Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Xeroderma Pigmento-summa ryhmässä D geeni (

XPD

) on keskeinen rooli nukleotidin Leikkauskorjauksessa. Yhden emäksen monimuotoisuus (SNP), joka sijaitsee sen toiminnallinen alue voi muuttaa DNA korjaus kapasiteetti fenotyyppi ja syöpäriskiä. Useat tutkimukset ovat osoittaneet, että

XPD

polymorfismit liittyvät merkittävästi ruoansulatuskanavan syöpien riskiä, ​​mutta tulokset ovat ristiriitaisia. Me teki laajan meta-analyysin arvioimaan yhdistyksen välillä

XPD

Lys751Gln polymorfismi ja ruoansulatuskanavan syöpien riskiä. Ruoansulatuskanavan syöpiä että tarkoitetun tutkimuksen, sisältää suun, ruokatorven syöpä, mahalaukun ja paksusuolen ja peräsuolen syövän.

Methods

Haimme PubMed ja EMBASE jopa 31 päivään joulukuuta 2012 tunnistaa oikeutettu opinnot. Kaikkiaan 37 tapausverrokkitutkimukset lukien 9027 tapaukset ja 16072 kontrolleja mukana tässä meta-analyysi. Tilastolliset analyysit tehtiin Stata (versio 11.0, USA). Kertoimet suhde (syrjäisimmät alueet), jossa 95%: n luottamusväli (CI) arviointiin käytettiin vahvuus yhdistyksen.

Tulokset

Tulokset osoittivat, että

XPD

Lys751Gln polymorfismi oli liittyy suurentunut ruoansulatuskanavan syöpien (homotsygoottinen vertailu (GlnGln

vs.

LysLys): OR = 1,12, 95% CI = 1,01-1,24,

P

= 0,029,

P

heterogeenisyys = 0,133). Emme löytäneet tilastollista näyttöä merkittävästi lisääntynyt ruuansulatuskanavan syöpien riskiä muiden geneettisten mallien. Vuonna Alaryhmäanalyysissä, huomasimme homotsygootti vertailun lisäsi alttiutta Aasian väestöstä (OR = 1,28, 95% CI = 1,01-1,63,

P

= 0,045,

P

heterogeenisyys = 0,287). Ositettu syöpätyypin ja lähde ohjaus, ei merkittävästi lisääntynyt syöpäriskiä havaittiin näissä alaryhmissä. Lisäksi riskiestimaattien sairaalasta perustuvat tutkimukset ja ruokatorven tutkimukset olivat heterogeenisiä.

Johtopäätökset

meta-analyysi ehdotti, että

XPD

751Gln /Gln genotyyppi oli matala- tunkeutua riskitekijä ruoansulatuskanavan syöpiin, erityisesti aasialaisilla.

Citation: Du H, Guo N, Shi B, Zhang Q, Chen Z, Lu K, et al. (2014) Vaikutus

XPD

polymorfismit on ruoansulatuskanavan syöpien riski: meta-analyysi. PLoS ONE 9 (5): e96301. doi: 10,1371 /journal.pone.0096301

Editor: Robert W. Sobol, University of Pittsburgh, Yhdysvallat

vastaanotettu: 14 marraskuu 2013; Hyväksytty: 06 huhtikuu 2014; Julkaistu: 02 toukokuu 2014

Copyright: © 2014 Du et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus oli osittain tukee Postdoctoral Science Foundation of Jiangsun maakunnassa (528) Health Department ohjauksen hanke Jiangsun maakunnassa (Z201201), Program for Development of Innovative Research Team ensimmäisessä Affiliated sairaala NJMU ja rahoittama Priority Academic ohjelman kehittäminen Jiangsu korkeakouluista (JX10231801), Jiangsun maakunnassa Clinical tieteen ja teknologian hankkeita (Clinical Research Center, BL2012008) ja Summit Six Top Talents ohjelma Jiangsun maakunnassa (2013-WSN-034). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Ruoansulatuskanavan syövät, erityisesti mahalaukun, ruokatorven ja peräsuolen syövät, ovat merkittävä maailmanlaajuinen terveysongelma. Globocan tiedot vuonna 2008 osoittivat [1], että standardoitu peräsuolisyövän ilmaantuvuus, mahasyövän ja ruokatorven syöpä sijaitsivat 4., 6. ja 9. kaikissa kasvaimia, vastaavasti. Vakioitu kuolleisuus mahalaukun syövän tulleen keuhkosyövän jälkeen ja rintasyöpä, sijoittui kolmanneksi. Lisäksi peräsuolen syövän ja ruokatorven syöpä myös sijoittui kärkikymmenikköön syöpäkuolleisuudessa rankingissa. Ilmaantuvuus eri syövän vaihtelee suuresti eri rotua ja etnistä ryhmää, jotka voivat osittain johtua elintapojen ja geneettistä taustaa [2]. Altistuminen ympäristön karsinogeenien voi aiheuttaa erilaisia ​​DNA-vaurion joka myöhemmin johtaa syövän synnyn eri kudoksissa, jos jätetään korjaamatta [3].

DNA korjausmekanismit, kuten nukleotidin Leikkauskorjauksessa (NER), pohja Leikkauskorjauksessa polku (BER) ja kaksinkertainen-lohkon murtuma reitissä ovat olennaisia ​​ylläpitämiseksi genomin eheyttä ja estää syövän syntymistä. NER, monipuolisin, hyvin tutkittu DNA korjautumismekanismi ihmisillä, on pääasiassa vastuussa korjaamisesta vieviä DNA-vaurioita, kuten DNA-addukteja aiheuttamaa UV-säteily, mutageenisia kemikaaleja tai kemoterapeuttiset lääkkeet [4]. Pääkomponentin NER, xeroderma pigmentosum ryhmä D (

XPD

tai

ERCC2

), kartoitettu kromosomiin 19q13.3, ulottuu yli 20 kb, sisältää 23exons ja koodaa 761 aminohapon proteiinia . Se on kaksi tehtävää: nukleotidin poisto korjaus ja pohjapinta transkription osana transkriptiotekijän kompleksin (TFIIH) [5]. Mutaatiot eri sivustoja

XPD

geeni voi aiheuttaa korjata ja transkription vikoja, ja muuttunut DNA korjauskapasiteettia voi tehdä suurempi riski sairastua eri syöpien [5] – [11]. Useat polymorfismia

XPD

tunnistettiin, kuten Asp312Asn, Lys751Gln, Arg194Trp ja Arg399Gln. XPD polymorfinen lokusta, joka on ollut erityisen kiinnostunut molekyyliepidemiologiset tutkimuksissa on Lys751Gln polymorfismi (rs13181) eksonissa 23 [12]. Lysiinistä glutamiini-transition kohdassa 751 eksonissa 23 voi vaikuttaa eri proteiini-vuorovaikutusten, vähentää aktiivisuutta TFIIH komplekseja, ja muuttaa geneettinen alttius syövälle [13].

Genetic muunnos

XPD

Lys751Gln oli osoitettu liittyvän joidenkin syöpien riskin eri meta-analyysissä, kuten ruokatorven syöpä, mahasyöpä, peräsuolen syöpä, rintasyöpä, eturauhassyöpä, keuhkosyöpä ja virtsarakon syövän [14] – [23]. Kuitenkin, koska riittämätön määrä julkaisuja, he eivät laske yhdistetyssä kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmille alueille) ruoansulatuskanavan syöpien kattavasti. Kun otetaan huomioon laaja rooli

XPD

ruuansulatuskanavassa syövät, suoritimme meta-analyysi kaikista 37 voivat tapausverrokkitutkimukset: suun, ruokatorven syöpä, mahasyöpä http: //www.sciencedirect. com /tiede /artikkeli /pii /S0188440911000853 – bib10and peräsuolen syövän, johtamiseksi tarkempi yhdistys

XPD

Lys751Gln polymorfismi ja erilaisia ​​ruoansulatuskanavan syöpien riskiä.

Materiaalit ja menetelmät

tunnistetiedot voivat tutkimusten

käyttäen PubMed tunnistimme kaikki julkaistut tapausverrokkitutkimukset jossa selvitettiin assosiaatiota

XPD

Lys751Gln polymorfismi ja ruoansulatuskanavan syöpien pääomavaatimuksensa käyttäen noutavana kyselyä muotoilua ”(

XPD

tai ERCC2) polymorfismit jA (peräsuolen syövän tai mahasyövän tai ruokatorven syöpä tai suun kautta syöpä)”. ruoansulatuskanavan syöpiä tässä artikkelissa viitataan suusyövän, ruokatorven syöpä, mahalaukun ja paksusuolen ja peräsuolen syöpä. Olemme myös etsitään viittauksia julkaissut artikkeleita ja arvosteluja tästä aiheesta PubMed. Hyväksyttävät tutkimukset oli täytettävä seuraavat kriteerit: (a) vain tapaus-verrokki malleja katsottiin, (b) Tutkimuksessa selvitettiin korrelaatio erityyppisten ruoansulatuskanavan syöpien ja

XPD

Lys751Gln polymorfismi. Tärkeimpiä poissulkukriteereitä olivat (a) ei ohjaus väestöstä, (b) ei ole käytettävissä genotyypin taajuutta. (C) Genotyyppikorrelaatit jakautuminen valvonnan ei ollut samaa mieltä Hardy-Weinberg tasapaino (HWE). (D) Kaksinkertainen edellisen julkaisuista, suurin tai viimeisin julkaisu valittiin.

Data Extraction

Tietoa huolellisesti poimittu kaikki voivat julkaisuista itsenäisesti kahdella kirjoittajat mukaisesti sisällyttämällä luetellut kriteerit edellä. Jos kaksi kappaletta kirjoitetut tiedot olivat erilaisia, kolmas tutkija pyydettäisiin tarkistamaan ja varmista, että kaikki tiedot olivat oikeassa. Seuraavat tiedot kustakin uutettiin tutkimus: ensimmäinen kirjoittaja, julkaisuvuosi, maan tutkimusväestöstä, etnisyys, lähde hallintalaitteiden, tapausten määrä ja valvonnan eri genotyyppien ja HWE (taulukko 1).

tilastollinen analyysi

arvioinut poikkeamat Hardy-Weinberg tasapainon verrokkiryhmässä jokaisessa tutkimuksessa käyttämällä Pearsonin hyvyys fit χ

2test 1 vapausastetta. Heterogeenisuus tutkimuksissa tarkastettiin random-vaikutusten malli (Der Simonian ja Laird menetelmä), jos siellä oli merkittävä heterogeenisyys [24].

P

arvo on yli nimellistasoa 0,05 Q tilaston osoitti puute heterogeenisuus tutkimuksissa mahdollistaa käytön kiinteään -effects malli (Mantel-Haenszel menetelmä) [25]. Jos

P

arvo alle 0,05 pidettiin olevan heterogeenisyys, tuloksia ei voida yhdistettiin ja niistä keskustellaan. Riskit syrjäisimmillä alueilla ruoansulatuskanavan syöpien liittyvät

XPD

Lys751Gln polymorfismin arvioitiin kullekin tutkimusta. Yhdistetty syrjäisimmillä alueilla arvioitiin yhteistyössä hallitseva malli (Lys /Gin

vs

.Lys /Lys, Gin /Gin

vs

. Lys /Lys), hallitseva malli (Gin /Gin + Lys /Gin

vs

. Lys /Lys), resessiivinen malli (Gin /Gin

vs

. Lys /Gin + Lys /Lys), tässä järjestyksessä. Alaryhmä analyysit tehtiin syövän tyyppejä, etnisyys ja lähde valvontaa. Julkaisussa bias diagnosoitiin suppiloon juoni, jossa keskivirhe log (OR) kukin tutkimus piirrettiin sen log (OR). Suppilo juoni epäsymmetria arvioitiin Egger n lineaarisen regression testi. Merkitys siepata määritettiin t-testillä ehdottamia Egger (

P

0,05 katsottiin edustavan tilastollisesti merkitsevä julkaisu bias) [26]. Kaikki tilastolliset testit suoritettiin STATA version11.0 (Stata Corporation, College Station, TX, USA).

Tulokset

Tutkimus ominainen

yhteensä 107 potentiaalisen asiaan tutkimuksia haettiin kautta PubMed (kuvio 1). Sen jälkeen huolellisesti tarkastellaan, 40 voivat tapausverrokkitutkimukset (3 tutkimukset eivät vastaa HWE myös esitetty) suhdetta

XPD

Lys715Gln polymorfismi ja ruoansulatuskanavan syöpien riski oli mukana tässä meta-analyysi, mukaan lukien 4 suusyöpä tutkimuksissa [62] – [65], 13 ruokatorven syöpä tutkimukset [27] – [39], 12 mahasyövän tutkimuksissa [36], [40] – [50] ja 11 peräsuolen syövän tutkimukset [51] – [61]. Kuten taulukosta 1, 17 tutkimukset tehtiin aasialaisilla, 20 tutkimukset eurooppalaisia. Lisäksi oli 18 sairaalassa perustuvat tutkimukset, 19 väestön perustuvat tutkimukset. Monipuolinen genotyypitysmenetelmiä käytettiin, kuten PCR-RFLP, PCR-SSCP, Taqman, reaaliaikainen PCR ja SEB PCR. Kaikki tutkimukset osoittivat, että genotyypin jakauma kontrollit olivat yhdenmukaisia ​​HWE.

Meta-analyysi

Ptaulukko 2 luetellaan tärkeimmät tulokset meta-analyysi

XPD

Lys751Gln: jolla on Gln /Gln genotyyppi on riskitekijä ruoansulatuskanavan syöpien: GlnGln

vs

. LysLys: OR = 1,12, 95% CI = 1,01-1,24,

P

= 0,029,

P

epäyhtenäisyys = 0,133.

I

2 = 20,9% (kuvio 2). Emme löytäneet mitään Merkitsevä yhteys muiden geneettisten mallien ja ruoansulatuskanavan syöpien. Tulokset kerrostunut analyysin syöpä tyyppi, lähde valvonnan ja etnisen näytettiin taulukossa 2. Gin /Gln vs. Lys /Lys genotyyppi oli kohonnut riski Aasian väestöstä (OR = 1,28, 95% CI = 1,01-1,63,

P

= 0,045,

P

heterogeenisyys = 0,287,

I

2 = 14,2%; kuva 3). Korkea heterogeenisuus todettiin ruokatorven syöpä ja sairaala-pohjainen tutkimuksia, joten tuloksia ei voida yhdistettiin. Lisäksi tulokset eivät viittaa yhdistyksen välillä

XPD

Lys751Gln polymorfismi ja ruoansulatuskanavan syöpien alttiuden kaikki geneettiset mallien Euroopan yksilöiden tai väestön perustuvat tutkimukset yleistä.

homotsygoottisia verrattuna.

kiinteiden vaikutusten mallia käytettiin. Neliöt ja vaakasuorat viivat vastaavat tutkimuksittain OR ja 95%: n luottamusväli. Alue neliöiden heijastaa paino (käänteinen varianssi). Timantti edustaa yhteenveto OR ja 95%: n luottamusväli.

Herkkyystarkastelu

herkkyysanalyysissä, kun kukin nimenomaisessa tutkimuksessa oli poistettu meta-analyysit tehtiin toistuvasti. Vastaavien yhdistettyjen syrjäisimpien ei laadullisesti muuttunut kanssa tai ilman tätä tutkimusta. Kuten on esitetty kuviossa 4, kaikkein vaikuttaminen yhden tutkimuksen koko yhdistetystä tai arvioita näytti olevan yksi suoritettiin Mariana et ai, joka oli suhteellisen suuri näytteen koko. Kuitenkin poistamisen jälkeen Tutkimuksen tulos meta-analyysi ei ole vaikuttanut merkittävästi: Gln /Gln vs. Lys /Lys: OR = 1,17, 95% CI: 1,05-1,30, mikä osoittaa erittäin vakaa meidän tuloksia.

tulokset laskettiin jättämällä kukin tutkimuksessa (vasen sarake) puolestaan. Bars, 95% CI.

heterogeenisuus analyysi

Ei ollut maltillista heterogeenisuus nämä tutkimukset GlnGln + GlnLys

vs

.LysLys vertailuja ja Gin /Gin

vs

. Lys /Lys vertailuja, mutta ei muiden geneettisten mallien. Olemme tutkineet lähde heterogeenisyys varten hallitseva mallia syöpätyypin, etnisyys, lähde ohjaus, ja totesi, että ruokatorven syöpä ja sairaala perustuvat tutkimukset edistäneet merkittävästi heterogeenisuus (Table3). Yksi syy voi olla, että sairaalan perustuvat tutkimukset oli suhteellisen pieniä näytteitä ja olivat alttiimpia satunnainen virhe ja vääriä positiivisia tai negatiivisia tuloksia. Lisäksi on hyvin todennäköistä, että heterogeenisuus ruokatorven tutkimuksissa ja sairaala perustuvat tutkimukset liittyvät koska sairaalassa perustuvat tutkimukset enemmistönä keskuudessa ruokatorven tutkimuksissa.

Julkaisu Bias

Begg listalla korrelaatio menetelmä ja Egger painotettu regressiomenetelmä arviointiin käytettiin julkaisun bias. Ei ollut todisteita julkaisemisesta puolueellisuudesta

XPD

Lys751Gln (Begg testi

P

= 0,284, Egger testi

P

= 0,324, t = 1,00, 95% CI = 0,41 -1,21). Esitämme suppilo kuvaaja syrjäisimmille alueille Gln /Gln versus Lys /Lys (kuva 5).

Jokainen piste edustaa erillistä tutkimusta osoitetun -alueella.

Keskustelu

XPD keskeinen rooli NER, joka on merkityksellinen lopettaa tiettyjen DNA ristisidosten, ultravioletti (UV) valokuva-vaurioita, ja tilaa vieviä kemiallisia addukteja.

XPD

proteiini on sekä yksijuosteisen DNA-riippuvainen ATP ase ja 5′-3 ’DNA helikaasiaktiivisuudet, joka on välttämätön NER reitin ja transkriptio [66]. Geneettinen vaihtelu

XPD

voivat edistää heikentyneen DNA korjaus kapasiteetti ja lisääntynyt syöpäriskiä. Lys Gln muutos asemassa 751 on

XPD

tuloksena oli täydellinen muutoksia veloituksen kokoonpano aminohappo, joka vaikuttaa vuorovaikutuksia

XPD

proteiinin ja sen helikaasia aktivaattori [67]. Tähän mennessä useat epidemiologiset tutkimukset on tehty arvioida roolia Lys751Gln polymorfismin useaan syöpäriskejä, mutta tulokset ovat edelleen kiistanalaisia. Sikäli kuin tiedämme, useat aikaisemmat meta-analyysit

XPD

Lys751Gln polymorfismi ja syöpien riski on tehty, kuten mahasyövän, peräsuolen syöpä, ruokatorven syöpä, rintasyöpä ja virtsarakon syöpä [14] – [23 ]. Mutta tähän mennessä ei ole meta-analyysin yhteydestä ruoansulatuskanavan syöpien riskiä ja

XPD

Lys751Gln polymorfismi. Johtamiseksi tarkempi arvio suhteesta, suoritimme tämä meta-analyysi 37 tutkimukset, mukaan lukien 9027 tapaukset ja 16072 valvontaa.

Analysoimalla genotyyppejä päässä 37 oikeutettu tutkimuksissa löysimme Gln /Gin genotyyppi kuljettaa voisi olla mahdollinen riski ruoansulatuskanavan syöpiin. Lys Gln muunnelma asemaa 751

XPD

johti täydelliseen muutokset sähköisistä kokoonpanosta aminohappo, joka vaikutti vuorovaikutuksia

XPD

proteiinin ja sen helikaasia aktivaattori [68]. Ruoansulatuskanavan syöpien edustavat homogeeninen ryhmä maligniteetteja tietyllä tavalla. Eri ensisijainen sivustoja ruoansulatuskanavan syöpien on joitakin yhteisiä riskitekijöitä. Esimerkiksi lukuun ottamatta tupakointi ja alkoholin kulutus, syöminen karkea, mausteinen, kuuma ja sulamattomia ruoka on omiaan vahingoittamaan ruoansulatuskanavan kudosta. Lisäksi

helikobakteeri

infektio on suurin syy mahasyöpä, kun nitriittejä johdettu punaisen lihan ja lihajalosteiden on keskeinen riskitekijä ruokatorven syöpä ja peräsuolen syöpä. Tällaisia ​​riskitekijöitä ja niiden kudosspesifisyyttä esiin mahdollisuuden, että

XPD

polymorfismi voi liittyä ruoansulatuskanavan syöpien riskiä. Toiminnallinen

XPD

Lys751Gln polymorfismi mikä laski aktiivisuutta

XPD

proteiini voi lisätä riskiä ruoansulatuskanavan syöpien perusteella vahinkojen kudosta.

kerrostunut analyysi syöpätyypin , huomasimme, että kaikki geneettiset mallit ei näyttänyt vaikuttavan riskeistä ruokatorven, mahalaukun, peräsuolen ja suusyöpä. Tämä oli erilainen kuin Ling Yuan ja Wu XB: n tutkimuksissa [69], [70]. Kuitenkin Bo Chen et al. [71] havainnut, että Gin /Gin genotyyppi harjoittajien saattaa olla lisääntynyt riski mahalaukun syövän helikobakteerin-bakteerin pylori (H. pylori) -positiivinen väestö, mutta ei helikobakteerin-bakteerin (Helicobacter pylori) -negatiivinen väestöstä. Yksi mahdollinen selitys on, että modulaatio ruoansulatuskanavan syöpien riski voi riippua paitsi yhden geenin /yhden emäksen monimuotoisuus, mutta myös yhteisestä vaikutuksesta useiden polymorfismien sisällä eri geenien tai kulkuväylillä tai läheiseen vuorovaikutukseen polymorfismien ja ympäristötekijä. Toinen on se, että Helicobacter pylori-infektio on yksi selkeä etiologies mahasyövän ja ehkä jonkin verran suhde Helicobacter pylori ja polymorfisen loci. Alaryhmässä etnisyyden, löysimme merkitsevästi yhteydessä

XPD

Gin /Gin polymorfismi ja lisääntyneiden riskien ruoansulatuskanavan syöpien aasialaisilla mutta ei Euroopan. Mielestämme etniset erot ja monipuolinen live ympäristö saattaa osittain selittää ilmiön. Lisäksi uskoimme erot ruokavalio, kuten elintarvikkeiden rakennetta ja ruoanlaittoon tavalla, oli tärkein syy tämän tuloksen. Lisäksi se oli myös todennäköistä, että havaitut etniset erot voivat johtua sattumasta, koska tutkimukset, joissa pieni näyte koko voi olla riittämätön tilastollinen voima havaita lievä vaikutus tai ehkä tuottaneet vaihdelleet riskiarvio [72].

Yhteenvetona tämä meta-analyysi osoitti, että

XPD

Lys751Gln polymorfismi, yksilöt kantavat variantti homozygoottisia Gln /Gln saattaa lisätä alttiutta ruoansulatuskanavan syöpien. Ja merkitseviä havaittiin keskuudessa aasialaiset väestöstä. On huomattava nimenomaisesti: ensinnäkin otoskoko on paljon pienempi, että Gln /Gln vs. Lys /Lys analysoi kuin muiden geneettisten mallien ja siksi se on altis satunnainen virhe ja vääriä positiivisia tuloksia; toiseksi, tulokset GlnGln vs. GlyLys + LysLys, mutta ei tilastollisesti merkitsevä (OR 1,09, 95% CI = 0,99-1,20,

P

= 0,072,

P

heterogeenisyys = 0,385), vahvistaa päätelmiä siitä, mikä geneettinen malli on sopivin. Laajamittainen tapaus-verrokki ja väestöpohjaiset assosiaatiotutkimuksiin perusteltua vahvistaa tunnistetun riskin nykyisessä meta-analyysi ja tutkia mahdollisuuksia geeni-geeni ja geeni-ympäristö vuorovaikutusta ruoansulatuskanavan syöpiin riski.

tukeminen tiedot

tarkistuslista S1.

doi: 10,1371 /journal.pone.0096301.s001

(DOC) B