon. Muita toiminnallisia analyysit osoittivat, että rs1057035 C-alleeli johti huomattavasti alhaisempi lusiferaasiaktiivisuuden, verrattuna T-alleelin. Nämä havainnot ehdottivat, ensimmäistä kertaa, että potentiaalisesti toiminnallinen polymorfismia

Dicer

voi olla rooli kehitettäessä HNC, erityisesti niiden kasvainten ilmenevien suuontelon.

Dicer on entsyymi vastuussa lohkaisu miRNA esiasteiden ja on aikaisemmin liitetty kasvaimia synnyttävän prosessin useiden syöpien [21], [22], [23]. Todisteet osoittavat, että

Dicer

voi olla erilaisia ​​rooleja kasvainten synnyssä eri syöpiä. Esimerkiksi jotkut tutkimukset osoittivat, että alhaisemmat tasot

Dicer

mRNA ilmaisu liittyivät kehittämiseen keuhkosyövän [24] ja ennusteen munasarjasyöpä [11]. Kuitenkin tutkimukset osoittivat myös, että kohonnut ekspressiotasot

Dicer

korreloivat lisääntynyt solujen lisääntymistä suun syöpäsolujen [12]. Tutkimuksessamme havaitsimme, että rs1057035 versio C-alleeli johti huomattavasti alhaisempi ekspressiotasoja

Dicer

ja näytteille suojaava vaikutus suusyövän alttius, jotka olivat sopusoinnussa havaintojen suun syöpäsoluissa [12]. Lisäksi olemme havainneet, että suojaava vaikutus rs1057035 variantin genotyyppien oli tilastollisesti merkittävä joissakin alaryhmissä, kuten naisilla, ei-tupakoivien ja juovat. Kuitenkin heterogeenisyys testi osoitti merkittävää heterogeenisyyttä (

P

0,05) välillä joka toinen stratums, mikä tarkoittaa, että ei ole vaaraa vaikutusta muutokseen, näiden muuttujien tutkittavana.

merkittäviä SNP (rs1057035 ) tunnistettu tutkimuksessamme sijaitsee 3 ’UTR:

Dicer

ja ennustetaan vaikuttavan sitoutumiseen HSA-miR-574-3p. HSA-miR-574-3p on evoluutiossa säilyneitä nukleotiditasolla kärpäset ihmisiin. Vaikka toiminto HSA-miR-574-3p ei ole selvä, on ennustettu, kohdistaa useita satoja ihmisen geenien [25]. Tuloksemme osoittivat, että

Dicer

rs1057035 C-alleeli saattaa vaikuttaa kohdentamista HSA-miR-574-3p ja johtaa vähentynyt ilmentyminen

Dicer

mRNA suun syöpäsoluja, jotka voivat olla mahdollinen oleva mekanismi havaitusta yhteydestä rs1057035 ja alentuneeseen suusyövän. Emme kuitenkaan ole löytäneet yhdistyksen välillä rs1057035 ja yleinen riski HNC syöpä tai ei-suun kautta syöpäriski tutkimuksessamme. Patogeneesin suullisen syöpä voi olla hieman erilainen kuin muut syövät, jotka aiheutuvat pään ja kaulan. Esimerkiksi viime epidemiologiset ja molekyylitason tutkimuksissa on todettu korkean riskin tyyppejä ihmisen papilloomaviruksen (HPV), kun potentiaalia etiologic tekijä HNC, mutta se on yhä näkyvämpi suunieluun syöpään kuin suuontelon syöpä [3], [26 ].

lisäksi meillä on myös havaittu huomattavia assosiaatioita SNP 3’UTR

RAN

ja

HIWI

ja HNC riski. RAN on ainutlaatuinen jäsen Ras superperheen GTPaaseja, mikä on olennaista kuljetus ennalta miRNA välillä tumasta sytoplasmaan kautta tumahuokonen kompleksia GTP-riippuvaisella tavalla [27]. HIWI on osa RNA aiheuttama hiljentäminen Complex (RISC) ja keskeinen säätelijä kantasolun pluripotenttisuuden ohjaamalla solujen itseuudistumiseen ja erilaistuminen [28]. Jotkut tutkimukset ovat tutkineet yhdistysten välillä polymorfismien näiden kahden geenin ja riski useiden syöpien, kuten ruokatorven syöpä, virtsarakon syöpä ja munuaissyöpä, mutta tulokset olivat ristiriitaisia ​​[15], [16], [17], [29] . Tutkimuksessamme ensin todettu, että

RAN

rs3803012 ja

HIWI

rs10773771 variantti genotyypit eivät liittyneet riskiä HNC, mikä viittaa siihen, nämä SNP ehkä ei moduloida alttiutta HNC Kiinan väestöstä.

Useat mahdollisten rajoitusten tämän tutkimuksen optio näkökohdat. Ensinnäkin suhteellisen pieni otoskoko voi rajoittaa tilastollisen tehon Tutkimuksessamme erityisesti jaottelu analyysi kasvain sivustoja. Arvioimme tilastollista voimaa vaikutuksen rs1057035 että PS ohjelmisto (Power and Sample Size Laskelmat versio 1.0.17) ja totesi, että kun on kyse OR = 0,65 (hallitseva malli), meidän näyte saattaa nousta 78,8%: n tilastollisen tehokkuus. Toiseksi, se on sairaala-pohjainen tapauskontrollitutkimuksessa ja luontainen valinta bias ei voida kokonaan sulkea pois. Olemme kuitenkin soveltaa tiukkaa epidemiologinen suunnittelu valinnassa tutkittavien ja käytetään edelleen tilastollinen oikaisu tunnettuja riskitekijöitä minimoida mahdollisia harhat. Kolmanneksi koska voimakkuus ja kesto tupakointi ja juominen olivat poissa tässä tutkimuksessa, oli vaikeaa tehdä tulevaisuuden analyysi altistuminen muuttujia. Viime, me vain valitut miRNA-sitova SNP genotyypin ja voinut arvioida suhdetta muihin mahdollisesti toiminnallisten SNP miRNA käsittely geenien ja HNC riski. Siten suurempia, hyvin suunniteltu epidemiologisten tutkimusten kanssa etnisesti eri väestöryhmien perusteltua vahvistaa ja laajentaa havainnoista.

tukeminen Information

Taulukko S1.

analyysi vaikutuksen muuttujien syrjäisimpien malleissa. HUOM:

uskottavuusosamäärä käytettiin tarkistaa eroa -2 * log todennäköisyys kaksi mallia.

b Verrattuna ensimmäiseen malliin kuten ikä, sukupuoli, tupakointi ja juominen.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0047544.s001

(DOCX) B