Bakteerien Epigenomics, se on vain ajan

Kun sovelluksia monen omiikka lähestymistapoja tutkia epigenome, a- eld epigenetiikka on valmis muuttamaan. Keskitymme integroimiseen omiikka lähestymistapoja sovellettuna DNA modi? Kationi suurikapasiteettisten lähestyy

Bakteerien epigenome on dynaaminen ominaisuus, joka muuttuu kasvun aikana vastauksena ulkoisiin ärsykkeisiin, ja mikä helpottaa mukautumista vaihtelevissa ympäristö- olosuhteissa. Monia tekniikoita on kehitetty määrällisesti metylaation määrä muunnetut? Ed nukleotidia, ja parantaa havaitsemisen tarkkuus. Bisul? Te sekvensointi oli? RST käytetyn menetelmän DNA: n metylaation kautta sekvensointi. NGS on pohjustettu useita mittavia sekvensointi ponnisteluja, mikä lisää löytö metylaation tiheys, sijainti ja katalyyttinen entsyymejä.

räjähdysmäinen tuotanto epigenomes lähivuosina ennustaa, että tarvitaan uusia laskennallisia työkaluja ja alustat ajaa laajamittainen tiedon analysointi genomin ja epigeneettiset huomautusta. Tietokannat suurikapasiteettisten analyysi fyysisen ja toiminnallisen proteiini-proteiini vuorovaikutusten sisältävät STRING, joka ennustaa proteiini-proteiini vuorovaikutuksen verkkojen yhden genomin ovat erittäin tarvitaan. Tulevaisuuden haasteet ovat jännittävä ja? Lled monia mahdollisuuksia tehdä uusia löytöjä, jotka de? Ne Epigenomics roolissa bakteerien elinkaaren aikakaudella multi-omiikka integraatio.

esiasteita solujen sitoutumaan niiden kohtalo askel-askeleelta erilaistumista prosessi, jota käytetään lukuisia panoksia ja mukana on epigeneettiset toimenpiteitä vahvistamalla sitoutumista päätöksiä. Valmistautuminen seksuaalinen lisääntyminen on kolmivaiheinen prosessi, joka koostuu poistamisen somaattisten allekirjoitusten sukusolujen esiasteita kattavalla uudelleenohjelmointi prosessi, perustaminen sukupuolesta riippuvaa ja sukusolujen erityisiä epigeneettisellä allekirjoitukset ja transkription profiileja ja lopuksi, post-lannoitus poistaminen allekirjoituksista laukaisemaan alkion kehitysohjelma ja alkaa uusi elinkaari.

DNA: n metylaation on yleinen eukaryooteissa vaihtelevat sienistä selkärankaisille, vaikka sen merkitys ja asema nämä organismit vaihtelee suuresti. Hallitseva asemointi 5mC symmetrisessä CpG yhteydessä johti alussa ehdotuksen DNA: n metylaatio perinnön kautta semiconservative DNA: n kahdentuminen,

5-hydroxymethylcytosine (5hmC) ja äskettäin löytyneen kymmenen-yksitoista translokaatio (Tet) perhe of dioksygenaasit ehdottaa uusia mahdollisuuksia aktiiviseen DNA demetylaation.

nyt on selvää, että passiivinen DNA demetylaation on kaikkein parsimonious mekanismi sekä PGC ja preimplantaation alkioiden ja on luultavasti riittää tähän tarkoitukseen.

Epigeneettiset uudelleenohjelmointi eroaa yksityiskohtia nisäkäslajeissa, mikä viittaa siihen, että demetylaatio-metylaatio alkion ovat uusia mekanismeja.

Vastaa