Krooninen sairaus

tiivistelmä

tavoite

tutkia yhdistyksen toiminnallisen ituradan muunnos 3′ UTR

KRAS

kohdun limakalvon syövän riskiä, ​​sekä yhdistyksen mikroRNA (miRNA) allekirjoitukset ja

KRAS

-variant kliinisiä ominaisuuksia ja eloonjäämisen kannalta: kaksi mahdollisille RTOG endometriumsyöpään tutkimuksissa.

menetelmät /Materiaalit

yhdistys

KRAS

-variant kohdun limakalvon syövän riskiä arvioitiin tapaus-verrokki analyysi 467 naista, joilla oli tyypin 1 tai 2 kohdun limakalvon syövän ja 582 ikä-verrokkeihin. miRNA ja DNA eristettiin n ilmentymisen profilointiin ja genotyyppitestiä kasvain yksilöitä 46 naista, joilla oli tyypin 1 endometriumsyöpään ilmoittautunut RTOG tutkimuksissa 9708 ja 9905. miRNA ekspressiotasot ja

KRAS-

variantti genotyypin korreloivat potilaan ja kasvainten ominaisuuksiin , ja selviytyminen tulokset arvioitiin variantti alleelin tyypin.

tulokset

KRAS

-variant ei merkittävästi liittynyt yleistä endometriumin syöpäriski (14% valvontaa ja 17% tyypin 1 syövät), vaikka oli rikastunut tyypin 2 kohdun limakalvon syöpiä (24%, p = 0,2). Yhdistetyssä analyysi RTOG 9708/9905 miRNA ilme vaihteli iän mukaan, läsnäolo lymphovascular hyökkäyksen ja

KRAS

-variant tila. Kaiken eloonjäämisluvut 3-vuotiaalla potilaalla on variantin ja villikannan alleelit olivat 100% ja 77% (HR 0,3, p = 0,24), vastaavasti, suosien variantti.

Johtopäätökset

KRAS-

variantti voi olla geneettinen markkeri riski tyypin 2 kohdun limakalvon syöpiä. Lisäksi kasvaimen miRNA ilmaisu näyttää liittyvän potilaan iän, lymphovascular invaasio ja

KRAS-

variantti, tukee oletusta, että muuttunut tuumoribiologiassa voidaan mitata miRNA ilmaisua, ja että

KRAS-

variantti todennäköisistä vaikutuksista kohdun limakalvon tuumoribiologiassa.

Citation: Lee LJ, Ratner E, Uduman M, Winter K, Boeke M, Greven KM, et al. (2014)

KRAS-

Variant ja miRNA ilmentäminen RTOG endometriumsyöpään Clinical Trials 9708 ja 9905. PLoS ONE 9 (4): e94167. doi: 10,1371 /journal.pone.0094167

Toimittaja: Shannon M. Hawkins, Baylor College of Medicine, Yhdysvallat

vastaanotettu: 02 joulukuu 2013; Hyväksytty: 12 maaliskuu 2014; Julkaistu: 14 huhtikuu 2014

Copyright: © 2014 Lee et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus tukivat NCI-NIH apurahan 5R01CA098346. Tämä tutkimus tuki myös Sädehoito Oncology Group /American College of radiologia (RTOG /ACR) -jäsenyysohjelma ja RTOG myöntää U10 CA21661 ja CCOP avustusta U10 CA37422 National Cancer Institute (NCI) ja NCI-NIH apurahan 5R01CA098346. JW tukivat R01 CA131301-04, CA-157749-01A15 ja 5R01CA131301-05. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Dr. Weidhaas ja Dr. Slack löysi KRAS-variantti, joka on patentoinut Yale University. Tämä patentti on nimeltään ”geneettisen vaurion liittyy syövän”, ja määrä on 8.221.980. Se on lisensoitu yritys, Mira Dx, että tohtori Slack ja Dr. Weidhaas mukana perustamassa. Kumpikaan Dr. Slack eikä Dr. Weidhaas työskentelevät tai maksama Mira Dx, mutta toimivat palkattoman tieteellinen konsultteja. Tämä ei muuta tekijöiden noudattaminen PLoS One politiikkaa jakaa tietoja ja materiaaleja.

Johdanto

kliininen ja biologinen heterogeenisuus kohdun limakalvon syöpä on hyvin tunnustettu, koska kuvaus kahden suuren alatyyppiä by Bokhman vuonna 1983 [1]. Type 1 kohdun limakalvon syöpä, The endomet- alatyyppi, joka liittyy pelkän estrogeenin altistuminen, krooninen Anovulaatiossa nulliparity ja liikalihavuus. Tyypin 2 kohdun limakalvon syöpä sisältää harvinaisempia kuin endomet- alatyyppejä kohdun papillaarisen vakavien ja selkeä cell carcinoma. Tyypin 2 syövät usein nähty vanhemmilla naisilla, syntyy atrofisen kohdun limakalvo, ja eivät ole estrogeenin reagoiva. Kahden porrastettua luokittelu kohdun limakalvon syövän kliinisen ja patologisen tekijät tukee myös molekyylitasolla. Edelleen molekyyli luokitus on hiljattain tuodaan esille julkaisemalla Cancer Genome Atlas [2]. Menetys tuumorisuppressorigeenin

PTEN

on raportoitu 30-50% tyypin 1 syöpien [3] – [5], mutta on harvoin havaittu vakavien tai kirkas solualatyyppien [6]. Esikasvaintekijän HER2 /neu, trans-kalvo kasvutekijän reseptori, on yleisesti täydentää tai yli-ilmaistaan ​​tyypin 2 syövät [7], [8]. Geeniekspressioprofilointi microarray analyysi on myös vahvistanut läsnäolon erillisten kohdun limakalvon syöpä alatyyppejä [9]. Muut ominaisuus molekyylitason muutoksiin kuuluvat mikrosatelliittien epävakautta [10] ja mutaatio

beta-

kateniinin [11] endomet- kohdun limakalvon karsinoomat ja menetys E-kadheriinin ilmentymisen ja p53 mutaatioita serous syövissä [5]. Kasvain hankittu mutaatiot

KRAS

on havaittu 15-30% tyypin 1 kohdun limakalvon syöpiä, mutta äärimmäisen harvoin (0-5%) kanssa tyypin 2 syövät [12]. Yleisyys kasvaimeen hankittujen

KRAS

mutaatioita on vaihtelevasti liittyy vaiheeseen, luokan ja selviytyminen kohdun limakalvon syöpä [13] – [16].

KRAS

mutaatioita on myös havaittu kohdun limakalvon liikakasvua, ja voi edustaa varhainen tapahtuma kasvaimien syntyyn tyypin 1 kohdun limakalvon syöpiä.

Vaikka adjuvanttihoito tyypin 2 kohdun limakalvon syövät usein kemoterapia, roolin yhdistettyjen kemoterapiaa ja sädehoitoa (RT) korkean riskin ja pitkälle tyypin 1 syöpiä on enemmän kiistanalainen. Naiset, joilla on tyypin 1 kohdun syöpiä patologinen riskitekijöitä kuten syvä myometrisia invaasio, korkea kasvaimen, kohdunkaulan invaasio ja /tai lantion suljetuissa extrauterine leviäminen on 15-30% uusiutumisen riskiä huolimatta adjuvanttia lantion sädehoitoa (RT) [17]. Säteilyturvakeskus Therapy Oncology Group (RTOG) teki kaksi mahdollisille, usean instituution tutkimuksissa (9708 ja 9905), jotka oli suunniteltu arvioimaan toteutettavuutta ja tehokkuutta samanaikaisen kemoterapian ja leikkauksen jälkeen RT naisille International Federation of Gynecology and Obstetrics (FIGO) vaiheet IC-IIIC, korkean riskin, tyypin 1 kohdun limakalvon syöpä. Koska raportoitu hoitovasteen 30-35% pelkkää solunsalpaajahoitoa, nämä tutkimukset tehtiin turvallisuuden arvioimiseksi ja selviytymisen lopputuloksia yhdistetyn tähtäävään lähestymistapaan, korkean riskin ja pitkälle kohdun limakalvon syöpä. RTOG 9905, satunnaistetun vertailu adjuvanttia kemosädehoito verrattuna pelkkään sädehoitoon, suljettiin aikaisin huonon karttuminen ja siksi elossaolopäätetapahtumiin ei analysoitu. Kuitenkin kudos kerättiin etsintään uusien biomarkkereiden ja kliinisen korrelaatioita.

MikroRNA (miRNA) ovat luokan pieniä ei-koodaavan RNA jotka estävät geenin ilmentymistä loppupään tavoitteita sitoutumalla täydentävien alueiden 3’alueet (UTR) lähetti-RNA. Globaalin geenin säätölaitteet, miRNA toimivat uuden luokan onkogeenien tai tuumorisuppressorit riippuen solujen yhteydessä. Muutoksia miRNA ekspressiotasot ovat sekaantuneet oncogenesis sekä tuumoribiologiassa lähes kaikista syövistä [18]. Selvät miRNA lauseke allekirjoitukset on myös kuvattu tyypin 1 ja tyypin 2 kohdun limakalvon syöpiä [19], joka tukee niiden kykyyn heijastaa luontainen tuumoribiologiassa. Lisäksi, perinnöllinen variantit miRNA sitoutumiskohdat onkogeenien on osoitettu ennustaa syövän riski, kasvaimen biologiaan ja muuttaa miRNA allekirjoitukset [20].

Ensimmäinen esimerkki funktionaalisesta miRNA sitoutumiskohdan mutaatio on muunnos alleelin 3′-UTR

KRAS

(rs61764370), ituradan mutaatio havaittiin häiritä

let-7

sitoutumisen lisäämiseksi

KRAS

ilmaisun [21] ja ennustaa syöpäriskiä [21] – [24]. Tämä mutaatio on lisäksi liitetty muunnetun geenin ja miRNA ilmentyminen kasvaimissa [21] – [23], [25]. Mielenkiintoista,

KRAS-

variantti ennustaa munasarjasyövän riskiä postmenopausaalisilla naisilla [22], kolminkertainen negatiivinen rintasyöpä ennalta vaihdevuodet ohittaneilla naisilla [22], ja aggressiivinen rintojen tuumoribiologiassa postmenopausaalisilla naisilla, joilla on historia hormonikorvaushoito [26], mikä viittaa siihen, että on olemassa todennäköinen vaikutus estrogeenin kasvainliitteisten funktio

KRAS-

variantti. Lisäksi

KRAS-

variantti näyttää ennustaa syövän biologian kaikista syövistä toistaiseksi tutkittu, mukaan lukien ne, joille ei näytä ennustaa lisääntynyt riski [27] – [28].

tavoitteet tässä tutkimuksessa olivat moninkertaiset: 1), voiko

KRAS-

variantti liittyy endometriumin syöpäriski; 2) arvioida yhdistyksen miRNA ilmaisun allekirjoituksia kliinisiä piirteitä kasvaimen yksilöitä RTOG 9708 ja 9905; ja 3) onko

KRAS

-variant liittyy kohdun limakalvon syövän biologian arvioimalla sekä kliinisen ja miRNA ilmaisun yhdistysten näissä samoissa kokeissa.

Materiaalit ja menetelmät

asia-ohjaus Data

aiheista tapauskontrollitutkimuksessa olivat Connecticut asukkaiden diagnosoitu primaarinen kohdun limakalvon syöpä lokakuun 2004 ja syyskuun 2008 tutkimus henkilöstö Rapid Case toteamista käsivarsi Yale Cancer Center kävi Connecticut yleisen sairaalat määrittää tapauksessa kelpoisuus ja tunnistetietoja. Kontrollit tunnistettiin satunnaisotannalla numeron valinta. Verinäytteet tai syljestä näytteet kerättiin koehenkilöistä. Kerätystä yksilöt, DNA eristettiin käyttäen Magna puhdasta nukleiinihapon kit (Roche Diagnostics, Indianapolis, IN) ja buffy-coat verisolut, ja Oragene Kit (DNA Genotek Inc, Kanada) ja sylkinäytteet. Läsnäolo

KRAS

-variant havaittiin käyttäen TaqMan PCR-määritys tunnistaa villin tyypin (T) tai variantin (G) alleeli käyttäen alleeli-koettimia, kuten on aiemmin kuvattu [21]. Koska pienet alleelin taajuus, heterotsygoottinen (TG) ja homotsygoottisia (GG) lomakkeet yhdistettiin analyysiä varten verrata villityypin alleelin (TT).

Ethics Statement for Asia-ohjaus Data

Tämä pöytäkirja hyväksyttiin Yale Human Tutkimukset komitean ja Connecticutin osavaltion Department of Public Health Human Investigation komitean. Tietyt tiedot Tässä tutkimuksessa käytetyt saatiin Connecticut Kasvain rekisterin Connecticut Department of Public Health.

RTOG 9708 ja 9905

RTOG 9708 oli yksihaarainen vaiheen II tutkimus adjuvanttia RT yhdistettynä sisplatiinin ja paklitakselikemoterapia, joka otettiin 45 potilasta, joilla on tyypin I FIGO 1988 Stage IC-IIIC endomet- adenokarsinooman kohtuun. Seuraaja tutkimuksessa, RTOG 9905, oli satunnaistettu kahden käsivarren vaiheen III tutkimuksessa adjuvanttia RT tai ilman samaa kemoterapiaa, joka otettiin 42 potilasta. Kaikki potilaat kirjoilla kahdessa tutkimuksessa alkoi apuaine sädehoito 8 viikon sisällä leikkauksesta (koko vatsan kohdunpoisto ja kahdenvälistä salpingo-oophorectomy). Hyväksytyillä potilailla oli asteen 2 tai 3 adenokarsinooma suuremmalla kuin 50% myometrisia invaasio, kohdunkaulan strooman osallistuminen tai lantion suljetuissa extrauterine sairaus ja /tai positiivinen vatsakalvon sytologia. Potilaat, joilla on ei-endometriod histologia, kuten papillaarinen vakavien tai kirkas solujen, suljettiin pois tutkimuksista.

adjuvanttihoito mukana lantion RT annoksen 45-50,4 Gy seuraa emättimen brakyhoidoksi. Sisplatiini (50 mg /m2) annettiin samanaikaisesti päivinä 1 ja 28. Sen jälkeen valmistumisen RT potilaat saivat 4 sykliä adjuvanttia sisplatiinia (50 mg /m

2) ja paklitakselin (160-175 mg /m

2) 4 viikon välein. Potilaat havaittiin seurannassa 4 kuukauden välein 2 vuoden ajan, sitten 6 kuukauden välein 1 vuosi ja sen jälkeen vuosittain. Papa ja rintakehän röntgen tehtiin vuosittain.

Ethics lausuma RTOG 9708 ja 9908

Kirjallinen suostumus saatiin kaikilta potilailta ennen tutkimusta. Kliininen tulos ja toksisuustietoja RTOG 9708 on aiemmin julkaistu [17], [29]. RTOG 9905 lopetettiin varhain huonon karttuminen ja seuranta lopetettiin vähintään 12 kuukauden kohdalla seurannan aikana jokaiselle potilaalle.

DNA: n eristäminen ja RNA: n ja testaus

KRAS

-variant ja miRNA

kasvain yksilöitä parafinoidut formaliinikiinnitetyt kapulat microdissected jälkeen tunnistaa alueet riittävän kasvaimen soluihin patologi. Kasvaimen sektiot de-paraffinized käyttäen Ksyleeni ja DNA eristettiin genotyypitys

KRAS

-variant kuten edellä on kuvattu. Kokonais-RNA eristettiin parafinoidut kasvain näytteet käyttäen Ambion takaisin kaikki Kit (Life Technologies, Grand Island, NY) valmistajan ohjeiden mukaisesti. miRNA ajettiin ABI Taqman TLDA alustalla. Näytteitä genotyypattiin varten

KRAS-

variantti. Aineisto oli Hardy-Weinberg tasapaino.

Tilastollinen analyysi

Tilastollinen analyysi suoritettiin käyttäen tilastollista ohjelmistoa JMP, v. 8.0.1 (SAS Institute, Cary, NC). Jotta tapaus-verrokki analyysi, esiintyvyys variantin alleelin (TG /GG) verrattiin tapauksista, joissa kohdun limakalvon syöpä ja väestön käyttäviin Fisherin tarkka testi. Kliiniset, patologista ja hoito ominaisuudet potilaista RTOG tutkimuksissa verrattiin alleelin tyypin (villityyppi vs. variantti) käyttäen t-testiä tai Fisherin tarkkaa testiä. Vakuutusmatemaattiset arviot tautivapaan elinajan (DFS) ja kokonaiseloonjääminen (OS) laskettiin käyttämällä Kaplan-Meier-menetelmällä. Kumulatiivinen ilmaantuvuus menetelmää käytettiin arvioitaessa hinnat paikallisten alueiden vika (LRF) ja kaukainen vajaatoiminta (DF). OS laskettiin alkaen satunnaistamisen kunnes kuolema mistä tahansa syystä. DFS määriteltiin aikaväli alkaen satunnaistamisen kunnes luodaan etäispesäkkeitä, paikallinen alueiden vajaatoiminta tai kuolema mistä tahansa syystä. LRF määriteltiin ensisijaisesti uusiutuvan tai etenevän, emättimen uusiutumisen ja /tai solmukohtien uusiutuvan tai etenevän. DF määriteltiin kaukaisia ​​etäpesäkkeitä ja /tai para-aortan vika. Univariate analyysi suoritettiin käyttäen Coxin suhteellisten riskien mallia. Arvioitu esiintyvyys hinnat variantin alleelin käytettiin tehon laskelmissa. Tyypin 1 virhe (α) on alle 0,05 pidettiin tilastollisesti merkitsevä.

miRNA ekspressiotietojen, kaikki esikäsittely- ja tilastollinen analyysi suoritettiin tilastollinen ohjelmointiympäristössä R, käyttäen räätälöityjä toimintoja ja Bioconductor Limma paketti. Kukin näyte normalisoitiin erikseen käyttäen kahdeksan endogeeninen kontrolli-RNA: ita, ja sitten intensiteetit skaalata koko näytteet ovat samanlaisia ​​jakaumat. Tilastollisesti merkittäviä muutoksia miRNA ilmaisun näytteiden välillä ryhmitelty iän, rodun, läsnäolo lymphovascular tilaa hyökkäystä, DFS ja

KRAS

-variant tila määritettiin käyttäen Limma kanssa p 0,05 oikaistaan ​​sellaisen Bonferroni korjaus, ja ehdoton kertainen -muutos ≥2. Hierarkkinen ryhmittely perustui euklidinen etäisyys metristä ja Wardin yhdistämiseen.

Tulokset

KRAS

-variant ja endometriumin syöpäriski

tapaus-verrokki tutkimuksessa arvioidaan rooli

KRAS-

variantti ennustettaessa kohdun syöpäriski, alleeli tiedot saatiin 583 populaatiokontrolleja, 430, joilla oli tyypin 1 kohdun limakalvon syöpä ja 37: lla tyypin 2 syöpä. Yleisyys variantin alleelin oli 13,9% kontrollien joukossa ja 16,5% potilailla, joilla kohdun limakalvon syöpä (p = 0,29). Kuten taulukosta 1, esiintyvyys variantin esiintyi useammin potilailla, joilla on tyypin 2 kohdun syöpä ei-endomet- histologia (24,3%) verrattuna tyypin 1 kohdun limakalvon syöpä (16,7%) tai populaatiokontrolleja (13,9%). Kuitenkaan yksikään erot olivat tilastollisesti merkitseviä todennäköisesti johtuen pieni määrä tyypin 2 syöpiä tässä tutkimuksessa.

Mirna ilmentäminen RTOG 9708 ja 9905

Mirna ilmentymiskuviot arvioitiin kasvaimen yksilöt osallistuvilla potilailla RTOG 9708 ja 9905 ja testattu yhdessä kliinisen ja patologisen ominaisuudet. Me ei havaittu huomattavia eroja miRNA ilmentymisen näytteiden välillä näiden kahden tutkimuksen (tuloksia ei ole esitetty), siis näytteet yhdistettiin myöhempää analyysiä varten. miRNA ekspressiokuvioiden vaihteli kasvaimista lymphovascular invaasiota (LVI) verrattuna ilman. Ilmentyvät eri miRNA (p-arvo 0,05 ja kertamuutosta 2) sisältyvät miR-194, miR-192, miR-203, miR-345, miR-30e-3p, miR-210 ja miR-301 (taulukko S1, kuva 1), jotka kaikki olivat yli-ilmentyy tuumoreissa LVI läsnä. Samoin oli eroja miRNA ilme potilaan iän perusteella: kasvaimia vanhemmilla naisilla (≥51 vuotta) osoitti yliekspressio miR-20b, miR-10a, ja miR-187 ja ali miR-432 ja anna-7d (taulukko S2 , kuva 2) verrattuna kasvaimet nuorempien naisten ( 51 vuotta).

keltainen edustaa potilaita, joilla LVI, ja sininen edustaa potilaita ilman LVI.

keltainen edustaa potilaita alle 51 vuotta ikää, ja sininen edustaa potilaita yhtä suuri tai vanhempia alle 51-vuotiaita.

Clinical Associations of

KRAS

-variant in Trials RTOG 9708 ja 9905

alleelityypitys oli saatavilla 46 87 arvioitavasta potilaasta (53%) ilmoittautunut RTOG 9708 ja 9905. saatavuus alleelin tiedot olivat samat molemmissa tutkimuksissa, johon kuului 22 potilasta (49%) vuoden 9708 ja 24 potilasta ( 57%) alkaen 9905. yleisyys

KRAS

-variant oli 22% kaiken kaikkiaan, ja oli 18% (n = 4) ja 25% (n = 6) 9708 ja 9905, vastaavasti.

KRAS-

variantti löydettiin vain 1 11 (10%) naisista nuorempi alle 51-vuotiaita aikaan kohdun syövän diagnosointiin ja 9 35 (28%) naisista, jotka olivat vanhempia, vaikka nämä yleisyys eivät olleet tilastollisesti erilaisia ​​(p = 0,41), mikä johtuu todennäköisesti pieni otoskoko.

mediaani seuranta-ajan potilaille, joilla alleeli tiedot yhdistetyssä analyysissä oli 29,3 kuukautta (min-max, 6,8-124,1kuukautta). Potilaiden ominaisuudet, kuten ikä, ECOG suorituskykyluokka, ja rotu, eivät eronneet merkittävästi naisten kanssa ja ilman

KRAS-

variantti (taulukko 2). Vuoden 1988 FIGO vaiheessa jakelu, histologia, syvyys myometrisia hyökkäyksen yli 50% ja läsnäolo LVI oli samanlainen ryhmien välillä.

3-vuoden OS hinnat olivat 100%:

KRAS-

variantti potilaista ja 77% (95% luottamusväli [CI]: 58% -87%) ja ei-variantin potilailla (riskisuhde [HR] = 0,3, 95% CI: 0,04-2,29, p = 0,24). Yksi 10 potilasta (10%) ja

KRAS-

variantti oli LRF ja 2 (20%) oli DF verrattuna 7 (19%) ja 13 (36%), vastaavasti potilailla, joilla ei -variant alleeli. HRS varten LRF ja DF oli 0,45 (95% CI: 0,05-3,65, p = 0,45) ja 0,44 (95% CI: 0,10-1,97, p = 0,28) muunnokseen harjoittajille. Nämä suuntaukset eivät olleet merkittäviä, ehkä siksi tutkimuksessa teho oli vain 14-41% havaita merkittävää eroa kliinisten päätepisteiden johtuen pienen otoksen koosta ja rajallisista seurantaa.

Mirna Expression ja

KRAS

-variant in RTOG 9708 ja 9905

koska

KRAS-

muunnos on aiemmin osoitettu liittyvän muuttuneeseen geeni sekä miRNA ilmentyminen kasvaimissa, arvioimme miRNA allekirjoitusta kasvaimia ja ilman

KRAS-

variantti. Kun lisäksi otetaan huomioon, että miRNA allekirjoitukset vaihteli kasvainten potilaan iän perusteella (cutpoint 51 vuotta), ja että suurin osa potilaista, joilla on

KRAS-

muunnelma ovat postmenopausaalisten, arvioimme nämä erot vain kasvaimia potilaat yli 51 vuotta. Löysimme merkittäviä eroja miRNA allekirjoituksia kasvaimia sairastavien potilaiden

KRAS-

variantti ja ilman

KRAS-

variantti. Näihin sisältyvät alempi ilmentymistä miR-181B, miR-324-3p ja miR-518b in

KRAS-

muunnelma potilaiden kasvaimia (taulukko 3, kuva 3).

keltainen edustaa potilaita ilman

KRAS-

variantti, ja sininen potilaiden kanssa

KRAS-

variantti.

keskustelu

Tämä tutkimus on ensimmäinen analyysi yhdistyksen

KRAS-

variantti kohdun limakalvon syöpä. Vaikka

KRAS

-variant ei ollut ennustaja yleisen endometriumin syövän riskiä, ​​sitä on tehostettu hoidettaessa tyypin 2 syöpiä, joiden esiintyvyys 24,3%. Lisäksi kaksi mahdollisille RTOG kohdun limakalvon syöpä tutkimuksissa miRNA allekirjoitukset sekä

KRAS-

variantti liittyivät erillisten kliinisiä piirteitä. miRNA allekirjoitukset olivat erilaiset kasvaimet tai ilman LVI, välillä kasvaimia pre versus vaihdevuosien jälkeisen potilaita, ja välillä

KRAS-

variantti potilaille ja ei-variantti potilaille. Vaikka RTOG 9708 ja 9905 ei oltu suunniteltu havaittu tilastollisesti merkitseviä assosiaatioita

KRAS

-variant ja lopputulos, suuntaus oli, että

KRAS-

variantti liittyi parempaan tulokseen, vaikka vahvistus tämän hypoteesin edellyttää testaus suuremmassa tutkimuksessa enemmän tilastollista voimaa.

Vaikka yhdistyksen miRNA ilmaisun ja muuttunut kliinisiä piirteitä kasvain on hyvin dokumentoitu, se saattaa vaikuttaa yllättävältä, että

KRAS

-variant, itu-line, ei-proteiinia koodaavan sekvenssin mutaatio, joka häiritsee miRNA sitova, ennustaa muuttunut miRNA allekirjoitusta kasvain ja myös muuttaa ennustetta. Kuitenkin yhdistys

KRAS-

variantti muuttuneeseen miRNA allekirjoitukset on todettu kaikissa kasvain, jossa se on analysoitu, kuten keuhkosyöpä [21], melanooma [10], pään ja kaulan alueen syöpä [30 ] ja kolminkertainen negatiivinen rintasyöpä [23].

yhdistys

KRAS-

variantti ennusteeseen poikki kasvaintyypeille on myös laajalti raportoitu. Kohortin 344 potilailla, joilla on pään ja kaulan alueen syöpä, vaikka yhdistys syöpäriskiä ei havaittu, variantti kantajia oli huonompi kliininen tulos, kun ikä- ja vaiheen (HR 1,6, 95% CI 1,0-2,5) [30], alhaisemmat eloonjäämisluvut selvin potilailla, joilla suuontelon syöpä verrattuna nielun ja kurkunpään sivustoja. Useissa tutkimuksissa on todettu, että

KRAS

-variant ennustaa muuttunut vastauksena setuksimabia metastasoituneen kolorektaalisyövän [28], [31]. Munasarjasyövän,

KRAS-

variantti ennustaa huono tulos johtui platinaa vastarintaa [23]. Platinaa vastarintaa todettiin myös potilailla, jotka saivat kemoterapiaa yksinään metastasoituneen pään ja kaulan alueen syöpä (Chung, toimitettu). Platinum vastus on erityisen mielenkiintoinen siinä yhteydessä RTOG tutkimuksessa selvitettiin tässä tutkimuksessa, jossa potilaiden osuus saivat sisplatiinia toimitetaan samanaikaisesti säteilyn ja yhdessä paklitakselin. Voisi hypoteesin, että lisäys säteilyn platinaa aineita voisi voittaa liittyvä vastus, hypoteesi, joka arvioidaan parhaillaan ylimääräisiä RTOG tutkimuksissa.

joukossa

KRAS

-variant positiiviset ja negatiiviset kasvaimia tässä tutkimuksessa 3 miRNA oli ilmennetty eri, kuten miR-181B, miR-324 ja miR-518b. Prekliinisissä tutkimuksissa miR-181B on osoitettu edistää solujen lisääntymistä ja vähentää apoptoosia kohdunkaulan syövän soluihin [32], välittää kasvaimen kehittymisen kautta STST3 [33], ja aiheuttaa gemsitabiini resistenssin haimasyöpäsoluissa [34]. Ihmisen itusolukasvaimet, säätely ylöspäin miR-518b liittyi sisplatiinin kestävä fenotyyppi [35]. Nämä tutkimukset voi selittää parantuneen tuloksia nähdään työmme että suosi

KRAS

-variant potilaille, koska

KRAS-

variantti kasvaimia oli pienempi ekspressiotasot miR-518b. Tutkimuksessa, nenänielun karsinooma, downregulation miR-324 liittyi radioresistance [36]. Tutkimuksessamme

KRAS-

variantti kasvaimia oli alhaisempi miR-324, vaikka ei ollut selkeää radioresistance koska nämä potilaat olivat parantuneet hinnat paikallisten alueiden valvonta.

globaali näkymä mitä ero miRNA ilmaus löytyy meidän kasvaimissa voi edustaa, käytimme miR System, jossa yhdistyvät 7 algoritmit ja 2 validoitu tietokannat tunnistamaan mahdolliset geenikohteet of miRNA ja niiden toiminta sekä koulutusjakson analyysi käyttäen Kegg (Kioto Encyclopedia of Genes and genomit) [37]. Tavoitteena geenit miR-181B sisältävät

MAP3K3

(mitogeeniaktivoidut proteiinikinaasi 3, ylhäältä osuma),

ESR1

(estrogeenireseptori 1, validoitu kohde), ja

KRAS

, kun taas ne, miR-518b sisältävät

CTNNBIP1

(β-kateniinin vuorovaikutuksessa proteiini) ja

MAP3K7IP3

(mitogeeniaktivoidut proteiinikinaasi 7 vuorovaikutuksessa proteiini 3). Sillä reitti rikastetun kohdegeenien, tasauspyörästö ilmentyminen miRNA Edellä luetellut liittyy pitkän aikavälin potentiaatiota, polkuja syövän ja kohdun limakalvon syöpä, kuten myös seuraavat signalointireittejä: TGF-β, ErbB, MAPK: n, ja Wnt . Wnt /β-kateniinin signalointireitin on osoitettu olevan väärin säädellystä vuonna 10-45% kohdun limakalvon syöpien ja on läheisesti säätelee estrogeenin ja progesteronin [38]. Lisäksi KRAS on tärkeä ylävirtaan välimies MAPK-reitin, ja yli-ilmentyminen voi lisätä aktivoitumisen RAF /MEK /MAPK-reitin ja siten edistää kasvaimen kehittymisen. Aiempi tutkimus on osoittanut, että MAPK-reitin aktivoituu kolminkertainen negatiivinen rintasyöpä kanssa

KRAS

-variant, ja siihen liittyy pienempi estrogeenin signalointi [24]. Nämä tulokset ja muut osoittavat, että rooli

KRAS

-variant syövän riskiä ja biologian voi olla riippuvainen hormonaalista ympäristössä, kuten vaihdevuosien tila, jatkuva aihe tutkimusta.

Meillä on myös suoritettu koulutusjakson analyysi 10 ilmentyvät eri miRNA kasvaimia ja ilman lymphovascular hyökkäystä. Kiinnostaa, ennusti reittejä mukana polttovälin tarttuvuus, sääntely aktiinisytoskeletonin, aukkoliitos ja vyöliitos olivat alkuun osumia Kegg sekä Wnt, MAPK, TGF-β, ja ErB signalointireittejä.

Vaikka tutkimuksemme rajoitti pieni näyte koko RTOG tutkimuksissa käytimme, joka antoi riittämättömän tilastollinen voima meitä kehittämään vankka päätelmiä mahdollisesta roolista

KRAS-

variantti ennustettaessa endometriumin syöpäriski tai lopputuloksesta pystyimme näkemään mahdollinen yhdistys kautta muuttunut miRNA ilmentyminen kasvaimissa. Lisäksi pystyimme takautuvasti keräämään kudosnäytteiden yhteistyöhön ryhmässä ja tehdä translaatiotutkimusta tutkimus, joka on tuottanut alustavia tietoja arvoinen validointi suuremmissa ikäryhmät. Nämä havainnot tukevat edelleen hypoteesia, että on olemassa mitattavissa tapoja arvioida heterogeenisyys kohdun limakalvon syöpä, joka voisi antaa tärkeitä varoituksia syntymässä olevista tulevaisuudessa mahdollistaa harjoittajia tarkoituksenmukaisempaa ja yksilöllisesti suoraan potilaan hoidon.

tukeminen Information

Taulukko S1.

Association välillä miRNA ilmaisun ja lymphovascular invaasio.

doi: 10,1371 /journal.pone.0094167.s001

(DOCX) B Taulukko S2.

Association välillä miRNA ilmaisun ja ikä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0094167.s002

(DOCX) B

Kiitokset

yhteistyö 28. Connecticut sairaaloiden, kuten Charlotte Hungerford Hospital, Bridgeport sairaala, Danbury Hospital, Hartford sairaala, Middlesex Hospital, New Britain General Hospital, Bradley Memorial Hospital, Yale /New Haven Hospital, St. Francis Hospital ja Medical Center, St. Maryn sairaalassa, sairaala St. Raphael , St. Vincent Medical Center, Stamford Hospital, William W. Backus Hospital, Windham Hospital, Eastern Connecticut Health Network, Griffin Hospital, Bristol Hospital, Johnson Memorial Hospital, Day Kimball sairaala, Greenwich Hospital, Lawrence ja Memorial Hospital, Milford Hospital, New Milford Hospital, Norwalk sairaala, Midstate Medical Center, John Dempsey Hospital ja Waterbury Hospital, sillä ne mahdollistavat potilaiden pääsyä, vilpittömät kiitokset. Haluamme kiittää Barbara Silver ja Corinne Doll kriittisiin lukema käsikirjoituksen.