Krooninen sairaus

tiivistelmä

Ruokatorven syöpä oli viidenneksi yleisin diagnosoitu syöpä ja neljänneksi suurin syy syöpään liittyvien kuolemaan Kiinassa vuonna 2009. Geneettiset tekijät saattavat olla tärkeä rooli syövän synnyn ruokatorven okasolusyöpä ( ESCC). Teimme sairaala-pohjainen tapauskontrollitutkimuksessa arvioimaan kymmenen

NAT2

koodaus yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) riskistä ESCC. Kuusisataa kaksikymmentä yhdeksän ESCC tapauksissa ja 686 verrokkia palvelukseen. Niiden genotyyppien määritettiin käyttäen ligaa- detektioreaktiossa menetelmällä. Vuonna yhden lokuksen analyysissä oli rajatapaus tilastollisesti merkitsevää eroa genotyyppi taajuuksilla

NAT2

rs1565684 T C SNP tapausten välillä ja säätimet (

p

= 0,057).

NAT2

rs1565684 CC-genotyyppi liittyi rajatapaus merkittävästi lisääntynyt riski ESCC (CC

vs.

TT: säätää OR = 1,77, 95% CI = 0,97-3,21,

p

= 0,063 ja CC

vs.

TT /TC: säätää OR = 1,68, 95% CI = ,93-+3,04,

p

= 0,085). Yhdistys näkyi iäkkäiden ja potilailla, jotka eivät koskaan humalassa. Kun Bonferroni korjauksen kaikissa verrattuna malleissa,

NAT2

rs1565684 T C SNP ei liittynyt ESCC riski (

p

0,05). Muiden yhdeksän

NAT2

SNP, kun Bonferronin korjauksen kaikissa verrattuna malleissa, yhdeksän SNP ei myöskään liittynyt ESCC riski (

p

0,05). Siten yhdeksän

NAT2

koodaus SNP eivät liittyneet riskiä ESCC.

NAT2

rs1565684 T C SNP voisi olla hieman rooli ESCC verestä. Muita suurempia tutkimuksia ja kudosspesifisiä biologisia ominaisuuksia, jotka vahvistavat tutkimuksen tuloksiin.

Citation: Wang L, Tang W, Chen S, Sun Y, Tuuletin Y, Shi Y, et al. (2014)

N-asetyylitransferaasi 2

polymorfismit ja riski ruokatorven syöpään kiinalaisessa väestöstä. PLoS ONE 9 (2): e87783. doi: 10,1371 /journal.pone.0087783

Editor: Qing-Yi Wei, Duke Cancer Institute, Yhdysvallat

vastaanotettu: 03 marraskuu 2013; Hyväksytty lukien: 1. tammikuuta 2014; Julkaistu: 19 helmikuu 2014

Copyright: © 2014 Wang et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus tuettiin osittain National Natural Science Foundation of China (81370001, 81371927, 81101889, 81000028), Jiangsu Natural Science Foundation (BK2010333, BK2011481), Social Development Foundation Zhenjiang (SH2010017), Changzhou Young Talents ja Science-Technology Foundation of Health Bureau (QN201102), Affiliated kansan sairaalan Jiangsu yliopiston rahasto (Y200913) ja Jiangsu University Clinical lääketieteen tieteen ja teknologian kehitysrahaston (JLY20120004). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Ruokatorven syöpä oli neljäs johtava syy syövän kuoleman ja viidenneksi yleisimmin diagnosoitu syöpä Kiinassa vuonna 2009 [1]. Geneettiset tekijät, kuten yhden emäksen monimuotoisuus (SNP), saattaa olla tärkeä rooli syövän synnyn ruokatorven okasolusyöpä (ESCC) [2].

N-asetyylitransferaasi 2 (NAT2) on entsyymi, joka toistaa keskeinen rooli aineenvaihdunnan mahdollisten eri karsinogeeneja. NAT2 ilmentyy pääasiassa ihmisen maksassa ja maha-suolikanavassa.

NAT2

geeni sijaitsee 8p21.3-23.1 ja koodaa 290 aminohapon proteiinia, NAT2 [3].

NAT2

on polymorfinen, ja ajateltiin, että NAT2 asetylaatio aseman muutos aiheuttamia

NAT

polymorfismien laski entsyymiaktiivisuuden ja johtaa ilman vieroitus tehokkuus, mikä voi johtaa kasvuun syöpäalttiutta [ ,,,0],4]. On raportoitu, että

NAT2

polymorfismien ja /tai niiden vuorovaikutus tupakointi liittyy erilaisia ​​syöpäsairauksia.

geneettinen vaihtelu

NAT2

voi johtaa eroihin nopeudella aryyliamiinina aineenvaihduntaa ja näin lisätä syöpäriskiä [5]. Substraatit NAT2, jotka osallistuvat Karsinogeneesin edustaa lähinnä heterosyklisiä amiineja ja polysyklisiä aromaattisia hiilivety renkaita löytyy keitetty tai savustettu liha [6] ja tupakansavun [7].

NAT2

geneettiset variaatiot voivat edistää ja ESCC. Sairaalassa perustuva tapauskontrollitutkimuksessa teimme genotyypitys analyysit kymmenen

NAT2

koodaus SNP 629 ESCC tapauksissa ja 686 kontrollit Kiinan väestön.

Materiaalit ja menetelmät

Eettinen hyväksyntä tutkimussuunnitelman

Review Board of Jiangsu University (Zhenjiang, Kiina) hyväksyi sairaala-pohjainen tapauskontrollitutkimuksessa. Olemme noudattaneet Maailman lääkäriliiton Helsingin julistuksen eettisten tutkimuksen suorittamisessa ihmiseen kohdistuvan ja /tai eläimiä. Kaikki koehenkilöt edellyttäen kirjallista, tietoon perustuvan suostumuksen olla mukana tutkimuksessa.

Potilaille ja säätimet

kuusisataa ja kaksikymmentä yhdeksän aiheita ruokatorven syöpään peräkkäin rekrytoitiin Affiliated Kansan sairaalan Jiangsu University ja Affiliated sairaala Jiangsu University (Zhenjiang, Kiina) välillä lokakuussa 2008 ja joulukuussa 2010. Kaikki tapaukset ruokatorven syöpään diagnosoitiin ESCC patologisesti. Poissulkukriteerit olivat potilaat, jotka olivat aiemmin: syöpä; mitään etäpesäkkeitä syöpä; sädehoidon tai kemoterapian. 686 kontrollit olivat potilaita ilman syövän ja sovitettiin tapauksiin iän suhteen (± 5 vuotta) ja sukupuoli. Heidät rekrytoitiin kaksi sairaalaa edellä mainittujen samana ajanjaksona. Useimmat tarkastukset otettiin sairaaloihin hoitoon trauma.

Koulutettu haastattelijat käyttäen esitestattuja kyselylomake, kyseenalaiseksi kuhunkin aiheeseen henkilökohtaisesti saada tietoa väestötietoja (esim, ikä, sukupuoli) ja siihen liittyvät riskitekijöitä (kuten tupakoinnin ja alkoholin kulutus). Haastattelun jälkeen, 2 ml näytettä laskimoverta kerättiin kustakin aiheesta. Yksilöt, jotka savustettu yhden savukkeen päivässä 1 vuosi määriteltiin ”tupakoitsijat”. Koehenkilöt, jotka kulutetaan enemmän kuin kolme alkoholijuomia viikossa 6 kuukautta katsottiin ”alkoholi juovat”.

DNA: n eristäminen, SNP valinta ja genotyypitys ligaatiolla detektioreaktiossa

verinäytteet kerättiin potilailta käyttäen vacutainers ja siirrettiin putkiin vuorattu etyleenidiamiinitetra-etikkahappoa (EDTA). Perimän DNA eristettiin kokoverestä kanssa QIAamp DNA Veren Mini Kit (Qiagen, Berliini, Saksa) [8]. Käytimme lohko-pohjainen koodaus strategia löytää koodaus SNP käyttämällä Haploview 4.2 ohjelmistoa, mukaan HapMap tietokantaan (https://www.hapmap.org/, vaihe II Nov08 puolesta NCBI B36 kokoonpanoon, dbSNP B126, väestö: Kiinan Han populaatio); vähäinen alleelin taajuus (MMM) ≥0.05, Hardy-Weinberg tasapaino (HWE)

p

≥0.05 ja soittaa korko ≥95%) perusteella pairwise kytkentäepätasapainossa r

2 kynnys 0,8. Kymmenen

NAT2

koodaus SNP oli siis valittu. Näytteet genotyyppi käyttäen ligaa- detektioreaktiossa (LDR) menetelmä, jossa tekninen tuki Shanghai Biowing Applied Biotechnology Company [9], [10]. Laadunvalvontaan, toistuvat analyysit tehtiin 160 (12,17%) satunnaisesti valitut näytteet korkea DNA laatu.

TILASTOANALYYSI

Erot jakaumia demografisten ominaisuuksien, valittujen muuttujien ja genotyyppien

NAT2

varianttien välillä tapausten ja kontrollien arvioitiin käyttämällä

χ

2 testiä. Liitot välinen kymmenen SNP ja riski ESCC arvioitiin laskemalla kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja niiden 95% luottamusväli (CI) käyttämällä logistista regressiota analyysit raakaöljyn syrjäisimmille alueille ja säätää syrjäisimpien säädettäessä ikä, sukupuoli, tupakointi ja juominen tila . Bonferronin korjausta menettelyä sovellettiin, koska määrä vertailuja. HWE testattiin jonka hyvyys fit

χ

2 testiä verrata havaittu genotyypin taajuuksia Esiintymistiheyksien joukossa verrokkien. Kaikki tilastolliset analyysit suoritettiin SAS 9.1.3 (SAS Institute, Cary, NC, USA).

Tulokset

Ominaisuudet tutkimuspopulaation

Ominaisuudet tapausten ja kontrollien tutkimuksessa mukana on koottu taulukkoon 1. tapausten ja kontrollien näytti riittävästi Hyväksytty iän ja sukupuolen ehdottivat

χ

2 testiä. Kuten taulukosta 1, merkitsevä ero havaittiin tupakoinnin asemasta tapausten välillä ja valvontaa, ja juominen oli suurempi ESCC potilailla kuin verrokeilla. Ensisijainen tieto kahdeksan genotyyppi SNP oli taulukossa 2. Konkordanssi luokallejääminen analyysit olivat 100% paitsi

NAT2

rs11996129 T C (157/160, 98.13%), rs1565684 T C (159/160 , 99,38%) ja rs1799930 G A (159/160, 99,38%). MAF meidän valvonta oli samanlainen MAF Kiinan tietokannassa kaikkien SNP. Havaittu genotyyppi taajuudet näiden kymmenen polymorfismien kontrollien olivat kaikki HWE paitsi

NAT2

rs4540438 A C (

p

= 0,015) (taulukko 2).

assosiaatioiden NAT2 koodaus polymorfismien ja riski ESCC

genotyyppi jakaumat

NAT2

rs1565684 T C tapauksissa ja säätimet on esitetty taulukossa 3. single locus analyysit oli rajatapaus tilastollisesti merkitsevää eroa genotyyppi taajuuksilla

NAT2

rs1565684 T C SNP tapausten välillä ja säätimet (

p

= 0,057). Kun

NAT2

rs1565684 TT homozygoottisia genotyyppi käytettiin vertailuryhmään, TC genotyyppi ei liittynyt riski ESCC (TC vs. TT: OR = 1,14, 95% CI = +0,90-+1,44,

p

= 0,269); CC-genotyyppi liittyi merkitsevästi lisääntynyt riski ESCC (CC vs. TT: OR = 1,95, 95% CI = 1,08-3,51,

p

= 0,026). Vuonna hallitseva mallissa

NAT2

rs1565684 TC /CC variantit eivät liittyneet riskiä ESCC verrattuna

NAT2

rs1565684 TT genotyyppi (TC /CC vs. TT: OR = 1,20, 95% CI = 0,96-1,51,

p

= 0,107). Vuonna väistyvä mallissa, kun

NAT2

rs1565684 TT /TC genotyypit käytettiin vertailuryhmään, CC homotsygoottinen genotyyppi liittyi 86% suurempi riski ESCC (CC vs. TT /TC: OR = 1,86, 95% CI = 1,04-3,33,

p

= 0,037) (taulukko 3). Sen jälkeen ikä-, sukupuoli, tupakointi ja juominen tila, CC genotyyppi liittyi rajatapaus merkittävästi lisääntynyt riski ESCC (CC vs. TT: säätää OR = 1,77, 95% CI = +0,97-+3,21,

p

= 0,063 ja CC vs. TT /TC: säätää OR = 1,68, 95% CI = ,93-+3,04,

p

= 0,085). Kun Bonferroni korjauksen kaikissa verrattuna malleissa,

NAT2

rs1565684 T C SNP ei liittynyt ESCC riski (

p

0,05).

muiden yhdeksän SNP, yhtenäisen lokuksessa analysoidaan, ei ollut tilastollisesti merkitsevää eroa genotyyppi taajuuksilla näistä yhdeksästä SNP tapausten välillä ja säätimet (

p

0,05). Logistinen regressio analyysit paljastivat, että mikään näistä yhdeksästä polymorfiset sijoituspaikoista liittyy alttiuteen ESCC. Kaikkiaan vertailussa malleissa, yhdeksän SNP eivät liittyneet ESCC riski (

p

0,05) ennen ja jälkeen Bonferronin korjauksen (taulukko 3).

ositus analyysit NAT2 rs1565684 T C polymorfismit ja riski ESCC

vaikutusten arvioimiseksi

NAT2

rs1565684 T C genotyypit on ESCC riskin mukaan eri ikä, sukupuoli, tupakointi ja alkoholin juominen asema; suoritimme ositus analyysit (taulukko 4). Merkitsevästi lisääntynyt riski ESCC liittyvä

NAT2

rs1565684 T C polymorfismin näkyi iäkkäiden ja potilailla, jotka eivät koskaan juoneet (taulukko 4).

Keskustelu

tässä sairaalan johdolla tapauskontrollitutkimuksessa of ESCC, huomasimme, että kymmenen valittu

NAT2

koodaus SNP eivät liittyneet riskiä ESCC jälkeen Bonferronin korjauksen.

NAT2

rs1565684 CC-genotyyppi liittyi rajatapaus merkittävästi lisääntynyt riski ESCC. Merkitsevästi lisääntynyt riski ESCC liittyvä

NAT2

rs1565684 T C polymorfismin näkyi iäkkäiden ja potilailla, jotka eivät koskaan humalassa. Parhaan tietomme mukaan se on ensimmäinen positiivisen havainnon

NAT2

rs1565684 T C polymorfismin ja ESCC riskiä.

NAT2 osallistuu metaboliaan suuren luokan tupakansavun karsinogeeneja ( aromaattiset amiinit) ja

NAT2

variantti alleelit johtavat hitaasti puhdistumaan aromaattisia amiineja. Ihmisillä

NAT2

geeni koodaa vaiheen II entsyymi, joka on olennainen rooli aromaattisia, heterosyklisiä amiineja ja hydratsiineja aineenvaihdunta [11]. NAT2 vaikuttaa vieroitus aromaattisista ja heterosyklisistä amiini karsinogeenejä (joita esiintyy tupakansavu) kaksi reittiä: aineenvaihdunnan reaktio voi johtaa siihen, että vieroitus N-asetylointi, tai bioaktivaatiosta O-asetylaatio edeltää usein CYP450 hydroksylaation [11].

Edellinen tapaus-verrokki raportit ovat tuottaneet ristiriitaisia ​​tuloksia, jotka koskevat yhdistyksen

NAT2

SNP kanssa syöpien, mahdollisesti koska pieni määrä aiheita, jotka vaarantaisivat voima tilastollisten analyysien näissä opinnot. Ruokatorven, hidas

NAT2

asetylaatiofenotyypistä genotyyppi oli alttiimpia ruokatorven syöpä Japanissa [12]. Kuitenkin toisessa tutkimuksessa Taiwanissa,

NAT2

polymorfismien ei vaikuttanut riskiä ruokatorven syöpä, riippumatta ympäristötekijöistä [13]. Uudemmassa tutkimuksessa Intiasta,

NAT2

asetylaatiofenotyypistä genotyypit eivät vaikuttaneet alttiutta ruokatorven syöpä.

NAT2

polymorfismien ei merkittävästi syöpäriskiä jälkeen vuorovaikutus ympäristötekijät, kuten tupakan, alkoholin tai työperäinen altistuminen [14]. Toisessa tutkimuksessa Kashmirin laaksossa, yksikään kolmesta

NAT2

polymorfisten alleelien (rs1799929, rs1799930 ja rs1799931) todettiin olevan itsenäisesti liittyy riski ruokatorven ja mahalaukun syövistä [15], joka oli myös mukaisesti meidän tuloksia. Meta-analyysi ehdotti myös, että

NAT2

genotyypit eivät liity keuhkosyöpä [16], mahasyöpä [17], rintasyöpä [18], eturauhassyöpä [19] ja suusyövän [20].

NAT2

rs1565684 T C on kytkentäepätasapainossa toisen tärkeän SNP

NAT2

rs4345600 A G (NS 12, -9306 A G) (r

2 = 0,845) vuonna Kiinan Han Beijing väestöstä. Vaikka

NAT2

rs1565684 T C SNP on toiminnallinen käyttää SNP toimintoa ennustaminen sivustot (https://snpinfo.niehs.nih.gov/snpinfo/snpfunc.htm ja https://www.regulomedb.org/) . Etiologia

NAT2

rs1565684 T C SNP ei vielä tunneta hyvin ja tarvitsevat lisätutkimuksia.

Tämä tapauskontrollitutkimuksessa oli useita rajoituksia. Ensinnäkin potilaiden ja verrokkien otettiin sairaaloista; luontainen bias voivat aiheuttaa vääriä päätelmiä. Toiseksi tilastollisen tehon Tutkimuksemme rajoittui takia maltillisen otoskoko ja ilman validointi kohortin; replikaatiosykliin tutkimuksia tarvitaan. Kolmanneksi virusinfektiot ja immuunijärjestelmän parametrit tietoja ei ollut saatavilla, mikä rajoitti voimaa meidän analyysejä. Lopuksi, emme saada yksityiskohtaista tietoa syöpäsolujen leviämiseen ja selviytymistä, jotka rajoittivat edelleen analyysejä roolit

NAT2

polymorfismit ESCC etenemisen ja ennusteen.

Yhteenvetona tutkimuksessamme antaa näyttöä että

NAT2

koodaus SNP eivät lisäisi riskiä ESCC. Suurempi hyvin suunnitelluissa kokeissa on vahvistettava nykyisten löydösten.

Kiitokset

Arvostamme kaikille potilaille, jotka osallistuivat tähän tutkimukseen. Haluamme kiittää tohtori Yiqun Chen (Biowing Applied Biotechnology Company, Shanghai, Kiina) teknistä tukea.