PLoS One: Association välinen ATM IVS 22-77 T & gt; C ja syöpäriski: Meta-analyysi

tiivistelmä

Tausta ja tavoitteet

On käynyt yhä selvemmäksi, että ATM (ataksia-telangiektasiassa-mutatoitu) takeet genomin vakaus, joka on kulmakivi solun homeostaasin, ja ATM IVS 22- 77 T C vaikuttaa normaalia toimintaa ATM proteiineja. Kuitenkin assosiaatio ATM IVS 22-77 T C geneettinen muunnos ja syövän riski on kiistanalainen. Siksi teimme systemaattisen meta-analyysi arvioida yleistä syöpään liittyvää riskiä polymorfismi ja määrällisesti mahdolliset Tutkimusten välisten heterogeenisuus.

Methods

Yhteensä yhdeksän tutkimusten mukaan lukien 4470 tapaukset ja 4862 tarkastukset analysoitiin ATM IVS 22-77 T C yhdistys syöpäriskiä tässä meta-analyysi. Heterogeenisuus artikkeleita ja niiden julkaiseminen bias testattiin myös.

Tulokset

Tuloksemme osoittivat, ettei yhdistys saavutti tilastollista merkittävyyttä yleisen riskin. Mielenkiintoista on, että kerrostunut analyysit, havaitsimme käänteinen suhde keuhkojen ja rintasyövän.

Johtopäätös

Muita funktionaalisia tutkimusta ATM mekanismin tulisi suorittaa selittää epäjohdonmukaisia ​​tuloksia eri syöpätyyppejä .

Citation: Zhao L, Gu A, Ji G, Zou P, Zhao P, Lu A (2012) Association välillä ATM IVS 22-77 T C ja syöpäriski: meta-analyysi. PLoS ONE 7 (1): e29479. doi: 10,1371 /journal.pone.0029479

Editor: Hongmei Wang, Institute of Zoology, Kiinan tiedeakatemia, Kiina

vastaanotettu: 23 heinäkuu 2011; Hyväksytty: 29 marraskuu 2011; Julkaistu: 19 tammikuu 2012

Copyright: © 2012 Zhao et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukee National Natural Science Foundation of China (avustus 30901534); Jiangsun maakunnassa Natural Science Foundation (Project no. BK2009444); ja Grant varten 135 Key Medical Project Jiangsun maakunnassa (no. XK201117) kielen muokkaus maksu ja julkaisumaksu. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Syöpä on monitekijäinen sairaus, joka johtuu monimutkainen ympäristö- ja geneettiset tekijät [1]. Geneettinen tekijät enemmän syy syövän kuin tehdä elämäntyyliin tai ympäristötekijöihin. Geneettisten tekijöiden, tie syöpä on päällystetty muutoksia järjestyksessä ja organisaatio solun genomiin, jotka vaihtelevat yhden nukleotidin substituutioita brutto kromosomimuutokset [2]. Viime vuosina tutkimukset perustuvat ehdokas-polymorfismi lähestymistapa merkittävästi lisännyt yhdistysten välillä polymorfismin ja syövän riski, että voitaisiin testata.

ataksia-telangiektasia (A-T) on harvinainen peittyvästi periytyvä sairaus, joka vaikuttaa monet ruumiinosat ja on poikkeuksellisen korkea syövän, mukaan lukien rintasyöpä, leukemia, ja lymfooma [3] – [5]. A-T johtuu mutaatioista ataksia-telangiectasia- mutatoitunut (ATM) geeni [6]. ATM-geeni tiedetään osallistuvan soluvasteen DNA taukoja useilla tasoilla, kuten solusyklin Checkpoint aktivointi, DNA: n korjaukseen, ja apoptoosin induktio [7]. Koodaaman proteiinin tämän geenin kuuluu PI3 /PI4-kinaasiperheen. Ihmisen ATM-geeni on kartoitettu kromosomiin 11q22-23, ja se kattaa 150 kb ja sisältää 66 eksonia [6].

DNA-vaurioita vaarantaa solujen homeostaasin ja aloittaa vastauksen, joka aktivoi eri korjausmekanismit, jotka tunnistavat spesifisiä DNA- leesiot [8]. Double-säikeen katkoksia (DSB: t) ovat erilaisia ​​DNA-vaurioita, jotka johtuvat eri DNA: ta vaurioittavien aineiden, kuten ionisoivan säteilyn ja reaktiivisia hapen, ja näiden DNA-vaurioiden ovat tappavia. ATM-geeni on keskeinen rooli tunnustamista, signalointi, ja korjaus DNA DSB: t [2], [9]. ATM vastaa myös aiheuttamaan vahinkoon aikana meioosi ja mitoosin tai vapaiden radikaalien syntyvän aineenvaihduntaan estrogeenien tai ympäristökemikaalien. Lisäksi ATM toimii säätelijänä monenlaisia ​​loppupään proteiineja, mukaan lukien tuumorisuppressoriproteiinia P53, BRCA1, onkogeeniset proteiini MDM2, tarkastuspiste kinaasi Chk2, tarkistuspiste proteiinia RAD50 ja DNA korjaus proteiinia NBS1 [2], [7]. Ilman näitä toimintoja, solujen mitoosin on altis jäljittelyn vaurioitunut DNA malleja ja seuraavissa sukupolvissa vahingoittuneiden kromosomeja. On erittäin todennäköistä, että syöpä on peräisin näistä muuttunut soluista. ATM takeet genomin vakautta, joka on kulmakivi solun homeostaasin. Tunnistamisen jälkeen ATM-geeni vuonna 1995 [10], lukuisat tutkimukset ovat osoittaneet, että yksilöiden ATM on suuri esiintyvyys pahanlaatuisten kasvainten, erityisesti rintasyövän [7], [11], [12].

polymorfismit ATM, jotka vaikuttavat normaalin proteiinin aktiivisuutta, voivat muuttaa tehokkuutta solusyklin Checkpoint aktivointi, DNA: n korjaukseen ja apoptoosin induktio ja johtavat geneettinen epävakaus ja lisääntynyt syöpäriskiä. Yksittäinen nukleotidin polymorfismi (SNP) IVS 22-77 T C (rs664677) sijaitsee intronin 22 ATM-geeni ja on vähäinen alleelin frekvenssi yli 10%. Lisäksi IVS 22-77 T C on tiukka kytkentäepätasapainossa IVS48 _ 238 G, toinen ATM variantti alleeli, joka oli osoitettu olevan yhteydessä rintasyövän riskiä [13]. Tähän mennessä monet molekyyli epidemiologiset tutkimukset ovat arvioineet rooli ATM IVS 22-77 T C syövän kehittymisessä populaatioissa eri etnisten ryhmien [13] – [21]. Vaikka jotkut tapaus-verrokki tutkimuksessa arvioitiin yhdessä syöpäriskiä [13] – [16], [20], muut tutkimukset eivät ole osoittaneet mitään yhdistys [17] – [19], [21] . Epäyhtenäisyyteen aiemmat tutkimukset saattavat johtua useiden etnisten satunnaisvirheet, ja kohtalainen otoskoot. Siksi Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli käyttää meta-analyysi lähestymistapa arvioida ATM rs664677 polymorfismi on todella liittyvät sairauden riskin.

Materiaalit ja menetelmät

hyväksyttävät tutkimukset

Jotta kirjallisuuskatsauksen, etsimme PubMed ja EMBASE tietokannat (edellinen haku suoritettiin 31. toukokuuta, 2011) käyttäen seuraavia hakutermejä: ”ATM” ja ”syöpä” tai ”kasvain” ja ”polymorfismi” tai ”variantti” . Lisäksi olemme seulotaan viiteluetteloihin kaikille mukana, arviot ja meta-analyysit.

voimassaolo arviointi

Aikaisemmat tutkimukset olivat mukana, jos ne sisältävät riittävästi julkaistut tiedot koskevat seuraavat tiedot: 1) ATM rs664677 polymorfismi ja syövän riskiä; 2) Ihmisen tapauskontrollitutkimuksessa polymorfismin liittyy syöpäriski; ja 3) genotyyppi taajuudet sekä syöpätapausta ja valvontaa. Ensisijainen syy poissulkemista tutkimuksissa, on lueteltu seuraavasti: 1) kirjallisuudessa ei sisältänyt tietoa syöpätutkimukseen; 2) Tutkimuksen kahdennettu aikaisemman julkaisun; 3) tutkimuksessa raportoitu mitään käyttökelpoista tietoa; ja 4) tutkimuksen ainoa mukana tapauspopulaatio.

Data louhinta

puretut tiedot kustakin oikeutettuja julkaisu sisälsi seuraavat tiedot: ensimmäisen tekijän nimi, vuonna julkaistu, vuoden tiedot kerättiin, maa, jossa tutkimus tehtiin, etnisten ryhmien liittyviä yksilöitä, syöpä tyyppi, lähde valvonnan käytetty, sovitus kriteerien mukaan genotyypitysmenetelmää, näytteen tyyppi, otoksen koko, genotyypin taajuudet kokeellinen tapauksissa ja valvonta sekä Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) keskuudessa valvontaa. Erityisesti kukin valittu tapaus luokiteltiin väestöpohjainen, sairaala-pohjainen tai sekoitettuna. Etnistä taustaa luokiteltiin Aasian ja Euroopan. Jos etnisyys ei ilmoiteta, pohdimme etnisyyden lähteen väestöstä maan, jossa tutkimus tehtiin.

Tutkimus ominaisuudet

Tiedot yhdeksästä syövän tapaus-verrokki julkaisuja käytettiin analyysien. Yhteenveto yksittäisistä tutkimuksista on esitetty taulukossa 1. Koska yhdessä tutkimuksessa esitteli tietoja genotyyppien kuin ”CC ja CT /TT” esittämättä tiedot kaikista kolmesta genotyyppejä, laskimme kerroinsuhde (OR) ja resessiivinen malleja tilastollinen analyysi [21].

tilastollinen

Kaikki tilastolliset testit suoritetaan tässä tutkimuksessa olivat kaksisuuntaisia ​​ja p-arvot alle 0,05 pidettiin merkittävinä, ellei toisin mainita. Tilastolliset analyysit tehtiin käyttäen Stata, versio 11.0.

verrokkiryhmien jokaisen tutkimuksen, alleelifrekvenssi laskettiin, ja havaitun genotyyppi taajuudet rs664677 polymorfismin arvioitiin Hardy-Weinberg tasapaino käyttäen testiä. Julkaisussa by Natallia M Akulevich et al. [16] esitti kaksi erillistä tapaus-verrokki tutkimuksissa. Kukin tutkimus pidettiin erikseen yhdistämiseksi analyysia. Siten yhteensä yhdeksän julkaisuissa, kuten kymmenen tutkimukset sisällytettiin lopulliseen meta-analyysi. Kaikki tutkimukset kontrolliryhmiin, jotka eivät olleet HWE (p 0,05) jätettiin pois.

Vahvuus välisen assosiaation rs664677 polymorfismin ja syövän riskiä arvioitiin kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmät alueet), jossa 95%: n luottamusväli (IVY). Yhdistettiin arviot syrjäisimpien alueiden ja 95% CI laskettiin logistinen regressio. Yhdistetty syrjäisimmillä alueilla laskettiin heterozygoottiset vertailua (CT vs. TT), homotsygoottinen vertailu (CC vs. TT), hallitseva malli (CT /CC vs. TT) ja väistyvä malli (CC vs. CT /TT), tässä järjestyksessä. Arvot syrjäisimpien alueiden ja CI kunkin pidettiin kahdesti. Meta-analyysit ositettiin syöpätyypin, etnisyys ja lähde syistä, jos data on sallittu; vähintään kolme tietolähteiden tarvittiin. Yksittäisistä tutkimuksista sisältyvät tähän yhdistetty analyysi, vain yksi lähde valvonnan kohti tutkimuksessa havaittiin kaikissa paitsi kahdessa tapauksessa; Näissä tutkimuksissa yhdistettiin osaksi ”mixed” ryhmä.

Kun arvioidaan, meta-analyysin tulokset sisältyi tarkastelun heterogeenisyys, analyysin herkkyys, ja kokeeseen puolueellisuudesta. Chi-neliö-pohjainen Q-tilastoa testiä käytettiin arvioimaan Tutkimusten välisten heterogeenisyys, ja sitä pidettiin merkittävinä, jos P 0,10. Kiinteän ja satunnaisia ​​vaikutuksia mallien suoritettiin vastaavasti yhdistää arvot kunkin tutkimusten perusteella Mantel-Haenszel [22] ja Dersimonian ja Laird [23] menetelmiä. Kun vaikutuksia oletettiin olevan homogeeninen, kiinteä-vaikutukset mallia käytettiin; muuten, se oli tarkoituksenmukaista käyttää random-vaikutus malli. Herkkyys analyysit suoritettiin arvioimaan kestävyyttä ja tutki tulokset meidän meta-analyysejä mahdollisten harhat.

käännetty suppilo tontteja ja Egger n testausalusta tutkittaessa käytettiin julkaisun bias. Mahdollista julkaisu bias arvioitiin kanssa suppilo tontit vaikutuksen kokoa verrattuna keskivirheet; Begg testi käytettiin tunnistamaan merkittävien epäsymmetriaa. Epäsymmetrinen juoni ehdottaa mahdollisia julkaisu puolueellisuudesta. Bias takia tuloksia pieniä tutkimuksia arvioitiin modifioitu Egger testi, joka korjataan mahdollisia tyypin I virheitä [24].

Tulokset

Flow sisältyi tutkimuksia

kaikkiaan 110 julkaisut olivat merkityksellisiä hakusanojen. Seitsemän tutkimukset olivat ilmeisesti merkityksetön. Neljäkymmentä tutkimukset suljettiin pois, koska ne olivat kopioita aikaisemmin julkaistu (27 tutkimusta) tai eri geenejä (13 artikkelit). Neljä artikkelit olivat meta-analyysit, ja kuusi julkaisut olivat arvioita. Niistä jäljellä 53 julkaisut, kuusi artikkelit eivät olleet ihmisen tutkimuksissa viisi julkaisuista eivät olleet syöpätutkimukseen ja kuusi artikkeleita ollut ohjaus väestöstä. Toinen kaksikymmentäkahdeksan tutkimuksia myös sulkea pois, koska ne eivät esittäneet yksityiskohtaista genotyypityksen tiedot (19 artikkelit) tai eivät ilmoittaneet käyttökelpoista tietoa (9 artikkelit). Lopuksi viittaukset kaikki mukana tutkimuksista arvioita ja meta-analyysit seulottiin. Yksi ylimääräinen oikeutettuja artikkeli on haettu. Kaiken kaikkiaan yhdeksässä tutkimuksessa, joissa 4470 tapauksia ja 4862 tarkastukset, jotka koskevat ATM rs664677 polymorfismia syöpäalttiutta olivat saatavilla tämän meta-analyysi (kuvio 1).

Ominaisuudet tutkimusten

tutkimuksissa, joissa tutkittiin eri syöpiä, useita etnisen tai eri lähteistä valvonnan erotettiin useisiin tutkimuksia alaryhmäanalyysi. Lisäksi yhdessä tutkimuksessa [21], että vasta, kun suurin sallittu määrä yhteisiä genotyyppien (TT ja CT) otettiin mukaan analyysiin, että väistyvä malli, mutta ei muita geneettisiä malleja. ATM rs664677 polymorfismi oli neljä tutkimuksia Aasian jälkeläisiään ja viisi tutkimuksia eurooppalaisten jälkeläisiä. Lopuksi, meidän meta-analyysi koostui yhdeksästä tapausverrokkitutkimukset: kolme rintasyöpätutkimuksissa, neljä keuhkosyöpä tutkimuksessa yksi papillaarinen kilpirauhassyövän tutkimuksessa, ja yksi haimasyövän tutkimuksessa; Useimmissa tapauksissa syöpiä todettiin histologisesti tai patologisesti. Lisäksi viisi tutkimukset olivat väestöpohjainen ja kaksi tutkimukset olivat sairaalassa perustuva; kaksi julkaisua, jotka eivät antaneet yksityiskohtaisia ​​tietoja lähteen ohjaus ei sekoitettu. Genotyyppi jakaumat kontrolleissa kaikkien tutkimukset olivat yhdenmukaisia ​​Hardy-Weinberg tasapaino, lukuun ottamatta osaa yhtä tutkimusta [16] (taulukko 1).

Quantitative synteesi

Tiedetään, että taajuus ATM rs664677 polymorfismi vaihtelee etnisten ryhmien. Euroopan väestö (n = 1542), CC-alleelin frekvenssi oli 40,9% (95% CI = 33,4-48,4), mikä oli merkittävästi pienempi kuin Aasian väestöstä (n = 2780, 60,6%, 95% CI = 57,5 -63,8; kuva 2).

yksittäiset riskiestimaattien (taulukko 2) lasketaan ja metsien tontteja (kuva 3a), jonka tutkimuksessa tyyppi kaikille yhdeksässä tutkimuksessa mukana analyysissä. Kaiken kaikkiaan ei ole merkittävää yhdistyksen välillä ATM rs664677 polymorfismi ja syövän riskiä ei havaittu geneettistä mallia (heterotsygoottinen vertailu: OR = 1,018, 95% CI = 0,791-1,311; hallitseva malli vertailu: OR = 1,026, 95% CI = 0,812-1,295 ). Jälleen syöpätapausta ja valvonta ei merkittävästi eroa alaryhmäanalyyseissa mukaan etnisyyteen ja lähde valvontaa. Kiehtovan, ATM rs664677 polymorfismi osoittivat todisteita yhdistyksen lisääntynyt rintasyöpäriski (hallitseva malli vertailu: OR = 1,447, 95% CI = 1,203-1,740), mutta osoitti suojaava rooli kehitettäessä keuhkosyövän meta -analyses stratifioitu syöpätyypin (hallitseva malli vertailu: OR = 0,764, 95% CI = 0,635-0,918; kuva 3b).

Testi heterogeenisyys

oli merkittävä heterogeenisyys homozygoottisia (CC vs. TT: P heterogeenisuus = 0,003), heterotsygoottinen (CT vs. TT: P heterogeenisuus 0,001), ja hallitseva malli (AA /GA versus GG: P heterogeenisuus 0,001) vertailuja. Kuitenkin resessiivinen mallin vertailun (CC vs. CT /TT: P heterogeenisuus = 0,539), heterogeenisyys ei löytynyt. Arvioimme lähde heterogeenisyys kasvaimen tyyppi, etnisyys, julkaisuvuosi, ohjaus lähde, ja otoskoko. Emme havainneet mitään osuutta merkittävän heterogeenisuus.

Herkkyysanalyysit

herkkyysanalyysi tehtiin selvittämään ensisijainen alkuperä heterogeenisyys. Neljä riippumatonta tutkimusta Sang-Ah Lee [15], Stefano Landi [18], Kyoung-Mu Lee [20], ja Sandra Angele [13] vaikutti heterogeenisyys. Heterogeenisuus oli tehokkaasti vähentää tai poistaa poissulkemista näistä neljästä tutkimuksesta (CC /CT vs. TT: P heterogeenisuus = 0,601). Lisäksi yksikään tutkimus muuttanut yhdistettyjen syrjäisimpien laadullisesti, mikä viittaa siihen, että tulokset meta-analyysissä olivat vakaat.

Julkaisu bias

Begger n suppilo juoni ja Egger testi käytettiin tunnistamaan mahdollisia julkaisu harhat kirjallisuuden, muodot suppilo tonttien näytti olevan symmetrisiä (kuva 3), mikä viittaa siihen, että ei ollut selvää julkaisua bias. Egger n testiä käytettiin antamaan lisää tilastollista näyttöä; Samoin tulokset osoittivat merkittävää julkaisua bias tässä meta-analyysissä (t = -0.02, P = 0,984 varten cc vs. tt) B

Keskustelu

Vastauksena DNA-vaurioita, lepotilassa kinaasi ja anturit ATM nopeasti aktivoitu, ja erilaiset alavirran substraattien ATM, joka säveltää alati laajeneva verkosto, ovat fosforyloitu. Osa alavirran substraattien ovat avaintekijöitä säätelyssä solukierron pidätyksen, DNA: n korjaukseen, ja apoptoosin. Koska tärkeä rooli ATM vastauksena DNA-vaurioita, perinnöllinen vaihtelu tämän geenin voi suoraan tai epäsuorasti edistää alttiutta syöpään [12].

Useat tutkimukset ovat raportoineet yhdistysten useiden geneettisiä variantteja ATM ja riskien syövän, esimerkiksi, rs1800057 (P1054R), rs1801516 (D1853N) ja rs1800054 (S49C) [25] – [28]. Jotkut näistä SNP mukana nonsynonymous variantit aiheuttanut aminohappomuutos ja saattaa olla fysiologinen vaikutus syövän kehittymisen. Täällä keskityimme yhdistyksen välillä synonyymi SNP (rs664677) ja syöpäriskiä. ATM IVS 22-77 T C (rs664677) sijaitsee koodittamattomalla alueella. Yksi mahdollisista mekanismeista IVS 22-77 T C ATM-geeni näytti välittyvän vaikuttamalla Silmukointi [29]. Toinen mahdollinen mekanismi saattaa olla vaikutteita mRNA vakautta. Kuitenkin todellinen mekanismi IVS 22-77 T C ATM-geeni on edelleen epävarma.

Tämä meta-analyysi 9 tutkimuksiin, joissa 4470 tapaukset ja 4862 tarkastukset, esittänyt todisteita siitä, että ei ole yhdistyksen välillä syöpä ja ATM rs664677 polymorfismi. Tulokset äskettäin meta-analyysi tutkimus assosiaation ATM D1853N polymorfismi ja rintasyövän riskiä esitti näyttöä vastaa meidän tuloksia [30]. Lisäksi alaryhmä tutkimuksia lähde valvonnan ja etnisyyden, eikä merkittäviä yhdistysten löytyivät geneettistä mallia. Kuitenkin rs664677 polymorfismi Aasian ja Euroopan populaatiot havaittiin olevan käänteinen yhdessä syöpäriskin kaikki geneettiset malleissa, tosin ilman mitään merkitystä. Ottaen huomioon, että ATM polymorfismi esittelee eri taajuuksilla eri väestöissä, analyysi tiedoista vastaavasti eri etnisten ryhmien voi poistaa jonkin verran vaikutusta. Ja tämä ero havaitsimme voi johtua eron lähteen valvontaa. Lähde valvonnan alkuperäisen tutkimusten saattaa olla heikko vaikutus tuloksiin analyysimme. Kuitenkin ajattelimme väestöstä perustuvan valvonnan olivat edustava väestössä. Siten geneettinen yhdistys tutkimuksissa valikoima säätimiä ja matching tila tulee harkita huolellisesti. Jos käytämme väestöön perustuvan valvonnan, voimme saada parempi luotettavuus.

Alaryhmäanalyysissä mukaan syövän tyypistä, riskisuhde CC homotsygootista versus Heterotsygoottisuuden plus TT homotsygootista väheni keuhkosyöpään, mutta tämä ei ollut tilastollisesti merkitsevä (0,972; 95% CI = 0,851-1,111). Muissa malleissa, kuitenkin OR väheni huomattavasti. Toisin kuin keuhkosyöpä, jossa ATM rs664677 C-alleeli on suojaava, rintasyövän, se näyttää olevan liittyy kohonnut riski. Tällaiset erot ovat aiemmin raportoitu; Esimerkiksi CHEK2 I157T variantti kanssa harvinainen alleeli myönnetty kohonnut rintasyövän riskiä, ​​mutta suojaava vaikutus keuhkosyöpään [31]. Mielenkiintoista, havaitsimme yhdistys omaavat disaccord rintasyövän ja keuhkosyöpä riskejä, jotka voivat johtua kahdesta syystä: yksi voisi olla, että ei-geneettiset tekijät ovat todennäköisesti täysin eri mekanismeja, jotka vaikuttavat kasvainten synnyssä yhteistuumin genotyyppi. Esimerkiksi geeni-ympäristön vuorovaikutukset saattavat moduloida syöpäriskiä. Toinen mahdollinen syy on se, että ATM käytetään monimuotoisuus mekanismeja, jotka säätelevät solujen lisääntymistä tai apoptoosia erilaisissa syöpäsoluissa.

Viime genomin laajuinen yhdistys tutkimukset (GWAS) ovat raportoineet useita SNP liittyvän rinta- tai keuhkosyöpä, mukaan lukien rs1219648, rs1092913, rs2736100, rs16969968, rs8034191, ja rs402710 et al [32] – [41]. Vaikka mikään GWAS ilmoitettujen tietojen yhdistys rs664677 rintasyöpään tai keuhkosyöpä tasalla. Kuten tiedetään, vuonna GWAS neljä keskeistä seikkaa (mallit alleelinen arkkitehtuurin yleisten sairauksien, otoskoko, kartta tiheys ja näytteen kerääminen harhat) on otettava huomioon, jotta voidaan optimoida kustannustehokkuuden tunnistaa aito taudin alttius loci [42]. Koska tiukat kriteerit, jotkut alhaisen riskin alleeleja voi jäädä huomaamatta huolimatta niiden potentiaalista merkitystä sairauden riskin.

kirjallisuus tarkistettava, että kahdeksan tunnusmerkkejä muodostavat järjestää periaate järkeistämiseksi monimutkaisuutta neoplastisen taudin. Ne sisältävät yllä proliferatiivinen signalointi, kiertää kasvu vaimentimet, vastustavat solukuoleman, joka mahdollistaa replikatiivisia kuolemattomuus, angiogeneesin, aktivoimalla invaasio ja metastaasi, uudelleenohjelmointi energia-aineenvaihduntaa ja kiertää immuunijärjestelmän tuhoa [43]. Tutkimukset ataksia teleangiektasia (A-T) solujen ja ATM-hiirissä ovat osoittaneet, että ATM on keskeinen säätelijä useita signalointikaskadien, jotka vastaavat DNA-säikeen katkoksia aiheuttama vaurioittavat aineet tai normaaleja prosesseja, kuten meioottisiin tai V (D ) J rekombinaatio. Nämä vasteet sisältävät aktivaation solusyklin tarkastuspisteiden, DNA: n korjaukseen ja apoptoosin [7]. Ottaen huomioon ATM monitoiminen, se saattaisi vaikuttaa useita reittejä tunnusmerkkejä ja jotka siksi sisältävät erilaisia ​​mekanismeja eri syöpätyyppejä. Tähän mennessä polku, jonka kautta ATM polymorfismi toimii on epäselvä. Lisätutkimuksia tarvitaan.

heterogeenisyys on mahdollinen ongelma, joka voi vaikuttaa tulosten tulkintaan. Merkitys välillä meta-analyysi heterogeenisuus olemassa lähes kaikissa vertailuissa, paitsi väistyvä malli. Olemme havainneet lähde heterogeenisyys kasvaimen tyyppi, etnisyys, julkaisuvuosi, ohjaus lähde, ja otoskoko. Kuitenkin, ei ollut näyttöä määrittää, mitkä niistä osaltaan merkittävä heterogeenisyys. Yksi mahdollisuus liittyy eroja matching tila. Emme kuitenkaan voi vahvistaa tätä mahdollisuutta koska ei ole yksityiskohtaisia ​​tietoja ei toimitettu. Heterogeenisyys voisi myös olla seurausta siitä, että kukin tutkimuksessa käytettiin erilaista lähestymistapaa osanottajat valitaan. Kuitenkin on epätodennäköistä, että valintamenettely vaikuttaisi genotyyppi lokukseen. Siten meillä ei ole selkeää selitystä varten tilastollisen heterogeenisuus, joka oli läsnä SNP. Lomaa-one-out herkkyysanalyysi ei olisi merkittävästi muuttuneet tuloksista yhdistetty analyysi, joka osoittaa, että meidän tulokset olivat kestäviä. Julkaisussa bias yhdistyksen välinen polymorfismin ja syövän riskiä ei havaittu.

Rajoitukset

Useat mahdollisten rajoitusten nykyisen meta-analyysissä olisi otettava huomioon. Ensinnäkin, vaikka suppilo juoni ja Egger n testi osoitti ole julkaistu bias ja vaikka tyhjentävä kirjallisuudesta tehtiin, on todennäköistä, että muutamia julkaisuja ja julkaisemattomia tietoja huomiotta. Valinta bias varten meta-analyysi on saattanut tapahtua. Toiseksi alaryhmäanalyysi syöpä tyyppi, määrä tutkimuksia ja aiheita analysoitiin rs664677 oli pieni, ja tilastollinen teho oli niin alhainen, että varovaisuutta tulee noudattaa Tuloksia tulkittaessa. Jatkotutkimuksessa paljon suurempi otoskoko tarvitaan. Kolmanneksi meidän tulokset perustuvat oikaisematon arvioihin puuttumisen vuoksi käytettävissä olevien tietojen. Tarkempi analyysi havaita, jos tarkempia yksittäiset tiedot olivat saatavilla, kuten ikä, sukupuoli, ja valotuksen. Puutteistaan ​​huolimatta meidän meta-analyysi oli myös joitakin etuja. Ei ollut näyttöä heterogeenisyys resessiivinen mallin joukossa tutkimuksia tämän SNP. Löysimme paradoksaalinen rooli ATM rs664677 polymorfismin edistävät sekä syöpää estävän ja edistäviä vaikutuksia.

Yhteenvetona tämä meta-analyysi vakuuttavasti osoitettu, että ATM rs664677 polymorfismi ei liity syöpäriskiä. Kohtalaisen suojaava vaikutus havaittiin keuhkojen syöpäriskiä. Sen sijaan havaitsimme, kohonnut riski sairastua rintasyöpään herkkyys. Lopuksi hyvin suunniteltu, puolueeton tutkimuksia olisi tehtävä saada kattavampi käsitys välisen assosiaation ATM-geeni ja syöpäriskiä.

Kiitokset

Kiitämme tohtori Meilin Wang tieteellisiin muotoilu.

Vastaa